Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RSTTLLALLALVLLYLVSGALVFRALEQPHEQQAQRELGEVREKFLRAHPCVSDQELGLLIKEVADALGGGADPQSSHSA
WDLGSAFFFSITIITTIGYGNVALRTDAGRLFCIFYALVGIPLFGILLAGVGDRLGSSLRHGIGHIEAIFLKWHVPPELV
RVLSAMLFLLIGCLLFVLTPTFVFCYMEDWSKLEAIYFVIVTLTTVGFGDYVAGADPRQDSPAYQPLVWFWILLGLAYFA
SVLTTIGNWLRV

The query sequence (length=252) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3um7:A 259 253 0.9762 0.9498 0.9723 2.26e-175 4i9w:A, 7lj4:A, 7lj5:A, 7lja:A, 7ljb:A, 4rue:A, 4rue:B, 4ruf:A, 4ruf:B, 3um7:B, 4wfe:A, 4wff:A, 4wfg:A, 4wfh:A
2 6cq6:B 282 255 0.5556 0.4965 0.5490 2.85e-93 6cq6:A, 6cq8:A, 6cq8:B, 6cq9:A, 6cq9:B, 4twk:A, 8ue2:A, 8ue2:B, 8ue9:A, 8ue9:B, 8uec:A, 8uec:B, 8uf6:A, 8uf6:B, 6v36:B, 6v37:A, 6v37:B, 6v3i:B, 6w7b:B, 6w7c:A, 6w7c:B, 6w7d:B, 6w7e:B, 6w82:A, 6w82:B, 6w83:A, 6w83:B, 6w84:A, 6w84:B, 6w85:A, 6w85:B, 6w86:A, 6w86:B, 6w87:A, 6w87:B, 6w88:A, 6w88:B, 6w8a:A, 6w8a:B, 6w8c:A, 6w8c:B, 6w8f:A, 6w8f:B
3 8de8:B 276 253 0.5357 0.4891 0.5336 3.43e-93 8de7:B, 8de7:A, 8de8:A, 8de9:A, 8de9:B
4 8qz3:B 266 245 0.5397 0.5113 0.5551 6.16e-92 4bw5:A, 4bw5:B, 4bw5:D, 8qz2:A, 8qz2:B, 8qz3:A, 8qz4:A, 8qz4:B, 4xdj:A, 4xdj:B, 4xdj:D, 4xdk:A, 4xdk:B, 4xdl:A, 4xdl:B, 4xdl:D
5 6v3c:B 260 251 0.5437 0.5269 0.5458 4.19e-85 6v36:A, 6v3c:A, 6v3i:A, 6w7b:A, 6w7d:A, 6w7e:A
6 8qz1:A 242 238 0.5198 0.5413 0.5504 1.42e-83 4bw5:C, 8qz1:B, 4xdj:C, 4xdk:C, 4xdk:D, 4xdl:C
7 4twk:B 241 252 0.4960 0.5187 0.4960 3.59e-82
8 8k1j:B 242 250 0.3214 0.3347 0.3240 1.26e-35 8k1j:A, 8k1q:A, 8k1q:B, 8k1v:A, 8k1v:B, 8k1z:A, 8k1z:B
9 6rv2:D 261 258 0.3254 0.3142 0.3178 6.02e-34 6rv2:A, 6rv2:B, 6rv2:C, 6rv3:A, 6rv3:B, 6rv3:C, 6rv3:D, 6rv4:A, 6rv4:B, 6rv4:C, 6rv4:D
10 3ukm:A 252 232 0.3056 0.3056 0.3319 1.68e-33 3ukm:B, 3ukm:C, 3ukm:D
11 7pxe:A 885 77 0.0952 0.0271 0.3117 2.23e-05 7pxe:B, 7pxe:C, 7pxe:D, 7pxf:A, 7pxf:B, 7pxf:C, 7pxf:D, 7pxg:A, 7pxg:B, 7pxg:C, 7pxg:D, 7pxh:A, 7pxh:B, 7pxh:C, 7pxh:D
