BioLiP

>protein
RTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDGYSLEECLEFIAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMA
DTIEEGTMPKEMSDIIQRLWKDSGIQACFDRASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRVKTTGIIETQFSF
KDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKK
DLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAGNYIKVQFLELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLK

The query sequence (length=318) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3v00:C	353	318	0.9906	0.8924	0.9906	0.0	1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
2	1agr:A	350	318	0.7799	0.7086	0.7799	0.0	1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
3	3ffb:A	327	318	0.7044	0.6850	0.7044	3.76e-168	1bof:A, 1gdd:A, 4pan:A
4	3c7k:C	311	312	0.6667	0.6817	0.6795	1.25e-154	3c7k:A
5	1shz:D	327	325	0.6447	0.6269	0.6308	2.45e-147	1shz:A
6	7rkf:A	350	319	0.5283	0.4800	0.5266	7.08e-111
7	8pjk:A	222	168	0.4560	0.6532	0.8631	6.08e-109	7e2x:A, 7e2z:A
8	8pjk:A	222	34	0.0660	0.0946	0.6176	6.75e-05	7e2x:A, 7e2z:A
9	8iys:A	355	323	0.5189	0.4648	0.5108	1.22e-104	3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
10	1zca:A	318	322	0.4308	0.4308	0.4255	9.59e-86	1zca:B
11	8htg:B	334	330	0.4560	0.4341	0.4394	1.01e-85	8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
12	3ab3:A	322	326	0.4308	0.4255	0.4202	3.86e-84	3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
13	6eg8:I	372	337	0.4434	0.3790	0.4184	4.03e-83	6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
14	8fn0:B	212	228	0.4057	0.6085	0.5658	1.24e-80
15	8fn0:B	212	25	0.0660	0.0991	0.8400	1.45e-04
16	2xtz:A	343	332	0.4214	0.3907	0.4036	1.95e-75
17	8uo1:A	334	334	0.4308	0.4102	0.4102	3.57e-71	8gga:A
18	2xtz:B	291	325	0.4119	0.4502	0.4031	2.16e-69
19	8ggb:A	310	333	0.4088	0.4194	0.3904	1.39e-67	8gg9:A, 8ggc:A
20	4fid:A	318	320	0.3648	0.3648	0.3625	1.15e-65	4fid:B
21	2xtz:C	270	325	0.4025	0.4741	0.3938	1.49e-62
22	8uo4:A	292	332	0.3648	0.3973	0.3494	2.97e-51	8uo2:A
23	8xql:A	240	185	0.2862	0.3792	0.4919	1.96e-47
24	8xql:A	240	25	0.0597	0.0792	0.7600	2.59e-04
25	8unx:A	244	184	0.2579	0.3361	0.4457	2.43e-45	7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
26	8unx:A	244	23	0.0629	0.0820	0.8696	8.62e-05	7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
27	3lvq:E	420	95	0.0912	0.0690	0.3053	3.04e-08	2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
28	8d4c:C	180	95	0.0912	0.1611	0.3053	5.05e-07	8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
29	6bbp:A	520	95	0.0881	0.0538	0.2947	5.59e-07	2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
30	3lrp:A	181	95	0.0912	0.1602	0.3053	5.68e-07
31	6a8d:A	181	110	0.0943	0.1657	0.2727	1.01e-06
32	7rll:B	177	95	0.0912	0.1638	0.3053	1.53e-06	7rll:A
33	2k5u:A	181	97	0.0912	0.1602	0.2990	7.09e-06	2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
