Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RPFKCTWPCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEK

The query sequence (length=30) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6pv0:A 31 31 1.0000 0.9677 0.9677 4.25e-15 6pv1:A, 6pv2:A, 6pv3:A, 1sp2:A, 6uco:A, 6ucp:A, 1va2:A
2 2ent:A 48 31 0.7000 0.4375 0.6774 5.54e-10
3 2ebt:A 100 31 0.6667 0.2000 0.6452 7.19e-07
4 2ebt:A 100 31 0.5333 0.1600 0.5161 0.006
5 2ebt:A 100 26 0.3667 0.1100 0.4231 0.98
6 2rpc:A 155 31 0.6667 0.1290 0.6452 7.48e-07 2ej4:A
7 2rpc:A 155 31 0.4000 0.0774 0.3871 0.14 2ej4:A
8 2rpc:A 155 21 0.3667 0.0710 0.5238 4.7 2ej4:A
9 2en1:A 46 30 0.6000 0.3913 0.6000 7.54e-07 2yth:A
10 1mey:F 84 30 0.6000 0.2143 0.6000 8.16e-07 1mey:C
11 1mey:F 84 30 0.6000 0.2143 0.6000 1.45e-06 1mey:C
12 1mey:F 84 26 0.5333 0.1905 0.6154 7.74e-05 1mey:C
13 1f2i:G 66 31 0.6000 0.2727 0.5806 1.45e-06 1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
14 1f2i:G 66 27 0.4667 0.2121 0.5185 0.009 1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
15 2epa:A 72 27 0.5667 0.2361 0.6296 2.35e-06
16 2epa:A 72 31 0.5333 0.2222 0.5161 0.003
17 2eme:A 46 30 0.5667 0.3696 0.5667 4.18e-06
18 1p47:A 87 31 0.6000 0.2069 0.5806 5.46e-06 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
19 1p47:A 87 30 0.5667 0.1954 0.5667 1.77e-04 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
20 1p47:A 87 26 0.4333 0.1494 0.5000 0.012 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
21 2i13:B 144 30 0.6000 0.1250 0.6000 1.06e-05
22 2i13:B 144 30 0.5667 0.1181 0.5667 1.33e-04
23 2i13:B 144 30 0.5333 0.1111 0.5333 7.03e-04
24 2i13:B 144 27 0.5000 0.1042 0.5556 0.001
25 2i13:B 144 30 0.5000 0.1042 0.5000 0.004
26 2eq2:A 46 30 0.5000 0.3261 0.5000 1.15e-05 2ytr:A
27 2i13:A 151 30 0.6000 0.1192 0.6000 1.27e-05
28 2i13:A 151 30 0.5667 0.1126 0.5667 1.55e-04
29 2i13:A 151 30 0.5333 0.1060 0.5333 7.99e-04
30 2i13:A 151 30 0.5000 0.0993 0.5000 0.004
31 2i13:A 151 26 0.4667 0.0927 0.5385 0.013
32 2i13:A 151 14 0.3000 0.0596 0.6429 4.4
33 2emj:A 46 30 0.5333 0.3478 0.5333 1.74e-05
34 1x6e:A 72 30 0.5333 0.2222 0.5333 3.28e-05
35 1x6e:A 72 27 0.4000 0.1667 0.4444 0.015
36 2eor:A 46 30 0.5000 0.3261 0.5000 4.67e-05
37 2enf:A 46 30 0.5333 0.3478 0.5333 5.57e-05 2yti:A, 2ytn:A, 2yu8:A
38 2emm:A 46 30 0.5667 0.3696 0.5667 5.63e-05
39 1llm:C 87 30 0.5667 0.1954 0.5667 5.70e-05 1llm:D
40 1llm:C 87 23 0.4000 0.1379 0.5217 0.029 1llm:D
41 8a4i:L 56 26 0.5000 0.2679 0.5769 5.75e-05 8a4i:I, 8a4i:K, 8a4i:J, 8cuc:F, 8cuc:G, 7y3i:B, 7y3i:A, 7y3k:A, 7y3k:B
42 8a4i:L 56 26 0.3667 0.1964 0.4231 1.1 8a4i:I, 8a4i:K, 8a4i:J, 8cuc:F, 8cuc:G, 7y3i:B, 7y3i:A, 7y3k:A, 7y3k:B
