BioLiP

>protein
RKVPGPITLIEPLSGNTSLLIKINAIHSVKKSPYQEIIIADTEDYGRVLILDDYIQSSYVDEQYYHESLVHPAMATHPNP
RDVLILGGGEGATLREALKHGTVKRAVMVDIDRDVVELSRAYLPQMHQGAFDDPRAKVVIQDGFVYVEEAIKAGDKYDVI
IMDLTDPYSSDIAKQLYTREFFAKIRRILNDDGVVVTQAGNSFYFPAEYDMVLEGVKANFPIVAEYEVWIPSFGYAVNFI
LGSLRYDPHALTPSEVDERLRARGVKTAFYTGRVHLALMNMPIHRKLR

The query sequence (length=288) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7xif:D	288	288	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7xif:A, 7xif:B, 7xif:C, 7xif:E, 7xif:F, 7xif:G, 7xif:H, 7xif:I, 7xif:J, 7xif:K, 7xif:L, 7xig:A, 7xig:B, 7xig:C, 7xig:D, 7xig:E, 7xig:F, 7xig:G, 7xig:H, 7xih:A, 7xih:B, 7xii:A, 7xii:B, 7xii:C, 7xii:D
2	3anx:B	313	276	0.3958	0.3642	0.4130	8.50e-65	3anx:A
3	6bq3:A	292	263	0.3403	0.3356	0.3726	9.70e-51	6bq3:B, 6bq4:A, 6bq4:B, 6bq5:A, 6bq5:B, 6bq6:A, 6bq6:B, 6bq7:A, 6bq7:B
4	1jq3:A	295	269	0.3264	0.3186	0.3494	3.13e-44	1jq3:C, 1jq3:D
5	6qmm:B	280	204	0.2882	0.2964	0.4069	3.04e-40	6qmm:A
6	6o65:B	294	291	0.3090	0.3027	0.3058	5.83e-40	6o65:A, 6o65:C, 6o65:D, 6o65:E, 6o65:F, 6o65:G, 6o65:H
7	2o06:A	297	266	0.2708	0.2626	0.2932	2.29e-38	2o05:A, 2o05:B, 2o06:B, 2o07:A, 2o07:B, 2o0l:A, 2o0l:B, 3rw9:A, 3rw9:B
8	5b1s:A	294	178	0.2431	0.2381	0.3933	1.24e-35	5b1s:B, 5b1s:C, 5b1s:D, 3bwc:A, 3bwc:B, 5y4p:A, 5y4p:B, 5y4p:C, 5y4p:D, 5y4q:A, 5y4q:B, 5y4q:C, 5y4q:D, 4yuv:A, 4yuv:B, 4yuw:A, 4yuw:B, 4yux:A, 4yux:B, 4yuy:A, 4yuy:B, 4yuz:A, 4yuz:B, 4yuz:C, 4yuz:D, 4yv0:A, 4yv0:B, 4yv0:C, 4yv0:D, 4yv1:A, 4yv1:B, 4yv1:C, 4yv1:D, 4yv2:A, 4yv2:B
9	2e5w:A	280	262	0.3264	0.3357	0.3588	1.11e-30	2e5w:C, 2zsu:A, 2zsu:C, 2zsu:E
10	3b7p:A	281	262	0.2708	0.2776	0.2977	7.39e-26	3b7p:B, 3b7p:C, 4bp1:A, 4bp1:B, 4bp1:C, 4bp3:A, 4bp3:B, 4bp3:C, 4cwa:A, 4cwa:C, 4cxm:A, 4cxm:B, 4cxm:C, 2hte:A, 2hte:B, 2hte:C, 6hy1:A, 6hy1:B, 6hy1:C, 6i1n:A, 6i1n:B, 6i1n:C, 2i7c:A, 2i7c:B, 2i7c:C, 2pt6:A, 2pt6:B, 2pt6:C, 2pt9:A, 2pt9:B, 2pt9:C, 3rie:A, 3rie:B, 3rie:C, 4uoe:A, 4uoe:B, 4uoe:C
11	3c6k:D	348	218	0.2083	0.1724	0.2752	7.46e-05	3c6k:A, 3c6k:B, 3c6k:C, 3c6m:A, 3c6m:B, 3c6m:C, 3c6m:D
