Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RTRKVLKEVRVQDENNVCFECGAFNPQWVSVTYGIWICLECSGRHRGLGVHLSFVRSVTMDKWKDIELEKMKAGGNAKFR
EFLESQEDYDPCWSLQEKYNSRAAALFRDKVVALAEGREWSLESWTPPQKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTT
IPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDL
PNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRN

The query sequence (length=289) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3o47:A 289 289 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
2 8d4c:C 180 165 0.5536 0.8889 0.9697 8.26e-114 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
3 3aq4:A 170 158 0.5017 0.8529 0.9177 3.26e-102 3aq4:B
4 6pta:A 165 156 0.4740 0.8303 0.8782 2.28e-100 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
5 5uf8:D 160 158 0.4844 0.8750 0.8861 6.32e-100
6 2b6h:A 171 158 0.4637 0.7836 0.8481 1.28e-97
7 1z6x:A 175 163 0.4637 0.7657 0.8221 3.08e-95 1z6x:B
8 3lrp:A 181 166 0.4360 0.6961 0.7590 1.34e-92
9 2k5u:A 181 164 0.4429 0.7072 0.7805 4.16e-92 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
10 4y0v:A 165 158 0.4291 0.7515 0.7848 2.43e-90 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
11 3lvq:E 420 163 0.3875 0.2667 0.6871 2.92e-78 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
12 3lvq:E 420 85 0.1142 0.0786 0.3882 1.95e-14 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
13 6bbp:A 520 160 0.3875 0.2154 0.7000 1.95e-76 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
14 6a8d:A 181 164 0.3322 0.5304 0.5854 5.06e-69
15 4q66:C 134 155 0.3737 0.8060 0.6968 3.90e-64
16 1upt:G 170 164 0.3218 0.5471 0.5671 1.42e-63 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
17 1moz:A 178 159 0.3149 0.5112 0.5723 2.04e-62 8ezj:C, 8ezj:D, 1moz:B
18 2x77:A 181 166 0.3149 0.5028 0.5482 2.64e-56 2x77:B
19 7rll:B 177 164 0.2872 0.4689 0.5061 4.80e-54 7rll:A
20 1zj6:A 173 165 0.2803 0.4682 0.4909 7.54e-53 2h16:A, 2h16:B, 2h16:C, 2h16:D, 2h17:A, 1z6y:A, 1z6y:B
21 1yzg:A 168 165 0.2768 0.4762 0.4848 5.38e-52
22 3doe:A 189 160 0.2630 0.4021 0.4750 1.09e-47 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
23 5de3:A 166 160 0.2561 0.4458 0.4625 1.57e-44 5di3:A
24 4zi2:A 185 158 0.2491 0.3892 0.4557 6.58e-40 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
