Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RRALRLGVNGLPNSLEPVNAISNVGPRIVNQIFDTLIARDFFAKGAPGNAIDLVPALAESWERIDEKSVRFKLRQKVMFH
DGVELTADDVAYTFSSERLWGPEAIKKIPLGKSYSLDFDEPVVEDKYTVTLRTKTPSYLIETFVASWMSRIVPKEYYKKL
GAVDFGNKPVGTGPYKFVEFVAGDRVVLEANDAYWGPKPTASKITYQIVAEPATRVAGLISEYDIITTLTPDDIQLINSY
PDLETRGTLIENFHMFTFNMNQEVFKDKKLRRALALAVNRPIMVEALWKKQASIPAGFNFPNYGETFDPKRKAMEYNVEE
AKRLVKESGYDGTPITYHTMGNYYANAMPALMMMIEMWKQIGVNVVMKTYAPGSFPPDNQTWMRNWSNGQWMTDAYATIV
PEFGPNGQVQKRWGWKAPAEFNELCQKVTVLPNGKERFDAYNRMRDIFEEEAPAVILYQPYDVYAARKDVHWKPVSFEMM
EFRNNLSFG

The query sequence (length=489) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8cko:A 492 490 1.0000 0.9939 0.9980 0.0 8ckd:A, 8cke:A, 6i7w:A, 4ra1:A, 4ze9:A, 4zeb:A, 4zeb:B, 4zec:A, 4zed:A, 4zei:A, 4zek:A
2 8ch2:A 479 478 0.7935 0.8100 0.8117 0.0 8ch1:A, 8ch3:A, 8chc:A, 8ci6:A, 8cju:A
3 8caw:A 491 489 0.7485 0.7454 0.7485 0.0 8cay:A, 8cb9:A, 8cdo:A
4 8upi:A 510 322 0.2127 0.2039 0.3230 2.21e-27
5 1dpp:A 507 453 0.2372 0.2288 0.2561 7.89e-27 1dpp:C, 1dpp:E, 1dpp:G
6 1xoc:A 504 504 0.2515 0.2440 0.2440 2.16e-24
7 6hlx:A 491 502 0.2679 0.2668 0.2610 2.65e-23
8 5f1q:A 513 451 0.2352 0.2242 0.2550 8.43e-23 5f1q:B
9 6ofq:A 512 485 0.2352 0.2246 0.2371 4.19e-22 6pu3:A
10 5z99:A 485 327 0.1738 0.1753 0.2599 1.17e-21 5yyb:A, 5yyb:B
11 3m8u:A 508 455 0.2290 0.2205 0.2462 6.42e-21
12 6tfx:B 494 357 0.1943 0.1923 0.2661 3.23e-20 6tfq:A, 6tfq:B, 6tfs:A, 6tfs:B, 6tfx:A
13 1b05:A 517 480 0.2393 0.2263 0.2437 3.56e-20 1b0h:A, 1b1h:A, 1b2h:A, 1b32:A, 1b3f:A, 1b3g:A, 1b3h:A, 1b3l:A, 1b3l:C, 1b40:A, 1b46:A, 1b4h:A, 1b4z:A, 1b51:A, 1b52:A, 1b58:A, 1b5h:A, 1b5i:A, 1b5j:A, 1b6h:A, 1b7h:A, 1b9j:A, 1jet:A, 1jeu:A, 1jev:A, 1ola:A, 1olc:A, 2olb:A, 1qka:A, 1qkb:A, 2rkm:A
14 4oev:A 494 296 0.1616 0.1599 0.2669 3.56e-18 4oeu:A, 4oeu:B, 4oev:B
15 4qfl:A 507 372 0.2004 0.1933 0.2634 6.45e-18 4qfl:B, 4qfn:A, 4qfn:B, 4qfo:A, 4qfo:B, 4qfp:A, 4qfp:B
16 3tcf:A 517 376 0.2147 0.2031 0.2793 8.12e-18 3tcf:B, 3tcf:C, 3tcf:D, 3tcf:E, 3tcf:F, 3tcf:G, 3tcf:H, 3tcg:A, 3tcg:B, 3tcg:C, 3tcg:D, 3tcg:E, 3tcg:F, 3tcg:G, 3tcg:H
17 4oes:A 498 325 0.1881 0.1847 0.2831 1.66e-17
18 8ay0:B 496 491 0.2168 0.2137 0.2159 1.06e-16 8ay0:A, 8ay0:C
19 4ofo:A 497 337 0.1636 0.1610 0.2374 1.60e-15 4ofl:A, 4ofl:B, 4ofo:B, 4ofo:C, 4ofo:D
20 2z23:A 517 473 0.2127 0.2012 0.2199 1.92e-15
21 7og0:B 498 491 0.2168 0.2129 0.2159 5.58e-15 7ofw:A, 7ofz:A, 7og0:A
22 1uqw:A 487 352 0.1820 0.1828 0.2528 1.32e-14 1uqw:B
23 5yh8:A 510 473 0.2311 0.2216 0.2389 1.03e-13 5yhe:A, 5yhe:B, 5yhg:A
24 3zs6:A 506 351 0.1902 0.1838 0.2650 1.16e-13
25 4gl8:A 500 353 0.1779 0.1740 0.2465 3.19e-13 4gl8:B
