Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RLICINDYEQHAKSVLPKSIYDYYRSGANDEETLADNIAAFSRWKLYPRMLRNVAETDLSTSVLGQRVSMPICVGATAMQ
RMAHVDGELATVRACQSLGTGMMLSSWATSSIEEVAEAGPEALRWLQLYIYKDREVTKKLVRQAEKMGYKAIFVTVDTPY
LGNRLDDVRNRFKLPPQLRMKNFETSTLSFSPDSGLAAYVAKAIDPSISWEDIKWLRRLTSLPIVAKGILRGDDAREAVK
HGLNGILVSNHGARQLDGVPATIDVLPEIVEAVEGKVEVFLDGGVRKGTDVLKALALGAKAVFVGRPIVWGLAFQGEKGV
QDVLEILKEEFRLAMALSGCQNVKVIDKTLVRK

The query sequence (length=353) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6gmb:A 362 359 1.0000 0.9751 0.9833 0.0 6gmc:A, 2nzl:A, 5qib:A, 5qic:A, 5qid:A, 5qie:A, 5qif:A, 5qig:A, 5qih:A, 7r4n:A, 7r4o:A, 2rdu:A, 2rdw:A
2 7r4p:A 337 353 0.9518 0.9970 0.9518 0.0 7m2o:A, 2rdt:A, 2w0u:A, 2w0u:B, 2w0u:C, 2w0u:D, 6w44:A, 6w45:A, 6w4c:A
3 5zbm:B 353 347 0.5581 0.5581 0.5677 3.15e-138 1al7:A, 1al8:A, 1gox:A, 1gyl:A, 5zbm:A
4 3sgz:A 336 351 0.4646 0.4881 0.4672 2.04e-111 3sgz:B, 3sgz:C, 1tb3:A, 1tb3:B, 1tb3:C, 1tb3:D, 1tb3:E, 1tb3:F, 1tb3:G, 1tb3:H
5 5zzq:A 355 344 0.4221 0.4197 0.4331 4.22e-94 6a24:A, 5zzp:A
6 6a08:A 335 341 0.4136 0.4358 0.4282 1.75e-90 6a00:A, 6a01:A, 6a0b:A, 6a0d:A, 6a0g:A, 6a0m:A, 6a0o:A, 6a0v:A, 6a0y:A, 6a11:A, 6a13:A, 6a19:A, 6a1a:A, 6a1b:A, 6a1h:A, 6a1l:A, 6a1m:A, 6a1n:A, 6a1p:A, 6a1r:A, 6a1w:A, 6a21:A, 6a23:A, 6a36:A, 6a39:A, 6a3d:A, 6a3t:A, 6a4g:A, 6a4h:A, 6ai7:A, 7bsr:A, 5zzr:A, 5zzs:A, 5zzt:A, 5zzx:A, 5zzy:A, 5zzz:A
7 1kbi:A 504 356 0.4136 0.2897 0.4101 3.86e-82 1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
8 1ldc:B 382 355 0.3966 0.3665 0.3944 8.89e-79
9 1huv:A 349 342 0.3768 0.3811 0.3889 2.87e-76
10 6r9v:A 369 350 0.3683 0.3523 0.3714 4.05e-74 6rhs:A, 6rht:A
11 6dvh:A 394 356 0.3626 0.3249 0.3596 5.11e-71 6dvh:B, 6dvh:C, 6dvh:D, 6dvh:E, 6dvh:F, 6dvi:A, 6dvi:B, 6dvi:C, 6dvi:E, 6dvi:F
12 6m73:A 364 353 0.3428 0.3324 0.3428 2.88e-68 6m74:A
13 6bfg:A 373 371 0.3739 0.3539 0.3558 1.37e-67 2a7n:A, 2a7p:A, 2a85:A, 6bfg:B, 3giy:A, 1p4c:A, 1p5b:A
