BioLiP

>protein
RWRQTWSGPGTTKRFPETVLARCVKYTEIHPEMRHVDCQSVWDAFKGAFISKHPCDITEEDYQPLMKLGTQTVPCNKILL
WSRIKDLAHQFTQVQRDMFTLEDTLLGYLADDLTWCGEFDTSKINYQSCPDWRKDCSNNPVSVFWKTVSRRFAEAACDVV
HVMLDGSRSKIFDKDSTFGSVQVHNLQPEKVQTLEAWVIHGGREDSRDLCQDPTIKELESIISKRNIQFSCKNIYRPDKF
LQCVKNPEDSSC

The query sequence (length=252) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7vke:A	255	251	0.9881	0.9765	0.9920	0.0	8d0m:A, 3dzf:A, 3dzf:B, 3dzf:C, 3dzf:D, 3dzf:E, 3dzf:F, 3dzg:A, 3dzg:B, 3dzh:A, 3dzh:B, 3dzi:A, 3dzi:B, 3dzj:A, 3dzj:B, 3dzk:A, 3dzk:B, 6edr:A, 6edr:B, 4f45:A, 4f45:B, 4f46:A, 4f46:B, 3f6y:A, 2hct:A, 2hct:B, 2i65:A, 2i65:B, 2i66:A, 2i66:B, 2i67:A, 2i67:B, 3i9m:A, 3i9m:B, 3i9n:A, 3i9n:B, 2o3q:A, 2o3q:B, 2o3r:A, 2o3r:B, 2o3s:A, 2o3s:B, 2o3t:A, 2o3u:A, 2o3u:B, 3ofs:A, 3ofs:B, 3ofs:C, 3ofs:D, 3ofs:E, 3ofs:F, 4ogw:A, 8p8c:A, 2pgj:A, 2pgl:A, 3rok:A, 3rok:B, 3rom:A, 3rom:B, 3rop:A, 3rop:B, 3roq:A, 3roq:B, 4tmf:A, 4tmf:B, 3u4h:A, 3u4h:B, 3u4i:A, 6vua:A, 6vua:B, 4xjs:A, 4xjt:A
2	5bni:B	231	232	0.5040	0.5498	0.5474	1.08e-91
3	3kou:B	238	238	0.4484	0.4748	0.4748	3.11e-76	3ghh:B, 3kou:A, 3p5s:A, 3p5s:B
4	1isg:A	250	249	0.3532	0.3560	0.3574	7.55e-52	1isg:B, 1ish:A, 1ish:B, 1isi:A, 1isi:B, 1isj:A, 1isj:B, 1ism:A, 1ism:B
5	3zwm:H	253	248	0.3214	0.3202	0.3266	3.40e-40	3i9j:A, 3i9j:B, 3i9k:B, 3i9l:A, 3i9o:A, 3i9o:B, 1r15:A, 1r15:B, 1r15:C, 1r15:D, 1r15:E, 1r15:F, 1r15:G, 1r15:H, 1r16:A, 1r16:B, 3zwm:A, 3zwm:B, 3zwm:C, 3zwm:D, 3zwm:E, 3zwm:F, 3zwm:G, 3zwn:A, 3zwn:B, 3zwo:A, 3zwo:B, 3zwo:C, 3zwo:E, 3zwo:F, 3zwo:G, 3zwo:H, 3zwp:A, 3zwp:B, 3zwp:C, 3zwp:D, 3zwp:E, 3zwp:F, 3zwp:G, 3zwp:H, 3zwv:A, 3zwv:H, 3zwv:B, 3zwv:C, 3zwv:D, 3zwv:E, 3zwv:F, 3zwv:G, 3zww:A, 3zww:B, 3zww:C, 3zww:D, 3zww:E, 3zww:F, 3zww:G, 3zww:H, 3zwx:A, 3zwx:B, 3zwx:C, 3zwx:D, 3zwx:E, 3zwx:F, 3zwx:G, 3zwx:H, 3zwy:A, 3zwy:B, 3zwy:C, 3zwy:D, 3zwy:E, 3zwy:F, 3zwy:G, 3zwy:H
6	5cxm:A	99	95	0.0913	0.2323	0.2421	0.25	5cxm:B, 5cxm:C, 5cxm:D
7	7yp3:F	419	70	0.0873	0.0525	0.3143	0.37	7yp3:B, 7yp3:C, 7yp3:D, 7yp3:E, 7yp5:A, 7yp5:B, 7yp6:A, 7yp6:B
8	6imv:A	494	78	0.0952	0.0486	0.3077	0.64	6imv:B, 6imw:A, 6imw:B
9	7wca:B	679	84	0.0952	0.0353	0.2857	2.1	4aue:A, 4aue:B, 4aue:C, 4aue:D, 4aul:A, 4aul:B, 4aul:C, 4aul:D, 4aum:A, 4aum:B, 4aum:C, 4aum:D, 4aun:A, 4aun:B, 4aun:C, 4aun:D, 4aun:E, 4aun:F, 4aun:G, 4aun:H, 4b2y:A, 4b2y:B, 4b2y:C, 4b2y:D, 4b31:A, 4b31:B, 4b31:C, 4b31:D, 4b40:A, 4b40:B, 4b40:C, 4b40:D, 4b5k:A, 4b5k:B, 4b5k:C, 4b5k:D, 4b7a:A, 4b7a:B, 4b7a:C, 4b7a:D, 7vn0:A, 7vn0:B, 7vn0:C, 7vn0:D, 7wca:A, 7wca:C, 7wca:D, 5xvz:A, 5xvz:B, 5xvz:C, 5xvz:D, 5xy4:A, 5xy4:B, 5xy4:C, 5xy4:D, 5xzm:A, 5xzm:B, 5xzm:C, 5xzm:D, 5xzn:A, 5xzn:B, 5xzn:C, 5xzn:D, 5y17:A, 5y17:B, 5y17:C, 5y17:D, 5yem:A, 5yem:B, 5yem:C, 5yem:D, 5zz1:A, 5zz1:B, 5zz1:D, 5zz1:C
10	4wcx:A	454	177	0.1389	0.0771	0.1977	2.4	4wcx:C
11	5tip:A	436	32	0.0437	0.0252	0.3438	6.1	5tip:B, 5tip:C, 5tip:D, 5tiq:A, 5tiq:B
12	4c7y:A	907	58	0.0675	0.0187	0.2931	6.8	4c7z:A, 4c80:A, 3fah:A, 3fc4:A, 3l4p:A, 1sij:A, 4us8:A, 4us9:A, 4usa:A, 1vlb:A
13	7pgr:N	2423	109	0.0913	0.0095	0.2110	7.4	2d4q:A, 2d4q:B, 2e2x:B, 3p7z:B, 3pg7:B, 7pgq:F, 7pgr:F, 7pgs:F, 7pgt:F, 7pgu:F, 7pgu:N
14	3b9t:A	419	133	0.1111	0.0668	0.2105	9.9	3b9t:B, 3b9t:C, 3b9t:D

[Back]