BioLiP

>protein
RNQGSAAERLITNLYLLLFDQSGANPAKYYIASGGIWLPDDMKVKLDMTQSEAGERKVYVVANVDNAVKTALDAVANESD
LQTVKRTTAMPWSTDIASPFLMSGNKTHDFLANRLLDNVPLVRAIAKVELNISLSEKFQIVPIIVNGSLSEFKFRYVNFD
KETYVVKPTTKPDNLISSANGVWPQITDWTVWGASLNTSPAPDAGTGYTLDANGKVTALRIVTYLNERDSKGATVEVALP
RGPELYRLPLPDKILRNHWYKYEVEI

The query sequence (length=266) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5dhm:C	268	267	0.9887	0.9813	0.9850	0.0	5dhm:D
2	4iu8:A	422	41	0.0489	0.0308	0.3171	1.2
3	5xya:A	1358	100	0.1015	0.0199	0.2700	2.2	5xxz:A
4	7edd:A	1394	100	0.1015	0.0194	0.2700	2.2	5xyr:A
5	5xxz:B	1310	98	0.0940	0.0191	0.2551	2.3
6	6b2m:A	268	123	0.1316	0.1306	0.2846	2.6	6b2m:B, 6b2m:C, 6b2m:D, 6b2m:E, 6b2m:F, 5udr:A, 5udr:B, 5udr:C, 5udr:D, 5udr:E, 5udr:F, 5uds:A, 5uds:B, 5uds:C, 5uds:D, 5uds:E, 5uds:F, 5udt:A, 5udt:B, 5udt:C, 5udx:D, 5udx:F, 6utp:F
7	7ar9:n	120	59	0.0602	0.1333	0.2712	2.9	7ard:n
8	8sc7:A	326	71	0.0752	0.0613	0.2817	3.2	7a2a:A, 7a2a:B, 8a27:A, 8a2a:A, 8a2b:A, 8a2d:A, 7a6i:A, 7a6j:A, 7a6j:B, 7a6k:A, 7aei:A, 7aem:A, 7b85:A, 3bel:A, 5c8k:A, 5c8m:A, 5c8n:A, 5cal:A, 5can:A, 5cao:A, 5cap:A, 5caq:A, 5cas:A, 5cau:A, 5cav:A, 5cnn:A, 5cnn:B, 5cno:A, 5cno:B, 5czh:A, 5czi:A, 5d41:A, 5d41:B, 8d73:A, 8d73:B, 8d76:A, 8d76:B, 6d8e:A, 8dsw:A, 6duk:A, 6duk:B, 6duk:C, 6duk:D, 6duk:E, 6duk:F, 2eb3:A, 5edq:A, 5edr:A, 5em6:A, 5em7:A, 5em8:A, 8eme:B, 7er2:A, 8f1h:A, 8f1w:A, 8f1w:B, 8f1w:C, 8f1w:D, 8f1x:A, 8f1y:A, 8f1z:A, 5fed:A, 5fee:A, 5feq:A, 8fv3:D, 8fv3:A, 8fv3:B, 8fv3:C, 8fv4:D, 8fv4:A, 8fv4:C, 4g5j:A, 4g5p:A, 8gb4:A, 8gb4:B, 8gb4:C, 8gb4:D, 8gk5:A, 8gk5:B, 8gk5:C, 8gk5:D, 5gmp:A, 5gnk:A, 2gs6:A, 2gs7:A, 2gs7:B, 3gt8:B, 3gt8:A, 3gt8:C, 3gt8:D, 5gty:A, 5gty:B, 5gty:D, 5gty:E, 5gty:F, 5gty:G, 5gty:H, 5gty:C, 5gtz:A, 8h7x:A, 5hcx:A, 5hcy:A, 5hcz:A, 5hg5:A, 5hg7:A, 5hg8:A, 