Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
RSVARMDGDVIIGALFSVHHQPPAEKVPERKCGEIREQYGIQRVEAMFHTLDKINADPVLLPNITLGSEIRDSCWHSSVA
LEQSIEFIRKPIAGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFDIPQIAYSATSIDLSDKTLYKYFLRVVPSDTLQARAMLDIVKRYNW
TYVSAVHTEGNYGESGMDAFKELAAQEGLCIAHSDKIYSNAGEKSFDRLLRKLRERLPKARVVVCFCEGMTVRGLLSAMR
RLGVVGEFSLIGSDGWADRDEVIEGYEVEANGGITIKLQSPEVRSFDDYFLKLRLDTNTRNPWFPEFWQHRFQCRLPGHL
LENPNFKKVCTGNESLEENYVQDSKMGFVINAIYAMAHGLQNMHHALCPGHVGLCDAMKPIDGRKLLDFLIKSSFVGVSG
EEVWFDEKGDAPGRYDIMNLQYTEANRYDYVHVGTWHEGVLNIDDYKI

The query sequence (length=448) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7dge:A 784 456 0.9754 0.5574 0.9583 0.0 1ewk:A, 1ewk:B, 1isr:A, 1iss:A, 1iss:B, 3ks9:A, 3ks9:B
2 8tao:B 771 453 0.7366 0.4280 0.7285 0.0 7fd8:A, 7fd8:B, 7fd9:A, 7fd9:B, 3lmk:A, 3lmk:B, 8t8m:A
3 6n51:B 793 460 0.7366 0.4161 0.7174 0.0 6n4x:B, 6n4y:C, 6n50:A, 6n50:B, 6n50:C, 6n51:A, 8t6j:B, 8t6j:A, 8t7h:A, 8t7h:B, 8t8m:B, 8tao:A
4 6e5v:B 447 439 0.4353 0.4362 0.4442 1.10e-125 6bsz:A, 6bsz:B, 6bt5:A, 6bt5:B, 6e5v:A
5 8jd6:R 774 440 0.4420 0.2558 0.4500 1.41e-121 7e9h:R, 7e9h:S, 8jd4:4, 8jd5:4, 8jd6:S
6 8jd5:2 785 455 0.4420 0.2522 0.4352 1.29e-120 5cni:A, 5cni:B, 5cnj:A, 5cnj:B, 7e9g:R, 7e9g:S, 8jcu:2, 8jcv:2, 8jcw:2, 8jcx:2, 8jcy:2, 8jcz:2, 8jd0:2, 8jd1:2, 8jd2:2, 8jd3:2, 5kzn:A, 5kzq:A, 7mtr:B, 7mtr:A, 7mts:A, 7mts:B, 4xaq:A, 4xaq:B, 4xas:A, 4xas:B
7 8jcu:3 765 461 0.4464 0.2614 0.4338 4.20e-120 6b7h:A, 5cnk:A, 5cnm:A, 8jcv:3, 8jcw:3, 8jcx:3, 8jcy:3, 8jcz:3, 8jd0:3, 8jd1:3, 8jd2:3, 8jd3:3, 3sm9:A, 8tr0:A, 7wih:A, 7wih:B, 4xar:A
8 7mtq:B 744 457 0.4531 0.2728 0.4442 1.52e-119 8jd4:2
9 8tr2:A 745 462 0.4420 0.2658 0.4286 2.25e-118 2e4u:A, 2e4u:B, 2e4v:A, 2e4v:B, 2e4w:A, 2e4w:B, 2e4x:A, 2e4x:B, 2e4y:A, 2e4y:B, 8tqb:A, 8tqb:B, 8tr0:B, 8tr2:B, 8trc:A, 8trc:B, 8trd:A, 8trd:B, 7wi6:A, 7wi6:B, 7wi8:A, 7wi8:B
