Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
RRESINPWILTGFADAEGSFLLRIRKNNKSSVGYSTELGFQITLHNKDKSILENIQSTWGVGVIANSGDNAVSLKVTRFE
DLKVIIDHFEKYPLITQKYADYMLFKQAFNVMENKEHLTIEGIKELVRIKAKLNWGLTDELKKAFPEIISKERSLINKNI
PNFKWLAGFTSGDGCFFVNLIKSKSKLGVQVQLVFSITQHIRDKNLMNSLITYLGCGYIKKKNKSEFSWLDFVVTKFSDI
RDKIIPFFQEYTLIGTKLKDFEDWCKVAKLIEEKKHLTEEGLDEIKKIKLNMNKGRVF

The query sequence (length=298) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6uw0:B 295 293 0.9362 0.9458 0.9522 0.0 6uw0:A, 6uwk:A
2 6bd0:A 300 298 0.9396 0.9333 0.9396 0.0 6bda:A, 6bdb:A, 3qqy:A, 6uvw:A, 6uvw:D, 6uwg:A, 6uwh:A, 6uwj:A
3 4yhx:A 294 295 0.8121 0.8231 0.8203 1.58e-179
4 5t2n:A 291 293 0.8054 0.8247 0.8191 2.25e-170
5 5t2h:A 296 295 0.8020 0.8074 0.8102 3.55e-170
6 5thg:A 294 297 0.7852 0.7959 0.7879 2.72e-164 5thg:D
7 5t8d:A 292 293 0.7819 0.7979 0.7952 3.29e-164 5v0q:A
8 5t2o:A 293 296 0.7718 0.7850 0.7770 8.61e-162
9 7rcf:A 290 295 0.7752 0.7966 0.7831 5.31e-161 7rcc:D, 7rcc:A, 7rcc:G, 7rcd:A, 7rce:A, 7rcg:A
10 6bci:A 292 299 0.5067 0.5171 0.5050 7.40e-102 6bce:A, 6bcf:D, 6bcf:A, 6bcf:G, 6bcf:J, 6bcg:D, 6bcg:A, 6bcg:G, 6bcg:J, 6bch:A, 6bch:D, 6bch:H, 6bch:L, 6bcn:A, 6bcn:C, 6bcn:G, 6bcn:J, 6bct:A, 3r7p:A
11 4lox:A 300 297 0.4899 0.4867 0.4916 2.24e-95 5e5o:A, 5e5s:A, 5e63:A, 5e67:A, 4z1z:A, 4z1z:B, 4z20:A, 4z20:D
12 4yit:D 277 293 0.4430 0.4765 0.4505 2.38e-83 4yit:A
13 5esp:A 292 296 0.4732 0.4829 0.4764 3.60e-81 5esp:B
14 4yis:A 295 295 0.4564 0.4610 0.4610 7.60e-80 4yis:B
15 4yis:A 295 133 0.1376 0.1390 0.3083 1.14e-09 4yis:B
16 4efj:B 291 298 0.4530 0.4639 0.4530 3.94e-78 4efj:A, 4z1x:B, 4z1x:A
17 4lq0:A 298 294 0.4228 0.4228 0.4286 2.35e-75
18 4lq0:A 298 133 0.1611 0.1611 0.3609 4.72e-18
19 3e54:A 159 146 0.1510 0.2830 0.3082 1.57e-09 3e54:B
20 3mxa:A 301 216 0.1678 0.1661 0.2315 1.80e-08 4aab:A, 4aab:B, 4aad:A, 4aad:B, 4aae:A, 4aae:B, 4aaf:A, 4aaf:B, 4aag:A, 4aag:B, 4aqu:A, 4aqu:B, 4aqx:A, 4aqx:B, 1bp7:A, 1bp7:B, 1bp7:C, 1bp7:D, 6fb0:A, 6fb0:B, 6fb1:A, 6fb1:B, 6fb2:A, 6fb2:B, 6fb5:A, 6fb5:B, 6fb6:A, 6fb6:B, 6fb7:A, 6fb7:B, 6fb8:A, 6fb8:B, 6fb9:A, 6fb9:B, 1g9y:A, 1g9y:B, 1g9z:A, 1g9z:B, 2i3p:A, 2i3p:B, 2i3q:A, 2i3q:B, 3mx9:A, 3mxb:A, 3mxb:B, 3mxb:R, 3mxb:S, 1n3e:A, 1n3e:B, 1n3e:G, 1n3e:H, 1n3f:A, 1n3f:B, 1n3f:G, 1n3f:H, 1t9i:A, 1t9i:B, 1t9j:A, 1t9j:B, 1u0c:A, 1u0c:B, 1u0d:A, 1u0d:B, 2vbj:A, 2vbj:B, 2vbl:A, 2vbl:B, 2vbn:A, 2vbn:B, 2vbo:A, 2vbo:B, 2xe0:A, 2xe0:B