43 2em6:A 46 28 0.5333 0.3478 0.5714 5.88e-05
44 6zr5:D 38 27 0.5333 0.4211 0.5926 6.11e-05 6zr5:C
45 6b0o:A 119 31 0.5667 0.1429 0.5484 6.38e-05 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
46 6b0o:A 119 31 0.5333 0.1345 0.5161 8.48e-05 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
47 6b0o:A 119 30 0.5667 0.1429 0.5667 1.10e-04 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
48 6b0o:A 119 27 0.5333 0.1345 0.5926 1.48e-04 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
49 2cot:A 77 30 0.5667 0.2208 0.5667 6.70e-05
50 2cot:A 77 28 0.4333 0.1688 0.4643 0.11
51 2emh:A 46 30 0.5333 0.3478 0.5333 6.94e-05
52 2emv:A 44 30 0.4667 0.3182 0.4667 7.70e-05
53 5ke9:A 88 31 0.5333 0.1818 0.5161 1.08e-04 5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
54 5ke9:A 88 22 0.4667 0.1591 0.6364 0.002 5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
55 2ene:A 46 30 0.5333 0.3478 0.5333 1.09e-04
56 2yto:A 46 30 0.5000 0.3261 0.5000 1.14e-04
57 2eoe:A 46 30 0.5000 0.3261 0.5000 1.17e-04 2ytk:A
58 2yts:A 46 30 0.5000 0.3261 0.5000 1.43e-04
59 2ely:A 46 30 0.5333 0.3478 0.5333 1.49e-04
60 2ema:A 46 28 0.4667 0.3043 0.5000 2.29e-04
61 2eq0:A 46 30 0.5333 0.3478 0.5333 2.32e-04
62 2en6:A 46 30 0.5000 0.3261 0.5000 2.32e-04
63 7y3l:A 57 23 0.4667 0.2456 0.6087 2.60e-04
64 7y3l:A 57 26 0.4000 0.2105 0.4615 0.30
65 2emf:A 46 28 0.5333 0.3478 0.5714 2.70e-04
66 2eol:A 42 30 0.5000 0.3571 0.5000 2.89e-04
67 5wjq:D 281 30 0.5333 0.0569 0.5333 3.51e-04 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
68 5wjq:D 281 29 0.5333 0.0569 0.5517 6.59e-04 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
69 5wjq:D 281 30 0.5667 0.0605 0.5667 8.18e-04 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
70 5wjq:D 281 30 0.5000 0.0534 0.5000 0.004 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
71 5wjq:D 281 28 0.5333 0.0569 0.5714 0.007 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
72 5wjq:D 281 27 0.4333 0.0463 0.4815 0.036 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
73 5wjq:D 281 30 0.4667 0.0498 0.4667 0.057 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
74 5wjq:D 281 29 0.4667 0.0498 0.4828 0.11 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
75 5wjq:D 281 30 0.4000 0.0427 0.4000 3.6 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
76 2emk:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 3.76e-04
77 2eoj:A 44 29 0.4333 0.2955 0.4483 3.86e-04
78 2epu:A 45 30 0.5333 0.3556 0.5333 4.25e-04
79 2ysv:A 42 30 0.5000 0.3571 0.5000 4.95e-04
80 2ep1:A 46 30 0.4333 0.2826 0.4333 5.05e-04 2ep2:A
