Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RVKKLINSQISLLIGKGLHEFDSLRDPEVNDFRTKMRQFCEEAAAHRQQLGWVEWLQYSFPLQLEPNRALLVNVKFEGSE
ESFTFQVSTKDMPLALMACALRKKATVFRQQPEEYALQVNGRHEYLYGNYPLCHFQYICSCLHSGLTPHLTMVHSSSILA
MRDEQSNSLEQPFSIELIRKVNADERMKLVVQAGLFHGNEMLCKTVSSSECSEPDISVCDLPRMARLCFALYAVDCPIAW
ANLMLFDYKDQLKTGERCLYMWPSLLNPAGTVRGNPNTESAAALVIYLPEVAPVYFPALEKILELLYEHEKDLVWKMRHE
VQEHFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLYLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDCYVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQ
VLKYESYLDCELTKFLLGRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGSTHHMKVLMKQGEALSKLKALND
FVKVSSQKTTKPQTKEMMHMCMRQETYMEALSHLQSPLDPSTLLEEVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSSEEAGSAGNVGII
FKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLPTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSTAAFNKDALLNWLKS
KNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNVPFILTYDFVHVIQQGKTNNSEK
FERFRGYCERAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRES

The query sequence (length=794) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5o83:A 794 800 0.9887 0.9887 0.9812 0.0 4ajw:B, 6dgt:A, 5is5:A, 7r2b:A, 4v0i:B
2 2wxl:A 823 825 0.9950 0.9599 0.9576 0.0 6gy0:A, 5i4u:A, 5i6u:A, 6mul:A, 6mul:B, 6mum:B, 5ngb:A, 7r26:A, 5t27:A, 5t28:A, 5t2b:A, 5t2d:A, 5t2g:A, 5t2i:A, 5t2m:A, 5t7f:A, 5t7f:B, 5t8i:A, 2wxf:A, 2wxh:A, 2wxi:A, 2wxj:A, 2wxm:A, 2wxn:A, 2wxo:A, 2wxp:A, 2wxq:A, 2x38:A, 4xe0:A
3 4ajw:A 765 795 0.9597 0.9961 0.9585 0.0 4v0i:A
4 7lq1:A 950 855 0.9433 0.7884 0.8760 0.0 5ae8:A, 5ae9:A, 6eyz:A, 6ez6:A, 6g6w:A, 6hi1:A, 6hi2:A, 6hi9:A, 5l72:A, 7lm2:A, 6oco:A, 7pop:A, 7por:A, 7pos:A, 7pot:A, 6pyr:A, 6q6y:A, 6q73:A, 6q74:A, 6tnr:A, 6tns:A, 5vlr:A, 6zaa:A, 6zac:A, 6zad:A
5 6pyu:A 930 843 0.9345 0.7978 0.8802 0.0 8bcy:A, 5dxu:A, 6ftn:A, 7jis:A, 5m6u:A, 6mum:A, 5ncy:A, 5ncz:A, 6ocu:A, 7oi4:AAA, 7oij:AAA, 7oil:AAA, 7ois:AAA, 8s3r:A, 5t2l:A, 5t8f:A, 5ubt:A, 2wxg:A, 2wxk:A
6 2y3a:A 976 869 0.6121 0.4980 0.5593 0.0
7 4bfr:A 855 851 0.6045 0.5614 0.5640 0.0 4bfr:B
8 5dxh:D 981 875 0.4395 0.3558 0.3989 0.0 8gua:A, 6oac:A
9 4ykn:A 1205 898 0.4471 0.2946 0.3953 0.0 4a55:A, 8am0:A, 8exl:A, 8exo:A, 8exu:A, 8exv:A, 5fi4:A, 8gub:A, 6gvf:A, 6gvg:A, 6gvi:A, 3hhm:A, 7jiu:A, 4jps:A, 4l23:A, 4l2y:A, 7mlk:A, 7myo:A, 4ovv:A, 8ow2:A, 7pg6:A, 6pys:A, 5sx9:A, 5sxj:A, 8tdu:A, 8tdu:C, 8tgd:A, 8tgd:C, 8ts9:A, 8tsa:A, 8tsb:A, 8tsc:A, 8tsd:A, 4tv3:A, 5uk8:A, 5ukj:A, 5ul1:A, 8v8h:A, 8v8h:C, 8v8i:A, 8v8i:C, 8v8j:A, 8v8j:C, 8v8v:A, 8v8v:C, 8w9a:A, 8w9b:A, 4waf:A, 5xgh:A, 5xgi:A, 3zim:A, 4zop:A
