Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
RTIGIIGAPFSKGQPRGGVEEGPTVLRKAGLLEKLKEQECDVKDYGDLPFADIPNDSPFQIVKNPRSVGKASEQLAGKVA
EVKKNGRISLVLGGDHSLAIGSISGHARVHPDLGVIWVDAHTDINTPLTTTSGNLHGQPVSFLLKELKGKIPDVPGFSWV
TPCISAKDIVYIGLRDVDPGEHYILKTLGIKYFSMTEVDRLGIGKVMEETLSYLLGRKKRPIHLSFDVDGLDPSFTPATG
TPVVGGLTYREGLYITEEIYKTGLLSGLDIMEVNPSLGKTPEEVTRTVNTAVAITLACFGLAREGNHKPIDYLN

The query sequence (length=314) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7k4g:E 319 314 1.0000 0.9843 1.0000 0.0 2aeb:A, 2aeb:B, 8aup:A, 8aup:B, 8aup:C, 8aup:D, 8aup:E, 8aup:F, 3dj8:A, 3dj8:B, 8e5m:A, 8e5m:B, 8e5m:C, 8e5m:D, 8e5m:E, 8e5m:F, 8e5n:A, 8e5n:B, 8e5n:C, 8e5n:D, 8e5n:E, 8e5n:F, 3e6k:A, 3e6k:B, 3e6v:A, 3e6v:B, 3f80:A, 3f80:B, 4fci:A, 4fci:B, 4fck:A, 4fck:B, 3gmz:A, 3gmz:B, 3gn0:A, 3gn0:B, 4gsv:A, 4gsv:B, 4gsz:A, 4gsz:B, 4gwc:A, 4gwc:B, 4gwd:A, 4gwd:B, 4hww:A, 4hww:B, 4hxq:A, 4hxq:B, 4ie1:A, 4ie1:B, 7k4g:A, 7k4g:B, 7k4g:C, 7k4g:D, 7k4g:F, 7k4h:A, 7k4h:B, 7k4h:C, 7k4h:D, 7k4h:E, 7k4h:F, 7k4i:A, 7k4i:B, 7k4i:C, 7k4i:D, 7k4i:E, 7k4i:F, 7k4j:A, 7k4j:B, 7k4j:C, 7k4j:D, 7k4j:E, 7k4j:F, 7k4k:A, 7k4k:B, 7k4k:C, 7k4k:D, 7k4k:E, 7k4k:F, 7klk:A, 7klk:B, 7klk:C, 7klk:D, 7klk:E, 7klk:F, 7kll:A, 7kll:B, 7kll:C, 7kll:D, 7kll:E, 7kll:F, 7klm:A, 7klm:B, 7klm:C, 7klm:D, 7klm:E, 7klm:F, 3kv2:A, 3kv2:B, 7ley:A, 7ley:B, 7ley:C, 7lez:A, 7lez:B, 7lez:C, 7lez:M, 7lez:N, 7lez:J, 7lf1:A, 7lf1:B, 7lf1:C, 7lf1:J, 7lf1:M, 7lf1:N, 7lf2:A, 7lf2:B, 7lf2:C, 7lf2:J, 7lf2:Q, 7lf2:R, 3lp4:A, 3lp4:B, 3lp7:A, 3lp7:B, 3mfv:A, 3mfv:B, 3mfw:A, 3mfw:B, 3mjl:A, 3mjl:B, 2pha:A, 2pha:B, 2pho:A, 2pho:B, 2pll:A, 2pll:B, 6q92:A, 6q92:B, 6q9p:A, 6q9p:B, 6qaf:A, 6qaf:B, 3sjt:A, 3sjt:B, 3skk:A, 3skk:B, 3th7:A, 3th7:B, 3the:A, 3the:B, 3thh:A, 3thh:B, 3thj:A, 3thj:B, 6v7c:A, 6v7c:B, 6v7c:C, 6v7c:D, 6v7c:E, 6v7c:F, 6v7d:A, 6v7d:B, 6v7d:C, 6v7d:D, 6v7d:E, 6v7d:F, 6v7e:A, 6v7e:B, 6v7e:C, 6v7e:D, 6v7e:E, 6v7e:F, 6v7f:A, 6v7f:B, 6v7f:C, 6v7f:D, 6v7f:E, 6v7f:F, 1wva:A, 1wva:B, 1wvb:A, 1wvb:B, 2zav:A, 2zav:B
