BioLiP

>protein
SAINWNKISDDKDLEVWNRLTSNFWLPEKVPLSNDIPAWQTLTVVEQQLTMRVFTGLTLLDTLQNVIGAPSLMPDALTPH
EEAVLSNISFMEAVHARSYSSIFSTLCQTKDVDAAYAWSEENAPLQRKAQIIQQHYRGDDPLKKKIASVFLESFLFYSGF
WLPMYFSSRGKLTNTADLIRLIIRDEAVHGYYIGYKYQKNMEKISLGQREELKSFAFDLLLELYDNELQYTDELYAETPW
ADDVKAFLCYNANKALMNLGYEPLFPAEMAEVNPAILAALSP

The query sequence (length=282) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3n37:A	284	282	1.0000	0.9930	1.0000	0.0	3n38:A, 3n39:B, 3n39:A, 3n3a:B, 3n3a:A, 3n3b:B, 3n3b:A
2	2bq1:I	294	282	0.8652	0.8299	0.8652	0.0	2bq1:J, 1r2f:A, 1r2f:B, 2r2f:A, 2r2f:B
3	1uzr:B	288	282	0.7021	0.6875	0.7021	5.58e-153	1uzr:A, 1uzr:C
4	1oqu:C	302	280	0.6560	0.6126	0.6607	1.32e-140	3dhz:A, 3dhz:B, 1kgn:A, 1kgn:B, 1kgn:C, 1kgn:D, 1kgo:A, 1kgo:B, 1kgo:C, 1kgo:D, 1kgp:A, 1kgp:B, 1kgp:C, 1kgp:D, 3mjo:A, 3mjo:B, 1oqu:A, 1oqu:B, 1oqu:D
5	4n83:A	285	280	0.5248	0.5193	0.5286	2.03e-104	4n83:B, 4n83:C, 4n83:D, 4n83:E, 4n83:F, 4n83:G, 4n83:H
6	6gp2:A	318	280	0.5071	0.4497	0.5107	4.49e-104	8bt4:A, 8bt4:B, 6gp2:B, 6gp3:A, 6gp3:B
7	7mms:D	320	280	0.4929	0.4344	0.4964	1.03e-97	6ebo:A, 6ebo:B, 6ebo:C, 6ebo:D, 6ebp:A, 6ebp:B, 6ebp:C, 6ebp:D, 6ebz:A, 6ebz:B, 6ebz:C, 6ebz:D, 7mmp:A, 7mmp:C, 7mmp:B, 7mmq:A, 7mmq:C, 7mmq:B, 7mmr:A, 7mmr:B, 7mmr:C, 7mmr:D, 7mms:A, 7mms:B, 7mms:C, 7mmw:A, 7mmw:B
8	4dr0:B	291	287	0.4574	0.4433	0.4495	5.85e-81	4dr0:A
9	4bmq:A	300	287	0.4220	0.3967	0.4146	6.61e-73	4bmo:A, 4bmp:A, 4bmr:A, 4bmr:B, 4bmt:A, 4bmt:B, 4bmu:A, 4bmu:B, 6qo7:A, 6qo7:B, 6qo8:A, 6qo8:B, 6qo9:A, 6qo9:B, 6qob:A, 6qob:B, 6tqv:A, 6tqv:B, 6tqw:A, 6tqw:B, 6tqy:A, 6tqy:B, 6tqz:A, 6tqz:B, 7z3d:A, 7z3e:A
10	2rcc:C	311	281	0.2589	0.2347	0.2598	9.46e-22	2rcc:B
11	6zjk:A	317	273	0.2624	0.2334	0.2711	1.82e-18	6zjk:C, 6zjk:D, 6zjk:B
12	7aik:A	321	177	0.1844	0.1620	0.2938	2.36e-15	7ail:A, 7q39:AAA, 7q3c:AAA
13	6w4x:C	375	265	0.2340	0.1760	0.2491	8.02e-14	7ai8:A, 7ai9:A, 2alx:A, 1av8:A, 1av8:B, 2av8:A, 2av8:B, 7bet:A, 1biq:A, 1biq:B, 5ci0:A, 5ci1:A, 5ci2:A, 5ci3:A, 5ci4:A, 5cns:E, 5cns:F, 5cns:G, 5cns:H, 5cnt:E, 5cnt:F, 5cnt:G, 5cnt:H, 5cnu:E, 5cnu:F, 5cnu:G, 5cnu:H, 5cnv:E, 5cnv:F, 5cnv:G, 5cnv:H, 4erm:E, 4erm:F, 4erm:G, 4erm:H, 4erp:E, 4erp:F, 4erp:G, 4erp:H, 1jpr:A, 1jpr:B, 1jqc:A, 1jqc:B, 1mrr:A, 1mrr:B, 1mxr:A, 1mxr:B, 1pfr:A, 1pfr:B, 1pim:A, 1pim:B, 1piu:A, 1piu:B, 1piy:A, 1piy:B, 1piz:A, 1piz:B, 1pj0:A, 1pj0:B, 1pj1:A, 1pj1:B, 1pm2:A, 1pm2:B, 1r65:A, 1r65:B, 1rib:A, 1rib:B, 1rnr:A, 1rnr:B, 1rsr:A, 1rsr:B, 1rsv:A, 1rsv:B, 3uus:E, 3uus:F, 3uus:G, 3uus:H, 6w4x:D, 1xik:A, 1xik:B, 2xof:A, 2xof:B, 1yfd:A, 1yfd:B
14	7mdi:E	353	215	0.2021	0.1615	0.2651	1.37e-10	7mdi:G, 7mdi:F, 7mdi:H
15	4d8f:B	334	185	0.1418	0.1198	0.2162	2.05e-10	2ani:A, 4d8f:A, 4d8f:C, 4d8f:D, 4d8g:A, 4d8g:B, 4d8g:C, 4d8g:D, 4m1i:A, 4m1i:B, 4m1i:C, 4m1i:D, 1syy:A
16	6y2n:A	306	272	0.2092	0.1928	0.2169	4.25e-07
17	1h0n:A	288	257	0.1738	0.1701	0.1907	4.70e-04	1h0o:A, 2uw2:A, 3vpm:A, 3vpm:B, 3vpn:A, 3vpn:B, 3vpo:A, 3vpo:B, 1w68:A, 1w69:A, 1xsm:A
18	1jk0:A	334	182	0.1383	0.1168	0.2143	0.001
19	3hf1:B	286	261	0.1809	0.1783	0.1954	0.001	3hf1:A, 2vux:A
20	2vux:B	255	264	0.1986	0.2196	0.2121	0.005
21	2o1z:A	288	180	0.1312	0.1285	0.2056	0.017	2o1z:B, 2p1i:A, 2p1i:B, 2p1i:C, 2p1i:D, 2p1i:E, 2p1i:F, 2p1i:G, 2p1i:H
22	7qbp:A	291	282	0.2340	0.2268	0.2340	0.053
23	3rpc:A	262	58	0.0674	0.0725	0.3276	2.6	3rpc:B, 3rpc:C, 3rpc:D
24	8kg9:7	636	60	0.0709	0.0314	0.3333	3.3	7pmk:7, 7pmn:7, 6skl:7, 8xgc:7
25	7v3u:7	699	60	0.0709	0.0286	0.3333	3.4	5bk4:F, 5bk4:7, 6eyc:7, 3ja8:7, 7p30:7, 7p30:F, 7p5z:7, 7p5z:F, 7v3u:G, 7v3v:7, 7v3v:G, 7w8g:7, 7w8g:G

[Back]