BioLiP

>protein
RLRVVVLGSTGSIGTQALQVIADNPDRFEVVGLAAGGAHLDTLLRQRAQTGVTNIAVIPYHGSDAATRLVEQTEADVVLN
ALVGALGLRPTLAALKTGARLALANKESLVAGGSLVLRAARPGQIVPVDSEHSALAQCLRGGTPDEVAKLVLTASGGPFR
GWSAADLEHVTPEQAGPMNTLNSASLVNKGLEVIETHLLFGIPYDRIDVVVHPQSIIHSMVTFIDGSTIAQASPPDMKLP
ISLALGWPRRVSGAAAACDFHTASSWEFEPLDTDVFPAVELARQAGVAGGCMTAVYNAANEEAAAAFLAGRIGFPAIVGI
IADVLHAADQWAVEPATVDDVLDAQRWARERAQRAVS

The query sequence (length=357) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2y1d:A	359	358	0.9944	0.9889	0.9916	0.0
2	4aic:A	379	376	1.0000	0.9420	0.9495	0.0	4a03:A, 4a03:B, 4aic:B, 2c82:A, 2c82:B, 2jcv:A, 2jcv:B, 2jcx:A, 2jcx:B, 2jd0:A, 2jd1:A, 2jd1:B, 2jd2:A, 2jd2:B, 4ooe:A, 4ooe:B, 4ooe:C, 4ooe:D, 4oof:A, 4oof:B, 3ras:A, 3ras:B, 4rcv:A, 4rcv:B, 2y1c:A, 2y1c:B, 2y1d:B, 2y1e:A, 2y1e:B, 2y1f:A, 2y1f:B, 2y1g:A, 2y1g:B, 3zhx:A, 3zhx:B, 3zhy:A, 3zhy:B, 3zhz:A, 3zi0:A, 3zi0:B
3	7s04:A	396	397	0.4622	0.4167	0.4156	6.27e-87
4	1r0l:B	379	374	0.4258	0.4011	0.4064	2.63e-79	1r0l:A, 1r0l:C, 1r0l:D
5	8s65:B	411	403	0.4566	0.3966	0.4045	2.62e-75	8s65:A
6	6mh5:B	375	373	0.3669	0.3493	0.3512	1.01e-72	6mh5:A
7	3anl:A	400	395	0.4342	0.3875	0.3924	2.94e-69	3anl:B, 3anm:A, 3anm:B, 3ann:A, 3ann:B, 2egh:A, 2egh:B, 1jvs:A, 1jvs:B, 1ono:A, 1ono:B, 1onp:A, 1onp:B, 1q0h:A, 1q0l:A, 1q0q:A, 1q0q:B, 3r0i:A, 3r0i:B, 1t1r:A, 1t1r:B, 1t1s:A, 1t1s:B
8	5kqo:A	398	363	0.4034	0.3618	0.3967	1.08e-67	5kqo:B, 5krr:A, 5krr:B, 5ks1:A, 5ks1:B
9	4gae:A	416	401	0.3725	0.3197	0.3317	2.89e-67	3au8:A, 3au8:B, 3au9:A, 3au9:B, 3aua:A, 3aua:B, 4gae:B, 5jaz:A, 5jaz:B, 5jbi:A, 5jbi:B, 5jc1:A, 5jc1:B, 5jmp:A, 5jmp:B, 5jmw:A, 5jmw:B, 5jnl:A, 5jnl:B, 8jnv:A, 8jnv:B, 8jnw:A, 8jnw:B, 5jo0:A, 5jo0:B, 4kp7:A, 4kp7:B, 3wqq:A, 3wqq:B, 3wqr:A, 3wqr:B, 3wqs:B, 4y67:A, 4y67:B, 4y6p:A, 4y6p:B, 4y6r:A, 4y6r:B, 4y6s:A, 4y6s:B
10	5dul:B	390	390	0.4006	0.3667	0.3667	7.16e-63	5dul:A, 5dul:D, 3iie:A, 3iie:B
11	3a06:B	373	372	0.3725	0.3566	0.3575	1.18e-62	3a06:A, 3a14:A, 3a14:B
12	4zqg:A	408	384	0.3669	0.3211	0.3411	1.25e-59	4zqf:A, 4zqf:B, 4zqg:B, 4zqh:A, 4zqh:B
13	5dul:C	367	378	0.3754	0.3651	0.3545	7.10e-54
14	1ys4:A	348	148	0.1064	0.1092	0.2568	0.013	1ys4:B
15	1vef:A	387	105	0.0868	0.0801	0.2952	0.58	1vef:B, 1wkg:A, 1wkg:B, 1wkh:A, 1wkh:B
16	1c7i:A	483	131	0.0980	0.0725	0.2672	0.92	1qe3:A
17	7p8p:B	147	73	0.0672	0.1633	0.3288	0.93	7p8p:D
18	2fit:A	130	72	0.0672	0.1846	0.3333	1.5	1fhi:A, 2fhi:A, 1fit:A, 3fit:A, 5fit:A, 6fit:A, 7p8p:A, 7p8p:C
19	2vn8:A	358	86	0.0644	0.0642	0.2674	4.3	2vn8:B
20	6tj5:A	131	41	0.0336	0.0916	0.2927	5.9
21	8r64:B	303	37	0.0336	0.0396	0.3243	6.0	8r64:C, 8r64:D, 8r64:E, 8r64:F
22	8gjh:A	639	44	0.0392	0.0219	0.3182	8.0	8gjh:B, 8gjh:C, 8gjh:D, 8gjh:E, 8gjh:F
23	1uqw:A	487	149	0.0924	0.0678	0.2215	9.3	1uqw:B

[Back]