10 5itd:A 995 888 0.4433 0.3538 0.3964 0.0 5dxh:A, 8ilr:A, 8ils:A, 8ilv:A, 7k6m:A, 7k6o:A, 7r9v:A, 7r9y:A, 8sbc:A, 8sbj:A, 8twy:A, 7tz7:A, 5xgj:A
11 5ubr:A 887 893 0.4395 0.3935 0.3908 0.0 5dxt:A, 7k6n:A
12 5swp:A 1060 923 0.4458 0.3340 0.3835 0.0 6gvh:A, 5swt:A, 8v8u:A, 8v8u:C
13 7k71:A 843 859 0.4345 0.4093 0.4016 0.0 8gud:A
14 3zw3:A 831 743 0.3501 0.3345 0.3742 5.80e-149 2a4z:A, 4fhj:A, 4fhk:A, 6fh5:A, 6gq7:A, 4hvb:A, 5jha:A, 5jhb:A, 7jwe:A, 4kzc:A, 3lj3:A, 3mjw:A, 3nzu:A, 3p2b:A, 3qk0:A, 3sd5:A, 5t23:A, 6t3b:A, 6t3c:A, 4wwo:A, 4wwp:A, 6xrm:A, 6xrn:A, 3zvv:A
15 7jx0:A 801 738 0.3514 0.3483 0.3780 1.05e-140 3qjz:A
16 1e7u:A 872 848 0.3703 0.3372 0.3467 1.55e-137 4anv:A, 3ibe:A
17 1e8w:A 851 830 0.3640 0.3396 0.3482 1.63e-137 2a5u:A, 4anu:A, 4anw:A, 4anx:A, 4aof:A, 3apc:A, 3apd:A, 3apf:A, 6aud:A, 6c1s:A, 2chw:A, 2chx:A, 2chz:A, 3csf:A, 3cst:A, 3dbs:A, 4dk5:A, 3dpd:A, 1e7v:A, 1e8x:A, 1e8z:A, 1e90:A, 5eds:A, 3ene:A, 4ezj:A, 4ezk:A, 4ezl:A, 4f1s:A, 4fa6:A, 4fad:A, 4fjy:A, 4fjz:A, 4flh:A, 4ful:A, 4g11:A, 5g2n:A, 5g55:A, 4gb9:A, 4hle:A, 4j6i:A, 7jwz:A, 5kae:A, 7kke:A, 4kz0:A, 3l08:A, 3l13:A, 3l16:A, 3l17:A, 3l54:A, 3ml8:A, 3ml9:A, 3nzs:A, 3oaw:A, 5oq4:A, 3pre:A, 3prz:A, 3ps6:A, 4ps3:A, 4ps7:A, 4ps8:A, 3qaq:A, 3qar:A, 3r7q:A, 3r7r:A, 3s2a:A, 8sc8:A, 3t8m:A, 3tjp:A, 3tl5:A, 4urk:A, 2v4l:A, 4wwn:A, 6xrl:A, 4xx5:A, 4xz4:A, 7z61:A
18 8sob:A 1005 881 0.3753 0.2965 0.3383 3.70e-133 8soa:A, 8soc:A
19 8sod:A 941 865 0.3627 0.3061 0.3329 4.19e-119 8soe:A
20 7bi6:A 829 790 0.3161 0.3028 0.3177 3.70e-102 8a9i:A, 7bi9:A, 7z74:A, 7z75:A
21 7bi2:A 1021 592 0.2708 0.2106 0.3632 3.14e-97
22 6ykg:AAA 559 527 0.1965 0.2791 0.2960 1.38e-68 5anl:A, 5enn:A, 5enn:B, 6i3u:A, 3ls8:A, 3ls8:B, 4oys:A, 4ph4:B, 7rsj:A, 7rsp:A, 7rsp:B, 7rsv:A, 7rsv:B, 8rxr:A, 8rxr:B, 4uwf:A, 4uwg:A, 4uwh:A, 4uwk:A, 4uwl:A
23 2x6k:A 550 521 0.2053 0.2964 0.3129 6.61e-61 2x6f:A, 2x6f:B, 2x6i:A, 2x6i:B, 2x6j:A, 2x6j:B, 2x6k:B
24 6bq1:E 1510 553 0.1650 0.0868 0.2369 1.21e-27 6bq1:A
25 4d0l:E 479 232 0.0894 0.1482 0.3060 1.43e-23 5c4g:E, 4d0l:A, 4d0l:C, 4d0m:A, 4d0m:C, 4d0m:G, 4d0m:I, 4d0m:M, 4d0m:O, 4d0m:Q, 4d0m:S, 4d0m:W, 4d0m:Y, 4d0m:c, 4d0m:g, 5euq:E, 5fbl:A, 5fbq:A, 5fbr:A, 5fbv:A, 5fbw:A, 6gl3:A, 8q6f:A, 8q6g:A, 8q6h:A, 8vof:A, 4wae:A, 4wag:A
26 7nfc:A 3562 244 0.0819 0.0182 0.2664 9.88e-13 8bh3:S, 8bh3:A, 8bhv:A, 8bhv:F, 8bhy:A, 8bhy:S, 8bot:F, 8bot:S, 7nfc:F
27 7nfe:A 3585 242 0.0806 0.0179 0.2645 3.38e-12
28 6s8f:F 2571 221 0.0781 0.0241 0.2805 5.44e-12 7mq8:NR, 7mq9:NR, 7mqa:NR, 6s8f:H
29 7z87:A 3689 251 0.0819 0.0176 0.2590 5.98e-12
