BioLiP

>protein
RPGGDTIFGKIIRKEIPAKIIFEDDRCLAFHDISPQAPTHFLVIPKKHISQISVAEDDDESLLGHLMIVGKKCAADLGLN
KGYRMVVNEGSDGGQSVYHVHLHVLGGRQMHWPPG

The query sequence (length=115) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6yqm:AAA	117	115	1.0000	0.9829	1.0000	7.84e-83	1av5:B, 6b42:A, 5ed3:B, 5ed6:B, 5emt:A, 5emt:B, 4eqe:B, 4eqg:B, 4eqh:B, 5i2e:A, 5i2e:B, 5i2f:A, 5ipc:A, 5ipd:A, 5ipe:A, 6j53:B, 6j58:B, 6j5s:B, 6j5z:A, 6j5z:D, 6j64:B, 6j65:B, 6j65:E, 5kly:A, 5kly:B, 5klz:B, 5km0:A, 5km0:D, 5km1:A, 5km2:A, 5km3:A, 5km4:A, 5km6:A, 5kma:A, 5kmb:A, 5kmb:B, 5kmc:A, 1kpe:B, 1kpf:A, 6n3v:A, 6n3w:A, 6n3x:A, 6n3y:A, 6n3y:B, 3o1c:A, 3o1x:A, 5o8i:B, 8p8p:A, 8pa6:A, 8pa6:B, 8pa9:A, 8paf:A, 8paf:B, 8pai:A, 8pwk:A, 3qgz:A, 3rhn:A, 4rhn:A, 5rhn:A, 1rzy:A, 3tw2:A, 5wa8:A, 5wa9:A, 4zkl:B, 4zkl:D
2	4ini:B	112	110	0.5739	0.5893	0.6000	7.16e-49	4ini:A, 5km5:B, 5km8:B, 5km9:B, 6yvp:AAA, 6yvp:BBB
3	6d6j:B	113	112	0.5652	0.5752	0.5804	1.70e-43	6d6j:A
4	3oxk:A	115	110	0.4174	0.4174	0.4364	8.28e-30	3oj7:A, 3omf:A
5	5uvm:A	115	107	0.3913	0.3913	0.4206	1.23e-28	5uvm:B
6	3n1s:J	119	105	0.4435	0.4286	0.4857	1.57e-28	3n1s:A, 3n1s:B, 3n1s:E, 3n1s:F, 3n1s:I, 3n1s:M, 3n1s:N, 3n1t:A, 3n1t:B, 3n1t:E, 3n1t:F
7	4egu:A	118	107	0.4087	0.3983	0.4393	6.22e-28	4egu:B
8	4zgl:F	102	103	0.3391	0.3824	0.3786	5.17e-19	4zgl:B, 4zgl:C, 4zgl:H, 4zgl:I
9	3ksv:A	141	103	0.3130	0.2553	0.3495	4.84e-14
10	1y23:B	141	101	0.3130	0.2553	0.3564	6.90e-14	1y23:A, 1y23:C, 1y23:D, 1y23:E
11	3l7x:A	157	103	0.2609	0.1911	0.2913	4.17e-12
12	2eo4:A	149	106	0.2696	0.2081	0.2925	4.55e-12
13	6iq1:B	145	123	0.3565	0.2828	0.3333	1.66e-11	6iq1:A, 6iq1:C, 6iq1:D
14	3imi:A	143	104	0.3130	0.2517	0.3462	2.75e-11	3imi:B, 3imi:C, 3imi:D
15	3o0m:A	139	107	0.3130	0.2590	0.3364	4.43e-11	3o0m:B
16	3r6f:A	130	99	0.2870	0.2538	0.3333	3.05e-07