25 8oun:A 181 167 0.2422 0.3867 0.4192 3.74e-38 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
26 2h57:B 167 167 0.2353 0.4072 0.4072 2.37e-37 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
27 4v0l:A 168 164 0.2284 0.3929 0.4024 2.83e-37 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
28 2crw:A 149 117 0.1869 0.3624 0.4615 1.18e-30
29 2p57:A 124 120 0.1765 0.4113 0.4250 2.20e-28
30 8oul:A 185 167 0.2145 0.3351 0.3713 5.38e-28 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
31 4bas:A 172 165 0.2111 0.3547 0.3697 8.71e-28
32 3sub:A 139 106 0.1626 0.3381 0.4434 2.00e-25 3sub:B
33 4ile:A 176 165 0.1696 0.2784 0.2970 2.57e-25 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
34 6zga:C 168 127 0.1834 0.3155 0.4173 7.30e-25 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
35 7jtz:B 143 82 0.1315 0.2657 0.4634 5.44e-24 7jtz:A, 7jtz:C, 7jtz:D
36 4q66:I 86 144 0.2422 0.8140 0.4861 7.04e-24
37 5di3:B 204 164 0.1938 0.2745 0.3415 2.01e-23 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
38 2owa:A 128 76 0.1211 0.2734 0.4605 9.07e-22 2owa:B
39 8e0c:A 185 133 0.1453 0.2270 0.3158 4.21e-20 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
40 8e0a:A 168 128 0.1419 0.2440 0.3203 5.51e-18 8e0b:A
41 1dcq:A 276 83 0.1315 0.1377 0.4578 5.97e-18
42 2iqj:B 123 110 0.1246 0.2927 0.3273 8.15e-17 2iqj:A
43 2crr:A 141 81 0.1073 0.2199 0.3827 6.43e-16
44 8e0h:A 179 174 0.1592 0.2570 0.2644 1.19e-15 8dzm:A, 8dzm:B, 8dzn:A, 8dzn:B, 8dzo:A, 8dzo:B, 8dzt:A, 8dzt:B, 8e0h:B, 2gao:A, 2gao:B
45 3t9k:A 281 100 0.1246 0.1281 0.3600 3.04e-14 4f1p:A, 4f1p:B, 3jue:A, 3jue:B, 3t9k:B
46 6vs4:A 223 115 0.1453 0.1883 0.3652 2.06e-13 6vs4:B
47 3lju:X 373 84 0.1142 0.0885 0.3929 5.93e-13 3feh:A, 3fm8:C, 3fm8:D, 3mdb:C, 3mdb:D
48 8fn0:B 212 141 0.1453 0.1981 0.2979 2.14e-11
49 8xql:A 240 114 0.1315 0.1583 0.3333 3.54e-09
50 6jmt:D 350 55 0.0761 0.0629 0.4000 3.52e-08 6jmt:C, 6jmt:E, 6jmt:F, 6jmt:A, 6jmt:B
51 2d9l:A 134 73 0.0830 0.1791 0.3288 2.20e-07 2olm:A
52 8pjk:A 222 125 0.1246 0.1622 0.2880 3.49e-07 7e2x:A, 7e2z:A
53 3sfv:A 179 158 0.1522 0.2458 0.2785 8.51e-07 8alk:B, 7eq2:A, 7eq2:B, 4fmb:B, 4fmb:D, 4fmb:F, 4fmc:B, 4fmc:D, 4fmd:B, 4fmd:D, 4fmd:F, 4fme:B, 4fme:E, 2fol:A, 4hlq:B, 4hlq:D, 4hlq:F, 4hlq:H, 4hlq:J, 4i1o:A, 4i1o:C, 4i1o:E, 4i1o:G, 4iru:B, 4iru:D, 4iru:F, 4jvs:B, 3nkv:A, 3nkv:B, 5o74:B, 5o74:D, 5o74:F, 5o74:H, 5o74:J, 5o74:L, 6sku:B, 5szh:B, 5szk:B, 3tkl:A