12 7pxe:A 885 52 0.0754 0.0215 0.3654 0.11 7pxe:B, 7pxe:C, 7pxe:D, 7pxf:A, 7pxf:B, 7pxf:C, 7pxf:D, 7pxg:A, 7pxg:B, 7pxg:C, 7pxg:D, 7pxh:A, 7pxh:B, 7pxh:C, 7pxh:D
13 8ctn:B 96 39 0.0675 0.1771 0.4359 5.83e-05 8cts:B, 8ctu:B, 8cu2:B, 8cu3:B, 8cu4:B, 6dz1:B, 6fiz:C, 6fiz:D, 6fiz:E, 6fiz:G, 6fiz:H, 6fiz:J, 6fiz:L, 6fiz:N, 6fiz:A, 6fiz:O, 6fiz:P, 4r50:B, 4r6z:A, 4r6z:B, 4r7c:C, 4r8c:A, 4ro2:A, 4ro2:B, 4ro2:D
14 8ctn:B 96 70 0.0833 0.2188 0.3000 4.52e-04 8cts:B, 8ctu:B, 8cu2:B, 8cu3:B, 8cu4:B, 6dz1:B, 6fiz:C, 6fiz:D, 6fiz:E, 6fiz:G, 6fiz:H, 6fiz:J, 6fiz:L, 6fiz:N, 6fiz:A, 6fiz:O, 6fiz:P, 4r50:B, 4r6z:A, 4r6z:B, 4r7c:C, 4r8c:A, 4ro2:A, 4ro2:B, 4ro2:D
15 2q67:A 104 84 0.1071 0.2596 0.3214 1.22e-04 2q67:B, 2q68:A, 2q68:B, 2q69:A, 2q6a:A, 2q6a:B, 4ro2:C, 6v8y:A
16 2q67:A 104 70 0.0794 0.1923 0.2857 0.013 2q67:B, 2q68:A, 2q68:B, 2q69:A, 2q6a:A, 2q6a:B, 4ro2:C, 6v8y:A
17 8vt9:A 406 95 0.1032 0.0640 0.2737 1.31e-04 6cjq:A, 6cjq:B, 6cjq:C, 6cjq:D, 6cjt:A, 6cjt:B, 6cjt:C, 6cjt:D, 6cju:A, 6cju:B, 6cju:C, 6cju:D, 4d7s:A, 4d7s:B, 4d7t:A, 7rsh:A, 7rsh:B, 7rsh:C, 7rsh:D, 7rtf:A, 7rtf:B, 7rtf:C, 7rtf:D, 7rtj:A, 7rtj:B, 7rtj:C, 7rtj:D, 7tj5:A, 7tj5:B, 7tj5:C, 7tj5:D, 7tj6:A, 7tj6:B, 7tj6:C, 7tj6:D, 7tkt:A, 7tkt:B, 7tkt:C, 7tkt:D, 8vt9:D, 8vt9:B, 8vt9:C, 8vta:A, 8vta:B, 8vta:C, 8vta:D, 8vtb:A, 8vtb:B, 8vtb:C, 8vtb:D, 6vxz:A, 6vxz:B, 6vxz:C, 6vxz:D
18 8vt9:A 406 74 0.0992 0.0616 0.3378 0.32 6cjq:A, 6cjq:B, 6cjq:C, 6cjq:D, 6cjt:A, 6cjt:B, 6cjt:C, 6cjt:D, 6cju:A, 6cju:B, 6cju:C, 6cju:D, 4d7s:A, 4d7s:B, 4d7t:A, 7rsh:A, 7rsh:B, 7rsh:C, 7rsh:D, 7rtf:A, 7rtf:B, 7rtf:C, 7rtf:D, 7rtj:A, 7rtj:B, 7rtj:C, 7rtj:D, 7tj5:A, 7tj5:B, 7tj5:C, 7tj5:D, 7tj6:A, 7tj6:B, 7tj6:C, 7tj6:D, 7tkt:A, 7tkt:B, 7tkt:C, 7tkt:D, 8vt9:D, 8vt9:B, 8vt9:C, 8vta:A, 8vta:B, 8vta:C, 8vta:D, 8vtb:A, 8vtb:B, 8vtb:C, 8vtb:D, 6vxz:A, 6vxz:B, 6vxz:C, 6vxz:D
19 7ryr:A 389 95 0.1032 0.0668 0.2737 1.34e-04 7ru0:A, 7ru0:B, 7ru0:C, 7ru0:D, 7ryr:C, 7ryr:D, 7ryr:B, 7rys:A, 7rys:B, 7rys:C, 7rys:D