34	1z6x:A	175	97	0.0849	0.1543	0.2784	1.43e-05	1z6x:B
35	2h57:B	167	143	0.1132	0.2156	0.2517	5.50e-05	2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
36	8e0c:A	185	112	0.0818	0.1405	0.2321	1.31e-04	8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
37	3aq4:A	170	95	0.0818	0.1529	0.2737	2.30e-04	3aq4:B
38	5de3:A	166	98	0.0881	0.1687	0.2857	3.56e-04	5di3:A
39	3o47:A	289	95	0.0849	0.0934	0.2842	4.86e-04	4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
40	5uf8:D	160	97	0.0818	0.1625	0.2680	5.73e-04
41	1upt:G	170	95	0.0786	0.1471	0.2632	6.86e-04	4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
42	5di3:B	204	101	0.0849	0.1324	0.2673	7.43e-04	4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
43	4y0v:A	165	97	0.0818	0.1576	0.2680	0.001	4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
44	6pta:A	165	97	0.0786	0.1515	0.2577	0.001	6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
45	3doe:A	189	90	0.0818	0.1376	0.2889	0.001	3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
46	1yzg:A	168	84	0.0755	0.1429	0.2857	0.001
47	2b6h:A	171	95	0.0755	0.1404	0.2526	0.002
48	2x77:A	181	85	0.0692	0.1215	0.2588	0.003	2x77:B
49	4ile:A	176	95	0.0660	0.1193	0.2211	0.005	2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
50	6zga:C	168	85	0.0660	0.1250	0.2471	0.025	8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
51	8oun:A	181	121	0.0818	0.1436	0.2149	0.025	8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
52	4v0l:A	168	108	0.0849	0.1607	0.2500	0.030	4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
53	8oul:A	185	99	0.0849	0.1459	0.2727	0.085	8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
54	4bas:A	172	55	0.0535	0.0988	0.3091	0.34
55	1moz:A	178	92	0.0723	0.1292	0.2500	0.42	8ezj:C, 8ezj:D, 1moz:B
56	4q66:C	134	69	0.0597	0.1418	0.2754	0.42
57	5irm:C	770	81	0.0723	0.0299	0.2840	1.1	5irl:A, 5irm:A, 5irn:A
58	4zi2:A	185	79	0.0566	0.0973	0.2278	1.6	3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
59	8e0a:A	168	85	0.0566	0.1071	0.2118	1.6	8e0b:A
60	3cnl:A	233	58	0.0566	0.0773	0.3103	1.9	3cnn:A, 3cno:A
61	5z3g:X	202	39	0.0346	0.0545	0.2821	1.9
62	3p27:B	444	95	0.0818	0.0586	0.2737	2.9	3p27:A
63	3b6n:A	150	65	0.0566	0.1200	0.2769	3.0
64	6vs4:A	223	170	0.1101	0.1570	0.2059	3.4	6vs4:B
65	2vma:A	122	51	0.0535	0.1393	0.3333	3.4	3c1q:A, 3c1q:B, 2vma:B, 2vmb:A, 2vmb:B
66	8e0h:A	179	97	0.0597	0.1061	0.1959	4.0	8dzm:A, 8dzm:B, 8dzn:A, 8dzn:B, 8dzo:A, 8dzo:B, 8dzt:A, 8dzt:B, 8e0h:B, 2gao:A, 2gao:B
67	5xc3:A	168	85	0.0660	0.1250	0.2471	4.3	5xc5:A
68	7sgl:D	406	119	0.0912	0.0714	0.2437	4.5	7abs:A, 7af1:A, 7afs:A, 7afu:A, 7agi:A, 7apv:A, 6tt5:AAA, 6wnl:A, 6wnl:B, 6wo0:A
69	8pv1:Cf	285	58	0.0566	0.0632	0.3103	6.7	8i9r:Cy, 7ozs:C, 8pv2:Cf, 8pv3:Cf, 8pv4:Cf, 8pv5:Cf, 8pv7:Cf, 8pvk:Cf, 8pvl:Cf
70	8hnc:A	570	44	0.0440	0.0246	0.3182	8.6	8hnd:A, 8hnh:A
71	4ewv:B	492	63	0.0629	0.0407	0.3175	9.2	4ewv:A

[Back]