RPSGTYAGLPIADYGDAPPLSTKTMFWRTSPEKLPPGAWEPAYLGSKDERVDGPSLQQVMRDQLKPYSEPRGLLPPQEIL
DAVCDAIENRLENTLEPQKPWTFKKACESLDKNTSSGYPYHKQKSKDWTGSAFIGDLGDQATHANNMYEMGKSMRPIYTA
ALKDELVKPDKIYGKIKKRLLWGSDLGTMIRAARAFGPFCDALKETCIFNPIRVGMSMNEDGPFIFARHANFRYHMDADY
TRWDSTQQRAILKRAGDIMVRLSPEPDLARVVMDDLLAPSLLDVGDYKIVVEEGLPSGCPCTTQLNSLAHWILTLCAMVE
VTRVDPDIVMQESEFSFYGDDEVVSTNLELDMVKYTMALRRYGLLPTRADKEEGPLERRQTLQGISFLRRAIVGDQFGWY
GRLDRASIDRQLLWTKGPNHQNPFETLPGHAQRPSQLMALLGEAAMHGEKYYRTVASRVSKEAAQSGIEMVVPRHRSVLR
WVRFGT
The query sequence (length=486) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
| # | Hit | Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
E-value | Homologs to hit |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 3qid:A | 492 | 486 | 1.0000 | 0.9878 | 1.0000 | 0.0 | 3nai:A, 3nai:B, 3nai:C, 4nru:A, 4nru:B, 4nru:C, 4nru:D, 4nru:E, 4nru:F, 4o4r:A, 4o4r:B, 4o4r:C, 3qid:B, 3qid:C, 3sfg:A, 3sfg:B, 3sfg:C, 3sfu:A, 3sfu:B, 3sfu:C, 3upf:A, 3upf:B, 3upf:C, 3ur0:B, 3ur0:C |
| 2 | 1sh3:B | 503 | 482 | 0.5947 | 0.5746 | 0.5996 | 0.0 | 3bsn:A, 3bso:A, 3h5x:A, 3h5y:A, 4lq3:A, 4lq9:A, 4nrt:A, 4qpx:A, 1sh3:A, 5tsn:A |
| 3 | 1khw:B | 497 | 448 | 0.2778 | 0.2716 | 0.3013 | 7.78e-41 | 1khw:A |
| 4 | 4nyz:A | 460 | 397 | 0.2099 | 0.2217 | 0.2569 | 6.70e-13 | |
| 5 | 5xe0:A | 457 | 409 | 0.2078 | 0.2210 | 0.2469 | 9.73e-13 | 5zit:A |
| 6 | 4k50:A | 460 | 415 | 0.2181 | 0.2304 | 0.2554 | 1.15e-12 | 4k50:I, 4k50:E, 4k50:M, 1tp7:A |
| 7 | 6lse:A | 464 | 398 | 0.1996 | 0.2091 | 0.2437 | 4.29e-10 | 5f8g:A, 5f8h:A, 5f8i:A, 5f8j:A, 5f8l:A, 5f8m:A, 5f8n:A, 4ika:A, 6kwq:A, 6kwr:A, 6lsf:A, 6lsg:A, 6lsh:A, 3n6m:A, 3n6n:A, 7w9s:A, 5y6z:A, 5y6z:E |
| 8 | 3cdu:A | 468 | 330 | 0.1708 | 0.1774 | 0.2515 | 7.73e-10 | 3cdw:A, 4k4x:A, 4k4x:E, 4k4x:I, 4k4x:M, 4k4y:A, 4k4y:E, 4k4y:I, 4k4y:M, 4k4z:A, 4k4z:E, 4k4z:I, 4k4z:M, 4y2a:A, 4y34:A |
| 9 | 2ijd:1 | 644 | 332 | 0.1687 | 0.1273 | 0.2470 | 4.24e-08 | 4dcd:A, 2ijd:2, 2ily:A, 2ilz:A, 2im0:A, 2im1:A, 2im2:A, 2im3:A, 4k4s:A, 4k4s:E, 4k4t:A, 4k4t:E, 4k4u:A, 4k4u:E, 4k4v:A, 4k4v:E, 4k4w:A, 4k4w:E, 3ol6:A, 3ol6:E, 3ol6:I, 3ol6:M, 3ol7:A, 3ol7:E, 3ol7:I, 3ol7:M, 3ol8:A, 3ol8:E, 3ol8:I, 3ol8:M, 3ol9:A, 3ol9:E, 3ol9:I, 3ol9:M, 3ola:A, 3ola:E, 3ola:I, 3ola:M, 3olb:A, 3olb:E, 3olb:I, 3olb:M, 1ra7:A |
| 10 | 4wyw:A | 479 | 464 | 0.2202 | 0.2234 | 0.2306 | 7.25e-07 | 8c1n:A, 8c1n:B, 8c2p:A, 2d7s:A, 2e9r:X, 2e9t:A, 2e9t:D, 2e9z:A, 2ec0:A, 2ec0:D, 2f8e:X, 6gvy:A, 4iqx:A, 5jxs:A, 3klv:A, 3kmq:A, 3kms:A, 3kna:A, 3koa:A, 5n95:A, 3nl0:A, 3nma:A, 1wne:A, 4wyl:A, 4wzm:A, 4wzq:A, 4x2b:A |
| 11 | 1rdr:A | 316 | 94 | 0.0576 | 0.0886 | 0.2979 | 0.21 | |
| 12 | 7v40:A | 432 | 54 | 0.0432 | 0.0486 | 0.3889 | 0.98 | 7v41:A, 7v42:A, 7v43:A, 7v44:A, 7v45:A, 7v46:A |
| 13 | 9jd2:A | 273 | 125 | 0.0658 | 0.1172 | 0.2560 | 1.0 | 9jhv:A, 1wta:A |
| 14 | 3t94:A | 270 | 128 | 0.0658 | 0.1185 | 0.2500 | 1.4 | 2a8y:A, 2a8y:B, 2a8y:C, 2a8y:D, 2a8y:E, 2a8y:F, 2a8y:G, 2a8y:H, 2a8y:I, 2a8y:J, 2a8y:K, 2a8y:L, 3t94:B, 3t94:C, 3t94:D, 3t94:E, 3t94:F |
| 15 | 6xi2:A | 528 | 63 | 0.0473 | 0.0436 | 0.3651 | 1.8 | 7e9j:A, 7e9j:B, 7e9k:A, 7e9k:B, 7e9k:D, 7e9k:E, 7e9l:A, 7e9l:B, 8kb7:A, 8kb7:B, 8kb7:C, 8kb7:D, 6xfi:A, 6xi2:D |
| 16 | 7xva:A | 226 | 47 | 0.0288 | 0.0619 | 0.2979 | 3.2 | |
| 17 | 3b70:A | 357 | 57 | 0.0370 | 0.0504 | 0.3158 | 4.3 | 3b6z:A, 3gqv:A |
| 18 | 1sza:B | 140 | 34 | 0.0309 | 0.1071 | 0.4412 | 6.1 | 2bf0:X |
| 19 | 3g27:A | 81 | 66 | 0.0391 | 0.2346 | 0.2879 | 6.9 |
umich.edu