12	5wcj:A	222	121	0.1215	0.1577	0.2893	0.003
13	7b0h:F	762	96	0.0903	0.0341	0.2708	1.1	7b07:A, 7b08:A, 7b0f:A, 7b0g:A, 7b0h:E, 1qqc:A, 5vu8:A, 2vwj:A, 2xhb:A
14	4fbg:A	399	123	0.1042	0.0752	0.2439	1.2	4fbg:E, 4fbg:G, 4fbg:H, 4fbg:I, 4fbg:K, 4fbg:M, 4fbg:P
15	6pbd:A	350	33	0.0451	0.0371	0.3939	2.1
16	5i4k:A	280	112	0.1076	0.1107	0.2768	2.4
17	8pdc:A	122	27	0.0347	0.0820	0.3704	2.8
18	6or5:A	2058	75	0.0729	0.0102	0.2800	3.7
19	7x3u:G	492	43	0.0486	0.0285	0.3256	3.7	8sfe:g, 8sfe:G, 8sgq:g, 8sgq:G, 7wz3:g, 7wz3:G
20	7nvm:g	538	43	0.0486	0.0260	0.3256	3.9	1gn1:F, 1gn1:H, 8i1u:C, 8i1u:K, 8i6j:C, 8i9u:C, 8i9u:K, 7nvl:G, 7nvl:g, 7nvm:G, 7nvn:G, 7nvn:g, 8sff:G, 8sff:g, 8sg8:G, 8sg8:g, 8sg9:G, 8sg9:g, 8sgc:G, 8sgc:g, 8sgl:G, 8sgl:g, 8sh9:G, 8sh9:g, 8sha:G, 8sha:g, 8shd:G, 8shd:g, 8she:G, 8she:g, 8shf:G, 8shf:g, 8shg:G, 8shg:g, 8shl:G, 8shl:g, 8shn:G, 8shn:g, 8sho:G, 8sho:g, 8shp:G, 8shp:g, 8shq:G, 8shq:g, 8sht:G, 8sht:g, 7trg:H, 7ttn:H, 7ttt:H, 7tub:H, 7x0s:G, 7x0s:N, 7x0v:G, 7x0v:N, 7x3j:G, 7x3j:g, 7x3u:g
21	4k8x:A	759	96	0.0868	0.0329	0.2604	5.5	6is7:A, 6is7:B, 6isf:A, 6isf:B, 6isg:A, 6ish:A, 6isi:A, 4k8z:A, 5omf:A, 5omq:A, 5omv:A, 7om3:A, 7omb:A, 7omg:A, 6q4t:A, 7rsr:A, 7rss:A, 7rsu:A, 8t3x:A, 7tqw:A, 5vu6:A, 5vu7:A, 5vu9:A
22	6cmk:A	375	46	0.0451	0.0347	0.2826	6.3	6cmk:B
23	8bsd:A	301	33	0.0347	0.0332	0.3030	6.4	8a23:A, 7bq7:A, 8bzv:A, 8c0g:A, 7c2i:A, 7c2j:A, 8c5m:A, 9emj:A, 9eml:A, 9emv:A, 9eun:A, 8f4s:A, 8f4y:A, 9gny:A, 9grp:A, 9grq:A, 7jhe:A, 7jib:A, 7jpe:A, 7jyy:A, 7jyy:C, 7jz0:A, 7jz0:C, 7koa:A, 7l6r:A, 7l6t:A, 7lw3:A, 7lw4:A, 8osx:A, 8ot0:A, 8oto:A, 8otr:A, 8ov1:A, 8ov2:A, 8ov3:A, 8ov4:A, 7r1t:A, 7r1u:A, 3r24:A, 8rv4:A, 8rv5:A, 8rv6:A, 8rv7:A, 8rv8:A, 8rv9:A, 8rva:A, 8rvb:A, 8rzc:A, 8rzd:A, 8rze:A, 8s8w:A, 8s8x:A, 8tyj:A, 6w4h:A, 6w61:A, 6w75:A, 6w75:C, 6wjt:A, 6wjt:C, 6wkq:A, 6wkq:C, 6wks:AAA, 6wq3:A, 6wrz:A, 6wvn:A, 6xkm:A, 2xyq:A, 2xyr:A, 2xyv:A, 6yz1:A
24	6bs3:A	330	77	0.0764	0.0667	0.2857	7.0	6bs4:A, 6bs5:A
25	5h3t:C	657	64	0.0660	0.0289	0.2969	7.7	5h3t:A, 5h3t:B, 5h3t:D

[Back]