54 1ukv:Y 197 125 0.1211 0.1777 0.2800 8.01e-05 2bcg:Y, 1yzn:A
55 8unx:A 244 122 0.1246 0.1475 0.2951 2.02e-04 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
56 1agr:A 350 97 0.0969 0.0800 0.2887 2.47e-04 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
57 7lwb:A 182 120 0.1038 0.1648 0.2500 3.24e-04 7bwt:B, 4lhv:A, 4lhv:B, 4lhv:C, 4lhv:D, 4lhw:A, 4lhw:B, 4lhw:C, 4lhw:D, 4lhw:E, 4lhy:A, 4lhy:B, 4lhz:A, 4lhz:B, 4li0:A, 4li0:B, 3qbt:A, 3qbt:C, 3qbt:E, 3qbt:G, 6rir:A, 6rir:B, 6sq2:A, 6sq2:B, 6stf:A, 6stf:B, 6stf:C, 6stf:D, 6stf:E, 6stg:A, 6stg:B, 5szi:A, 3tnf:A, 6whe:A, 6whe:B, 6yx5:A, 6zsi:A, 6zsi:B, 6zsj:A, 6zsj:B
58 5ymx:A 202 175 0.1592 0.2277 0.2629 5.40e-04 6h17:A, 6h35:A, 6h35:B, 6h5b:A, 6hjh:A, 6hjo:A, 6hjo:B, 6izw:A, 5ymx:B
59 2zet:A 181 161 0.1246 0.1989 0.2236 0.001 2f7s:A, 2f7s:B, 2iey:A, 2iey:B, 2iez:A, 2iez:B, 2iez:H, 2iez:I, 2if0:A, 2if0:B, 2zet:B
60 5szj:A 175 120 0.1073 0.1771 0.2583 0.002 5lpn:A, 5lpn:C
61 3v00:C 353 95 0.0934 0.0765 0.2842 0.002 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
62 2rhd:A 164 124 0.1142 0.2012 0.2661 0.003
63 3c7k:C 311 97 0.0934 0.0868 0.2784 0.006 3c7k:A
64 3q85:B 151 111 0.0900 0.1722 0.2342 0.007 4aii:A, 4aii:B, 3q85:A
65 1x3s:A 177 156 0.1419 0.2316 0.2628 0.008
66 3ref:B 180 59 0.0830 0.1333 0.4068 0.011 4dvg:A, 3ref:A, 3reg:A, 3reg:B
67 7rkf:A 350 95 0.0830 0.0686 0.2526 0.011
68 7obr:x 488 75 0.0830 0.0492 0.3200 0.025 2go5:W, 2j37:W, 5l3q:A, 5l3q:C, 1mfq:C, 7nfx:x, 7qwq:x, 1ry1:W, 4ue5:D, 6y2z:A, 6y32:A, 6y32:C, 6y32:E, 6y32:G
69 6y09:A 176 127 0.1142 0.1875 0.2598 0.026 2g77:B, 6sur:A, 6sur:B, 6sur:C, 6sur:D, 6sur:E, 6sur:F, 6y09:B, 1z06:A, 6zay:A, 6zay:B
70 3jaj:z 426 75 0.0830 0.0563 0.3200 0.028 6frk:x, 3jan:z, 7obq:x, 6r6g:AB
71 6l6o:A 165 119 0.1073 0.1879 0.2605 0.030 8jqu:A
72 2g6b:A 162 113 0.0900 0.1605 0.2301 0.052
73 2hup:A 162 116 0.0934 0.1667 0.2328 0.054 2hup:B
74 8iys:A 355 95 0.0761 0.0620 0.2316 0.061 3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
75 5ck3:F 147 119 0.1107 0.2177 0.2689 0.076
76 7obq:v 201 139 0.1419 0.2040 0.2950 0.078 2fh5:B, 6frk:v, 7nfx:v