10 5c5c:A 432 454 0.4263 0.4421 0.4207 4.09e-118
11 7epb:A 779 480 0.4420 0.2542 0.4125 9.68e-117 7epb:B, 7mtq:A
12 3mq4:A 386 453 0.3929 0.4560 0.3885 1.82e-96
13 8szi:B 802 439 0.3147 0.1758 0.3212 8.80e-62 9avg:Q, 9axf:Q, 9ayf:Q, 7dd6:A, 7dd6:B, 7dd7:A, 7dd7:B, 7m3j:A, 7m3j:B, 7sil:A, 7sil:B, 7sim:A, 7sim:B, 7sin:A, 7sin:B, 8szf:A, 8szf:B, 8szg:B
14 8szh:A 835 448 0.3147 0.1689 0.3147 2.14e-60 9asb:Q, 9asb:R, 9avg:R, 9avl:Q, 9avl:R, 9axf:R, 9ayf:R, 7dd5:A, 7dd5:B, 7e6t:B, 7e6t:A, 5fbh:B, 5fbh:A, 5fbk:A, 5fbk:B, 5k5s:A, 5k5s:B, 7m3e:A, 7m3e:B, 7m3f:A, 7m3f:B, 7m3g:A, 7m3g:B, 8szg:A, 8szh:B, 8szi:A, 8wpg:B, 8wpg:A, 8wpu:B, 8wpu:A
15 7dtv:A 779 453 0.3147 0.1810 0.3113 5.53e-60 7dtu:A, 7dtu:B, 7dtv:B
16 5k5t:A 578 467 0.3125 0.2422 0.2998 1.78e-59
17 5x2n:B 459 474 0.2768 0.2702 0.2616 6.90e-32 5x2m:B, 5x2n:D, 5x2o:B, 5x2o:D, 5x2p:B, 5x2q:B, 5x2q:D
18 5x2n:C 433 438 0.2254 0.2333 0.2306 2.24e-25 5x2m:A, 5x2m:C, 5x2n:A, 5x2o:A, 5x2o:C, 5x2p:A, 5x2p:C, 5x2q:A, 5x2q:C
19 5x2m:D 422 470 0.2634 0.2796 0.2511 3.43e-23 5x2p:D
20 7lzh:A 798 202 0.1071 0.0602 0.2376 1.51e-11 7lzh:B, 7lzh:C, 7lzh:D, 7lzi:A, 7lzi:B, 7lzi:C, 7lzi:D
21 4n0q:B 345 168 0.1116 0.1449 0.2976 6.35e-08 4n0q:A, 4n0q:C, 4n0q:D
22 6uo8:A 689 151 0.0759 0.0493 0.2252 5.20e-07 7c7q:A, 7c7s:A, 7ca3:A, 7cum:A, 7eb2:C, 4mqf:A, 4mr7:A, 4mr8:A, 4mr9:A, 4mrm:A, 4ms1:A, 4ms3:A, 4ms4:A, 6uo9:A, 6w2x:A, 6w2y:A, 6w2y:B, 6wiv:A
23 6uo8:B 696 72 0.0580 0.0374 0.3611 2.72e-06 7ca3:B, 7eb2:D
24 7cum:B 675 72 0.0580 0.0385 0.3611 3.09e-06 7c7q:B, 6w2x:B, 6wiv:B
25 4uqq:A 693 139 0.0781 0.0505 0.2518 2.87e-05 9b38:A, 9b38:B, 9b38:C, 9b38:D, 4uqq:B, 4uqq:C, 4uqq:D
26 9b36:A 842 139 0.0781 0.0416 0.2518 2.87e-05 9b35:A, 9b35:B, 9b35:C, 9b35:D, 9b36:C, 9b36:D, 9b36:B, 9b37:A, 9b37:D, 9b37:B, 9b37:C, 9b39:A, 9b39:B, 9b39:C, 9b39:D, 8fwq:A, 8fwq:D, 8fwq:B, 8fwq:C, 8fws:A, 8fws:D, 8fws:B, 8fws:C, 8fwu:A, 8fwu:B, 8fwu:C, 8fwu:D, 8fww:A, 8fww:D, 8fww:B, 8fww:C, 3h6g:A, 3h6g:B, 3h6h:A, 3h6h:B
