BioLiP

>protein
RRRLGVMGGTFDPIHNGHLVAASEVADRFALDEVIFVPTGQPWQKQRKVSPAEHRYLMTVIATASNPRFTVSRADIDRGG
ATYTVDTLTDLRTAHPDADLYFITGADALASILSWENWEQLFTLAKFIGVSRPGYELSSDHIAHAELPPDGLSLVEVPAL
AISSTDCRIRAGQARPIWYLVPDGVVQYVAKHRLYS

The query sequence (length=196) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4ymi:B	198	196	1.0000	0.9899	1.0000	1.76e-145	5db4:A, 5deo:A, 5deo:B, 5deo:C, 5deo:D, 5vir:A, 5vir:B, 4ymi:A
2	5db4:B	175	196	0.8878	0.9943	0.8878	7.28e-118
3	5das:A	198	197	0.7500	0.7424	0.7462	6.89e-107	6buv:B, 4s1o:A, 4ybr:A, 4ybr:B
4	5das:C	180	195	0.7194	0.7833	0.7231	1.74e-98	5das:B, 5das:D, 4s1o:B
5	1kaq:A	186	195	0.3776	0.3978	0.3795	2.51e-45	1kaq:B, 1kaq:C, 1kaq:D, 1kaq:E, 1kaq:F
6	3e27:C	189	196	0.3673	0.3810	0.3673	5.14e-43	3e27:A, 3e27:B, 3e27:D, 3hfj:A, 3hfj:B, 3mla:A, 3mla:B, 3mlb:A, 3mlb:B, 3mmx:B, 3mmx:C, 3mmx:A, 3mmx:D, 2qtn:B, 2qtr:A, 2qtr:B, 2qtr:C
7	8aih:A	184	196	0.3418	0.3641	0.3418	1.47e-37	8aii:A, 9fyb:A, 9fyb:B
8	4wso:A	227	223	0.4439	0.3833	0.3901	1.91e-33	4wso:B
9	1yum:A	212	208	0.3418	0.3160	0.3221	1.72e-32	1yum:B, 1yum:C, 1yum:D, 1yun:A, 1yun:B
10	2h2a:A	189	196	0.2959	0.3069	0.2959	1.88e-28	2h29:A, 2h29:B, 2h2a:B
11	1k4m:A	213	207	0.3316	0.3052	0.3140	1.31e-27	1k4m:B, 1k4m:C
12	1kqo:A	233	209	0.3214	0.2704	0.3014	2.43e-09	1gzu:A, 1gzu:B, 1gzu:C, 1kqn:A, 1kqn:B, 1kqn:C, 1kqn:D, 1kqn:E, 1kqn:F, 1kqo:B, 1kqo:C, 1kqo:D, 1kqo:E, 1kqo:F, 1kr2:A, 1kr2:B, 1kr2:C, 1kr2:D, 1kr2:E, 1kr2:F, 8qe8:4, 8qe8:3
13	5llt:A	205	206	0.2398	0.2293	0.2282	3.85e-08	5llt:B, 5lm3:A
14	1nup:A	213	207	0.2551	0.2347	0.2415	1.76e-05	1nup:B, 1nuq:A, 1nuq:B, 1nus:A, 1nus:B, 1nut:A, 1nut:B, 1nuu:A, 1nuu:B
15	9iye:B	173	37	0.0816	0.0925	0.4324	0.24	8i8j:A, 8i8j:B, 8i8j:C, 8i8j:D, 8i8j:E, 8i8j:F, 8i8k:A, 8i8k:B, 8i8k:C, 8i8k:D, 8i8k:E, 8i8k:F, 8i8l:A, 8i8l:B, 8i8l:C, 8i8l:D, 8i8l:E, 8i8l:F, 8i8m:A, 8i8m:B, 8i8m:C, 8i8m:D, 8i8m:E, 8i8m:F, 8i8n:A, 8i8n:B, 8i8n:C, 8i8n:D, 8i8n:E, 8i8n:F, 8i8o:A, 8i8o:B, 8i8o:C, 8i8o:D, 8i8o:E, 8i8o:F, 9iye:A, 9iye:C, 9iye:D, 9iye:E, 9iye:F, 9iyf:A, 9iyf:B, 9iyf:C, 9iyf:D, 9iyf:E, 9iyf:F, 9iyh:A, 9iyh:B, 9iyh:C, 9iyh:D, 9iyh:E, 9iyh:F, 8zn2:A, 8zn2:B, 8zn2:C, 8zn2:D, 8zn2:E, 8zn2:F, 8zn3:A, 8zn3:B, 8zn3:C, 8zn3:D, 8zn3:E, 8zn3:F
16	3nd6:A	152	34	0.0765	0.0987	0.4412	0.26	3nd6:B, 3nd6:C, 3nd6:D, 3nd6:E, 3nd6:F, 3nd7:A, 3nd7:B, 3nd7:C, 3nd7:D, 3nd7:E, 3nd7:F
17	6cck:B	160	44	0.0765	0.0938	0.3409	0.69	1b6t:B, 6b7a:A, 6b7a:B, 6b7b:A, 6b7b:B, 6b7c:A, 6b7c:B, 6b7d:A, 6b7e:B, 6b7f:A, 6b7f:B, 6cck:A, 6ccl:A, 6ccl:B, 6ccm:A, 6ccn:A, 6ccn:B, 6cco:A, 6ccq:A, 6ccq:B, 6ccs:A, 6ccs:B, 6chl:A, 6chl:B, 6chm:A, 6chm:B, 6chn:A, 6chn:B, 6cho:A, 6cho:B, 6chp:A, 6chp:B, 6chq:A, 6ckw:A, 6ckw:B, 1gn8:A, 1gn8:B, 1h1t:A, 1h1t:B, 1qjc:B
18	3otw:A	157	64	0.1020	0.1274	0.3125	0.76	3otw:D, 3otw:B, 3otw:C, 3otw:E, 3otw:F
19	4nah:C	160	31	0.0714	0.0875	0.4516	1.9	3f3m:A, 4nah:A, 4nah:B, 4nah:D, 4nah:E, 4nah:F, 4nat:A, 4nat:B, 4nat:C, 4nau:A, 4nau:B, 4nau:C
20	1f9a:A	164	31	0.0612	0.0732	0.3871	2.3	1f9a:B, 1f9a:C, 1f9a:D, 1f9a:E, 1f9a:F
21	3rza:A	373	88	0.1276	0.0670	0.2841	3.1	3rza:B
22	8cli:C	579	43	0.0714	0.0242	0.3256	4.4	8clj:C, 8clj:H
23	6yxx:EC	373	71	0.1020	0.0536	0.2817	4.6	7aoi:XP, 6yxy:EC
24	3l92:A	159	22	0.0561	0.0692	0.5000	4.7
25	1lw7:A	344	19	0.0408	0.0233	0.4211	5.7
26	6a6d:A	163	27	0.0663	0.0798	0.4815	5.9	6a75:A, 6a7d:A, 8i8p:A, 6j3m:A, 6jnh:A, 6jog:A, 6kkw:A, 5yh7:A, 5yrr:A, 5zzc:A
27	7am2:BZ	351	24	0.0459	0.0256	0.3750	6.3
28	7ybu:P	507	93	0.1224	0.0473	0.2581	9.5	7ybu:G, 7ybu:C, 7ybu:K, 7ybu:E, 7ybu:I

[Back]