Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
RKTYTLTDYLKNTYRLKLYSLRWISDHEYLYKQENNILVFNAEYGNSSVFLENSTFDEFGHSINDYSISPDGQFILLEYN
YVKQWRHSYTASYDIYDLNKRQLITEERIPNNTQWVTWSPVGHKLAYVWNNDIYVKIEPNLPSYRITWTGKEDIIYNGIT
DWVYEEEVFSAYSALWWSPNGTFLAYAQFNDTEVPLIEYSFYSDESLQYPKTVRVPYPKAGAVNPTVKFFVVNTDSLSSV
TNATSIQITAPASMLIGDHYLCDVTWATQERISLQWLRRIQNYSVMDICDYDESSGRWNCLVARQHIEMSTTGWVGRFRP
SEPHFTLDGNSFYKIISNEEGYRHICYFQIDKKDCTFITKGTWEVIGIEALTSDYLYYISNEYKGMPGGRNLYKIQLIDY
TKVTCLSCELNPERCQYYSVSFSKEAKYYQLRCSGPGLPLYTLHSSVNDKGLRVLEDNSALDKMLQNVQMPSKKLDFIIL
NETKFWYQMILPPHFDKSKKYPLLLDVYAGPCSQKADTVFRLNWATYLASTENIIVASFDGRGSGYQGDKIMHAINRRLG
TFEVEDQIEAARQFSKMGFVDNKRIAIWGWSYGGYVTSMVLGSGSGVFKCGIAVAPVSRWEYYDSVYTERYMGLPTPEDN
LDHYRNSTVMSRAENFKQVEYLLIHGTADDNVHFQQSAQISKALVDVGVDFQAMWYTDEDHGIASSTAHQHIYTHMSHFI
KQCFSLPAAASWS

The query sequence (length=733) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4n8e:B 734 733 1.0000 0.9986 1.0000 0.0 4a5s:A, 4a5s:B, 2ajl:I, 2ajl:J, 6b1e:A, 6b1e:B, 6b1o:A, 6b1o:B, 2bgn:A, 2bgn:B, 2bgn:C, 2bgn:D, 2bgr:A, 2bgr:B, 3bjm:A, 3bjm:B, 2bub:A, 2bub:B, 3c43:A, 3c43:B, 3c45:A, 3c45:B, 3ccb:A, 3ccb:B, 3ccb:C, 3ccb:D, 3ccc:A, 3ccc:B, 3ccc:C, 3ccc:D, 3d4l:A, 3d4l:B, 4dsa:A, 4dsz:A, 4dsz:B, 4dtc:A, 4dtc:B, 3eio:A, 3eio:B, 3f8s:A, 3f8s:B, 2fjp:A, 2fjp:B, 3g0b:A, 3g0b:B, 3g0b:C, 3g0b:D, 3g0c:A, 3g0c:B, 3g0c:C, 3g0c:D, 3g0d:A, 3g0d:B, 3g0d:C, 3g0d:D, 3g0g:A, 3g0g:B, 3g0g:C, 3g0g:D, 4g1f:A, 4g1f:B, 4g1f:C, 4g1f:D, 2g5p:A, 2g5t:A, 2g63:B, 3h0c:A, 3h0c:B, 3hab:A, 3hab:B, 3hac:A, 3hac:B, 2hha:A, 2hha:B, 2i03:B, 2i78:B, 5i7u:A, 5i7u:B, 2iit:A, 2iit:B, 2iiv:A, 2iiv:B, 5ism:A, 5ism:B, 4j3j:A, 4j3j:B, 5j3j:A, 5j3j:B, 4jh0:A, 4jh0:B, 2jid:A, 2jid:B, 5kby:A, 5kby:B, 5kby:C, 5kby:D, 3kwf:A, 3kwf:B, 3kwj:A, 3kwj:B, 4lko:A, 4lko:B, 1n1m:A, 1n1m:B, 4n8d:A, 4n8d:B, 4n8e:A, 3nox:A, 3nox:B, 1nu8:B, 3o95:A, 3o95:B, 3o95:C, 3o95:D, 3o9v:A, 3o9v:B, 3o9v:C, 3o9v:D, 2oag:B, 3oc0:A, 3oc0:B, 2ogz:A, 2ogz:B, 2ole:A, 2ole:B, 2onc:A, 2onc:B, 2onc:C, 2onc:D, 2oph:A, 2oph:B, 3opm:A, 3opm:B, 3opm:C, 3opm:D, 2oqi:B, 2oqv:A, 2p8s:A, 2p8s:B, 4pnz:A, 4pnz:B, 4pv7:A, 4pv7:B, 3q0t:A, 3q0t:B, 3q8w:A, 3q8w:B, 3qbj:A, 3qbj:B, 2qjr:A, 2qjr:B, 2qky:A, 2qky:B, 2qky:C, 2qky:D, 2qoe:A, 2qoe:B, 2qt9:A, 2qt9:B, 2qtb:A, 2qtb:B, 1r9n:A, 