14 2du2:A 374 345 0.3428 0.3235 0.3507 5.00e-66 2du2:B, 2du2:C, 2du2:D, 2e77:A, 2e77:B, 2e77:C, 2e77:D, 5ebu:A, 5ebu:B, 5ebu:C, 5ebu:D, 5ebu:E, 5ebu:F, 5ebu:G, 5ebu:H, 7f1y:A, 7f1y:B, 7f20:A, 7f20:B, 7f21:A, 7f21:B, 7f22:A, 7f22:B, 2j6x:A, 2j6x:B, 2j6x:C, 2j6x:D, 2j6x:E, 2j6x:F, 2j6x:G, 2nli:A, 4rje:A, 4rje:B, 4rje:C, 4rje:D, 8ufy:A, 4yl2:A, 4yl2:B, 4yl2:C, 4yl2:D, 2zfa:A
15 2j6x:H 348 343 0.3343 0.3391 0.3440 1.61e-65 8ufy:B, 2zfa:B
16 6dvi:D 338 340 0.3229 0.3373 0.3353 5.73e-60
17 2nli:B 326 343 0.3116 0.3374 0.3207 2.33e-57
18 5lsm:A 339 188 0.1388 0.1445 0.2606 1.11e-04 5lsm:B, 5lsm:C, 5lsm:D, 5lsm:E, 5lsm:F, 5lsm:G, 5lsm:H
19 3b03:B 364 69 0.0623 0.0604 0.3188 0.001 3b03:A, 3b03:C, 3b03:D, 3b04:A, 3b04:B, 3b04:C, 3b04:D, 3b05:A, 3b05:B, 3b05:C, 3b05:D, 3b06:A, 3b06:B, 3b06:C, 3b06:D, 3vkj:A, 3vkj:B, 3vkj:C, 3vkj:D, 2zru:A, 2zru:B, 2zru:C, 2zru:D, 2zrv:A, 2zrv:B, 2zrv:C, 2zrv:D, 2zrw:A, 2zrw:B, 2zrw:C, 2zrw:D, 2zrx:A, 2zrx:B, 2zrx:C, 2zrx:D, 2zry:A, 2zry:B, 2zry:C, 2zry:D, 2zrz:A, 2zrz:B, 2zrz:C, 2zrz:D
20 4n02:A 332 73 0.0652 0.0693 0.3151 0.003
21 1p0k:B 309 67 0.0567 0.0647 0.2985 0.004 1p0k:A, 1p0n:A, 1p0n:B
22 8c51:A 449 115 0.0850 0.0668 0.2609 0.018 8c51:B, 8c53:A, 8c53:B, 8cgy:A, 8cgy:B, 6rfu:A, 6rfu:B
23 8p4q:E 390 48 0.0538 0.0487 0.3958 0.019 8p37:A, 8p4q:A, 8p4q:B, 8p4q:C, 8p4q:D, 8p4q:F, 8p4q:G, 8p4q:H
24 1jcn:A 395 68 0.0680 0.0608 0.3529 0.047 1jcn:B
25 6mgr:C 369 49 0.0623 0.0596 0.4490 0.090 6mgr:A, 6mgr:B, 6mgr:D, 4mz1:A, 4mz1:B, 4mz1:C, 4mz8:A, 4mz8:B, 4mz8:C, 4mz8:D, 4r7j:A, 5uqf:A, 5uqf:B, 5uqf:C, 5uqg:A, 5uqg:B, 5uqg:H, 5uqg:C, 5uqg:G, 5uqg:D, 5uqg:E, 5uqg:F, 5uqh:A, 5uqh:B, 5uqh:C, 5uqh:D, 5uqh:E, 5uqh:F, 5uqh:G, 5uqh:H, 5urq:A, 5urq:D, 5urq:B, 5urq:C, 5urq:E, 5urq:H, 5urq:F, 5urq:G
26 1eep:A 314 50 0.0538 0.0605 0.3800 0.14
27 3khj:A 302 113 0.0822 0.0960 0.2566 0.15 3khj:E, 3khj:F, 3khj:G
28 4qj1:D 346 113 0.0822 0.0838 0.2566 0.16 4ixh:A, 4ixh:D, 4ixh:B, 4ixh:C, 3khj:B, 3khj:C, 3khj:D, 3khj:H, 4qj1:A, 4qj1:B, 4qj1:C, 4rv8:A, 4rv8:D, 4rv8:B, 4rv8:C
29 3tsb:A 490 48 0.0538 0.0388 0.3958 0.21 3tsd:A, 3usb:A
30 3tsb:B 434 48 0.0538 0.0438 0.3958 0.22
31 3tsd:B 426 48 0.0538 0.0446 0.3958 0.23
32 5mcp:C 446 94 0.0737 0.0583 0.2766 0.25 5mcp:A, 5mcp:B, 5mcp:D, 6rpu:A