81 2ytg:A 46 30 0.5000 0.3261 0.5000 5.11e-04
82 6wmi:A 146 31 0.5333 0.1096 0.5161 5.22e-04 6wmi:D
83 6wmi:A 146 31 0.4000 0.0822 0.3871 0.22 6wmi:D
84 6wmi:A 146 31 0.5000 0.1027 0.4839 0.25 6wmi:D
85 2yrj:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 5.39e-04
86 2emy:A 46 30 0.5000 0.3261 0.5000 5.39e-04 2el5:A
87 2em3:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 5.51e-04
88 8e3e:F 121 30 0.5333 0.1322 0.5333 5.62e-04 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
89 8e3e:F 121 28 0.3667 0.0909 0.3929 0.48 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
90 8e3e:F 121 22 0.4000 0.0992 0.5455 0.55 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
91 8e3e:F 121 22 0.4000 0.0992 0.5455 1.2 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
92 1ubd:C 114 31 0.5000 0.1316 0.4839 5.71e-04
93 1ubd:C 114 22 0.4333 0.1140 0.5909 0.004
94 1ubd:C 114 28 0.3667 0.0965 0.3929 1.4
95 2ma7:A 73 30 0.5000 0.2055 0.5000 6.29e-04
96 2ma7:A 73 22 0.3333 0.1370 0.4545 1.3
97 2epz:A 46 30 0.5000 0.3261 0.5000 6.72e-04
98 2kmk:A 82 30 0.4667 0.1707 0.4667 6.93e-04
99 2kmk:A 82 28 0.4667 0.1707 0.5000 0.036
100 2em8:A 46 30 0.5000 0.3261 0.5000 6.94e-04
101 2em2:A 46 30 0.5333 0.3478 0.5333 7.58e-04
102 2emc:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 8.27e-04
103 8dey:C 57 30 0.5000 0.2632 0.5000 0.001 8dey:F
104 8dey:C 57 27 0.4000 0.2105 0.4444 3.9 8dey:F
105 2ytq:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 0.002 2eog:A
106 2en9:A 46 28 0.5333 0.3478 0.5714 0.002
107 2elz:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 0.002
108 2ytf:A 46 30 0.5000 0.3261 0.5000 0.002 2eof:A
109 2emw:A 44 30 0.4667 0.3182 0.4667 0.002
110 2lvr:A 30 30 0.4667 0.4667 0.4667 0.002
111 2lce:A 64 30 0.4333 0.2031 0.4333 0.002
112 2lce:A 64 30 0.4333 0.2031 0.4333 0.49
113 2ytd:A 46 28 0.4667 0.3043 0.5000 0.002
114 2enc:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 0.002
115 2em4:A 46 30 0.5000 0.3261 0.5000 0.003
116 1zfd:A 32 27 0.4333 0.4062 0.4815 0.003
117 2eqw:A 42 30 0.4667 0.3333 0.4667 0.003
118 2eoq:A 46 30 0.5000 0.3261 0.5000 0.003
119 2ep3:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 0.003
120 2en4:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 0.003
121 2yrh:A 44 30 0.4667 0.3182 0.4667 0.004
122 7ysf:A 113 30 0.4667 0.1239 0.4667 0.004
123 7ysf:A 113 28 0.4333 0.1150 0.4643 0.33
124 7ysf:A 113 27 0.4333 0.1150 0.4815 7.3
125 2eow:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 0.004
126 2emg:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 0.004
127 2eml:A 46 30 0.4000 0.2609 0.4000 0.004
