Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RREIKIEGDLVLGGLFPINEKGTGTEECGRINEDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQS
LEFVRASLIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLSDKSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFN
WTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQEARLRNISIATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAAS
RANASFTWVASDGWGAQESIIKGSEHVAYGAITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNNHRNPWFRDFWEQKFQCSLQRVCDK
HLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHALHKMQRTLCPNTTKLCDAMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPDSIVKFDTF
GDGMGRYNVFNFQNVGGKYSYLKVGHWAETLSLDVNSIHWSRNS

The query sequence (length=444) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8jcu:3 765 458 0.9977 0.5791 0.9672 0.0 6b7h:A, 5cnk:A, 5cnm:A, 8jcv:3, 8jcw:3, 8jcx:3, 8jcy:3, 8jcz:3, 8jd0:3, 8jd1:3, 8jd2:3, 8jd3:3, 3sm9:A, 8tr0:A, 7wih:A, 7wih:B, 4xar:A
2 8tr2:A 745 451 0.9640 0.5745 0.9490 0.0 2e4u:A, 2e4u:B, 2e4v:A, 2e4v:B, 2e4w:A, 2e4w:B, 2e4x:A, 2e4x:B, 2e4y:A, 2e4y:B, 8tqb:A, 8tqb:B, 8tr0:B, 8tr2:B, 8trc:A, 8trc:B, 8trd:A, 8trd:B, 7wi6:A, 7wi6:B, 7wi8:A, 7wi8:B
3 7mtq:B 744 445 0.7005 0.4180 0.6989 0.0 8jd4:2
4 8jd5:2 785 449 0.6982 0.3949 0.6904 0.0 5cni:A, 5cni:B, 5cnj:A, 5cnj:B, 7e9g:R, 7e9g:S, 8jcu:2, 8jcv:2, 8jcw:2, 8jcx:2, 8jcy:2, 8jcz:2, 8jd0:2, 8jd1:2, 8jd2:2, 8jd3:2, 5kzn:A, 5kzq:A, 7mtr:B, 7mtr:A, 7mts:A, 7mts:B, 4xaq:A, 4xaq:B, 4xas:A, 4xas:B
5 7epb:A 779 470 0.7027 0.4005 0.6638 0.0 7epb:B, 7mtq:A
6 6e5v:B 447 451 0.4865 0.4832 0.4789 4.11e-148 6bsz:A, 6bsz:B, 6bt5:A, 6bt5:B, 6e5v:A
7 5c5c:A 432 443 0.4820 0.4954 0.4831 1.39e-143
8 8jd6:R 774 442 0.4977 0.2855 0.5000 1.78e-141 7e9h:R, 7e9h:S, 8jd4:4, 8jd5:4, 8jd6:S
9 7dge:A 784 465 0.4527 0.2564 0.4323 6.39e-120 1ewk:A, 1ewk:B, 1isr:A, 1iss:A, 1iss:B, 3ks9:A, 3ks9:B
10 8tao:B 771 463 0.4459 0.2568 0.4276 1.03e-118 7fd8:A, 7fd8:B, 7fd9:A, 7fd9:B, 3lmk:A, 3lmk:B, 8t8m:A
11 3mq4:A 386 439 0.4437 0.5104 0.4487 3.13e-118
12 6n51:B 793 470 0.4459 0.2497 0.4213 1.01e-117 6n4x:B, 6n4y:C, 6n50:A, 6n50:B, 6n50:C, 6n51:A, 8t6j:B, 8t6j:A, 8t7h:A, 8t7h:B, 8t8m:B, 8tao:A
13 8szi:B 802 471 0.3829 0.2120 0.3609 1.36e-71 9avg:Q, 9axf:Q, 9ayf:Q, 7dd6:A, 7dd6:B, 7dd7:A, 7dd7:B, 7m3j:A, 7m3j:B, 7sil:A, 7sil:B, 7sim:A, 7sim:B, 7sin:A, 7sin:B, 8szf:A, 8szf:B, 8szg:B