33 4myx:G 356 48 0.0538 0.0534 0.3958 0.26 6mgu:A, 6mgu:B, 7mtu:A, 7mtu:C, 7mtu:B, 7mtu:D, 7mtu:E, 7mtu:G, 7mtu:F, 7mtu:H, 7mtx:A, 7mtx:C, 7mtx:B, 7mtx:D, 7mtx:E, 7mtx:G, 7mtx:F, 7mtx:H, 4my1:A, 4my1:C, 4my1:B, 4my1:D, 4my1:E, 4my1:F, 4my1:G, 4my1:H, 4my8:A, 4my8:B, 4my8:C, 4my8:D, 4my9:A, 4my9:C, 4my9:B, 4my9:D, 4my9:E, 4my9:F, 4my9:H, 4my9:G, 4mya:A, 4mya:B, 4myx:A, 4myx:C, 4myx:B, 4myx:D, 4myx:E, 4myx:F, 4myx:H, 4qm1:A, 4qm1:B, 4qm1:D, 4qm1:C, 5urs:A, 5urs:C, 5urs:B, 5urs:D, 5urs:E, 5urs:G, 5urs:F, 5urs:H, 5uuv:A, 5uuv:D, 5uuv:B, 5uuv:C, 5uuz:A, 5uuz:C, 5uuz:B, 5uuz:D, 5uuz:E, 5uuz:G, 5uuz:F, 5uuz:H
34 6qd5:A 356 102 0.0708 0.0702 0.2451 0.27 8blp:A, 8blp:C, 8blp:B
35 3usb:B 401 48 0.0538 0.0474 0.3958 0.28
36 2ggh:C 370 130 0.0878 0.0838 0.2385 0.33 2ggh:A, 2ggh:B, 2ggh:D, 1xpy:A, 1xpy:B, 1xpy:C, 1xpy:D, 1xs2:A, 1xs2:B, 1xs2:C, 1xs2:D
37 4qq3:A 302 101 0.0793 0.0927 0.2772 0.49
38 2cu0:A 358 48 0.0567 0.0559 0.4167 0.51 2cu0:B
39 6aje:A 378 114 0.0765 0.0714 0.2368 0.65 6aj5:A, 6aj5:B, 6aj5:C, 6aj5:D, 6aje:B, 6aje:C, 6aje:D
40 4fo4:A 348 48 0.0538 0.0546 0.3958 0.66 4fo4:B, 4ix2:A, 4ix2:B, 4ix2:C, 4ix2:D, 4qne:A, 4qne:B, 4x3z:A, 4x3z:B
41 4fxs:A 467 48 0.0538 0.0407 0.3958 0.78
42 1zfj:A 476 48 0.0482 0.0357 0.3542 1.1
43 5ahn:A 297 88 0.0708 0.0842 0.2841 1.1
44 5mcp:E 387 94 0.0708 0.0646 0.2660 1.2 5mcp:G
45 7oj1:A 401 93 0.0737 0.0648 0.2796 1.2
46 7rfh:H 451 89 0.0680 0.0532 0.2697 1.3 7rfh:A, 7rfh:B, 7rfh:C, 7rfh:D, 7rfh:E, 7rfh:F, 7rfh:G
47 5csr:C 220 50 0.0425 0.0682 0.3000 1.4 5csr:A, 5csr:B, 5csr:D, 5css:A, 5css:B, 5css:C, 5css:D
48 7oj2:A 353 48 0.0482 0.0482 0.3542 1.5
49 9c4m:A 335 48 0.0425 0.0448 0.3125 1.5 9c4m:B, 9c4m:C, 9c4m:D, 9c4m:E, 9c4m:F, 9c4m:G, 9c4m:H
50 7oj1:B 425 48 0.0482 0.0400 0.3542 1.6
51 4ezc:B 346 104 0.0765 0.0780 0.2596 1.7 4ezc:A, 4ezc:C, 4ezd:A, 4ezd:C, 4ezd:B
52 5ahm:A 354 49 0.0538 0.0537 0.3878 1.7 5ahm:B
53 8u7m:A 451 76 0.0680 0.0532 0.3158 1.9 8u7m:B, 8u7m:C, 8u7m:D, 8u7m:E, 8u7m:F, 8u7m:G, 8u7m:H
54 7rgi:A 357 82 0.0737 0.0728 0.3171 2.1 7rgi:B, 7rgi:C, 7rgi:D, 7rgi:E, 7rgi:H, 7rgi:F, 7rgi:G