128 2dmd:A 96 29 0.5333 0.1667 0.5517 0.004
129 2dmd:A 96 29 0.4333 0.1354 0.4483 1.2
130 6h0f:C 32 28 0.4333 0.4062 0.4643 0.004 6h0f:F, 6h0f:I, 6h0f:L
131 2eov:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 0.004
132 2eoz:A 46 29 0.4333 0.2826 0.4483 0.004
133 6ml4:A 143 30 0.5333 0.1119 0.5333 0.005 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
134 6ml4:A 143 30 0.4333 0.0909 0.4333 0.097 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
135 6ml4:A 143 22 0.3667 0.0769 0.5000 0.15 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
136 6ml4:A 143 30 0.4333 0.0909 0.4333 0.46 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
137 6ml4:A 143 20 0.3333 0.0699 0.5000 0.63 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
138 2emp:A 46 30 0.4333 0.2826 0.4333 0.005
139 2eq4:A 46 22 0.4000 0.2609 0.5455 0.006
140 2em1:A 44 30 0.4667 0.3182 0.4667 0.006
141 2eon:A 46 30 0.4333 0.2826 0.4333 0.007
142 5v3g:D 170 30 0.5000 0.0882 0.5000 0.007 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
143 5v3g:D 170 30 0.5000 0.0882 0.5000 0.035 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
144 5v3g:D 170 30 0.4667 0.0824 0.4667 0.15 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
145 5v3g:D 170 30 0.4667 0.0824 0.4667 0.15 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
146 5v3g:D 170 30 0.4667 0.0824 0.4667 0.17 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
147 5v3g:D 170 27 0.4000 0.0706 0.4444 1.6 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
148 2eq1:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 0.007
149 7txc:E 84 30 0.5000 0.1786 0.5000 0.008
150 7txc:E 84 28 0.4667 0.1667 0.5000 0.023
151 2en0:A 42 29 0.4333 0.3095 0.4483 0.008
152 2gli:A 155 31 0.5000 0.0968 0.4839 0.008 7t91:A, 7t91:B
153 2gli:A 155 29 0.3667 0.0710 0.3793 4.7 7t91:A, 7t91:B
154 2emz:A 46 30 0.5333 0.3478 0.5333 0.009
155 2em5:A 46 22 0.4000 0.2609 0.5455 0.012
156 2el4:A 46 30 0.4000 0.2609 0.4000 0.014
157 6e93:A 112 30 0.4667 0.1250 0.4667 0.015 6e94:A
158 6e93:A 112 29 0.4333 0.1161 0.4483 0.12 6e94:A
159 6e93:A 112 30 0.4000 0.1071 0.4000 0.12 6e94:A
160 2ep0:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 0.019
161 1g2d:C 89 30 0.4667 0.1573 0.4667 0.019 1g2d:F, 1g2f:C, 1g2f:F
162 1g2d:C 89 31 0.4333 0.1461 0.4194 0.035 1g2d:F, 1g2f:C, 1g2f:F
163 2en7:A 44 29 0.4667 0.3182 0.4828 0.019
164 2yta:A 41 28 0.4000 0.2927 0.4286 0.021
165 2epq:A 45 29 0.4000 0.2667 0.4138 0.021
166 2ytm:A 46 30 0.4000 0.2609 0.4000 0.022
167 2ytb:A 42 29 0.4000 0.2857 0.4138 0.023
168 8ffz:A 314 27 0.4333 0.0414 0.4815 0.023