21 3mxa:A 301 57 0.0570 0.0565 0.2982 0.005 4aab:A, 4aab:B, 4aad:A, 4aad:B, 4aae:A, 4aae:B, 4aaf:A, 4aaf:B, 4aag:A, 4aag:B, 4aqu:A, 4aqu:B, 4aqx:A, 4aqx:B, 1bp7:A, 1bp7:B, 1bp7:C, 1bp7:D, 6fb0:A, 6fb0:B, 6fb1:A, 6fb1:B, 6fb2:A, 6fb2:B, 6fb5:A, 6fb5:B, 6fb6:A, 6fb6:B, 6fb7:A, 6fb7:B, 6fb8:A, 6fb8:B, 6fb9:A, 6fb9:B, 1g9y:A, 1g9y:B, 1g9z:A, 1g9z:B, 2i3p:A, 2i3p:B, 2i3q:A, 2i3q:B, 3mx9:A, 3mxb:A, 3mxb:B, 3mxb:R, 3mxb:S, 1n3e:A, 1n3e:B, 1n3e:G, 1n3e:H, 1n3f:A, 1n3f:B, 1n3f:G, 1n3f:H, 1t9i:A, 1t9i:B, 1t9j:A, 1t9j:B, 1u0c:A, 1u0c:B, 1u0d:A, 1u0d:B, 2vbj:A, 2vbj:B, 2vbl:A, 2vbl:B, 2vbn:A, 2vbn:B, 2vbo:A, 2vbo:B, 2xe0:A, 2xe0:B
22 3mxa:A 301 95 0.0705 0.0698 0.2211 0.009 4aab:A, 4aab:B, 4aad:A, 4aad:B, 4aae:A, 4aae:B, 4aaf:A, 4aaf:B, 4aag:A, 4aag:B, 4aqu:A, 4aqu:B, 4aqx:A, 4aqx:B, 1bp7:A, 1bp7:B, 1bp7:C, 1bp7:D, 6fb0:A, 6fb0:B, 6fb1:A, 6fb1:B, 6fb2:A, 6fb2:B, 6fb5:A, 6fb5:B, 6fb6:A, 6fb6:B, 6fb7:A, 6fb7:B, 6fb8:A, 6fb8:B, 6fb9:A, 6fb9:B, 1g9y:A, 1g9y:B, 1g9z:A, 1g9z:B, 2i3p:A, 2i3p:B, 2i3q:A, 2i3q:B, 3mx9:A, 3mxb:A, 3mxb:B, 3mxb:R, 3mxb:S, 1n3e:A, 1n3e:B, 1n3e:G, 1n3e:H, 1n3f:A, 1n3f:B, 1n3f:G, 1n3f:H, 1t9i:A, 1t9i:B, 1t9j:A, 1t9j:B, 1u0c:A, 1u0c:B, 1u0d:A, 1u0d:B, 2vbj:A, 2vbj:B, 2vbl:A, 2vbl:B, 2vbn:A, 2vbn:B, 2vbo:A, 2vbo:B, 2xe0:A, 2xe0:B
23 3eh8:A 254 270 0.2383 0.2795 0.2630 5.03e-07 3eh8:D, 3eh8:G, 1p8k:Z, 2qoj:Z
24 3eh8:A 254 100 0.0805 0.0945 0.2400 0.002 3eh8:D, 3eh8:G, 1p8k:Z, 2qoj:Z
25 5a72:B 158 87 0.0738 0.1392 0.2529 1.67e-05 5a72:A, 5a74:A, 5a74:B, 5a77:A, 5a77:B, 5a78:A, 5a78:B
26 5a72:B 158 105 0.0772 0.1456 0.2190 5.2 5a72:A, 5a74:A, 5a74:B, 5a77:A, 5a77:B, 5a78:A, 5a78:B
27 3uvf:A 255 173 0.1577 0.1843 0.2717 2.53e-05 3uvf:B
28 3uvf:A 255 99 0.0772 0.0902 0.2323 0.017 3uvf:B
29 2ex5:A 207 90 0.0772 0.1111 0.2556 2.24e-04 2ex5:B
30 1mow:A 248 88 0.0705 0.0847 0.2386 0.008 1mow:D, 1mow:G, 1mow:J
31 1mow:A 248 59 0.0537 0.0645 0.2712 0.095 1mow:D, 1mow:G, 1mow:J
32 4ml9:A 276 101 0.0805 0.0870 0.2376 0.59 4ml9:B
33 1dq3:A 454 12 0.0336 0.0220 0.8333 0.81
34 8egs:Y 586 70 0.0738 0.0375 0.3143 1.5
35 7r81:J1 236 55 0.0537 0.0678 0.2909 3.4
36 2cia:A 98 93 0.0638 0.1939 0.2043 3.7
37 4lum:A 190 54 0.0570 0.0895 0.3148 4.7 2gc0:A, 2gc0:B, 2gc1:A, 2gc1:B, 2gc2:A, 2gc2:B, 2gc3:A, 2gc3:B, 4lta:A, 4lta:B, 4luk:A, 4lul:A, 4lul:B, 4lum:B, 1qxr:A, 1qxr:B, 1qy4:A, 1qy4:B, 1x7n:A, 1x82:A
38 5ow5:A 170 144 0.1342 0.2353 0.2778 6.6 5ow5:C
39 4jie:A 484 71 0.0705 0.0434 0.2958 8.6 4re2:A, 4re3:A, 4re4:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218