Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SALTDLFPLPIVQAPMAGGVSVPQLAAAVCEAGGLGFLAAGYKTADGMYQEIKRLRGLTGRPFGVNVFMPQPELGAVEVY
AHQLAGEAAWYETELGDPDGGRDDGYDAKLAVLLDDPVPVVSFHFGVPDREVIARLRRAGTLTLVTATTPEEARAVEAAG
ADAVIAQGVEAGGDQGTHRDSSEDDGAGIGLLSLLAQVREAVDIPVVAAGGIMRGGQIAAVLAAGADAAQLGTAFLATDE
SGAPGPHKRALTDPLFARTRLTRAFTGRPARSLVNRFLREHGPYAPAAYPDVHHLTSPLRKAAAKAGDAQGMALWAGQGH
RMARELPAGRLVEVLAAELAEARTAL

The query sequence (length=346) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3bw2:A 347 346 0.9971 0.9942 0.9971 0.0 3bw3:A, 3bw4:A
2 5lsm:A 339 347 0.4017 0.4100 0.4006 1.21e-62 5lsm:B, 5lsm:C, 5lsm:D, 5lsm:E, 5lsm:F, 5lsm:G, 5lsm:H
3 4q4k:A 351 346 0.4422 0.4359 0.4422 2.12e-57 4q4k:B, 4qis:A, 4qis:B, 4qit:A, 4qit:B, 4qiu:A, 4qiu:B
4 7l00:C 315 344 0.3150 0.3460 0.3169 2.60e-32 7l00:A, 7l00:B, 7l00:D
5 5gvh:A 311 350 0.3266 0.3633 0.3229 2.65e-31
6 4iql:A 313 272 0.2601 0.2875 0.3309 8.31e-25 4iql:B
7 6bka:A 374 312 0.2688 0.2487 0.2981 2.79e-24
8 2z6i:B 321 325 0.2775 0.2991 0.2954 4.11e-20 2z6i:A, 2z6j:A, 2z6j:B
9 6e2a:A 326 295 0.2457 0.2607 0.2881 1.58e-11 2gjl:A, 2gjn:A
10 7e1q:A 366 247 0.1908 0.1803 0.2672 1.57e-10 7e1r:A, 7e1r:C, 7e1s:C, 7e1s:A
11 4qj1:D 346 112 0.0896 0.0896 0.2768 2.88e-04 4ixh:A, 4ixh:D, 4ixh:B, 4ixh:C, 3khj:B, 3khj:C, 3khj:D, 3khj:H, 4qj1:A, 4qj1:B, 4qj1:C, 4rv8:A, 4rv8:D, 4rv8:B, 4rv8:C
12 5ahm:A 354 127 0.1185 0.1158 0.3228 2.90e-04 5ahm:B
13 5ahn:A 297 85 0.0809 0.0943 0.3294 0.002
14 1ep3:A 311 94 0.0896 0.0997 0.3298 0.004 1ep1:A, 1ep2:A, 5ksw:A, 5ksw:C, 5ue9:A, 5ue9:C
15 8p4q:E 390 73 0.0780 0.0692 0.3699 0.004 8p37:A, 8p4q:A, 8p4q:B, 8p4q:C, 8p4q:D, 8p4q:F, 8p4q:G, 8p4q:H
16 7pji:A 445 127 0.1069 0.0831 0.2913 0.004 4dqw:A, 4dqw:B, 6gk9:A, 6gk9:D, 7pji:B
17 1eep:A 314 59 0.0607 0.0669 0.3559 0.005
18 6mgr:C 369 59 0.0636 0.0596 0.3729 0.006 6mgr:A, 6mgr:B, 6mgr:D, 4mz1:A, 4mz1:B, 4mz1:C, 4mz8:A, 4mz8:B, 4mz8:C, 4mz8:D, 4r7j:A, 5uqf:A, 5uqf:B, 5uqf:C, 5uqg:A, 5uqg:B, 5uqg:H, 5uqg:C, 5uqg:G, 5uqg:D, 5uqg:E, 5uqg:F, 5uqh:A, 5uqh:B, 5uqh:C, 5uqh:D, 5uqh:E, 5uqh:F, 5uqh:G, 5uqh:H, 5urq:A, 5urq:D, 5urq:B, 5urq:C, 5urq:E, 5urq:H, 5urq:F, 5urq:G