169 8ffz:A 314 30 0.4000 0.0382 0.4000 0.89
170 2adr:A 60 30 0.4667 0.2333 0.4667 0.023 1paa:A
171 2adr:A 60 30 0.4000 0.2000 0.4000 2.2 1paa:A
172 2em9:A 46 30 0.4333 0.2826 0.4333 0.024
173 2eq3:A 46 30 0.4000 0.2609 0.4000 0.026
174 2eoh:A 46 30 0.4333 0.2826 0.4333 0.027
175 2ysp:A 46 30 0.4000 0.2609 0.4000 0.028
176 4m9v:C 60 28 0.4333 0.2167 0.4643 0.029 4gzn:C, 4m9v:F
177 2eop:A 46 30 0.4333 0.2826 0.4333 0.029
178 2enh:A 46 30 0.4000 0.2609 0.4000 0.032
179 2en2:A 42 29 0.4000 0.2857 0.4138 0.034
180 2eok:A 42 28 0.4000 0.2857 0.4286 0.035
181 2eom:A 46 22 0.3667 0.2391 0.5000 0.038
182 2emi:A 46 30 0.4333 0.2826 0.4333 0.045 2ytp:A
183 4is1:D 54 27 0.4667 0.2593 0.5185 0.047 4f2j:C, 4is1:C, 3uk3:C, 3uk3:D
184 2epw:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 0.049
185 2ena:A 46 30 0.4333 0.2826 0.4333 0.053
186 2n26:A 55 20 0.3667 0.2000 0.5500 0.056
187 2n26:A 55 29 0.3667 0.2000 0.3793 1.0
188 2ee8:A 106 30 0.4667 0.1321 0.4667 0.056
189 2ee8:A 106 30 0.4333 0.1226 0.4333 0.44
190 2ee8:A 106 26 0.4333 0.1226 0.5000 2.3
191 2ytj:A 46 30 0.4000 0.2609 0.4000 0.062
192 7mc1:A 31 28 0.4000 0.3871 0.4286 0.062
193 2epy:A 42 21 0.3667 0.2619 0.5238 0.068
194 2epv:A 44 28 0.4000 0.2727 0.4286 0.070
195 2em7:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 0.075
196 2ytt:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 0.075
197 7w1m:H 322 30 0.4667 0.0435 0.4667 0.083 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
198 7w1m:H 322 30 0.4333 0.0404 0.4333 0.091 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
199 7w1m:H 322 28 0.4333 0.0404 0.4643 2.9 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
200 7w1m:H 322 28 0.4333 0.0404 0.4643 9.6 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
201 1tf6:D 182 31 0.5333 0.0879 0.5161 0.090 2hgh:A, 2j7j:A, 1tf3:A, 1tf6:A, 1un6:C, 1un6:B, 1un6:D
202 1tf6:D 182 28 0.3667 0.0604 0.3929 1.1 2hgh:A, 2j7j:A, 1tf3:A, 1tf6:A, 1un6:C, 1un6:B, 1un6:D
203 1tf6:D 182 22 0.3333 0.0549 0.4545 4.4 2hgh:A, 2j7j:A, 1tf3:A, 1tf6:A, 1un6:C, 1un6:B, 1un6:D
204 1tf6:D 182 21 0.2667 0.0440 0.3810 7.1 2hgh:A, 2j7j:A, 1tf3:A, 1tf6:A, 1un6:C, 1un6:B, 1un6:D
205 2eps:A 54 31 0.4667 0.2593 0.4516 0.097
206 2epr:A 48 22 0.4000 0.2500 0.5455 0.099
207 2en8:A 46 22 0.3667 0.2391 0.5000 0.10
208 3w5k:B 110 20 0.4333 0.1182 0.6500 0.13
209 5yj3:C 70 26 0.4333 0.1857 0.5000 0.13 5yj3:D
210 8tho:A 100 22 0.3667 0.1100 0.5000 0.14 8dtn:F, 6ki6:A, 6ki6:B, 8tlo:A, 6u9q:A
211 8tho:A 100 26 0.3667 0.1100 0.4231 3.4 8dtn:F, 6ki6:A, 6ki6:B, 8tlo:A, 6u9q:A
212 7y3m:C 70 27 0.4333 0.1857 0.4815 0.15 8u15:C, 8u15:F, 8u16:C, 8u16:F, 8u17:C, 8u17:F, 7y3m:B, 7y3m:A, 7y3m:F, 7y3m:J, 7y3m:I
