Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RKSKAELQSEERKRIDELIESGKEEGMKIDLIDGKGRGVIATKQFSRGDFVVEYHGDLIEITDAKKREALYAQDPSTGCY
MYYFQYLSKTYCVDATRETNRLGRLINHSKCGNCQTKLHDIDGVPHLILIASRDIAAGEELLFDYGDRSKASIEAHPWLK
H

The query sequence (length=161) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7xpx:K 167 161 0.9938 0.9581 0.9938 8.56e-119 6boz:A, 6boz:B, 2bqz:A, 2bqz:E, 3f9w:B, 3f9w:A, 3f9w:C, 3f9w:D, 3f9x:B, 3f9x:A, 3f9x:C, 3f9x:D, 3f9y:A, 3f9y:B, 3f9z:B, 3f9z:A, 3f9z:C, 3f9z:D, 4ij8:A, 4ij8:B, 5t5g:A, 5teg:A, 5teg:B, 5th7:A, 5th7:B, 5w1y:A, 5w1y:B, 1zkk:A, 1zkk:B, 1zkk:C, 1zkk:D
2 2w5z:A 180 110 0.2609 0.2333 0.3818 2.16e-17 5f5e:A, 5f6l:A, 6pwv:C, 6pww:C, 7u5v:A, 6u9k:A, 6u9k:B, 6u9m:A, 6u9m:B, 6u9n:A, 6u9n:B, 6u9r:A, 6u9r:B, 2w5y:A, 7w67:C, 7w6a:C, 7w6i:C, 7w6j:C
3 6kiu:K 179 110 0.2609 0.2346 0.3818 2.64e-17 6kiv:K, 6kix:K, 6kiz:K, 7ud5:K
4 7bre:B 163 110 0.2484 0.2454 0.3636 1.70e-14 7bre:E
5 7td5:A 497 128 0.2671 0.0865 0.3359 6.83e-14
6 6wkr:C 606 128 0.2547 0.0677 0.3203 1.50e-13 4mi0:A, 4mi5:A, 8t9g:I
7 7kso:A 395 128 0.2671 0.1089 0.3359 1.50e-13 7ksr:A, 7ktp:A
8 7td5:F 447 128 0.2671 0.0962 0.3359 1.75e-13
9 5ij7:B 469 128 0.2547 0.0874 0.3203 1.85e-13 6b3w:A, 6b3w:B, 6c23:K, 6c24:K, 5ij7:A, 5ij8:A, 5ij8:B, 4w2r:A, 4w2r:B
10 9c8u:A 475 128 0.2547 0.0863 0.3203 2.00e-13
11 5wg6:A 517 128 0.2547 0.0793 0.3203 2.95e-13 5wg6:C
12 7at8:A 311 128 0.2547 0.1318 0.3203 3.39e-13
13 8t9g:C 536 128 0.2547 0.0765 0.3203 4.08e-13 8fyh:A, 8fyh:G
14 5hyn:A 581 128 0.2547 0.0706 0.3203 4.19e-13 5hyn:F, 5hyn:K, 5hyn:Q, 5ls6:A, 5ls6:G, 5ls6:J, 5ls6:D
15 8tas:E 570 128 0.2547 0.0719 0.3203 5.06e-13 8tb9:E
16 5jlb:A 248 119 0.2298 0.1492 0.3109 9.23e-13 7ea8:L, 4fmu:A, 4h12:A, 6j9j:A, 5jjy:A, 5jle:A, 5lss:A, 5lsx:A, 5lsy:A, 5lsz:A, 5lt6:A, 5lt6:B, 5lt7:A, 5lt8:A, 7lzb:A, 7lzd:A, 7lzf:A, 8q5p:A, 7ty2:A, 7ty3:A, 5v21:A, 5v22:A, 6vdb:A
17 2r3a:A 270 135 0.2733 0.1630 0.3259 4.99e-12 6p0r:A, 6p0r:B
18 6nzo:S 233 111 0.2484 0.1717 0.3604 2.35e-11 6px3:S
19 5tqr:B 809 116 0.2360 0.0470 0.3276 2.36e-11 5bjs:B, 5vk3:B