2 1hqf:A 314 314 0.8758 0.8758 0.8758 0.0 1d3v:A, 1d3v:B, 3e8q:A, 3e8q:B, 3e8q:C, 3e8z:A, 3e8z:B, 3e8z:C, 3e9b:A, 3e9b:B, 3e9b:C, 1hq5:A, 1hq5:B, 1hqf:B, 1hqf:C, 1hqg:A, 1hqg:B, 1hqg:C, 1hqh:A, 1hqh:B, 1hqh:C, 1hqx:A, 1hqx:B, 1hqx:C, 1p8m:A, 1p8m:B, 1p8m:C, 1p8n:A, 1p8n:B, 1p8n:C, 1p8o:A, 1p8o:B, 1p8o:C, 1p8p:A, 1p8p:B, 1p8p:C, 1p8q:A, 1p8q:B, 1p8q:C, 1p8r:A, 1p8r:B, 1p8s:A, 1p8s:B, 1p8s:C, 1r1o:A, 1r1o:B, 1r1o:C, 1rla:A, 1rla:B, 1rla:C, 2rla:A, 2rla:B, 2rla:C, 3rla:A, 3rla:B, 3rla:C, 4rla:A, 4rla:B, 4rla:C, 5rla:A, 5rla:B, 5rla:C, 1t4p:A, 1t4p:B, 1t4p:C, 1t4r:A, 1t4r:B, 1t4r:C, 1t4s:A, 1t4s:B, 1t4s:C, 1t4t:A, 1t4t:B, 1t4t:C, 1t5f:A, 1t5f:B, 1t5f:C, 1t5g:A, 1t5g:B, 1t5g:C, 1ta1:A, 1ta1:B, 1ta1:C, 1tbh:A, 1tbh:B, 1tbh:C, 1tbj:A, 1tbj:B, 1tbj:C, 1tbl:A, 1tbl:B, 1tbl:C, 1zpe:A, 1zpe:B, 1zpe:C, 1zpg:A, 1zpg:B, 1zpg:C
3 6ss2:AAA 320 314 0.6019 0.5906 0.6019 2.59e-142 4hze:A, 4hze:B, 4hze:C, 4i06:A, 4i06:B, 4i06:C, 4ie2:A, 4ie2:B, 4ie2:C, 4ie3:A, 4ie3:B, 4ie3:C, 4ixu:A, 4ixu:B, 4ixu:C, 4ixv:A, 4ixv:B, 4ixv:C, 1pq3:A, 1pq3:B, 1pq3:C, 1pq3:D, 1pq3:E, 1pq3:F, 6q37:A, 6q37:B, 6q37:C, 6q39:A, 6q39:B, 6q39:C, 6ss4:AAA, 6ss6:AAA, 6ss6:BBB, 6ss6:CCC
4 4q3v:C 339 319 0.4395 0.4071 0.4326 3.25e-85 4q3p:A, 4q3p:B, 4q3p:C, 4q3p:D, 4q3q:A, 4q3q:B, 4q3q:C, 4q3q:D, 4q3r:A, 4q3r:B, 4q3r:C, 4q3r:D, 4q3s:A, 4q3s:B, 4q3s:C, 4q3s:D, 4q3t:A, 4q3t:B, 4q3t:C, 4q3t:D, 4q3u:A, 4q3u:B, 4q3u:C, 4q3u:D, 4q3v:A, 4q3v:B, 4q3v:D, 4q40:A, 4q40:B, 4q40:C, 4q40:D, 4q41:A, 4q41:B, 4q41:C, 4q41:D, 4q42:A, 4q42:B, 4q42:C, 4q42:D
5 1cev:A 299 302 0.4108 0.4314 0.4272 5.33e-77 1cev:B, 1cev:C, 1cev:D, 1cev:E, 1cev:F, 2cev:A, 2cev:C, 2cev:B, 2cev:D, 2cev:E, 2cev:F, 3cev:A, 3cev:B, 3cev:C, 3cev:D, 3cev:E, 3cev:F, 4cev:A, 4cev:B, 4cev:C, 4cev:D, 4cev:E, 4cev:F, 5cev:A, 5cev:B, 5cev:C, 5cev:D, 5cev:F, 5cev:E
6 5hj9:A 311 306 0.4204 0.4244 0.4314 1.41e-75 5hja:A, 4ity:A, 4iu0:A, 4iu1:A, 4iu4:A, 4iu5:A