213 7y3m:C 70 26 0.4000 0.1714 0.4615 2.3 8u15:C, 8u15:F, 8u16:C, 8u16:F, 8u17:C, 8u17:F, 7y3m:B, 7y3m:A, 7y3m:F, 7y3m:J, 7y3m:I
214 2yu5:A 44 26 0.4000 0.2727 0.4615 0.16
215 2eox:A 44 19 0.3667 0.2500 0.5789 0.19
216 1p7a:A 37 26 0.3667 0.2973 0.4231 0.22 1u85:A, 1u86:A
217 8gn3:B 60 26 0.4000 0.2000 0.4615 0.25 8gn3:A, 8gn4:A
218 2eos:A 42 29 0.4000 0.2857 0.4138 0.25
219 2m9a:A 89 30 0.4000 0.1348 0.4000 0.30
220 2ept:A 41 28 0.4000 0.2927 0.4286 0.32
221 2yt9:A 95 28 0.4000 0.1263 0.4286 0.32
222 2yt9:A 95 22 0.4000 0.1263 0.5455 0.84
223 2yt9:A 95 29 0.4333 0.1368 0.4483 4.3
224 2csh:A 110 30 0.4333 0.1182 0.4333 0.35
225 2csh:A 110 20 0.3000 0.0818 0.4500 9.2
226 1va1:A 37 22 0.3333 0.2703 0.4545 0.46
227 2rsj:A 92 30 0.4333 0.1413 0.4333 0.56 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
228 2rsj:A 92 30 0.4000 0.1304 0.4000 7.5 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
229 2m0d:A 30 30 0.3333 0.3333 0.3333 0.62
230 2emx:A 44 30 0.4000 0.2727 0.4000 0.63
231 2el6:A 46 29 0.4333 0.2826 0.4483 0.69
232 2eoo:A 46 30 0.4333 0.2826 0.4333 1.0
233 7mc3:A 31 25 0.3333 0.3226 0.4000 1.1
234 2o1o:A 335 21 0.3333 0.0299 0.4762 1.4 2o1o:B, 2q58:A, 2q58:B
235 2dlq:A 124 22 0.3667 0.0887 0.5000 2.4
236 2elr:A 36 21 0.3000 0.2500 0.4286 2.4 2rv3:A
237 2eou:A 44 22 0.3333 0.2273 0.4545 2.5
238 7ok0:A 880 24 0.2667 0.0091 0.3333 2.8 7oq4:A, 7oqy:A
239 2en3:A 46 26 0.3667 0.2391 0.4231 3.0
240 7zdi:B 49 17 0.2333 0.1429 0.4118 3.3 7zdi:D, 7zdi:J, 7zdi:L, 7zdi:N, 7zdi:P, 7zdi:R, 7zdi:F, 7zdi:H, 7ze3:B, 7ze3:D, 7ze3:P, 7ze3:R, 7ze3:F, 7ze3:H, 7ze3:J, 7ze3:L, 7ze3:N, 7ze8:B, 7ze8:R, 7ze8:D, 7ze8:F, 7ze8:H, 7ze8:J, 7ze8:L, 7ze8:N, 7ze8:P
241 6a57:A 131 25 0.3667 0.0840 0.4400 3.4 6a58:A, 6a59:A, 6jnl:A, 6jnm:A, 6jnm:B, 6jnn:A, 6jnn:B, 6jnn:N, 6jnn:G
242 2eoi:A 44 22 0.3333 0.2273 0.4545 3.8
243 2epc:A 42 24 0.3333 0.2381 0.4167 4.1
244 7b9q:A 868 20 0.2667 0.0092 0.4000 4.7 7b9q:B
245 5y0u:A 109 32 0.4333 0.1193 0.4062 4.8
246 7b9p:A 899 20 0.2667 0.0089 0.4000 5.1
247 2yte:A 42 27 0.2667 0.1905 0.2963 5.5
248 4kgi:C 206 11 0.2333 0.0340 0.6364 6.2 1a0f:A, 1a0f:B, 4kgi:A, 4kgi:B, 4kgi:D, 1n2a:A, 1n2a:B
249 2rsi:A 92 30 0.4000 0.1304 0.4000 7.5 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
250 1ncs:A 47 29 0.3333 0.2128 0.3448 7.5
251 2eoy:A 46 25 0.4000 0.2609 0.4800 7.6
252 1x9r:A 105 18 0.3000 0.0857 0.5000 8.3 1x9r:B, 1x9u:A, 1x9u:B
253 8tnq:C 35 22 0.3333 0.2857 0.4545 8.4 8tnp:C, 8tnr:C
254 7nf9:A 67 25 0.3667 0.1642 0.4400 8.7

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218