17	6cvq:A	180	98	0.2435	0.1556	0.2857	6.06e-07	6cvo:A, 6cvo:B, 6cvp:A, 6cvp:B, 6cvq:B, 6cvr:A, 6cvr:B, 6cvs:A, 6cvs:B, 6cvt:A, 6cvt:B, 4ndf:A, 4ndf:B, 4ndg:A, 4ndg:B, 4ndh:A, 4ndh:B, 4ndi:A, 4ndi:B
18	5cs2:A	147	79	0.1913	0.1497	0.2785	0.001
19	2fit:A	130	101	0.2261	0.2000	0.2574	0.004	1fhi:A, 2fhi:A, 1fit:A, 3fit:A, 5fit:A, 6fit:A, 7p8p:A, 7p8p:C
20	3ano:A	158	78	0.1652	0.1203	0.2436	0.008
21	3ano:B	175	78	0.1652	0.1086	0.2436	0.010
22	7p8p:B	147	100	0.2261	0.1769	0.2600	0.037	7p8p:D
23	6k5z:B	314	106	0.2087	0.0764	0.2264	0.066	6k5z:A, 6k9z:A, 6k9z:B
24	5vld:F	435	56	0.1565	0.0414	0.3214	2.0	5vlb:A, 5vlb:B, 5vlb:C, 5vlb:D, 5vlb:E, 5vlb:F, 5vlc:A, 5vlc:B, 5vlc:C, 5vlc:D, 5vlc:E, 5vlc:F, 5vld:A, 5vld:B, 5vld:C, 5vld:D, 5vld:E
25	7aih:Ab	260	30	0.0957	0.0423	0.3667	3.0	7am2:Ab, 7ane:Ab
26	7krw:A	608	33	0.1130	0.0214	0.3939	4.3	4b9q:A, 4b9q:B, 4b9q:C, 4b9q:D, 1dkx:A, 1dky:A, 1dky:B, 1dkz:A, 3dpo:B, 3dpo:A, 3dpp:A, 3dpp:B, 3dpq:B, 3dpq:A, 3dpq:F, 3dpq:E, 4e81:A, 4e81:B, 4ezn:A, 4ezn:B, 4ezo:A, 4ezo:B, 4ezp:A, 4ezp:B, 4ezq:A, 4ezr:A, 4ezs:A, 4ezt:A, 4ezu:A, 4ezv:A, 4ezv:B, 4ezw:A, 4ezw:B, 4ezw:C, 4ezw:D, 4ezx:A, 4ezx:B, 4ezy:A, 4ezz:A, 4f00:A, 4hy9:A, 4hy9:B, 4hyb:A, 4hyb:B, 7jmm:A, 4jn4:A, 4jn4:B, 4jne:A, 4jne:B, 7jn8:A, 7jn9:A, 7jne:A, 4jwc:A, 4jwc:B, 4jwd:B, 4jwd:A, 4jwe:A, 4jwe:B, 4jwi:A, 4jwi:B, 7ko2:A, 7ko2:B, 7ko2:C, 7ko2:D, 7krt:A, 7krt:B, 7krt:C, 7krt:D, 7kru:B, 7kru:A, 7krv:B, 7krv:A, 7krw:C, 7krw:B, 7krw:D, 7kzi:A, 7kzi:B, 7kzu:A, 7n46:A, 7n6j:A, 7n6k:A, 7n6l:A, 7n6m:A, 5nro:A, 5oow:A, 5oow:B, 1q5l:A, 3qnj:A, 3qnj:B, 4r5g:B, 4r5i:A, 4r5j:A, 4r5j:C, 4r5j:B, 4r5j:D, 4r5k:A, 4r5k:B, 7rax:A
27	2vsq:A	1273	37	0.1217	0.0110	0.3784	7.3
28	3qis:A	293	68	0.1652	0.0648	0.2794	7.6
29	3hi7:A	715	18	0.0870	0.0140	0.5556	9.9	3hi7:B, 3hig:A, 3hig:B, 3hii:A, 3hii:B, 3k5t:A, 3mph:A, 3mph:B

[Back]