BioLiP

>protein
RVVGVVVPLIHTNFADEIIKGLYETTISSGYELLITYLDEDEDHQYQVFQTLLSRQVGAVFMLSLDIPSWMIDKLLEEQI
SVISLTALLSEQISAVTSNEFEMMNSIVDYLIDMGHKNIALVGDTKLTTNISSTRRTNFIKSMTDHNLAYENIFLYGNDH
SYETGYTSVTTGYDINQLPFTAAIATADMVGQGLINAMSDHGKTVPEDLSIVTIDGLQQTEIARPKLTTVKQDFPEIGRI
AMQLFLDSDEPQIIYIPTELIQRDSVLNLN

The query sequence (length=270) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4rk6:A	270	270	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	4rk6:B, 4rk7:A, 4rk7:B
2	1rzr:G	332	245	0.2481	0.2018	0.2735	6.24e-27	2jcg:A, 2nzu:G, 2nzv:G, 1rzr:C, 1rzr:A, 1rzr:D, 1sxg:B, 1zvv:A, 1zvv:B, 1zvv:G
3	3oqo:A	333	270	0.2519	0.2042	0.2519	1.22e-24	3oqm:A, 3oqm:C, 3oqn:A, 3oqn:C, 3oqo:C
4	3k4h:A	282	280	0.2815	0.2695	0.2714	2.29e-22	3k4h:B
5	1jft:A	340	274	0.2407	0.1912	0.2372	2.07e-19	1bdh:A, 1bdi:A, 1jfs:A, 1jh9:A, 1pnr:A, 2pua:A, 2pub:A, 2puc:A, 2pud:A, 2pue:A, 2puf:A, 2pug:A, 1qp0:A, 1qp4:A, 1qp7:A, 1qpz:A, 1qqa:A, 1qqb:A, 1vpw:A, 1wet:A, 1zay:A
6	2o20:B	275	245	0.2259	0.2218	0.2490	2.93e-17	2o20:A, 2o20:F, 2o20:G
7	4rk0:D	269	277	0.2556	0.2565	0.2491	9.07e-16	4rk0:A, 4rk0:B, 4rk0:C
8	4rk1:D	269	249	0.2296	0.2305	0.2490	2.54e-15	4rk1:A, 4rk1:B, 4rk1:C, 4rk1:E, 4rk1:F
9	4rk5:A	275	240	0.2074	0.2036	0.2333	3.14e-11	4rk4:A
10	5ysz:A	327	267	0.2259	0.1865	0.2285	7.37e-10
11	1lbg:A	357	167	0.1593	0.1204	0.2575	6.47e-09	2bjc:A, 2bjc:B, 1cjg:A, 1cjg:B, 1efa:A, 1efa:B, 1efa:C, 1jwl:B, 1jwl:A, 1jwl:C, 2kei:A, 2kei:B, 2kej:A, 2kej:B, 2kek:A, 2kek:B, 1l1m:A, 1l1m:B, 1lbg:D, 1lbh:A, 1lbh:B, 1lbh:C, 1lbh:D, 1lcc:A, 1lcd:A, 1osl:A, 1osl:B, 2p9h:A, 2p9h:B, 2paf:A, 2paf:B, 2pe5:A, 2pe5:B, 2pe5:C, 4rzt:A, 4rzt:B, 4rzt:C, 4rzt:D, 1tlf:A, 1tlf:B, 1tlf:C, 1tlf:D
12	4rkr:A	274	63	0.0815	0.0803	0.3492	1.46e-08	4rkr:B, 4rkr:C, 4rkr:D
13	7x7h:A	267	202	0.1963	0.1985	0.2624	1.65e-07	7x7h:C
14	8jff:A	274	255	0.2000	0.1971	0.2118	5.29e-07	8jff:B, 8jfv:A, 8jfv:B
15	3tb6:A	283	286	0.2444	0.2332	0.2308	6.10e-07	3tb6:B
16	3o75:A	270	147	0.1296	0.1296	0.2381	2.94e-06	3o75:B
17	3ctp:A	266	250	0.1630	0.1654	0.1760	1.66e-05	3ctp:B
18	3gyb:A	261	181	0.1815	0.1877	0.2707	1.51e-04	3gyb:B
19	4xxh:A	255	192	0.1519	0.1608	0.2135	0.81	4xxh:B
20	4iqy:A	221	80	0.0815	0.0995	0.2750	1.3	4iqy:B
21	2civ:A	299	48	0.0556	0.0502	0.3125	2.1	2ciw:A, 2cix:A, 2ciy:A, 2ciz:A, 2cj0:A, 2cj1:A, 2cj2:A, 1cpo:A, 2cpo:A, 2j18:A, 2j19:A, 2j5m:A, 7rst:A
22	6bdo:D	395	45	0.0630	0.0430	0.3778	3.2	6bdo:B, 6bdo:A, 6bdo:C, 5kmp:A, 5kmp:B, 5kmq:A, 5kmq:B, 5kmq:C, 5kmq:D, 5kmr:B, 5kmr:A, 5kmr:C, 5kmr:D, 5kms:A, 5kms:B, 5kms:C, 5kms:D, 4nwz:A, 4nwz:B, 4nwz:C, 4nwz:D, 5wed:B, 5wed:A, 5wed:C, 5wed:D
23	2z06:A	252	46	0.0667	0.0714	0.3913	8.2	2z06:B, 2z06:C, 2z06:D

[Back]