14 8szh:A 835 481 0.3829 0.2036 0.3534 3.93e-70 9asb:Q, 9asb:R, 9avg:R, 9avl:Q, 9avl:R, 9axf:R, 9ayf:R, 7dd5:A, 7dd5:B, 7e6t:B, 7e6t:A, 5fbh:B, 5fbh:A, 5fbk:A, 5fbk:B, 5k5s:A, 5k5s:B, 7m3e:A, 7m3e:B, 7m3f:A, 7m3f:B, 7m3g:A, 7m3g:B, 8szg:A, 8szh:B, 8szi:A, 8wpg:B, 8wpg:A, 8wpu:B, 8wpu:A
15 7dtv:A 779 486 0.3829 0.2182 0.3498 1.44e-69 7dtu:A, 7dtu:B, 7dtv:B
16 5k5t:A 578 509 0.3874 0.2976 0.3379 1.11e-68
17 5x2n:B 459 464 0.2950 0.2854 0.2823 1.52e-38 5x2m:B, 5x2n:D, 5x2o:B, 5x2o:D, 5x2p:B, 5x2q:B, 5x2q:D
18 5x2m:D 422 468 0.2838 0.2986 0.2692 5.81e-30 5x2p:D
19 5x2n:C 433 468 0.2680 0.2748 0.2543 6.51e-30 5x2m:A, 5x2m:C, 5x2n:A, 5x2o:A, 5x2o:C, 5x2p:A, 5x2p:C, 5x2q:A, 5x2q:C
20 6uo8:B 696 161 0.1059 0.0675 0.2919 3.16e-10 7ca3:B, 7eb2:D
21 7cum:B 675 161 0.1059 0.0696 0.2919 4.26e-10 7c7q:B, 6w2x:B, 6wiv:B
22 7lzh:A 798 266 0.1419 0.0789 0.2368 5.33e-10 7lzh:B, 7lzh:C, 7lzh:D, 7lzi:A, 7lzi:B, 7lzi:C, 7lzi:D
23 6uo8:A 689 359 0.1644 0.1060 0.2033 1.59e-07 7c7q:A, 7c7s:A, 7ca3:A, 7cum:A, 7eb2:C, 4mqf:A, 4mr7:A, 4mr8:A, 4mr9:A, 4mrm:A, 4ms1:A, 4ms3:A, 4ms4:A, 6uo9:A, 6w2x:A, 6w2y:A, 6w2y:B, 6wiv:A
24 4tlm:C 750 145 0.0878 0.0520 0.2690 4.28e-07 4tll:C
25 4tlm:A 796 145 0.0878 0.0490 0.2690 5.01e-07 6e7r:A, 6e7r:C, 6e7s:A, 6e7s:C, 6e7t:A, 6e7t:C, 6e7u:A, 6e7u:C, 6e7v:A, 6e7v:C, 6e7w:A, 6e7w:C, 6e7x:A, 6e7x:C, 5ewj:A, 5ewj:C, 5ewl:A, 5ewl:C, 5ewm:A, 5ewm:C, 8g18:A, 8g18:C, 3qel:A, 3qem:A, 3qem:C, 4tll:A, 5tq2:A, 5un1:G, 5un1:A, 5un1:C
26 7yfg:C 659 142 0.0788 0.0531 0.2465 1.01e-06 2a5t:A, 5dex:A, 5h8f:B, 5h8h:B, 5h8n:B, 5h8q:B, 5i2k:B, 5i2n:B, 5i56:A, 5i57:A, 5i59:A, 5kcj:B, 5kdt:B, 4kfq:A, 4kfq:B, 4nf4:A, 4nf5:A, 4nf6:A, 4nf8:A, 6ovd:A, 6ove:A, 1pb7:A, 1pb8:A, 1pb9:A, 1pbq:A, 5tp9:B, 5tpa:B, 5u8c:A, 6usu:A, 6usv:A, 6uz6:A, 6uzg:A, 6uzr:A, 6uzw:A, 6uzx:A, 5vih:A, 5vii:A, 5vij:A, 1y1m:A, 1y1z:A, 1y20:A, 7yfg:A, 7yfh:A, 7yfh:C
27 9arh:A 802 147 0.0833 0.0461 0.2517 2.33e-06 9are:A, 9are:C, 9arf:A, 9arf:C, 9arh:C, 9bib:A, 9bib:C, 7eot:B, 7eot:D, 7eou:B, 7eou:D, 7eu7:A, 7eu7:C, 7saa:A, 7saa:C, 7sac:A, 7sac:C, 5uow:C, 6whu:A, 6whu:C, 6whv:C, 6why:A, 6why:C, 6wi0:A, 6wi0:C, 7yff:A, 7yff:C, 7yfi:A, 7yfi:C
28 7eor:B 770 142 0.0766 0.0442 0.2394 2.62e-06 8e96:A, 8e96:C, 7eor:D, 4pe5:A, 4pe5:C, 8usw:A, 8usw:C
29 7yfl:A 708 142 0.0766 0.0480 0.2394 3.06e-06 7yfl:C
30 7yfr:A 691 144 0.0811 0.0521 0.2500 1.09e-05 7yfr:C