27 5kuh:A 636 139 0.0781 0.0550 0.2518 2.88e-05 4bdl:A, 4bdl:B, 4bdm:A, 4bdm:B, 4bdm:C, 4bdm:D, 4bdn:A, 4bdn:B, 4bdn:C, 4bdn:D, 4bdo:A, 4bdo:B, 4bdo:C, 4bdo:D, 4bdq:A, 4bdq:B, 4bdr:A, 4bdr:B, 5cmk:A, 5cmk:B, 5cmm:A, 3g3f:A, 3g3f:B, 3g3g:A, 3g3g:B, 3g3h:A, 3g3h:B, 3g3i:A, 3g3i:B, 3g3j:A, 3g3j:B, 3g3k:A, 3g3k:B, 4h8i:A, 2i0b:A, 2i0b:B, 2i0b:C, 2i0c:A, 2i0c:B, 5kuh:B, 5kuh:C, 5kuh:D, 3qxm:A, 3qxm:B, 8r32:A, 8r32:B, 1s50:A, 1s7y:A, 1s7y:B, 1s9t:A, 1s9t:B, 1sd3:A, 1sd3:B, 1tt1:A, 1tt1:B, 2xxr:A, 2xxr:B, 2xxt:A, 2xxt:B, 2xxu:A, 2xxu:B, 2xxv:A, 2xxv:B, 2xxw:A, 2xxw:B, 2xxx:A, 2xxx:B, 2xxx:C, 2xxx:D, 2xxy:A, 2xxy:B, 2xxy:C, 2xxy:D, 1yae:A, 1yae:B, 1yae:C, 1yae:D, 1yae:E
28 8gc2:D 760 139 0.0781 0.0461 0.2518 4.35e-05 8f0o:B, 8gc2:A, 8gc2:B, 8gc2:C, 8gc3:B, 8gc3:C, 8gc3:D, 8gc3:A, 8gc4:A, 8gc4:B, 8gc4:C, 8gc4:D, 8gc5:A, 8gc5:B, 8gc5:C, 8gc5:D, 5kuf:A, 5kuf:B, 5kuf:C, 5kuf:D
29 4mlc:A 336 196 0.1094 0.1458 0.2500 2.84e-04 4q6b:A
30 4tlm:C 750 113 0.0625 0.0373 0.2478 4.47e-04 4tll:C
31 4tlm:A 796 113 0.0625 0.0352 0.2478 4.49e-04 6e7r:A, 6e7r:C, 6e7s:A, 6e7s:C, 6e7t:A, 6e7t:C, 6e7u:A, 6e7u:C, 6e7v:A, 6e7v:C, 6e7w:A, 6e7w:C, 6e7x:A, 6e7x:C, 5ewj:A, 5ewj:C, 5ewl:A, 5ewl:C, 5ewm:A, 5ewm:C, 8g18:A, 8g18:C, 3qel:A, 3qem:A, 3qem:C, 4tll:A, 5tq2:A, 5un1:G, 5un1:A, 5un1:C
32 1jdn:A 407 162 0.0804 0.0885 0.2222 7.18e-04 1jdp:A, 1jdp:B, 1yk0:A, 1yk0:B, 1yk1:A, 1yk1:B
33 3ip5:A 348 200 0.1027 0.1322 0.2300 0.001 3ip6:A, 3ip7:A, 3ip9:A, 3ipa:A, 3ipc:A
34 7yfg:C 659 113 0.0580 0.0395 0.2301 0.003 2a5t:A, 5dex:A, 5h8f:B, 5h8h:B, 5h8n:B, 5h8q:B, 5i2k:B, 5i2n:B, 5i56:A, 5i57:A, 5i59:A, 5kcj:B, 5kdt:B, 4kfq:A, 4kfq:B, 4nf4:A, 4nf5:A, 4nf6:A, 4nf8:A, 6ovd:A, 6ove:A, 1pb7:A, 1pb8:A, 1pb9:A, 1pbq:A, 5tp9:B, 5tpa:B, 5u8c:A, 6usu:A, 6usv:A, 6uz6:A, 6uzg:A, 6uzr:A, 6uzw:A, 6uzx:A, 5vih:A, 5vii:A, 5vij:A, 1y1m:A, 1y1z:A, 1y20:A, 7yfg:A, 7yfh:A, 7yfh:C
