BioLiP Library

>protein
RVARLEKKVSALEKKVACLEKEVARLKKLVGE

The query sequence (length=32) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3w8v:A	32	32	0.9688	0.9688	0.9688	1.14e-12	3w8v:B, 3w92:A, 3w92:B, 3w92:C, 3w93:A, 3w93:B, 3w93:C
2	1ysa:C	57	32	0.6250	0.3509	0.6250	3.36e-04	1dgc:A, 2dgc:A, 1ysa:D
3	1llm:C	87	28	0.5938	0.2184	0.6786	0.002	1llm:D
4	4etp:B	287	27	0.4375	0.0488	0.5185	0.003
5	4etp:B	287	20	0.3125	0.0348	0.5000	4.2
6	5apw:B	64	27	0.5625	0.2812	0.6667	0.006
7	5apw:B	64	31	0.5312	0.2656	0.5484	0.010
8	1fav:A	78	28	0.3750	0.1538	0.4286	0.011	6j5e:G, 6tvq:AaA, 6tvu:AaA, 6tvw:CCC, 3vgx:C, 3vu5:A, 3vu6:A, 3w19:C, 5yb4:E, 5yb4:F, 5yb4:D
9	3i5c:B	198	30	0.5625	0.0909	0.6000	0.020	3i5c:A, 1ij0:A, 1ij0:B, 1ij0:C, 1ij1:A, 1ij1:B, 1ij1:C, 3k7z:A, 3k7z:B, 1rb4:A, 1rb4:B, 1swi:C, 6xne:C
10	3crp:B	34	32	0.5312	0.5000	0.5312	0.074	2b1f:A, 2b1f:C, 3crp:C
11	4u5t:A	37	31	0.5000	0.4324	0.5161	0.082
12	4u5t:A	37	27	0.4062	0.3514	0.4815	4.4
13	1czq:A	45	30	0.3750	0.2667	0.4000	0.19	1gzl:A, 1gzl:B, 3l35:A, 3l35:C, 3l35:B, 3l36:A, 3l37:A, 3mgn:D, 3mgn:F, 3mgn:A, 3mgn:C, 3mgn:E, 3mgn:B, 6psa:A, 2q3i:A, 2r3c:A, 2r3c:B, 2r5b:A, 2r5b:C, 2r5b:B, 2r5d:A, 2r5d:C, 2r5d:B
14	1uo4:B	31	29	0.3750	0.3871	0.4138	0.57	1uo5:A
15	5uxt:A	33	25	0.5000	0.4848	0.6400	0.86	5uxt:C
16	5uxt:A	33	22	0.4062	0.3939	0.5909	4.9	5uxt:C
17	1mwq:A	100	23	0.3438	0.1100	0.4783	0.91
18	4g1e:A	964	26	0.4062	0.0135	0.5000	2.3	5ffg:A, 5ffo:A, 5ffo:E, 4g1m:A, 3ije:A, 1jv2:A, 1l5g:A, 1m1x:A, 6mk0:A, 4mmx:A, 4mmy:A, 4mmz:A, 6msl:A, 6msu:A, 6naj:A, 5nem:A, 5ner:A, 5net:A, 4o02:A, 6om1:A, 6om1:C, 6om1:E, 6om1:G, 6om2:A, 6om2:C, 8tcf:A, 8tcg:A, 1u8c:A, 6uja:A, 6ujb:A, 6ujc:A, 4um8:C, 4um8:A, 4um9:A, 4um9:C, 8vs6:A, 8vsd:A, 7y1t:A
19	8rve:i	246	28	0.4375	0.0569	0.5000	3.5	8rve:j
20	6egl:A	36	26	0.4062	0.3611	0.5000	3.6	6egm:A, 6egn:C, 6egn:B, 6ego:A, 6egp:A, 5kb0:A, 5kb1:A, 5kb2:A, 6mcd:A, 7n2y:A, 7n2z:A
21	6egl:A	36	24	0.4062	0.3611	0.5417	4.5	6egm:A, 6egn:C, 6egn:B, 6ego:A, 6egp:A, 5kb0:A, 5kb1:A, 5kb2:A, 6mcd:A, 7n2y:A, 7n2z:A
22	2bni:C	34	32	0.3750	0.3529	0.3750	3.8	2bni:D, 1u9h:A
23	3ju8:A	486	28	0.2812	0.0185	0.3214	4.6	3ju8:B
24	1g6u:A	48	26	0.3750	0.2500	0.4615	7.3	1g6u:B
25	8hw0:A	329	31	0.3125	0.0304	0.3226	7.5

[Back]