20 7ryr:A 389 70 0.0952 0.0617 0.3429 2.6 7ru0:A, 7ru0:B, 7ru0:C, 7ru0:D, 7ryr:C, 7ryr:D, 7ryr:B, 7rys:A, 7rys:B, 7rys:C, 7rys:D
21 7yid:A 660 47 0.0675 0.0258 0.3617 4.23e-04 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
22 8ghf:A 910 65 0.0754 0.0209 0.2923 0.001 8ghf:B, 8ghf:C, 8ghf:D, 3mt5:A, 8s3e:A, 8s3e:B, 8s3e:C, 8s3e:D, 3u6n:A, 3u6n:B, 3u6n:C, 3u6n:D, 3u6n:E, 3u6n:F, 3u6n:G, 3u6n:H, 6v22:A, 6v22:B, 6v22:C, 6v22:D, 6v38:A, 6v38:B, 6v38:C, 6v38:D, 6v5a:A, 7ynz:A, 7ynz:C, 7ynz:E, 7ynz:G, 7yo0:A, 7yo0:C, 7yo0:E, 7yo0:G, 7yo1:A, 7yo1:C, 7yo1:E, 7yo1:G, 7yo3:A, 7yo5:A, 7yo5:B, 7yo5:C, 7yo5:D
23 8ghf:A 910 59 0.0873 0.0242 0.3729 0.33 8ghf:B, 8ghf:C, 8ghf:D, 3mt5:A, 8s3e:A, 8s3e:B, 8s3e:C, 8s3e:D, 3u6n:A, 3u6n:B, 3u6n:C, 3u6n:D, 3u6n:E, 3u6n:F, 3u6n:G, 3u6n:H, 6v22:A, 6v22:B, 6v22:C, 6v22:D, 6v38:A, 6v38:B, 6v38:C, 6v38:D, 6v5a:A, 7ynz:A, 7ynz:C, 7ynz:E, 7ynz:G, 7yo0:A, 7yo0:C, 7yo0:E, 7yo0:G, 7yo1:A, 7yo1:C, 7yo1:E, 7yo1:G, 7yo3:A, 7yo5:A, 7yo5:B, 7yo5:C, 7yo5:D
24 6v35:A 914 65 0.0754 0.0208 0.2923 0.001 6v35:D, 6v35:B, 6v35:C, 8z3s:A, 8z3s:B, 8z3s:C, 8z3s:D
25 6v35:A 914 59 0.0873 0.0241 0.3729 0.30 6v35:D, 6v35:B, 6v35:C, 8z3s:A, 8z3s:B, 8z3s:C, 8z3s:D
26 4gx0:D 376 49 0.0595 0.0399 0.3061 0.010 4gx0:A, 4gx1:A, 4gx1:D, 4gx2:A, 4gx2:D, 4gx5:A, 4gx5:D
27 4gx2:B 548 49 0.0595 0.0274 0.3061 0.011 4gvl:A, 4gvl:B, 4gvl:D, 4gvl:C, 4gx0:B, 4gx0:C, 4gx1:B, 4gx1:C, 4gx2:C, 4gx5:B, 4gx5:C
28 8zyq:A 166 48 0.0516 0.0783 0.2708 0.047
29 7ssy:A 346 127 0.1429 0.1040 0.2835 0.063 7ssy:B, 7ssy:C, 7ssy:D, 7wf3:B, 7wf3:D, 7wf3:F, 7wf3:H
30 7e8e:D 459 51 0.0714 0.0392 0.3529 0.080 7e87:B, 7e87:A, 7e87:C, 7e87:D, 7e8e:B, 1nn7:A, 7ukg:A, 7ukg:B, 7ukg:C, 7ukg:D
31 8zyo:A 210 48 0.0516 0.0619 0.2708 0.099 8zyo:B, 8zyo:D, 8zyp:A, 8zyp:C, 8zyp:D, 8zyq:B, 8zyq:C, 8zyq:D
32 7e7o:A 2003 169 0.1786 0.0225 0.2663 0.16 7lkp:A
33 8hir:A 918 56 0.0833 0.0229 0.3750 0.17 8hir:B, 8hir:C, 8hir:D, 8hk6:A, 8hk6:B, 8hk6:C, 8hk6:D, 8hkf:A, 8hkf:B, 8hkf:C, 8hkf:D, 8hkk:A, 8hkk:B, 8hkk:C, 8hkk:D, 8hkm:A, 8hkm:B, 8hkm:C, 8hkm:D, 8hkq:D, 8hkq:A, 8hkq:C, 8hkq:B