55 6knh:C 384 40 0.0397 0.0365 0.3500 2.2 6knh:A, 6knh:B, 6kni:A, 6kni:B, 6kni:C, 6knk:A, 6knk:B, 6knk:C
56 2ihn:A 299 58 0.0482 0.0569 0.2931 2.2
57 6uc2:A 453 119 0.0793 0.0618 0.2353 2.4 6i0m:B, 6i0o:A, 6uc2:B, 6uc2:C, 6uc2:D, 6uc2:E, 6uc2:F, 6uc2:G, 6uc2:H
58 7r50:G 424 91 0.0850 0.0708 0.3297 2.7
59 7pji:A 445 49 0.0538 0.0427 0.3878 2.7 4dqw:A, 4dqw:B, 6gk9:A, 6gk9:D, 7pji:B
60 4ori:A 355 78 0.0680 0.0676 0.3077 2.7 1uum:A, 1uum:B, 1uuo:A
61 7r50:O 455 91 0.0850 0.0659 0.3297 2.8 7r50:B, 7r50:C, 7r50:F, 7r50:J, 7r50:K
62 7r50:A 473 91 0.0850 0.0634 0.3297 2.9 7r50:D, 7r50:E, 7r50:H, 7r50:I, 7r50:L, 7r50:M, 7r50:N, 7r50:P
63 5upx:A 380 48 0.0482 0.0447 0.3542 3.1
64 6jig:A 480 101 0.0822 0.0604 0.2871 3.3 6lk4:A
65 3n2s:A 248 46 0.0510 0.0726 0.3913 3.3 3n2s:B, 3n2s:C, 3n2s:D
66 5upy:A 350 27 0.0340 0.0343 0.4444 3.4
67 1iuq:A 357 71 0.0538 0.0532 0.2676 3.5
68 7rer:A 389 91 0.0708 0.0643 0.2747 3.6 7rer:D, 7rer:C, 7rer:B, 7rer:E, 7rer:H, 7rer:G, 7rer:F, 8u8y:A, 8u8y:B, 8u8y:C, 8u8y:D, 8u8y:E, 8u8y:F, 8u8y:G, 8u8y:H
69 1b3o:A 304 94 0.0708 0.0822 0.2660 3.7
70 1wnb:A 474 30 0.0482 0.0359 0.5667 4.0 1wnb:B, 1wnb:C, 1wnb:D, 1wnd:A, 1wnd:B, 1wnd:C, 1wnd:D
71 7rgd:A 519 29 0.0397 0.0270 0.4828 4.0 7res:A, 7res:B, 7res:C, 7res:D, 7res:E, 7res:F, 7res:G, 7res:H, 7rfe:A, 7rfe:B, 7rfe:C, 7rfe:D, 7rfe:E, 7rfe:F, 7rfe:G, 7rfe:H, 7rfg:A, 7rfg:B, 7rfg:C, 7rfg:D, 7rfg:E, 7rfg:F, 7rfg:G, 7rfg:H, 7rgd:B, 7rgd:C, 7rgd:D, 7rgd:E, 7rgd:F, 7rgd:G, 7rgd:H, 7rgm:A, 7rgm:B, 7rgm:C, 7rgm:D, 7rgm:E, 7rgm:F, 7rgm:G, 7rgm:H, 7rgq:A, 7rgq:B, 7rgq:C, 7rgq:D, 7rgq:E, 7rgq:F, 7rgq:G, 7rgq:H, 8u7q:A, 8u7q:B, 8u7q:C, 8u7q:D, 8u7q:E, 8u7q:F, 8u7q:G, 8u7q:H, 8u7v:A, 8u7v:B, 8u7v:C, 8u7v:D, 8u7v:E, 8u7v:F, 8u7v:G, 8u7v:H, 8u8o:A, 8u8o:B, 8u8o:C, 8u8o:D, 8u8o:E, 8u8o:F, 8u8o:G, 8u8o:H
72 7rfi:A 422 29 0.0397 0.0332 0.4828 4.1 7rfi:B, 7rfi:C, 7rfi:D, 7rfi:E, 7rfi:F, 7rfi:G, 7rfi:H, 7rgl:A, 7rgl:B, 7rgl:C, 7rgl:D, 7rgl:E, 7rgl:F, 7rgl:G, 7rgl:H
73 1nfb:A 396 52 0.0510 0.0455 0.3462 4.4 1nfb:B