35 9arh:A 802 133 0.0714 0.0399 0.2406 0.011 9are:A, 9are:C, 9arf:A, 9arf:C, 9arh:C, 9bib:A, 9bib:C, 7eot:B, 7eot:D, 7eou:B, 7eou:D, 7eu7:A, 7eu7:C, 7saa:A, 7saa:C, 7sac:A, 7sac:C, 5uow:C, 6whu:A, 6whu:C, 6whv:C, 6why:A, 6why:C, 6wi0:A, 6wi0:C, 7yff:A, 7yff:C, 7yfi:A, 7yfi:C
36 7eor:B 770 113 0.0536 0.0312 0.2124 0.030 8e96:A, 8e96:C, 7eor:D, 4pe5:A, 4pe5:C, 8usw:A, 8usw:C
37 7yfl:A 708 113 0.0536 0.0339 0.2124 0.030 7yfl:C
38 5iov:B 798 64 0.0469 0.0263 0.3281 0.18 5iou:B, 5iou:D, 5iov:D, 5un1:D, 5un1:H
39 7yfr:A 691 71 0.0335 0.0217 0.2113 0.20 7yfr:C
40 4tll:D 757 64 0.0469 0.0277 0.3281 0.22 4tll:B, 4tlm:B, 5un1:B
41 4tlm:D 753 64 0.0469 0.0279 0.3281 0.23
42 9are:B 789 64 0.0446 0.0253 0.3125 0.60 9are:D, 9arf:B, 9arf:D, 9ari:B, 9ari:D, 9bib:B, 9bib:D, 6e7r:B, 6e7r:D, 6e7s:B, 6e7s:D, 6e7t:B, 6e7t:D, 6e7u:B, 6e7u:D, 6e7v:B, 6e7v:D, 6e7w:B, 6e7w:D, 6e7x:B, 6e7x:D, 5ewj:B, 5ewj:D, 5ewl:B, 5ewl:D, 5ewm:B, 5ewm:D, 8g18:B, 8g18:D, 3jpy:A, 3qel:B, 3qel:D, 3qem:B, 3qem:D, 7saa:B, 7saa:D, 7sac:B, 7sac:D, 6whu:B, 6whu:D, 6whv:B, 6whv:D, 6whw:B, 6whw:D, 6whx:B, 6whx:D
43 4pe5:D 727 64 0.0446 0.0275 0.3125 0.65 4pe5:B
44 8bos:G 320 45 0.0357 0.0500 0.3556 0.76 1wq1:G
45 7yfl:B 679 79 0.0402 0.0265 0.2278 0.80 7yfl:D
46 8wch:A 396 124 0.0603 0.0682 0.2177 4.2 8wch:B
47 5hcc:A 982 69 0.0469 0.0214 0.3043 4.4 7ad6:A, 8ayh:A, 1cfa:A, 5hcd:A, 5hce:A
48 6y01:DDD 166 26 0.0268 0.0723 0.4615 5.6 6y01:AAA, 6y01:BBB, 6y01:CCC
49 7jfz:A 547 77 0.0446 0.0366 0.2597 7.5
50 3c03:A 97 45 0.0379 0.1753 0.3778 9.3 3bzl:C, 3bzo:B, 3bzv:B, 3bzx:B, 3bzy:B, 3bzz:B, 3c00:B, 3c03:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218