26 3o9p:A 509 484 0.2209 0.2122 0.2231 5.30e-13
27 7kz9:A 478 311 0.1431 0.1464 0.2251 4.41e-12 7kz9:B
28 8wda:A 517 344 0.1738 0.1644 0.2471 5.05e-12 6e3d:A, 6e4d:A, 7jls:A
29 6dtg:A 522 375 0.1759 0.1648 0.2293 1.86e-11 6dqq:A, 6dqr:A, 6dqt:A, 6dqu:A, 6dtf:A, 6dth:A
30 3ryb:A 563 353 0.1616 0.1403 0.2238 2.79e-11 3drf:A, 3drg:A, 3drh:A, 3dri:A, 3drj:A, 3drk:A, 3rya:A
31 4pfu:B 542 404 0.1963 0.1771 0.2376 4.05e-11 5hm4:B, 4pfu:A, 4pfw:A, 4pfw:B
32 3e3k:B 500 330 0.1718 0.1680 0.2545 8.31e-11 7a0c:A, 7a0c:B, 4dcx:A, 4dcx:B, 4dcy:A, 4dcy:B, 3dp8:A, 3dp8:B, 3dp8:C, 3e3k:A, 3e3k:C, 4i8c:A, 4i8c:B, 4i8c:C, 4i9d:A, 4i9d:B, 5l8d:A, 5l8d:B, 3mvw:A, 3mvw:B, 3mvx:A, 3mvx:B, 3mvy:A, 3mvy:B, 3mvz:A, 3mvz:B, 3mw0:A, 3mw0:B, 5mwu:A, 5mwu:B, 3mz9:A, 3mz9:B, 3mzb:A, 3mzb:B, 2noo:A, 5on0:A, 5on0:B, 5on1:A, 5on1:B, 5on4:A, 5on4:B, 5on5:A, 5on5:B, 5on8:A, 5on8:B, 5on9:A, 5on9:B, 6r4q:A, 6r4q:B, 8spm:A, 1zlq:A, 1zlq:B
33 4ofj:A 465 280 0.1370 0.1441 0.2393 1.24e-10 3rqt:A, 4xkn:A, 4xkp:A, 4xkq:A, 4xkr:A
34 4pfy:A 539 358 0.2004 0.1818 0.2737 1.25e-09 4pft:A, 4pft:B, 4pfy:B
35 5kzt:B 510 357 0.1779 0.1706 0.2437 2.53e-08 5kzt:A
36 6lu4:A 481 291 0.1534 0.1559 0.2577 1.06e-07 6lu3:A
37 8arn:A 509 507 0.2290 0.2200 0.2209 2.74e-07 8are:A, 8arn:B
38 7z8e:A 590 306 0.1472 0.1220 0.2353 6.17e-07
39 6npo:A 518 272 0.1472 0.1390 0.2647 1.01e-06
40 7z6f:E 581 311 0.1493 0.1256 0.2347 4.47e-06 7atr:A, 8fsq:A, 8fsr:A, 8fss:A
41 7ebi:A 537 300 0.1431 0.1304 0.2333 7.98e-06 7ebm:A, 6lzq:A, 6lzt:A, 6lzu:A, 6lzv:A, 6lzw:A
42 4gfr:A 529 298 0.1493 0.1380 0.2450 1.20e-05 8i5j:A, 8i5j:B, 8i5k:A, 1zu0:A
43 3i5o:A 582 481 0.2045 0.1718 0.2079 2.13e-05 3i5o:B, 4jsd:A, 4jso:A, 2o7i:A
44 8j5u:A 534 150 0.0757 0.0693 0.2467 2.43e-04 8j5q:A, 8j5s:A
45 2d5w:A 602 357 0.1595 0.1296 0.2185 2.94e-04 2d5w:B
46 2wop:A 554 186 0.0879 0.0776 0.2312 0.002 2wok:A
47 7veu:A 612 308 0.1472 0.1176 0.2338 0.012 7vev:A, 7vew:A, 7vew:B
48 1gax:A 862 135 0.0695 0.0394 0.2519 0.51 1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
49 4gyi:A 339 97 0.0491 0.0708 0.2474 1.9
50 7wq5:A 172 131 0.0654 0.1860 0.2443 3.0 7wq5:B
51 7fdz:A 417 82 0.0511 0.0600 0.3049 4.2
52 8g7m:G 343 114 0.0573 0.0816 0.2456 4.4
53 5oyn:A 589 66 0.0491 0.0407 0.3636 8.2 5oyn:B, 5oyn:C, 5oyn:D
54 8eew:A 766 108 0.0409 0.0261 0.1852 9.2 8eew:B, 8eff:A, 8eff:B, 8eff:C, 8eff:D, 8efr:A, 8efr:B, 8efr:C, 8efr:K, 8efr:D, 8efr:L, 8efr:E, 8efr:M, 8efr:F, 8efr:N, 8efr:G, 8efr:O, 8efr:H, 8efr:P, 8efr:I, 8efr:Q, 8efr:J, 8efr:R, 6jtg:A
55 7s2z:B 173 102 0.0491 0.1387 0.2353 9.8 6o0w:A, 7s2z:A, 7s2z:C, 7s2z:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218