34 8hir:A 918 44 0.0595 0.0163 0.3409 3.9 8hir:B, 8hir:C, 8hir:D, 8hk6:A, 8hk6:B, 8hk6:C, 8hk6:D, 8hkf:A, 8hkf:B, 8hkf:C, 8hkf:D, 8hkk:A, 8hkk:B, 8hkk:C, 8hkk:D, 8hkm:A, 8hkm:B, 8hkm:C, 8hkm:D, 8hkq:D, 8hkq:A, 8hkq:C, 8hkq:B
35 7cr7:A 354 68 0.0913 0.0650 0.3382 0.22 7cr1:A, 7cr1:B, 7cr1:C, 7cr1:D, 7cr2:B, 7cr2:C, 7cr2:D, 7cr2:A, 7cr4:A, 7cr4:B, 7cr4:D, 7cr4:F, 7cr7:G, 7cr7:B, 7cr7:D, 8ijk:A, 8ijk:C, 8ijk:B, 8ijk:D, 8izy:A, 8izy:B, 8izy:D, 8izy:C, 8j01:G, 8j01:A, 8j01:B, 8j01:D, 8j02:G, 8j02:A, 8j02:B, 8j02:D, 8j03:A, 8j03:D, 8j03:G, 8j03:I, 8j04:A, 8j04:G, 8j04:B, 8j04:D, 8w4u:A, 8w4u:B, 8w4u:D, 8w4u:G
36 8x43:A 327 68 0.0913 0.0703 0.3382 0.25 8j00:A, 8j00:B, 8j00:C, 8j00:D, 8x43:G, 8x43:C, 8x43:E
37 3rbz:A 289 77 0.1032 0.0900 0.3377 0.25 3rbz:B, 3rbz:C, 3rbz:D
38 7e7q:A 1958 155 0.1667 0.0215 0.2710 0.28
39 7byl:A 354 79 0.1032 0.0734 0.3291 0.34 7byl:C, 7byl:E, 7byl:G, 7bym:A, 7bym:C, 7bym:E, 7bym:G, 7byn:A, 7byn:C, 7byn:E, 7byn:G, 7vnp:A, 7vnp:C, 7vnp:G, 7vnp:E, 7vnq:A, 7vnq:C, 7vnq:E, 7vnq:G
40 7vnr:A 333 85 0.0952 0.0721 0.2824 0.34 7vnr:C, 7vnr:E, 7vnr:G
41 7rjt:A 902 34 0.0595 0.0166 0.4412 0.38 7rjt:B, 7rjt:C, 7rjt:D, 7rk6:A, 7rk6:B, 7rk6:C, 7rk6:D, 5tj6:A
42 6oly:C 318 78 0.0992 0.0786 0.3205 0.50 2aef:A, 2aef:B, 5bkj:A, 5bkj:C, 5bkj:E, 5bkj:G, 5bkk:A, 5bkk:C, 5bkk:G, 8fz7:A, 8fz7:C, 8fz7:E, 8fz7:G, 3kxd:A, 3kxd:B, 4l73:A, 4l73:B, 4l74:A, 4l74:B, 4l75:A, 4l75:B, 4l75:C, 4l75:D, 4l75:E, 4l75:F, 4l76:A, 4l76:B, 4l76:C, 4l76:D, 4l76:E, 4l76:F, 1lnq:A, 1lnq:B, 1lnq:C, 1lnq:D, 1lnq:E, 1lnq:F, 1lnq:G, 1lnq:H, 6oly:A, 6oly:B, 6oly:D, 3rbx:A, 3rbx:B, 3rbx:C, 3rbx:D, 3rbx:E, 3rbx:F, 6u5n:A, 6u5n:E, 6u5n:B, 6u5n:F, 6u5n:C, 6u5n:G, 6u5n:D, 6u5n:H, 6u5p:A, 6u5p:E, 6u5p:B, 6u5p:F, 6u5p:C, 6u5p:G, 6u5p:D, 6u5p:H, 6u5r:A, 6u5r:B, 6u5r:C, 6u5r:D, 6u5r:E, 6u5r:F, 6u5r:G, 6u5r:H, 6uwn:A, 6uwn:E, 6uwn:B, 6uwn:F, 6uwn:C, 6uwn:G, 6uwn:D, 6uwn:H, 6ux4:A, 6ux4:E, 6ux4:B, 6ux4:F, 6ux4:C, 6ux4:G, 6ux4:D, 6ux4:H