31 5kuh:A 636 165 0.0968 0.0676 0.2606 9.74e-05 4bdl:A, 4bdl:B, 4bdm:A, 4bdm:B, 4bdm:C, 4bdm:D, 4bdn:A, 4bdn:B, 4bdn:C, 4bdn:D, 4bdo:A, 4bdo:B, 4bdo:C, 4bdo:D, 4bdq:A, 4bdq:B, 4bdr:A, 4bdr:B, 5cmk:A, 5cmk:B, 5cmm:A, 3g3f:A, 3g3f:B, 3g3g:A, 3g3g:B, 3g3h:A, 3g3h:B, 3g3i:A, 3g3i:B, 3g3j:A, 3g3j:B, 3g3k:A, 3g3k:B, 4h8i:A, 2i0b:A, 2i0b:B, 2i0b:C, 2i0c:A, 2i0c:B, 5kuh:B, 5kuh:C, 5kuh:D, 3qxm:A, 3qxm:B, 8r32:A, 8r32:B, 1s50:A, 1s7y:A, 1s7y:B, 1s9t:A, 1s9t:B, 1sd3:A, 1sd3:B, 1tt1:A, 1tt1:B, 2xxr:A, 2xxr:B, 2xxt:A, 2xxt:B, 2xxu:A, 2xxu:B, 2xxv:A, 2xxv:B, 2xxw:A, 2xxw:B, 2xxx:A, 2xxx:B, 2xxx:C, 2xxx:D, 2xxy:A, 2xxy:B, 2xxy:C, 2xxy:D, 1yae:A, 1yae:B, 1yae:C, 1yae:D, 1yae:E
32 4uqq:A 693 165 0.0968 0.0620 0.2606 1.27e-04 9b38:A, 9b38:B, 9b38:C, 9b38:D, 4uqq:B, 4uqq:C, 4uqq:D
33 9b36:A 842 165 0.0968 0.0511 0.2606 1.29e-04 9b35:A, 9b35:B, 9b35:C, 9b35:D, 9b36:C, 9b36:D, 9b36:B, 9b37:A, 9b37:D, 9b37:B, 9b37:C, 9b39:A, 9b39:B, 9b39:C, 9b39:D, 8fwq:A, 8fwq:D, 8fwq:B, 8fwq:C, 8fws:A, 8fws:D, 8fws:B, 8fws:C, 8fwu:A, 8fwu:B, 8fwu:C, 8fwu:D, 8fww:A, 8fww:D, 8fww:B, 8fww:C, 3h6g:A, 3h6g:B, 3h6h:A, 3h6h:B
34 8gc2:D 760 165 0.0968 0.0566 0.2606 1.59e-04 8f0o:B, 8gc2:A, 8gc2:B, 8gc2:C, 8gc3:B, 8gc3:C, 8gc3:D, 8gc3:A, 8gc4:A, 8gc4:B, 8gc4:C, 8gc4:D, 8gc5:A, 8gc5:B, 8gc5:C, 8gc5:D, 5kuf:A, 5kuf:B, 5kuf:C, 5kuf:D
35 4mlc:A 336 152 0.0991 0.1310 0.2895 0.002 4q6b:A
36 1jdn:A 407 195 0.0968 0.1057 0.2205 0.29 1jdp:A, 1jdp:B, 1yk0:A, 1yk0:B, 1yk1:A, 1yk1:B
37 4yed:D 255 123 0.0698 0.1216 0.2520 0.42 4d79:A, 4d79:B, 4d79:C, 4d79:D, 4d7a:A, 4d7a:B, 4d7a:D, 4rdh:A, 4rdh:B, 4rdh:C, 4rdh:D, 4rdi:A, 4rdi:B, 4rdi:C, 4rdi:D, 4yed:A, 4yed:B, 4yed:C
38 8wch:A 396 68 0.0473 0.0530 0.3088 0.72 8wch:B
39 4rul:A 823 85 0.0518 0.0279 0.2706 0.95 1cy1:A, 1cy2:A, 1cy4:A, 1cy6:A, 1cy7:A, 1cy8:A, 1mw8:X, 3px7:A
40 2bsl:A 311 61 0.0450 0.0643 0.3279 1.1 2bsl:B, 2bx7:A, 2bx7:B, 1dor:A, 1dor:B, 2dor:A, 2dor:B, 1jqv:A, 1jqv:B, 1jqx:A, 1jqx:B, 1jrb:A, 1jrb:B, 1jrc:A, 1jrc:B, 1jub:A, 1jub:B, 1jue:A, 1jue:B, 1ovd:A, 1ovd:B
41 4jb0:A 367 188 0.0878 0.1063 0.2074 1.7 4eyq:A, 4fb4:A, 3tx6:A, 3uk0:A, 3ukj:A
42 5iov:B 798 186 0.0923 0.0514 0.2204 3.0 5iou:B, 5iou:D, 5iov:D, 5un1:D, 5un1:H
43 6rm3:SAA 97 55 0.0360 0.1649 0.2909 4.9
44 3r11:B 364 70 0.0541 0.0659 0.3429 6.3 3r0u:A, 3r10:A, 3r11:A, 3r1z:A, 3r1z:B
45 4tlm:D 753 186 0.0923 0.0544 0.2204 7.4
46 4tll:D 757 186 0.0923 0.0542 0.2204 7.9 4tll:B, 4tlm:B, 5un1:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218