19 2a1y:A 301 110 0.1012 0.1163 0.3182 0.007
20 4qq3:A 302 105 0.1040 0.1192 0.3429 0.007
21 4zqr:C 358 145 0.1243 0.1201 0.2966 0.010 6d4q:A, 6d4r:A, 6d4s:A, 6d4t:A, 6d4u:A, 6d4v:A, 6d4w:A, 5j5r:A, 5k4x:A, 5k4z:A, 6mjy:A, 5ou1:A, 5ou2:A, 5ou3:A, 5upu:A, 5upv:A, 4zqm:A, 4zqn:A, 4zqo:A, 4zqp:A, 4zqr:A, 4zqr:B, 4zqr:D
22 8qqp:A 464 151 0.1272 0.0948 0.2914 0.012 8q65:A, 8q65:E, 8qqp:B, 8qqp:C, 8qqp:D, 8qqp:E, 8qqp:F, 8qqp:G, 8qqp:H, 8qqq:A, 8qqq:B, 8qqq:C, 8qqq:D, 8qqq:E, 8qqq:F, 8qqq:G, 8qqq:H, 8qqr:A, 8qqr:B, 8qqr:C, 8qqr:D, 8qqr:E, 8qqr:F, 8qqr:G, 8qqr:H, 8qqt:A, 8qqt:B, 8qqt:C, 8qqt:D, 8qqt:E, 8qqt:F, 8qqt:G, 8qqt:H
23 4fxs:A 467 100 0.1012 0.0749 0.3500 0.012
24 4fo4:A 348 100 0.1012 0.1006 0.3500 0.013 4fo4:B, 4ix2:A, 4ix2:B, 4ix2:C, 4ix2:D, 4qne:A, 4qne:B, 4x3z:A, 4x3z:B
25 5dn1:A 240 48 0.0636 0.0917 0.4583 0.017
26 9c4m:A 335 130 0.1127 0.1164 0.3000 0.022 9c4m:B, 9c4m:C, 9c4m:D, 9c4m:E, 9c4m:F, 9c4m:G, 9c4m:H
27 3khj:A 302 112 0.0896 0.1026 0.2768 0.024 3khj:E, 3khj:F, 3khj:G
28 1b3o:A 304 48 0.0607 0.0691 0.4375 0.027
29 1zfj:A 476 40 0.0578 0.0420 0.5000 0.029
30 1b3o:B 410 48 0.0607 0.0512 0.4375 0.030
31 6jig:A 480 100 0.1069 0.0771 0.3700 0.041 6lk4:A
32 6uc2:A 453 44 0.0578 0.0442 0.4545 0.043 6i0m:B, 6i0o:A, 6uc2:B, 6uc2:C, 6uc2:D, 6uc2:E, 6uc2:F, 6uc2:G, 6uc2:H
33 8qqv:A 356 118 0.0925 0.0899 0.2712 0.043 8qqv:B, 8qqv:D, 8qqv:C, 8qqv:E, 8qqv:F, 8qqv:G, 8qqv:H, 8qqx:A, 8qqx:B, 8qqx:C, 8qqx:D, 8qqx:E, 8qqx:F, 8qqx:G, 8qqx:H
34 1nf7:A 454 44 0.0578 0.0441 0.4545 0.043 1jr1:A, 1nf7:B
35 8g8f:A 491 44 0.0578 0.0407 0.4545 0.046 8g8f:B, 8g8f:C, 8g8f:D, 8g8f:E, 8g8f:F, 8g8f:G, 8g8f:H, 8g9b:A, 8g9b:B, 8g9b:C, 8g9b:D, 8g9b:E, 8g9b:F, 8g9b:G, 8g9b:H, 6i0m:A, 6i0o:B, 6u8n:A, 6u8n:B, 6u8n:C, 6u8n:D, 6u8n:E, 6u8n:F, 6u8n:G, 6u8n:H, 6u8r:D, 6u8r:A, 6u8r:B, 6u8r:C, 6u8r:H, 6u8r:E, 6u8r:F, 6u8r:G, 6u9o:A, 6u9o:B, 6u9o:C, 6u9o:D, 6u9o:E, 6u9o:F, 6u9o:G, 6u9o:H, 6ua2:B, 6ua2:A, 