43 8f5b:A 1924 168 0.1786 0.0234 0.2679 0.63 7lkz:A
44 4uuj:C 111 44 0.0595 0.1351 0.3409 0.67 2bob:C, 2dwd:C, 2dwe:C, 2h8p:C, 2h8p:D, 2hfe:C, 2hfe:D, 2hg5:C, 2hg5:D, 2hvj:C, 3ifx:A, 3ifx:B, 3ifx:C, 3ifx:D, 2jk5:C, 7m2h:C, 7m2h:F, 3stz:C, 8thn:C, 2w0f:C
45 6v1x:A 446 49 0.0595 0.0336 0.3061 0.78 6v1x:B, 6v1x:C, 6v1x:D, 6v1y:A, 6v1y:B, 6v1y:C, 6v1y:D, 6v1y:M, 6v1y:N, 6v1y:O, 6v1y:P
46 6v1x:A 446 31 0.0556 0.0314 0.4516 1.8 6v1x:B, 6v1x:C, 6v1x:D, 6v1y:A, 6v1y:B, 6v1y:C, 6v1y:D, 6v1y:M, 6v1y:N, 6v1y:O, 6v1y:P
47 7m1q:A 1911 106 0.1190 0.0157 0.2830 1.0
48 2wll:B 266 56 0.0754 0.0714 0.3393 2.4
49 8pnt:A 749 45 0.0556 0.0187 0.3111 3.2 8by6:A, 6d0y:C, 1n52:A, 5oo6:D, 5oo6:G, 5oo6:J, 5oo6:M, 5oo6:P, 5oob:I, 5oob:A, 8pmp:A
50 6sg8:B 381 70 0.0714 0.0472 0.2571 4.3 6sg8:A
51 7tys:A 361 78 0.0833 0.0582 0.2692 5.3 6baa:A, 6baa:D, 6baa:B, 6baa:C, 6c3o:A, 6c3o:B, 6c3o:C, 6c3o:D, 6c3p:A, 6c3p:B, 6c3p:D, 6c3p:C, 6jb1:A, 6jb1:G, 6jb1:C, 6jb1:E, 8ti1:D, 8ti1:A, 8ti1:B, 8ti1:C, 8ti2:D, 8ti2:A, 8ti2:B, 8ti2:C, 5twv:A, 5twv:C, 5twv:E, 5twv:G, 7tys:D, 7tys:B, 7tys:C, 7tyt:A, 7tyt:D, 7tyt:B, 7tyt:C, 7u1e:B, 7u1e:C, 7u1e:D, 7u1e:A, 7u1q:A, 7u1q:B, 7u1q:C, 7u1q:D, 7u1s:A, 7u1s:D, 7u1s:B, 7u1s:C, 7u24:A, 7u24:D, 7u24:B, 7u24:C, 7u6y:A, 7u6y:B, 7u6y:C, 7u6y:D, 7uaa:B, 7uaa:C, 7uaa:D, 7w4p:A, 7w4p:C, 7w4p:E, 7w4p:G, 5ykf:A, 5ykf:C, 5ykf:E, 5ykf:G, 5ykg:A, 5ykg:C, 5ykg:E, 5ykg:G, 5yw8:C, 5yw8:E, 5yw8:G, 5yw8:A, 5yw9:C, 5yw9:E, 5yw9:G, 5yw9:A, 5ywa:A, 5ywa:C, 5ywa:E, 5ywa:G, 5ywb:A, 5ywb:C, 5ywb:E, 5ywb:G, 5ywc:A, 5ywc:C, 5ywc:E, 5ywc:G
52 8et7:A 532 51 0.0714 0.0338 0.3529 7.9 8et8:A
53 5wie:B 390 50 0.0714 0.0462 0.3600 8.3 4jta:B, 4jtc:B, 4jtd:B, 3lnm:B, 2r9r:B
54 5jjv:B 356 45 0.0556 0.0393 0.3111 8.6 5jjv:A, 5jk0:A, 5jk0:C, 5jk0:B, 5jk0:D
55 8teg:A 539 33 0.0476 0.0223 0.3636 9.1
56 5wie:H 328 50 0.0714 0.0549 0.3600 10.0 3lnm:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218