77 3t1t:A 193 100 0.1003 0.1503 0.2900 0.093 3t12:A, 3t1o:A, 3t1o:B, 3t1q:A, 3t1t:B, 3t1t:C, 3t1t:D, 3t1v:A, 3t1v:B, 3t1v:C, 3t1v:D
78 4lhv:E 148 112 0.0830 0.1622 0.2143 0.10
79 1xzq:A 449 163 0.1453 0.0935 0.2577 0.11 1xzq:B
80 2gf9:A 176 139 0.1073 0.1761 0.2230 0.12
81 1k6m:A 432 53 0.0761 0.0509 0.4151 0.24 1c7z:A, 1c7z:B, 1c80:A, 1c80:B, 1c81:A, 1fbt:A, 1fbt:B, 1k6m:B, 1tip:A, 1tip:B
82 4fid:A 318 80 0.0796 0.0723 0.2875 0.27 4fid:B
83 6dly:B 384 54 0.0657 0.0495 0.3519 0.34 6dly:A
84 5iby:A 321 71 0.0796 0.0717 0.3239 0.39 5ich:A, 5ich:B, 5icl:A, 5icl:B, 5idh:A
85 3cbq:A 169 79 0.0692 0.1183 0.2532 0.40
86 5agv:B 393 83 0.0865 0.0636 0.3012 0.49 5agu:A, 5agu:B, 5agv:A, 6fvn:A, 6fvn:B, 6fvn:C, 6fvn:D, 6fvo:A, 6fvo:B, 6fvo:C, 6fvo:D
87 6jmg:A 267 160 0.1384 0.1498 0.2500 0.52 6jmg:B
88 4wnr:A 323 100 0.1142 0.1022 0.3300 0.64
89 3ab3:A 322 94 0.0865 0.0776 0.2660 0.72 3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
90 1byu:B 215 86 0.0796 0.1070 0.2674 0.91 6a38:A, 6a3a:A, 6a3b:A, 6a3c:A, 6a3e:A, 3a6p:C, 3a6p:H, 7b51:B, 2bku:A, 2bku:C, 5bxq:C, 5bxq:D, 5bxq:E, 1byu:A, 4c0q:C, 4c0q:D, 3ch5:A, 5ciq:A, 5ciq:B, 5cit:A, 5cit:B, 5ciw:A, 5ciw:B, 6cit:A, 5cj2:A, 5cj2:B, 5cj2:C, 5cj2:D, 5cj2:E, 5cj2:F, 5cj2:G, 5cj2:H, 5cll:A, 5cll:C, 5clq:A, 5clq:C, 7cnd:A, 7dbg:A, 5dh9:A, 5dha:A, 5dhf:A, 5di9:A, 5dif:A, 5dis:B, 5dlq:C, 5dlq:D, 3ea5:A, 3ea5:C, 3gj0:A, 3gj0:B, 3gj3:A, 3gj4:A, 3gj4:C, 3gj5:A, 3gj5:C, 3gj6:A, 3gj7:A, 3gj7:C, 3gj8:A, 3gj8:C, 3gjx:C, 3gjx:F, 4gmx:A, 4gpt:A, 4hat:A, 4hau:A, 4hav:A, 4haw:A, 4hax:A, 4hay:A, 4haz:A, 4hb0:A, 4hb2:A, 4hb3:A, 4hb4:A, 8hq3:A, 8hq4:A, 8hq5:A, 8hq6:A, 8huf:A, 8hug:A, 1ibr:A, 1ibr:C, 8itv:A, 5jlj:A, 1k5d:A, 1k5d:D, 1k5d:G, 1k5d:J, 1k5g:A, 1k5g:D, 1k5g:G, 1k5g:J, 6kft:A, 7l5e:A, 6lq9:A, 6m60:A, 6m6x:A, 7mnp:A, 7mnp:C, 7mnq:A, 7mnr:A, 7mns:A, 7mnt:A, 7mnt:C, 7mnu:A, 7mnv:A, 7mnw:A, 7mnw:C, 7mnw:E, 7mnw:G, 7mnx:A, 7mnx:C, 7mnx:E, 7mnx:G, 7mnx:I, 7mnx:K, 7mny:A, 7mny:C, 7mny:E, 7mny:G, 7mny:I, 7mny:K, 7mnz:A, 7mnz:C, 7mnz:E, 7mnz:G, 7mnz:I, 7mnz:K, 7mo0:A, 7mo0:C, 7mo1:A, 7mo2:A, 7mo2:C, 7mo3:A, 7mo3:C, 7mo4:A, 7mo4:C, 7mo5:A, 3nby:C, 3nby:F, 3nbz:C, 3nbz:F, 3nc0:C, 3nc0:F, 3nc1:C, 4ol0:A, 6q82:B, 6q84:B, 6q84:E, 1qbk:C, 1qg2:A, 1qg4:A, 1qg4:B, 3ran:A, 3ran:B, 3ran:C, 3ran:D, 1rrp:A, 1rrp:C, 6tvo:B, 5uwh:A, 5uwi:A, 5uwj:A, 5uwo:A, 5uwp:A, 5uwq:A, 5uwr:A, 5uws:A, 5uwt:A, 5uwu:A, 5uww:A, 3w3z:B, 1wa5:A, 4wvf:A, 6x2m:A, 6x2o:A, 6x2p:A, 6x2r:A, 6x2s:A, 6x2u:A, 6x2v:A, 6x2w:A, 6x2x:A, 6x2y:A, 6xjp:A, 6xjr:A, 6xjs:A, 6xjt:A, 6xju:A, 7ypz:A, 5yro:A, 5yst:A, 5ysu:A, 5ytb:A, 5yu6:B, 5yu6:D, 3zjy:A, 3zjy:D, 3zjy:F, 5zpu:A