6ua2:D, 6ua2:C, 6ua2:F, 6ua2:E, 6ua2:H, 6ua2:G, 6ua4:B, 6ua4:A, 6ua4:D, 6ua4:C, 6ua4:F, 6ua4:E, 6ua4:H, 6ua4:G, 6uaj:A, 6uaj:B, 6uaj:C, 6uaj:D, 6uaj:E, 6uaj:F, 6uaj:G, 6uaj:H, 6udo:A, 6udo:B, 6udo:C, 6udo:D, 6udo:E, 6udo:F, 6udo:G, 6udo:H, 6udq:A, 6udq:B, 6udq:C, 6udq:D, 6udq:E, 6udq:F, 6udq:G, 6udq:H
36 8fuz:A 390 44 0.0578 0.0513 0.4545 0.048 8foz:A, 8foz:B, 8foz:C, 8foz:D, 8foz:E, 8foz:F, 8foz:G, 8foz:H, 8fuz:B, 8fuz:C, 8fuz:D, 8fuz:E, 8fuz:F, 8fuz:G, 8fuz:H, 1jr1:B, 6u8e:A, 6u8e:B, 6u8e:C, 6u8e:D, 6u8e:E, 6u8e:F, 6u8e:G, 6u8e:H, 6u8s:A, 6u8s:B, 6u8s:C, 6u8s:D, 6u8s:E, 6u8s:F, 6u8s:G, 6u8s:H, 6ua5:A, 6ua5:B, 6ua5:C, 6ua5:D, 6ua5:E, 6ua5:F, 6ua5:G, 6ua5:H, 6udp:A, 6udp:B, 6udp:C, 6udp:D, 6udp:E, 6udp:F, 6udp:G, 6udp:H
37 1nfb:A 396 44 0.0578 0.0505 0.4545 0.053 1nfb:B
38 4jej:A 241 44 0.0462 0.0664 0.3636 0.054
39 3usb:B 401 95 0.0954 0.0823 0.3474 0.12
40 3tsb:A 490 60 0.0694 0.0490 0.4000 0.13 3tsd:A, 3usb:A
41 3tsb:B 434 60 0.0694 0.0553 0.4000 0.13
42 3tsd:B 426 96 0.0925 0.0751 0.3333 0.15
43 5upx:A 380 36 0.0491 0.0447 0.4722 0.15
44 4myx:G 356 60 0.0694 0.0674 0.4000 0.15 6mgu:A, 6mgu:B, 7mtu:A, 7mtu:C, 7mtu:B, 7mtu:D, 7mtu:E, 7mtu:G, 7mtu:F, 7mtu:H, 7mtx:A, 7mtx:C, 7mtx:B, 7mtx:D, 7mtx:E, 7mtx:G, 7mtx:F, 7mtx:H, 4my1:A, 4my1:C, 4my1:B, 4my1:D, 4my1:E, 4my1:F, 4my1:G, 4my1:H, 4my8:A, 4my8:B, 4my8:C, 4my8:D, 4my9:A, 4my9:C, 4my9:B, 4my9:D, 4my9:E, 4my9:F, 4my9:H, 4my9:G, 4mya:A, 4mya:B, 4myx:A, 4myx:C, 4myx:B, 4myx:D, 4myx:E, 4myx:F, 4myx:H, 4qm1:A, 4qm1:B, 4qm1:D, 4qm1:C, 5urs:A, 5urs:C, 5urs:B, 5urs:D, 5urs:E, 5urs:G, 5urs:F, 5urs:H, 5uuv:A, 5uuv:D, 5uuv:B, 5uuv:C, 5uuz:A, 5uuz:C, 5uuz:B, 5uuz:D, 5uuz:E, 5uuz:G, 5uuz:F, 5uuz:H
45 5upy:A 350 36 0.0491 0.0486 0.4722 0.16
46 3iiv:B 262 44 0.0434 0.0573 0.3409 0.17 7ac8:A, 7ac8:C, 7ac8:E, 6ct3:A, 5d2t:A, 5d2w:A, 6dc1:A, 6dc1:B, 6dc1:H, 6dc1:K, 6dkv:A, 6dnj:A, 1gpw:C, 1gpw:E, 6rtz:A, 6ru0:A, 6ru0:C, 6ru0:E, 2wjz:A, 2wjz:C
47 8ebc:C 355 97 0.0983 0.0958 0.3505 0.23 8ebc:A, 8ebc:B, 8ebc:D, 8ebc:F, 8ebc:E