5hg9:A, 5hib:A, 5hic:A, 4hjo:A, 8hv1:A, 8hv2:A, 8hv3:A, 8hv4:A, 8hv5:A, 8hv6:A, 8hv7:A, 8hv8:A, 8hv9:A, 8hva:A, 8hy7:A, 4i21:B, 4i22:A, 4i23:A, 4i24:B, 3ika:A, 2itn:A, 2ito:A, 2itp:A, 2itq:A, 2itt:A, 2itu:A, 2itv:A, 2itw:A, 2itx:A, 2ity:A, 2itz:A, 2j5f:A, 2j6m:A, 5j9y:A, 5j9z:A, 5jeb:A, 2jiu:A, 2jiv:A, 2jiv:B, 4jq7:A, 4jq8:A, 4jr3:A, 4jrv:A, 6jrj:A, 6jrx:A, 6jwl:A, 6jx0:A, 6jx4:A, 6jxt:A, 7jxi:D, 7jxi:A, 7jxk:D, 7jxk:A, 7jxk:C, 7jxk:F, 7jxk:E, 7jxk:B, 7jxl:D, 7jxl:A, 7jxl:C, 7jxl:B, 7jxm:D, 7jxm:A, 7jxm:B, 7jxp:D, 7jxp:A, 7jxp:C, 7jxp:F, 7jxp:B, 7jxp:E, 7jxq:D, 7jxq:A, 7jxq:B, 7jxq:C, 7jxw:C, 7jxw:B, 6jz0:A, 7k1h:B, 7k1h:A, 7k1h:C, 7k1h:D, 7k1h:E, 7k1h:F, 8kfq:A, 7kxz:A, 7ky0:D, 7ky0:A, 7ky0:C, 7lg8:A, 7lg8:B, 7lg8:C, 7lg8:D, 7lgs:A, 7lgs:B, 7lgs:C, 7lgs:D, 4li5:A, 4ll0:A, 4ll0:B, 4lqm:A, 4lrm:A, 4lrm:B, 4lrm:C, 4lrm:D, 4lrm:E, 7ltx:A, 7ltx:B, 7ltx:C, 7ltx:D, 6lub:A, 6lud:A, 3lzb:B, 3lzb:A, 1m17:A, 7oxb:A, 6p1d:D, 6p1d:A, 6p1d:B, 6p1d:C, 6p1l:A, 6p1l:B, 6p1l:D, 6p8q:A, 6p8q:B, 6p8q:C, 6p8q:D, 8pnz:A, 3poz:A, 8po0:A, 8po1:A, 8po2:A, 8po2:B, 8po3:A, 8po4:A, 4r3p:A, 4r3r:A, 4r5s:A, 2rf9:A, 2rf9:B, 2rfd:A, 2rfd:B, 2rfe:A, 2rfe:B, 2rgp:A, 4riw:B, 4riw:D, 4rix:B, 4rix:D, 4riy:B, 4riy:D, 4rj4:A, 4rj6:A, 4rj7:A, 4rj8:A, 6s89:A, 6s8a:A, 6s9b:A, 6s9c:A, 6s9d:A, 7t4i:A, 7t4j:A, 7t4j:B, 6tfu:A, 6tfv:A, 6tfv:B, 6tfw:A, 6tfy:A, 6tfz:A, 6tfz:B, 6tg0:A, 6tg0:B, 6tg1:A, 6tg1:B, 8tjl:A, 8to3:D, 8to3:A, 8to3:B, 8to3:C, 8to4:A, 8to4:B, 8to4:C, 5u8l:A, 7u98:B, 7u99:A, 7u9a:A, 3ug2:A, 5ug8:A, 5ug9:A, 5uga:A, 5ugb:A, 5ugc:A, 7ukv:A, 7ukw:B, 7ukw:C, 5uwd:A, 6v5n:D, 6v5n:A, 6v5n:B, 6v5n:C, 6v5p:A, 6v5p:B, 6v5p:C, 6v5p:D, 6v66:D, 6v66:A, 6v66:B, 6v66:C, 6v6k:D, 6v6k:A, 6v6k:B, 6v6k:C, 6v6k:E, 6v6k:F, 6v6k:G, 6v6k:H, 6v6o:D, 6v6o:A, 6v6o:B, 6v6o:C, 6v6o:E, 