91 6iae:B 148 109 0.0969 0.1892 0.2569 0.95 6ia7:B
92 6dxs:A 342 53 0.0623 0.0526 0.3396 1.4 6dwv:B, 6dwv:A, 6dwv:C, 6dwv:D, 6dxq:A, 6dxq:B, 6dxq:C, 6dxq:D, 6dxs:B, 6dxs:C, 6dxs:D
93 7opr:A 218 132 0.1142 0.1514 0.2500 1.7 3bc1:A, 3bc1:E, 6huf:A, 6huf:O, 6huf:N, 6huf:B, 6huf:E, 6huf:C, 6huf:K, 6huf:M, 6huf:D, 6huf:P, 6huf:F, 6huf:J, 6huf:G, 6huf:I, 6huf:H, 6huf:L, 7opp:A, 7opp:C, 7opq:A, 7opq:B, 7opr:B
94 8fac:A 1377 68 0.0692 0.0145 0.2941 1.8 8e04:A
95 8e05:A 1749 67 0.0692 0.0114 0.2985 2.3 8e05:B, 8e06:A
96 4izc:B 266 60 0.0657 0.0714 0.3167 2.6 4izc:A, 4izd:A, 4izd:B
97 5v8f:3 654 75 0.0761 0.0336 0.2933 2.8 5bk4:B, 5bk4:3, 6eyc:3, 6f0l:3, 6f0l:B, 3ja8:3, 7p30:3, 7p30:B, 7p5z:3, 7p5z:B, 6ptn:j, 6ptn:3, 6pto:i, 6pto:3, 6rqc:3, 6sko:3, 6u0m:3, 5u8s:3, 5u8t:3
98 8ggb:A 310 80 0.0830 0.0774 0.3000 2.8 8gg9:A, 8ggc:A
99 8uo1:A 334 80 0.0830 0.0719 0.3000 3.4 8gga:A
100 2pk3:A 309 81 0.0796 0.0744 0.2840 3.6 2pk3:B
101 6eg8:I 372 80 0.0830 0.0645 0.3000 3.7 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
102 1bif:A 432 34 0.0588 0.0394 0.5000 4.3 2bif:A, 2bif:B
103 3ats:A 352 39 0.0484 0.0398 0.3590 4.4 3att:A
104 8tzh:A 1485 36 0.0484 0.0094 0.3889 4.8 3d6t:B
105 2ax4:A 198 49 0.0519 0.0758 0.3061 5.3 2ax4:B, 2ax4:C, 2ax4:D, 8i1n:A, 8i1n:B, 8i1n:C, 8i1n:D, 8i1o:A, 8i1o:B, 8i1o:C, 8i1o:D
106 6s6d:C 284 77 0.0761 0.0775 0.2857 5.8
107 8h1j:A 362 31 0.0311 0.0249 0.2903 6.6 8ex9:A, 8exa:A
108 4jvh:A 176 59 0.0623 0.1023 0.3051 7.5
109 5x2g:A 749 58 0.0554 0.0214 0.2759 8.0 5x2h:A
110 2xtz:A 343 43 0.0484 0.0408 0.3256 9.2
111 2xtz:B 291 43 0.0484 0.0481 0.3256 9.5
112 6ulg:G 310 86 0.0727 0.0677 0.2442 9.6 8dhb:A, 3llu:A, 6nzd:G, 2q3f:A, 2q3f:B, 6s6a:C, 6s6a:D, 6s6d:D, 6sb0:D, 6sb0:J, 6sb2:D, 6sb2:J, 7t3b:E, 7t3c:E, 6u62:C, 7ux2:C, 7ux2:J, 7uxc:E, 7uxc:L, 7uxh:G, 7uxh:N, 7uxh:W, 7uxh:d, 6wj2:G, 6wj3:G
113 6zwm:B 2185 78 0.0727 0.0096 0.2692 9.9 6zwm:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218