48 2cu0:A 358 66 0.0694 0.0670 0.3636 0.23 2cu0:B
49 7oj1:A 401 51 0.0520 0.0449 0.3529 0.27
50 8c51:A 449 44 0.0491 0.0379 0.3864 0.27 8c51:B, 8c53:A, 8c53:B, 8cgy:A, 8cgy:B, 6rfu:A, 6rfu:B
51 6uy4:A 354 109 0.1069 0.1045 0.3394 0.34
52 1gvf:B 275 83 0.0809 0.1018 0.3373 0.35 1gvf:A
53 8u7m:A 451 47 0.0549 0.0421 0.4043 0.41 8u7m:B, 8u7m:C, 8u7m:D, 8u7m:E, 8u7m:F, 8u7m:G, 8u7m:H
54 6ei9:A 306 105 0.1012 0.1144 0.3333 0.43 6ei9:B
55 7rer:A 389 44 0.0491 0.0437 0.3864 0.46 7rer:D, 7rer:C, 7rer:B, 7rer:E, 7rer:H, 7rer:G, 7rer:F, 8u8y:A, 8u8y:B, 8u8y:C, 8u8y:D, 8u8y:E, 8u8y:F, 8u8y:G, 8u8y:H
56 7rfi:A 422 44 0.0491 0.0403 0.3864 0.49 7rfi:B, 7rfi:C, 7rfi:D, 7rfi:E, 7rfi:F, 7rfi:G, 7rfi:H, 7rgl:A, 7rgl:B, 7rgl:C, 7rgl:D, 7rgl:E, 7rgl:F, 7rgl:G, 7rgl:H
57 7rgd:A 519 44 0.0491 0.0328 0.3864 0.50 7res:A, 7res:B, 7res:C, 7res:D, 7res:E, 7res:F, 7res:G, 7res:H, 7rfe:A, 7rfe:B, 7rfe:C, 7rfe:D, 7rfe:E, 7rfe:F, 7rfe:G, 7rfe:H, 7rfg:A, 7rfg:B, 7rfg:C, 7rfg:D, 7rfg:E, 7rfg:F, 7rfg:G, 7rfg:H, 7rgd:B, 7rgd:C, 7rgd:D, 7rgd:E, 7rgd:F, 7rgd:G, 7rgd:H, 7rgm:A, 7rgm:B, 7rgm:C, 7rgm:D, 7rgm:E, 7rgm:F, 7rgm:G, 7rgm:H, 7rgq:A, 7rgq:B, 7rgq:C, 7rgq:D, 7rgq:E, 7rgq:F, 7rgq:G, 7rgq:H, 8u7q:A, 8u7q:B, 8u7q:C, 8u7q:D, 8u7q:E, 8u7q:F, 8u7q:G, 8u7q:H, 8u7v:A, 8u7v:B, 8u7v:C, 8u7v:D, 8u7v:E, 8u7v:F, 8u7v:G, 8u7v:H, 8u8o:A, 8u8o:B, 8u8o:C, 8u8o:D, 8u8o:E, 8u8o:F, 8u8o:G, 8u8o:H
58 7rfh:H 451 46 0.0491 0.0377 0.3696 0.57 7rfh:A, 7rfh:B, 7rfh:C, 7rfh:D, 7rfh:E, 7rfh:F, 7rfh:G
59 7qc8:A 250 65 0.0549 0.0760 0.2923 0.58 4ewn:D, 2wjz:E, 3zr4:E
60 7pmz:B 430 38 0.0434 0.0349 0.3947 0.63 7pmz:A, 7pmz:C, 7pmz:D, 7pmz:E, 7pmz:F, 7pmz:G, 7pmz:H, 7pmz:I, 7pmz:J, 7pmz:K, 7pmz:L, 7pmz:M, 7pmz:N, 7pmz:O, 7pmz:P
61 1jcn:A 395 42 0.0491 0.0430 0.4048 0.80 1jcn:B
62 6bfg:A 373 88 0.0867 0.0804 0.3409 1.1 2a7n:A, 2a7p:A, 2a85:A, 6bfg:B, 3giy:A, 1p4c:A, 1p5b:A
63 1h5y:B 253 57 0.0694 0.0949 0.4211 1.1 1h5y:A
64 1huv:A 349 88 0.0867 0.0860 0.3409 1.2
65 2j6x:H 348 49 0.0520 0.0517 0.3673 1.2 8ufy:B, 2zfa:B
66 7oj2:A 353 173 0.1387 0.1360 0.2775 1.3