20 7x73:A 274 140 0.2857 0.1679 0.3286 5.41e-11 7btv:A, 7btv:B, 7buc:A, 7buc:B, 7dcf:A, 7dcf:B, 5jhn:A, 5jhn:B, 5jin:A, 5jin:B, 5jiy:A, 5jiy:B, 5jj0:A, 5jj0:B, 3k5k:A, 3k5k:B, 4nvq:A, 4nvq:B, 2o8j:A, 2o8j:B, 2o8j:C, 2o8j:D, 3rjw:A, 3rjw:B, 5t0k:A, 5t0k:B, 5t0m:A, 5t0m:B, 7t7l:A, 7t7l:B, 7t7l:C, 7t7l:D, 5ttf:A, 5ttf:B, 5ttf:C, 5ttf:D, 5tuy:A, 5tuy:B, 5v9i:A, 5v9i:B, 5v9i:C, 5v9i:D, 5vsc:A, 5vsc:B, 5vse:A, 5vse:B, 7x73:B, 7xua:A, 7xua:B, 7xub:A, 7xub:B, 7xuc:A, 7xuc:B, 7xud:A, 7xud:B
21 5wf7:B 765 116 0.2422 0.0510 0.3362 2.50e-10 5kji:B
22 5kjh:B 807 116 0.2360 0.0471 0.3276 2.91e-10 5m5g:B
23 5kkl:B 839 116 0.2360 0.0453 0.3276 3.31e-10
24 6ven:N 218 108 0.2050 0.1514 0.3056 4.25e-10
25 5wfd:B 774 117 0.2422 0.0504 0.3333 5.70e-10 5wfc:B
26 6cen:A 226 122 0.2298 0.1637 0.3033 8.81e-10 7crp:I, 7crq:L, 7crq:I, 7crr:I, 5upd:A
27 7w6l:C 158 111 0.2236 0.2278 0.3243 9.37e-10 5f59:A, 5f6k:C, 5f6k:E, 6kiw:K, 7w6l:E
28 5lsu:A 231 112 0.2236 0.1558 0.3214 3.56e-09 7cro:I, 7e8d:K, 5lsu:B
29 6uh5:M 222 108 0.1925 0.1396 0.2870 5.19e-09 6chg:C
30 6ugm:M 188 108 0.1925 0.1649 0.2870 5.79e-09
31 3hna:A 280 144 0.2609 0.1500 0.2917 6.06e-09 3fpd:A, 3fpd:B, 3hna:B, 4i51:A, 4i51:B, 2igq:A, 2igq:B, 6mbo:A, 6mbo:B, 6mbp:A, 6mbp:B, 3mo0:A, 3mo0:B, 3mo2:A, 3mo2:B, 3mo2:C, 3mo2:D, 3mo5:A, 3mo5:B, 3mo5:C, 3mo5:D, 2rfi:A, 2rfi:B, 3sw9:A, 3sw9:B, 3swc:A, 3swc:B, 7t7m:A, 7t7m:B, 7t7m:C, 7t7m:D, 5ttg:A, 5ttg:B, 5tuz:A, 5tuz:B, 5v9j:A, 5v9j:B, 5vsd:A, 5vsd:B, 5vsf:A, 5vsf:B, 8xpt:A, 8xpt:B, 8xpt:C, 8xpt:D
32 6ine:A 247 114 0.2050 0.1336 0.2895 1.90e-08 6ago:A, 6ago:B, 3ope:A, 3ope:B, 6wzw:A, 6x0p:A, 6x0p:B, 6x0p:C, 6x0p:D, 4ynm:A, 4ynm:B, 4ynp:A, 4ynp:B, 4ypa:A, 4ypa:B, 4ypa:C, 4ypa:D, 4ype:A, 4ype:B, 4ypu:A, 4ypu:B
33 8fbh:A 232 111 0.2236 0.1552 0.3243 1.92e-08 8fbg:A, 8fbg:B, 6kqp:A, 6kqq:A, 6kqq:B, 3ooi:A
34 3bo5:A 269 135 0.2484 0.1487 0.2963 2.50e-08
35 4z4p:A 161 111 0.2422 0.2422 0.3514 1.68e-07
36 6a5m:A 488 138 0.2671 0.0881 0.3116 3.31e-07 6a5k:A
37 7ea5:K 228 112 0.2174 0.1535 0.3125 2.65e-06
38 6a5n:A 502 150 0.2609 0.0837 0.2800 1.35e-05
39 4o30:A 217 123 0.2236 0.1659 0.2927 5.41e-05 4o30:B, 5va6:A, 5va6:B, 5vac:A, 5vah:A, 5vah:B, 5vbc:A, 5vbc:B
40 1peg:A 266 147 0.2298 0.1391 0.2517 3.68e-04 1ml9:A, 1peg:B
41 6z2a:A 283 137 0.2174 0.1237 0.2555 0.001 6box:A, 6box:B, 6bp4:B, 6bp4:A, 1mvh:A, 1mvx:A, 6z2a:B
42 4qen:A 472 116 0.1925 0.0657 0.2672 0.004 4qeo:A, 4qep:A