1r9n:B, 1r9n:C, 1r9n:D, 2rgu:A, 2rgu:B, 2rip:A, 1rwq:A, 1rwq:B, 3sww:A, 3sww:B, 3sx4:A, 3sx4:B, 5t4b:A, 5t4b:B, 5t4e:A, 5t4e:B, 5t4f:A, 5t4f:B, 5t4h:A, 5t4h:B, 1tkr:A, 1tkr:B, 3vjk:A, 3vjk:B, 3vjl:A, 3vjl:B, 3vjm:A, 3vjm:B, 3w2t:A, 3w2t:B, 1wcy:A, 1wcy:B, 3wqh:A, 3wqh:B, 1x70:A, 1x70:B, 5y7h:A, 5y7h:B, 5y7j:A, 5y7j:B, 5y7j:C, 5y7j:D, 5y7k:A, 5y7k:B, 5y7k:C, 5y7k:D, 5zid:A, 5zid:B
2 2aj8:A 728 727 0.8745 0.8805 0.8817 0.0 2aj8:B, 2aj8:C, 2aj8:D, 2ajb:A, 2ajb:B, 2ajb:C, 2ajb:D, 2ajc:A, 2ajc:B, 2ajc:C, 2ajc:D, 2ajd:A, 2ajd:B, 2ajd:C, 2ajd:D, 2bua:A, 2bua:B, 2bua:C, 2bua:D, 2buc:A, 2buc:B, 2buc:C, 2buc:D, 5lls:A, 5lls:B, 5lls:D, 5lls:C, 1orw:A, 1orw:B, 1orw:C, 1orw:D, 7xnm:B, 7xnm:A
3 2gbf:A 730 729 0.8417 0.8452 0.8464 0.0 4ffw:A, 4ffw:B, 2gbg:A, 2gbi:A, 2i3z:A, 2oae:A, 5vta:A, 5vta:B, 5vta:C, 5vta:D
4 6y0f:C 722 726 0.5266 0.5346 0.5317 0.0 6y0f:A, 6y0f:B, 6y0f:D
5 7y4g:A 715 691 0.2947 0.3021 0.3126 2.03e-90 8hay:A, 8hay:B, 8hay:C, 7y4g:B, 7y4g:C
6 5yp2:A 724 686 0.2538 0.2569 0.2711 3.46e-57 5yp2:B, 5yp3:A, 5yp3:B, 5yp3:C, 5yp3:D, 5yp4:A, 5yp4:B, 5yp4:C, 5yp4:D
7 7svm:A 852 685 0.2483 0.2136 0.2657 3.29e-45 7a3g:B, 7a3g:A, 7a3i:B, 7a3i:C, 7a3j:C, 7a3j:A, 7a3j:B, 7a3k:C, 7a3k:A, 7a3k:B, 7a3l:A, 7a3l:B, 7a3l:C, 7ayq:B, 7ayr:A, 7ayr:B, 6eop:A, 6eop:B, 6eop:C, 6eot:A, 6eot:B, 6eot:D, 6eot:G, 6eot:I, 6eot:K, 6hp8:A, 6hp8:B, 6hp8:C, 7or4:B, 7or4:A, 7oz7:A, 7oz7:B, 6qzw:A, 6qzw:B, 6qzw:C, 7svm:B, 7svm:C, 7svo:A, 7svo:B, 7svo:C, 6trw:A, 6trw:B, 6trw:C, 6trx:B, 6trx:C, 6trx:A
8 2dcm:A 662 605 0.2196 0.2432 0.2661 4.18e-45 2eep:A, 2z3z:A
9 7ayq:A 808 685 0.2456 0.2228 0.2628 4.61e-41 7a3i:A
10 4q1v:A 707 672 0.2251 0.2334 0.2455 3.98e-40 4q1v:B
11 6eor:B 805 656 0.2347 0.2137 0.2622 2.57e-39 6qzv:B
12 7jn7:A 846 675 0.2278 0.1974 0.2474 1.11e-36 6eor:A, 6eor:C, 6eor:D, 7jn7:D, 6qzv:A, 6qzv:C, 6qzv:D, 7svl:A, 7svl:B, 7svl:C, 7svl:D, 7svn:A, 7svn:B, 7svn:C, 7svn:D, 6x6c:A, 6x6c:D, 7zxs:A, 7zxs:B, 7zxs:C, 7zxs:D
13 8wt1:C 651 241 0.0750 0.0845 0.2282 4.27e-12 8wt1:A, 8wt1:B, 8wt1:D, 8wt1:E, 8wt1:F, 8wt1:G, 8wt1:H
14 4hxg:F 614 243 0.0819 0.0977 0.2469 5.11e-09 4hxe:B, 4hxf:B, 4hxg:A, 4hxg:B, 4hxg:C, 4hxg:D, 4hxg:E, 4hxg:G, 4hxg:H, 4hxg:I, 4hxg:L