74 8fuz:A 390 88 0.0708 0.0641 0.2841 4.7 8foz:A, 8foz:B, 8foz:C, 8foz:D, 8foz:E, 8foz:F, 8foz:G, 8foz:H, 8fuz:B, 8fuz:C, 8fuz:D, 8fuz:E, 8fuz:F, 8fuz:G, 8fuz:H, 1jr1:B, 6u8e:A, 6u8e:B, 6u8e:C, 6u8e:D, 6u8e:E, 6u8e:F, 6u8e:G, 6u8e:H, 6u8s:A, 6u8s:B, 6u8s:C, 6u8s:D, 6u8s:E, 6u8s:F, 6u8s:G, 6u8s:H, 6ua5:A, 6ua5:B, 6ua5:C, 6ua5:D, 6ua5:E, 6ua5:F, 6ua5:G, 6ua5:H, 6udp:A, 6udp:B, 6udp:C, 6udp:D, 6udp:E, 6udp:F, 6udp:G, 6udp:H
75 4zqr:C 358 48 0.0453 0.0447 0.3333 4.9 6d4q:A, 6d4r:A, 6d4s:A, 6d4t:A, 6d4u:A, 6d4v:A, 6d4w:A, 5j5r:A, 5k4x:A, 5k4z:A, 6mjy:A, 5ou1:A, 5ou2:A, 5ou3:A, 5upu:A, 5upv:A, 4zqm:A, 4zqn:A, 4zqo:A, 4zqp:A, 4zqr:A, 4zqr:B, 4zqr:D
76 8phx:C 130 115 0.0878 0.2385 0.2696 5.1 8phx:A, 8phx:B, 8phx:D
77 1b3o:B 410 29 0.0397 0.0341 0.4828 5.2
78 5z9y:B 234 58 0.0482 0.0726 0.2931 5.2 5z9y:A
79 7pmz:B 430 103 0.0737 0.0605 0.2524 5.4 7pmz:A, 7pmz:C, 7pmz:D, 7pmz:E, 7pmz:F, 7pmz:G, 7pmz:H, 7pmz:I, 7pmz:J, 7pmz:K, 7pmz:L, 7pmz:M, 7pmz:N, 7pmz:O, 7pmz:P
80 1nf7:A 454 52 0.0510 0.0396 0.3462 5.7 1jr1:A, 1nf7:B
81 4twe:A 706 40 0.0425 0.0212 0.3750 5.8 4twe:B
82 8g8f:A 491 52 0.0510 0.0367 0.3462 5.9 8g8f:B, 8g8f:C, 8g8f:D, 8g8f:E, 8g8f:F, 8g8f:G, 8g8f:H, 8g9b:A, 8g9b:B, 8g9b:C, 8g9b:D, 8g9b:E, 8g9b:F, 8g9b:G, 8g9b:H, 6i0m:A, 6i0o:B, 6u8n:A, 6u8n:B, 6u8n:C, 6u8n:D, 6u8n:E, 6u8n:F, 6u8n:G, 6u8n:H, 6u8r:D, 6u8r:A, 6u8r:B, 6u8r:C, 6u8r:H, 6u8r:E, 6u8r:F, 6u8r:G, 6u9o:A, 6u9o:B, 6u9o:C, 6u9o:D, 6u9o:E, 6u9o:F, 6u9o:G, 6u9o:H, 6ua2:B, 6ua2:A, 6ua2:D, 6ua2:C, 6ua2:F, 6ua2:E, 6ua2:H, 6ua2:G, 6ua4:B, 6ua4:A, 6ua4:D, 6ua4:C, 6ua4:F, 6ua4:E, 6ua4:H, 6ua4:G, 6uaj:A, 6uaj:B, 6uaj:C, 6uaj:D, 6uaj:E, 6uaj:F, 6uaj:G, 6uaj:H, 6udo:A, 6udo:B, 6udo:C, 6udo:D, 6udo:E, 6udo:F, 6udo:G, 6udo:H, 6udq:A, 6udq:B, 6udq:C, 6udq:D, 6udq:E, 6udq:F, 6udq:G, 6udq:H
83 7l00:C 315 44 0.0453 0.0508 0.3636 7.3 7l00:A, 7l00:B, 7l00:D
84 2a1y:A 301 27 0.0312 0.0365 0.4074 8.3
85 4z0g:B 390 101 0.0737 0.0667 0.2574 8.7 4xtd:A, 4xtd:B, 4xti:A, 4xti:B, 4z0g:A
86 8qqv:A 356 48 0.0453 0.0449 0.3333 10.0 8qqv:B, 8qqv:D, 8qqv:C, 8qqv:E, 8qqv:F, 8qqv:G, 8qqv:H, 8qqx:A, 8qqx:B, 8qqx:C, 8qqx:D, 8qqx:E, 8qqx:F, 8qqx:G, 8qqx:H

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218