67 2du2:A 374 49 0.0520 0.0481 0.3673 1.3 2du2:B, 2du2:C, 2du2:D, 2e77:A, 2e77:B, 2e77:C, 2e77:D, 5ebu:A, 5ebu:B, 5ebu:C, 5ebu:D, 5ebu:E, 5ebu:F, 5ebu:G, 5ebu:H, 7f1y:A, 7f1y:B, 7f20:A, 7f20:B, 7f21:A, 7f21:B, 7f22:A, 7f22:B, 2j6x:A, 2j6x:B, 2j6x:C, 2j6x:D, 2j6x:E, 2j6x:F, 2j6x:G, 2nli:A, 4rje:A, 4rje:B, 4rje:C, 4rje:D, 8ufy:A, 4yl2:A, 4yl2:B, 4yl2:C, 4yl2:D, 2zfa:A
68 7oj1:B 425 53 0.0549 0.0447 0.3585 1.3
69 2nli:B 326 49 0.0520 0.0552 0.3673 1.4
70 7rgi:A 357 38 0.0405 0.0392 0.3684 1.9 7rgi:B, 7rgi:C, 7rgi:D, 7rgi:E, 7rgi:H, 7rgi:F, 7rgi:G
71 7l01:B 385 55 0.0520 0.0468 0.3273 2.1 5boo:A, 5boo:B, 4cq8:A, 4cq8:B, 4cq9:A, 4cq9:B, 4cqa:A, 4cqa:B, 5del:A, 6e0b:A, 5fi8:A, 6gjg:A, 6gjg:B, 6i4b:A, 6i4b:B, 6i55:A, 6i55:B, 3i65:A, 3i68:A, 3i6r:A, 7kyk:A, 7kyk:B, 7kyk:C, 7kyk:D, 7kyv:A, 7kyy:A, 7kyy:B, 7kyy:C, 7kyy:D, 7kz4:A, 7kz4:B, 7kzy:A, 7kzy:B, 7l01:A, 7l0k:A, 7l0k:B, 3o8a:A, 4orm:A, 4rx0:A, 7s87:A, 7s87:B, 3sfk:A, 5tbo:A, 1tv5:A, 6vtn:A, 6vty:A, 6vty:B, 6vty:C, 6vty:D, 7wyf:A
72 6m73:A 364 40 0.0491 0.0467 0.4250 2.2 6m74:A
73 3qh2:B 196 49 0.0462 0.0816 0.3265 2.6 3qh2:A, 3qh2:C, 3qh2:D
74 1lrt:A 338 40 0.0462 0.0473 0.4000 3.5 1lrt:B, 1lrt:C
75 1me7:A 365 40 0.0462 0.0438 0.4000 3.8 1lrt:D, 1me8:A, 1me9:A, 1meh:A, 1mei:A, 1mew:A, 1pvn:A, 1pvn:B, 1pvn:C, 1pvn:D
76 6hm3:A 183 43 0.0376 0.0710 0.3023 4.0 4bu0:A, 4bu1:A, 4bu1:B, 6hm4:A
77 8e5h:A 368 49 0.0520 0.0489 0.3673 6.7
78 4tx9:A 246 47 0.0636 0.0894 0.4681 6.7
79 5unc:A 289 69 0.0665 0.0796 0.3333 7.1 5unc:B, 5unc:C, 5unc:D
80 7wge:A 698 49 0.0462 0.0229 0.3265 7.1
81 3w9z:A 290 83 0.0723 0.0862 0.3012 7.5
82 4n6f:A 242 107 0.0954 0.1364 0.3084 8.2 4n6f:B
83 2y88:A 244 43 0.0520 0.0738 0.4186 8.5 2y85:A, 2y85:B, 2y85:C, 2y85:D, 3zs4:A
84 4bf9:A 318 123 0.0983 0.1069 0.2764 8.9 4bfa:A, 4bfa:B, 4yco:A, 4yco:B, 4yco:C, 4ycp:A
85 6vox:A 407 96 0.0780 0.0663 0.2812 9.3
86 4cw5:B 438 71 0.0549 0.0434 0.2676 9.7 4cw5:A
87 6zzx:5 229 27 0.0289 0.0437 0.3704 10.0 7a4p:5, 6zzy:5

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218