7 6nfp:A 292 300 0.3981 0.4281 0.4167 5.04e-71 6dkt:A, 6dkt:B, 6dkt:C, 6dkt:D, 6dkt:F, 6nfp:B, 6nfp:C, 6nfp:D, 6nfp:E, 6nfp:F
8 6nbk:A 289 300 0.3885 0.4221 0.4067 3.88e-70 6nbk:B, 6nbk:C, 6nbk:D, 6nbk:E, 6nbk:F
9 6dkt:E 268 300 0.3758 0.4403 0.3933 5.89e-63
10 2ef5:A 273 298 0.3694 0.4249 0.3893 2.73e-60 2ef5:B, 2ef5:D, 2ef5:E, 2ef5:F, 2ef5:G
11 3mmr:A 308 286 0.2994 0.3052 0.3287 2.05e-47 3sl0:A, 3sl1:A
12 5zee:B 297 287 0.3057 0.3232 0.3345 4.12e-44 5zee:A, 5zef:A, 5zef:B, 5zeh:A, 5zeh:B
13 3nip:B 316 276 0.2389 0.2373 0.2717 1.21e-19 3nip:C, 3nip:E, 3nip:D, 3nip:F, 3niq:A, 3niq:B
14 1gq6:B 301 284 0.2611 0.2724 0.2887 1.18e-18 1gq6:A, 1gq6:C, 1gq7:A, 1gq7:B, 1gq7:C, 1gq7:D, 1gq7:E, 1gq7:F
15 9fek:G 377 304 0.2866 0.2387 0.2961 2.83e-18 9fek:A, 9fek:B, 9fek:C, 9fek:D, 9fek:E, 9fek:F, 9fek:H, 9fek:I, 9fek:J, 9fek:K, 9fek:L
16 4dz4:B 323 295 0.2707 0.2632 0.2881 5.00e-18 4dz4:A, 4dz4:C, 4dz4:D, 4dz4:E, 4dz4:F
17 4g3h:C 310 247 0.1911 0.1935 0.2429 1.46e-16 4g3h:A, 4g3h:B, 4g3h:D
18 3nio:A 316 282 0.2166 0.2152 0.2411 1.56e-15 3nio:B, 3nio:C, 3nio:D, 3nio:E, 3nio:F
19 3pzl:B 293 198 0.1815 0.1945 0.2879 6.78e-15 3pzl:A, 3pzl:C
20 7lba:B 310 288 0.2325 0.2355 0.2535 9.85e-15 7lba:A, 7lba:C, 7lba:D, 7lba:E, 7lba:F, 7lba:G, 7lba:H, 7lba:I, 7lba:J, 7lba:K, 7lba:L, 7lba:M, 7lba:P, 7lba:Q, 7lol:A, 7lox:A, 7lox:B, 7lox:C
21 7esr:A 378 283 0.2197 0.1825 0.2438 3.45e-14
22 1wog:A 303 292 0.2452 0.2541 0.2637 9.39e-13 1wog:B, 1wog:C, 1wog:D, 1wog:E, 1wog:F, 1woi:A, 1woi:B, 1woi:C, 1woi:D, 1woi:E, 1woi:F
23 4rhm:A 308 295 0.2357 0.2403 0.2508 5.14e-12 4rhl:A, 4rhl:B, 4rhm:B, 4rhm:C
24 4myn:A 298 285 0.2452 0.2584 0.2702 2.66e-11 4mxr:A, 4mxr:B, 4myf:A, 4myk:A
25 3lhl:A 276 265 0.2038 0.2319 0.2415 1.89e-10
26 6vsu:E 318 242 0.1975 0.1950 0.2562 3.49e-09 6vsu:A, 6vsu:B, 6vsu:C, 6vsu:D, 6vsu:F, 6vsu:G, 6vsu:I, 6vsu:H, 6vsu:J, 6vsu:K, 6vsu:L, 6vsu:M, 6vsu:N, 6vsu:O, 6vsu:P, 6vsu:Q, 6vsu:R, 6vsu:S, 6vsu:T, 6vsu:U, 6vsu:V, 6vsu:W, 6vsu:X
