Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RTEKIICRDVARGYENVPIPCVNGVDGEPCPEDYKYISENCETSTMNIDRNITHLQHCTCVDDCSSSNCLCGQLSIRCWY
DKDGRLLQEFNKIEPPLIFECNQACSCWRNCKNRVVQSGIKVRLQLYRTAKMGWGVRALQTIPQGTFICEYVGELISDAE
ADVREDDSYLFDLDNEVYCIDARYYGNISRFINHLCDPNIIPVRVFMLHQDLRFPRIAFFSSRDIRTGEELGFDYGDRFW
DIKSKYFTCQCGSEKCKHSAEAIALEQSR

The query sequence (length=269) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7x73:A 274 272 1.0000 0.9818 0.9890 0.0 7btv:A, 7btv:B, 7buc:A, 7buc:B, 7dcf:A, 7dcf:B, 5jhn:A, 5jhn:B, 5jin:A, 5jin:B, 5jiy:A, 5jiy:B, 5jj0:A, 5jj0:B, 3k5k:A, 3k5k:B, 4nvq:A, 4nvq:B, 2o8j:A, 2o8j:B, 2o8j:C, 2o8j:D, 3rjw:A, 3rjw:B, 5t0k:A, 5t0k:B, 5t0m:A, 5t0m:B, 7t7l:A, 7t7l:B, 7t7l:C, 7t7l:D, 5ttf:A, 5ttf:B, 5ttf:C, 5ttf:D, 5tuy:A, 5tuy:B, 5v9i:A, 5v9i:B, 5v9i:C, 5v9i:D, 5vsc:A, 5vsc:B, 5vse:A, 5vse:B, 7x73:B, 7xua:A, 7xua:B, 7xub:A, 7xub:B, 7xuc:A, 7xuc:B, 7xud:A, 7xud:B
2 3hna:A 280 261 0.7509 0.7214 0.7739 2.13e-160 3fpd:A, 3fpd:B, 3hna:B, 4i51:A, 4i51:B, 2igq:A, 2igq:B, 6mbo:A, 6mbo:B, 6mbp:A, 6mbp:B, 3mo0:A, 3mo0:B, 3mo2:A, 3mo2:B, 3mo2:C, 3mo2:D, 3mo5:A, 3mo5:B, 3mo5:C, 3mo5:D, 2rfi:A, 2rfi:B, 3sw9:A, 3sw9:B, 3swc:A, 3swc:B, 7t7m:A, 7t7m:B, 7t7m:C, 7t7m:D, 5ttg:A, 5ttg:B, 5tuz:A, 5tuz:B, 5v9j:A, 5v9j:B, 5vsd:A, 5vsd:B, 5vsf:A, 5vsf:B, 8xpt:A, 8xpt:B, 8xpt:C, 8xpt:D
3 6z2a:A 283 267 0.3680 0.3498 0.3708 3.75e-44 6box:A, 6box:B, 6bp4:B, 6bp4:A, 1mvh:A, 1mvx:A, 6z2a:B
4 2r3a:A 270 245 0.3494 0.3481 0.3837 1.02e-43 6p0r:A, 6p0r:B
5 4qen:A 472 266 0.3420 0.1949 0.3459 5.99e-41 4qeo:A, 4qep:A
6 3bo5:A 269 245 0.3160 0.3160 0.3469 6.66e-39
7 6a5m:A 488 275 0.3532 0.1947 0.3455 1.06e-38 6a5k:A
8 6a5n:A 502 261 0.3234 0.1733 0.3333 1.16e-35
9 4nj5:A 482 267 0.3086 0.1722 0.3109 1.74e-34
10 1peg:A 266 274 0.3048 0.3083 0.2993 1.58e-30 1ml9:A, 1peg:B
11 5kjh:B 807 147 0.2119 0.0706 0.3878 4.73e-21 5m5g:B
12 5wf7:B 765 146 0.2119 0.0745 0.3904 5.67e-21 5kji:B
13 5jlb:A 248 169 0.2082 0.2258 0.3314 7.65e-21 7ea8:L, 4fmu:A, 4h12:A, 6j9j:A, 5jjy:A, 5jle:A, 5lss:A, 5lsx:A, 5lsy:A, 5lsz:A, 5lt6:A, 5lt6:B, 5lt7:A, 5lt8:A, 7lzb:A, 7lzd:A, 7lzf:A, 8q5p:A, 7ty2:A, 7ty3:A, 5v21:A, 5v22:A, 6vdb:A
14 5tqr:B 809 146 0.2119 0.0705 0.3904 7.96e-21 5bjs:B, 5vk3:B
15 5kkl:B 839 143 0.2082 0.0667 0.3916 1.29e-20
16 7td5:F 447 188 0.2454 0.1477 0.3511 8.30e-20
17 7kso:A 395 188 0.2454 0.1671 0.3511 9.13e-20 7ksr:A, 7ktp:A
18 7td5:A 497 188 0.2454 0.1328 0.3511 9.95e-20
19 5wfd:B 774 112 0.1822 0.0633 0.4375 1.48e-19 5wfc:B
20 7at8:A 311 188 0.2454 0.2122 0.3511 5.44e-19
21 8tas:E 570 188 0.2454 0.1158 0.3511 5.60e-19 8tb9:E
22 6wkr:C 606 188 0.2454 0.1089 0.3511 6.07e-19 4mi0:A, 4mi5:A, 8t9g:I