30 7k17:B 3645 251 0.0819 0.0178 0.2590 6.03e-12 7k17:A
31 8eza:L 3720 251 0.0819 0.0175 0.2590 6.14e-12 8eza:C, 7lt3:C, 7lt3:L
32 7k1k:A 3604 251 0.0819 0.0180 0.2590 6.18e-12 7k1b:A
33 7k0y:A 3669 251 0.0819 0.0177 0.2590 6.46e-12
34 7su3:A 3802 251 0.0819 0.0171 0.2590 6.47e-12
35 7sud:A 3740 251 0.0819 0.0174 0.2590 6.86e-12
36 5y3r:C 3636 251 0.0819 0.0179 0.2590 6.96e-12
37 7k1j:A 3584 251 0.0819 0.0181 0.2590 7.01e-12 7k19:A
38 8ezb:C 3724 251 0.0819 0.0175 0.2590 7.04e-12 8ezb:L
39 6zhe:A 3768 251 0.0819 0.0173 0.2590 7.10e-12
40 7sgl:A 3852 251 0.0819 0.0169 0.2590 7.18e-12
41 7k1n:A 3634 251 0.0819 0.0179 0.2590 7.20e-12 7z88:A
42 6zhe:F 3731 251 0.0819 0.0174 0.2590 7.22e-12
43 6zha:A 3707 251 0.0819 0.0175 0.2590 7.46e-12 6zh8:A
44 8ez9:L 3662 251 0.0819 0.0177 0.2590 7.84e-12 8ez9:C
45 7otm:A 3656 251 0.0819 0.0178 0.2590 8.68e-12 7otp:A, 7otv:A, 7otw:A, 7oty:A
46 6zwm:B 2185 241 0.0819 0.0297 0.2697 1.54e-11 6zwm:A
47 8rch:A 2036 241 0.0819 0.0319 0.2697 1.60e-11 8rch:B, 8rck:B, 8rcn:B
48 6bcu:A 2204 241 0.0819 0.0295 0.2697 1.79e-11 6bcu:B, 6bcx:A, 6bcx:B, 4drh:B, 4drh:E, 4dri:B, 4drj:B, 8er6:B, 8er6:D, 8er6:F, 8er7:B, 8er7:D, 8er7:F, 8era:A, 9f44:A, 9f44:B, 9f45:A, 9f45:B, 1fap:B, 2fap:B, 3fap:B, 4fap:B, 5flc:B, 5flc:F, 5gpg:B, 4jsp:B, 4jsp:A, 4jsv:B, 4jsv:A, 4jsx:B, 4jsx:A, 4jt5:B, 4jt5:A, 4jt6:B, 4jt6:A, 6m4u:B, 6m4u:F, 6m4w:G, 6m4w:H, 6m4w:I, 1nsg:B, 7pe7:B, 7pe7:A, 7pe8:A, 7pe9:A, 7pea:B, 7pea:A, 7peb:A, 7pec:A, 8ppz:B, 7uxc:A, 7uxh:A, 7uxh:C, 5wbh:C, 5wbh:D, 5wbu:B, 5wbu:A, 6zwo:B
49 3jbz:A 960 241 0.0819 0.0677 0.2697 1.87e-11
50 8bot:A 3528 242 0.0793 0.0179 0.2603 4.17e-10
51 7ni5:A 2791 230 0.0718 0.0204 0.2478 1.12e-07 7ni4:A, 7ni4:B, 7ni5:B, 7ni6:A, 7ni6:B, 8oxq:A, 8oxq:B
52 7sic:A 2773 230 0.0718 0.0206 0.2478 1.14e-07 8oxo:A, 8oxo:B, 8oxp:A, 8oxp:B, 7sic:B, 7sid:A, 7sid:C
53 8oxm:A 2748 230 0.0718 0.0207 0.2478 1.26e-07 8oxm:B
54 6sl1:A 2652 338 0.1071 0.0321 0.2515 2.48e-06 6sky:A, 6sky:B
55 6skz:A 2638 348 0.1083 0.0326 0.2471 2.52e-06 6sl0:A, 6sl0:B
56 7pw9:A 1952 111 0.0403 0.0164 0.2883 2.32e-04 7pw4:A, 7pw5:A, 7pw6:A, 7pw7:A, 7pw8:A, 6z3r:A
57 6syt:A 1896 111 0.0390 0.0164 0.2793 0.002
58 6z2w:E 2325 176 0.0529 0.0181 0.2386 0.004 6z2w:F, 6z2x:E, 6z2x:F, 6z3a:F, 6z3a:E
59 7r5y:E 414 241 0.0680 0.1304 0.2241 1.4 7r5y:A, 7r5y:B, 7r5y:C, 7r5y:D, 7r5y:F
60 7jl5:B 90 53 0.0202 0.1778 0.3019 3.8 7jl5:A
61 8ogi:B 465 66 0.0239 0.0409 0.2879 6.3
62 3tbo:A 54 19 0.0113 0.1667 0.4737 7.6
63 4mij:A 302 166 0.0504 0.1325 0.2410 9.4 4mhf:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218