27 3m1r:D 321 285 0.2229 0.2181 0.2456 4.41e-09 3m1r:A, 3m1r:B, 3m1r:C, 3m1r:E, 3m1r:F
28 8ryi:E 361 301 0.2293 0.1994 0.2392 7.91e-09 8ryi:B, 8snf:D, 8snf:F, 8snk:I, 8snk:A, 8sp2:G, 8sp2:H, 8sp2:I, 8sp2:J, 8x3g:A, 8x3g:B
29 6vst:D 320 246 0.1975 0.1938 0.2520 4.22e-08 6vss:A, 6vss:B, 6vss:C, 6vss:D, 6vss:E, 6vss:F, 6vst:A, 6vst:B, 6vst:C, 6vst:E, 6vst:F, 6vst:G, 6vst:H, 6vst:I, 6vst:J, 6vst:K, 6vst:L
30 9iq9:B 275 216 0.1783 0.2036 0.2593 4.86e-08 7euk:A, 7euk:B, 7eul:A, 7eun:A, 7eun:B, 7euq:A, 7euq:B, 9iq9:A, 8ius:A, 8ius:B, 8iut:A, 8iut:B, 8iuu:A, 8iuu:B, 8iuv:A, 8iuv:B, 8iuw:A, 8iuw:B, 6lug:A, 6lug:B, 6luh:A, 6luh:B
31 6ksy:B 289 163 0.1465 0.1592 0.2822 1.71e-04 6ksy:A, 6ksy:C, 6ksy:D
32 7yrg:L 240 184 0.1338 0.1750 0.2283 0.50
33 6n2b:B 355 73 0.0669 0.0592 0.2877 0.83 6n2b:A
34 6z42:A 336 43 0.0510 0.0476 0.3721 0.92 6z42:B, 6z42:C, 6z42:D
35 6ey7:B 227 81 0.0669 0.0925 0.2593 0.96 6ey7:A, 6ey7:C, 6ey7:D, 3n4p:A, 3n4p:B, 3n4p:C, 3n4p:D, 3n4q:A, 3n4q:B, 3n4q:C, 3n4q:D
36 4v4o:F 529 59 0.0605 0.0359 0.3220 0.98 4v4o:A, 4v4o:B, 4v4o:C, 4v4o:D, 4v4o:E, 4v4o:G, 4v4o:a, 4v4o:b, 4v4o:c, 4v4o:d, 4v4o:e, 4v4o:f, 4v4o:g
37 8orh:A 649 220 0.1592 0.0770 0.2273 1.5 8orh:B, 8ors:A, 8ors:B, 7yx3:A, 7yx3:B, 4z24:A, 4z24:B, 4z25:A, 4z25:B, 4z25:C, 4z25:D, 4z25:E, 4z25:F, 4z25:G, 4z25:H, 4z25:I, 4z25:J, 4z25:K, 4z25:L, 4z26:A, 4z26:B, 4z26:C, 4z26:D, 4z26:E, 4z26:F, 4z26:G, 4z26:H
38 1gxd:A 624 43 0.0541 0.0272 0.3953 1.5 1ck7:A, 1eak:A, 1eak:B, 1eak:D, 1eak:C, 1gen:A, 1gxd:B, 1rtg:A
39 1mqs:A 588 76 0.0732 0.0391 0.3026 1.7
40 2b5w:A 357 70 0.0669 0.0588 0.3000 2.6 2b5v:A, 2vwg:A, 2vwh:A, 2vwp:A, 2vwq:A
41 8bf6:A 278 76 0.0764 0.0863 0.3158 2.6 8bj9:A
42 2q37:A 142 54 0.0478 0.1056 0.2778 3.4
43 6ax8:A 509 35 0.0478 0.0295 0.4286 3.6 5xet:C