15 4re6:A 577 213 0.0750 0.0953 0.2582 1.29e-06 2hu5:A, 2hu5:B, 2hu7:A, 2hu7:B, 2hu8:A, 2hu8:B, 4re5:A, 4re5:B, 4re6:C, 1ve7:A, 1ve7:B
16 3azq:A 661 245 0.0791 0.0877 0.2367 2.72e-05 3azq:B
17 6ikg:A 644 264 0.0805 0.0916 0.2235 0.011 6ikg:B
18 5uw3:D 698 148 0.0437 0.0458 0.2162 0.015 5uw5:D, 5uw6:D, 5uw7:A, 5uw7:B, 5uzw:D
19 5o3w:B 717 148 0.0423 0.0432 0.2095 0.030 5o3u:A, 5o3u:B, 5o3u:C, 5o3u:D, 5o3v:B, 5o3v:A, 5o3w:A, 5o3w:C, 5o3w:D, 5uw3:A, 5uw3:B, 5uw3:C, 5uw5:A, 5uw5:B, 5uw5:C, 5uw6:A, 5uw6:B, 5uw6:C, 5uzw:A, 5uzw:B, 5uzw:C
20 7qun:A 694 224 0.0614 0.0648 0.2009 0.19 7qun:B, 7qun:C, 7qun:D
21 1pp8:P 118 62 0.0273 0.1695 0.3226 0.23 1pp7:U, 1pp8:U, 1pp8:M, 1pp8:F
22 2d81:A 318 112 0.0409 0.0943 0.2679 0.54
23 6can:A 616 204 0.0655 0.0779 0.2353 0.72 6can:B, 5t88:A, 5t88:B
24 8qd8:B 413 152 0.0491 0.0872 0.2368 0.79 8qd8:A, 8qd9:A, 8qd9:B
25 8qbh:A 377 144 0.0409 0.0796 0.2083 0.83
26 7kc4:D 278 162 0.0559 0.1475 0.2531 0.83
27 7ne7:A 677 167 0.0477 0.0517 0.2096 1.3 7ne4:A, 7ne5:A, 7ob1:A, 7ywp:A
28 7d79:D 295 55 0.0218 0.0542 0.2909 1.7 7d79:B
29 6nkf:A 301 29 0.0191 0.0465 0.4828 1.9 6nkf:D
30 3dlt:A 239 158 0.0491 0.1506 0.2278 2.0
31 4ggz:A 106 27 0.0177 0.1226 0.4815 2.1 4ggz:B, 4ggz:C, 4ggz:D
32 6bge:A 323 76 0.0273 0.0619 0.2632 3.0 6bge:B, 1g6o:A, 1g6o:B, 1nly:A, 1nly:B
33 3f98:A 377 58 0.0259 0.0504 0.3276 5.8 3f97:A, 3f97:B, 3f98:B, 3f98:C, 3f9c:A, 3f9c:B, 5i8p:A, 5i8p:B, 5i9i:A, 5i9i:B, 5jad:A, 5jah:A, 5jal:A, 5jan:A, 5jao:A, 5jap:A, 5jar:A, 5jas:A, 5jat:A, 5jau:A, 5lp1:A, 5lyy:A, 5lz2:A, 5lz4:A, 5lz5:A, 5lz7:A, 5lz8:A, 5lz9:A, 6m06:A, 6m06:B, 6m07:A, 6m07:B, 6m08:B, 5ye7:B, 5ye7:A, 5ye8:B, 5ye8:A, 5ye9:A, 5ye9:B, 5yea:A, 5yea:B
34 3guz:B 167 85 0.0341 0.1497 0.2941 6.0 3guz:A
35 3tm5:A 368 45 0.0259 0.0516 0.4222 6.9 3tlj:A, 3tlj:B, 3tm4:A, 3tm4:B, 3tm5:B
36 6gi5:B 271 122 0.0464 0.1255 0.2787 7.4 6gi1:A, 6gi1:B, 6gi2:A, 6gi2:B, 6gi5:A
37 7zaz:CCC 690 36 0.0164 0.0174 0.3333 7.6
38 7zaz:AAA 727 36 0.0164 0.0165 0.3333 8.0 7zaz:BBB, 7zaz:DDD, 7zb0:A, 7zb0:B, 7zb0:C, 7zb0:D, 7zb1:A, 7zb1:B, 7zb1:C, 7zb1:D, 7zb2:CCC, 7zb2:FFF
39 6sup:A 2128 25 0.0136 0.0047 0.4000 8.9
40 3ivt:B 400 47 0.0246 0.0450 0.3830 9.1 3ivs:A, 3ivs:B, 3ivt:A, 3ivu:A, 3ivu:B, 3mi3:A, 3mi3:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218