6v6o:F, 6v6o:G, 6v6o:H, 6vh4:A, 6vhn:A, 6vhp:A, 3vjn:A, 3vjo:A, 7vra:A, 7vre:A, 3w2o:A, 3w2p:A, 3w2q:A, 3w2r:A, 3w2s:A, 3w32:A, 3w33:A, 6wa2:D, 6wa2:A, 6wa2:B, 6wa2:C, 6wak:D, 6wak:A, 6wak:B, 6wak:C, 4wd5:A, 8wd4:A, 4wkq:A, 6wxn:D, 6wxn:B, 5x26:A, 5x27:A, 5x28:A, 5x2a:A, 5x2a:B, 5x2a:C, 5x2a:D, 5x2c:A, 5x2c:B, 5x2f:A, 5x2f:B, 5x2f:C, 5x2f:D, 5x2k:A, 5xdk:A, 5xdl:A, 5xgn:A, 1xkk:A, 6xl4:A, 6xl4:B, 6xl4:D, 5y25:A, 5y9t:A, 5yu9:A, 5yu9:B, 5yu9:C, 5yu9:D, 6z4b:A, 6z4d:A, 6z4d:B, 4zau:A, 4zse:A, 4zse:B, 4zse:C, 4zse:D, 5zto:A, 5zwj:A, 7zym:A, 7zyn:A, 7zyp:A, 7zyq:A
9	6vz8:D	531	93	0.1090	0.0546	0.3118	3.9	6vz8:H, 6vz8:L, 6vz8:P
10	5k2o:A	585	93	0.1090	0.0496	0.3118	4.2	3e9y:A, 3ea4:A, 8et4:A, 8et5:A, 5k3s:A, 5k6q:A, 5k6r:A, 5k6t:A, 7stq:A, 7tzz:A, 7u1d:A, 7u1u:A, 7u25:A, 6u9h:A, 6u9h:B, 6u9h:H, 6u9h:I, 6u9h:L, 6u9h:M, 6u9h:P, 6u9h:Q, 6vz8:E, 6vz8:I, 6vz8:M, 6vz8:Q, 5wj1:A, 1ybh:A, 1yhy:A, 1yhz:A, 1yi0:A, 1yi1:A, 1z8n:A
11	8jp5:C	101	39	0.0526	0.1386	0.3590	4.9	3a4u:B, 8jp4:C, 8jp4:D, 8jp4:G, 8jp4:H, 8jp5:D, 8jp5:G, 8jp5:H, 8jp6:C, 8jp6:D, 8jp6:G, 8jp6:H, 8jp7:C, 8jp7:D, 8jp7:G, 8jp7:H, 8jp8:C, 8jp8:D, 8jp8:G, 8jp8:H, 8jp9:C, 8jp9:D, 8jp9:G, 8jp9:H, 8jpg:C, 8jpg:G, 8jpg:D, 8jpg:H, 3lcp:C, 3lcp:D, 2vrg:A, 4ygb:B, 4ygb:D, 4ygc:B, 4ygc:D, 4ygd:B, 4ygd:F, 4ygd:H, 4yge:B, 4yge:D, 4yge:F
12	5em5:A	298	67	0.0677	0.0604	0.2687	5.0	7a6k:B, 7a6k:C, 7a6k:D, 8g63:A, 4i24:A, 6jrk:A, 7jxi:C, 7jxi:B, 7jxm:C, 7jxw:D, 7jxw:A, 7k1i:A, 7ky0:B, 3lzb:C, 3lzb:D, 6p1l:C, 8po4:B, 4rj5:A, 6tfu:B, 6tfw:B, 6tfy:B, 8to4:D, 7u98:A, 7u98:C, 7u98:D, 6wxn:C, 5xgm:A, 6z4b:B, 7zyq:B
13	7en2:B	1410	57	0.0865	0.0163	0.4035	5.5	7emy:A, 7emy:B, 7en1:A, 7en1:B, 7en2:A
14	4jnd:A	408	48	0.0489	0.0319	0.2708	5.6
15	5gvy:A	145	122	0.1128	0.2069	0.2459	6.6	5gvy:B, 5xfh:A

[Back]