44 5nh4:A 436 53 0.0573 0.0413 0.3396 4.5 5nh4:B, 5nh4:C, 5nh4:D, 5nh5:A, 5nh5:B, 5nh5:C, 5nh5:D, 5nh6:A, 5nh6:B, 5nh6:C, 5nh6:D, 5nh7:A, 5nh7:B, 5nh7:C, 5nh7:D, 5nh8:A, 5nh8:B, 5nh8:C, 5nh8:D, 5nh9:A, 5nh9:C, 5nh9:B, 5nh9:D, 5nha:A, 5nha:B, 5nha:C, 5nha:D, 5nhb:A, 5nhb:B, 5nhb:C, 5nhb:D, 5nhc:A, 5nhc:B, 5nhc:C, 5nhc:D, 5nhd:A, 5nhd:B, 5nhd:D, 5nhd:C, 5nhe:A, 5nhe:B, 5nhe:C, 5nhe:D, 6t8e:A, 6t8e:B, 6t8e:C, 6t8e:D, 6t8f:A, 6t8f:B, 6t8f:C, 6t8f:D, 5yn3:A, 5yn3:B, 5yn3:C, 5yn3:D
45 7yx4:A 650 79 0.0669 0.0323 0.2658 4.6 7ptv:A, 7ptv:B, 7yx4:B, 7yx5:A
46 4gw1:B 221 18 0.0350 0.0498 0.6111 5.3 6au5:B, 6au5:D, 6axp:B, 6axp:D, 6ayn:D, 6ayn:B, 6azk:B, 6azk:D, 6azl:B, 6azl:D, 5esq:B, 5esq:D, 5etu:B, 5etu:D, 5euk:B, 5euk:D, 5f88:B, 5f88:D, 5ff6:B, 5ff6:D, 4gw1:D, 4gw5:B, 4gw5:D, 5hpm:B, 5hpm:D, 5hyq:B, 5hyq:D, 5i2i:B, 5i2i:D, 5icx:B, 5icx:D, 5icy:B, 5icy:D, 5icz:B, 5icz:D, 5id0:B, 5id0:D, 5id1:D, 5id1:B, 5iop:B, 5iop:D, 5ir1:B, 5ir1:D, 5itf:B, 5itf:D, 5iv2:B, 5iv2:D, 5ivz:B, 5ivz:D, 5t1k:B, 5t1k:D, 5t1l:B, 5t1l:D, 5t1m:B, 5t1m:D, 5th2:B, 5th2:D
47 7ane:m 288 50 0.0478 0.0521 0.3000 5.6
48 1w78:A 414 47 0.0541 0.0411 0.3617 5.7 1w7k:A
49 1o8b:B 212 19 0.0382 0.0566 0.6316 7.3 1o8b:A
50 6bni:A 502 74 0.0605 0.0378 0.2568 8.5 6bni:B, 6c86:A, 6c86:B, 5eln:A, 5eln:B, 5eln:C, 5eln:D, 5elo:A, 5elo:B, 5elo:C, 5elo:D, 6hcw:A, 6hcw:B, 7zog:A, 7zog:B, 7zog:C, 7zog:D
51 8wuw:H 529 67 0.0605 0.0359 0.2836 9.3 8wuw:A, 8wuw:B, 8wuw:I, 8wuw:C, 8wuw:J, 8wuw:D, 8wuw:K, 8wuw:E, 8wuw:L, 8wuw:F, 8wuw:M, 8wuw:G, 8wuw:N, 8wux:A, 8wux:H, 8wux:B, 8wux:I, 8wux:C, 8wux:J, 8wux:D, 8wux:K, 8wux:E, 8wux:L, 8wux:F, 8wux:M, 8wux:G, 8wux:N
52 3s2e:A 340 43 0.0478 0.0441 0.3488 9.9 3s1l:A, 3s1l:B, 3s1l:C, 3s1l:D, 3s2e:B, 3s2e:C, 3s2e:D, 3s2e:E, 3s2e:F, 3s2e:G, 3s2e:H, 3s2f:A, 3s2f:B, 3s2f:C, 3s2f:D, 3s2f:E, 3s2f:F, 3s2f:G, 3s2f:H, 3s2g:A, 3s2g:B, 3s2g:C, 3s2g:D, 3s2g:E, 3s2g:F, 3s2g:G, 3s2g:H, 3s2i:A, 3s2i:B, 3s2i:C, 3s2i:D, 3s2i:E, 3s2i:F, 3s2i:G, 3s2i:H

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218