23 5hyn:A 581 188 0.2454 0.1136 0.3511 6.40e-19 5hyn:F, 5hyn:K, 5hyn:Q, 5ls6:A, 5ls6:G, 5ls6:J, 5ls6:D
24 8t9g:C 536 188 0.2454 0.1231 0.3511 6.55e-19 8fyh:A, 8fyh:G
25 9c8u:A 475 188 0.2454 0.1389 0.3511 6.69e-19
26 5ij7:B 469 188 0.2454 0.1407 0.3511 7.24e-19 6b3w:A, 6b3w:B, 6c23:K, 6c24:K, 5ij7:A, 5ij8:A, 5ij8:B, 4w2r:A, 4w2r:B
27 5wg6:A 517 132 0.2007 0.1044 0.4091 1.38e-18 5wg6:C
28 8fbh:A 232 169 0.2045 0.2371 0.3254 1.43e-18 8fbg:A, 8fbg:B, 6kqp:A, 6kqq:A, 6kqq:B, 3ooi:A
29 6ine:A 247 171 0.2119 0.2308 0.3333 1.75e-18 6ago:A, 6ago:B, 3ope:A, 3ope:B, 6wzw:A, 6x0p:A, 6x0p:B, 6x0p:C, 6x0p:D, 4ynm:A, 4ynm:B, 4ynp:A, 4ynp:B, 4ypa:A, 4ypa:B, 4ypa:C, 4ypa:D, 4ype:A, 4ype:B, 4ypu:A, 4ypu:B
30 5lsu:A 231 170 0.2156 0.2511 0.3412 2.03e-17 7cro:I, 7e8d:K, 5lsu:B
31 6ven:N 218 142 0.1970 0.2431 0.3732 3.16e-17
32 6ugm:M 188 145 0.2045 0.2926 0.3793 3.41e-17
33 6cen:A 226 168 0.1970 0.2345 0.3155 3.98e-17 7crp:I, 7crq:L, 7crq:I, 7crr:I, 5upd:A
34 6uh5:M 222 138 0.2007 0.2432 0.3913 4.42e-16 6chg:C
35 7ea5:K 228 142 0.1822 0.2149 0.3451 7.07e-16
36 2w5z:A 180 151 0.1859 0.2778 0.3311 9.49e-16 5f5e:A, 5f6l:A, 6pwv:C, 6pww:C, 7u5v:A, 6u9k:A, 6u9k:B, 6u9m:A, 6u9m:B, 6u9n:A, 6u9n:B, 6u9r:A, 6u9r:B, 2w5y:A, 7w67:C, 7w6a:C, 7w6i:C, 7w6j:C
37 7w6l:C 158 156 0.1859 0.3165 0.3205 1.07e-15 5f59:A, 5f6k:C, 5f6k:E, 6kiw:K, 7w6l:E
38 6nzo:S 233 161 0.1896 0.2189 0.3168 1.41e-14 6px3:S
39 7bre:B 163 151 0.1747 0.2883 0.3113 2.12e-14 7bre:E
40 6kiu:K 179 151 0.1784 0.2682 0.3179 5.62e-14 6kiv:K, 6kix:K, 6kiz:K, 7ud5:K
41 7xpx:K 167 137 0.1710 0.2754 0.3358 1.97e-11 6boz:A, 6boz:B, 2bqz:A, 2bqz:E, 3f9w:B, 3f9w:A, 3f9w:C, 3f9w:D, 3f9x:B, 3f9x:A, 3f9x:C, 3f9x:D, 3f9y:A, 3f9y:B, 3f9z:B, 3f9z:A, 3f9z:C, 3f9z:D, 4ij8:A, 4ij8:B, 5t5g:A, 5teg:A, 5teg:B, 5th7:A, 5th7:B, 5w1y:A, 5w1y:B, 1zkk:A, 1zkk:B, 1zkk:C, 1zkk:D
42 4z4p:A 161 156 0.1822 0.3043 0.3141 2.63e-11
43 8sr6:A 451 122 0.1264 0.0754 0.2787 0.010 5czy:A, 8swi:A
44 4o30:A 217 134 0.1561 0.1935 0.3134 0.071 4o30:B, 5va6:A, 5va6:B, 5vac:A, 5vah:A, 5vah:B, 5vbc:A, 5vbc:B
45 2g46:A 119 121 0.1152 0.2605 0.2562 0.14 2g46:B, 3kmt:A, 3kmt:B, 3kmt:C
46 5ex0:A 429 86 0.0967 0.0606 0.3023 2.3 7bj1:A, 5ccl:A, 5ccm:A, 5ex3:A, 5hi7:A, 5hq8:A, 5hq8:B, 6ijl:A, 3mek:A, 7o2a:A, 7o2b:A, 7o2c:A, 6o9o:A, 8owo:A, 3oxf:A, 3oxf:B, 3oxg:A, 3oxl:A, 6p6g:A, 6p6k:A, 6p7z:A, 6paf:A, 3pdn:A, 7qlb:A, 7qnr:A, 7qnu:A, 3qwp:A, 3ru0:A, 3ru0:B, 5v37:A, 5xxd:A, 5xxg:A, 5xxj:A, 5yjo:A, 6yuh:A, 6zrb:A
47 4au7:A 243 114 0.1115 0.1235 0.2632 3.4 4au7:B, 3rq4:A
48 6c26:B 397 107 0.0967 0.0655 0.2430 4.1 8age:G, 6ezn:G, 7oci:G
49 1sqi:B 342 109 0.1152 0.0906 0.2844 7.4

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218