BioLiP

>protein
RLRLQDIPALTQDHCRMRDPAEVERIINEFVIGGPERMQIVSDFDYTITKQRTEDGGAVPSSFGIFNACQSLPENFKAET
DKLYHKYRPIEIDPHMPIAEKVQYMIEWWTKSGELTSGFPFDQSEIDQIASKYTHALRDRTHEFFADLQRLGIPTLVFSA
GLGNSVVSVLRQANVLHPNVKVVSNFLQFRDGLLDGFQQPMIHTFNKNETVLNETSEYYDLVHTRDHIIVMGDSIGDADM
ASGVPASSHIMKIGFLFDHVEANMKKYMDTFDIVLVDDQTMDVPRTLLSLIEKQHKLNLE

The query sequence (length=300) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4nv0:B	300	300	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	4nv0:A, 4nwi:A, 4nwi:B
2	7zee:A	282	288	0.3733	0.3972	0.3889	6.78e-72	7zeg:A, 7zeg:B, 7zeh:A, 7zeh:B, 7zeh:C, 7zeh:D
3	4fe3:A	291	290	0.3600	0.3711	0.3724	1.24e-67	2g06:A, 2g06:B, 2g07:A, 2g07:B, 2g08:A, 2g08:B, 2g09:A, 2g09:B, 2g0a:A, 2g0a:B, 2jga:A, 4kx3:A, 4kx5:A, 2vkq:A
4	5cxx:B	274	153	0.1133	0.1241	0.2222	0.20	5cxx:A, 5cxx:C
5	1ici:A	256	73	0.0600	0.0703	0.2466	1.2	1ici:B, 1m2g:A, 1m2h:A, 1m2j:A, 1m2k:A, 1m2n:A, 1m2n:B, 4twi:A
6	2g36:A	322	82	0.0733	0.0683	0.2683	1.3
7	3kd3:A	216	65	0.0667	0.0926	0.3077	1.9	3kd3:B
8	4nx2:A	313	55	0.0667	0.0639	0.3636	3.0	2ag6:A, 7ckg:B, 3d6u:A, 3d6v:A, 2hgz:A, 4hjx:A, 4hjx:B, 4hpw:A, 1j1u:A, 5l7p:B, 3n2y:A, 3n2y:B, 5n5u:A, 4nda:A, 5nsf:B, 5nsf:A, 5nsf:C, 5nsf:D, 4pbr:A, 4pbs:A, 4pbt:A, 2pxh:A, 3qe4:A, 3qe4:B, 6wrk:A, 6wrn:A, 6wrq:A, 6wrt:A, 7ynw:A, 7ynw:B, 1zh0:A, 1zh6:A, 2zp1:A
9	4woe:A	716	46	0.0500	0.0209	0.3261	4.0	4wod:A, 4woe:B
10	4x95:B	377	63	0.0567	0.0451	0.2698	4.5	6mtw:A, 6mtw:B, 4x91:A, 4x91:B, 4x91:C, 4x91:D, 4x95:A, 4x97:A, 4x97:B, 4x97:C, 4x97:D
11	1ql6:A	281	50	0.0567	0.0605	0.3400	7.9	1phk:A, 2phk:A
12	1qzw:A	432	42	0.0500	0.0347	0.3571	9.5	3kl4:A, 5l3s:A, 5l3s:C, 5l3s:E, 5l3s:G, 5l3v:A, 5l3v:B, 1qzw:C, 1qzw:E, 1qzw:G, 3zn8:M

[Back]