43 5ex0:A 429 50 0.1366 0.0513 0.4400 0.011 7bj1:A, 5ccl:A, 5ccm:A, 5ex3:A, 5hi7:A, 5hq8:A, 5hq8:B, 6ijl:A, 3mek:A, 7o2a:A, 7o2b:A, 7o2c:A, 6o9o:A, 8owo:A, 3oxf:A, 3oxf:B, 3oxg:A, 3oxl:A, 6p6g:A, 6p6k:A, 6p7z:A, 6paf:A, 3pdn:A, 7qlb:A, 7qnr:A, 7qnu:A, 3qwp:A, 3ru0:A, 3ru0:B, 5v37:A, 5xxd:A, 5xxg:A, 5xxj:A, 5yjo:A, 6yuh:A, 6zrb:A
44 6n7l:C 344 73 0.1366 0.0640 0.3014 0.070 6n7l:A, 6n7l:B, 6n7l:D, 6n7l:E, 6n7l:F, 6n7l:G, 6n7l:H, 6n7l:I, 6n7l:J, 6n7l:K, 6n7l:L
45 2g46:A 119 46 0.0994 0.1345 0.3478 0.38 2g46:B, 3kmt:A, 3kmt:B, 3kmt:C
46 1hyu:A 521 75 0.1429 0.0441 0.3067 1.5 1fl2:A, 4o5q:A, 4o5u:A, 4xvg:A, 4ykf:A, 4ykg:A
47 5abm:A 494 25 0.0683 0.0223 0.4400 1.8 5abm:B, 5abm:C, 5abm:D, 5ac0:A, 5ac0:B, 5ac1:A, 5ac1:B, 5ac1:C, 5ac1:D, 5ac2:A, 1bxs:A, 1bxs:B, 1bxs:C, 1bxs:D, 6dum:A, 8ene:A, 8ene:B, 8ene:C, 8ene:D, 7jws:A, 7jwt:A, 7jwu:A, 7jwv:A, 7jww:A, 5l2m:A, 5l2n:A, 5l2o:A, 5l2o:B, 5l2o:C, 5l2o:D, 5l2o:E, 5l2o:F, 5l2o:G, 5l2o:H, 8t0n:A, 8t0t:A, 5tei:A, 7um9:A, 4wb9:A, 8wfq:A, 8wfq:B, 8wfq:C, 8wfq:D, 8wfq:E, 8wfq:F, 8wfq:G, 8wfq:H, 4wp7:A, 4wpn:A, 4x4l:A
48 4x2z:A 301 91 0.1429 0.0764 0.2527 2.3 5bz0:A
49 3n71:A 468 30 0.0745 0.0256 0.4000 2.4
50 1o9j:A 494 25 0.0683 0.0223 0.4400 2.7 1o9j:B, 1o9j:C, 1o9j:D
51 4fl4:I 309 37 0.0683 0.0356 0.2973 3.1 2b59:B, 4fl4:C, 4fl4:F, 4fl4:L, 5g5d:B, 3kcp:A
52 6geq:A 395 45 0.0994 0.0405 0.3556 4.6 3cxv:A, 3cxx:A, 3cxy:A, 3cxz:A, 3cy0:A, 3cy1:A, 5edt:A, 4g1x:A, 4g2g:A, 4g44:A, 4g45:A, 4g46:A, 4g47:A, 4g48:A, 3g5f:A, 3g5h:A, 6geo:A, 5ibd:A, 5ibe:A, 5ibf:A, 5ibg:A, 5ibh:A, 5ibi:A, 5ibj:A, 4ict:A, 2ij5:A, 2ij5:B, 2ij5:C, 2ij5:D, 2ij5:E, 2ij5:F, 2ij7:A, 2ij7:B, 2ij7:C, 2ij7:D, 2ij7:E, 2ij7:F, 4ips:A, 4ipw:A, 4iq7:A, 4iq9:A, 4ktf:A, 4ktj:A, 4ktk:A, 4ktl:A, 1n40:A, 1n4g:A, 7nqm:A, 7nqn:A, 7nqo:A, 5o4k:A, 5o4l:A, 5op9:A, 5opa:A, 6rq0:A, 6rq1:A, 6rq3:A, 6rq5:A, 6rq6:A, 6rq8:A, 6rq9:A, 6rqb:A, 6rqd:A, 6rqe:A, 7ruk:A, 7s0o:A, 8tdp:A, 8tdq:A, 6te7:A, 6tet:A, 6tev:A, 6upg:A, 6upi:A, 5wp2:A
53 7a6q:A 489 25 0.0683 0.0225 0.4400 5.3 7a6q:B, 5fhz:A, 5fhz:B, 5fhz:C, 5fhz:D, 5fhz:E, 5fhz:G, 5fhz:H, 7qk8:A, 7qk8:B, 7qk9:A, 7qk9:B, 6s6w:A, 6s6w:B, 6te5:A, 6te5:B, 6tgw:A, 6tgw:B, 6tgw:C, 6tgw:D, 6try:A, 6try:B
54 2m6s:A 149 25 0.0559 0.0604 0.3600 5.3
55 3r0h:D 199 67 0.1056 0.0854 0.2537 5.7 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
56 7wmz:C 292 52 0.0994 0.0548 0.3077 8.3 7wmz:E, 7wmz:A, 7wmz:B, 7wmz:D, 7wmz:F
57 4iym:C 491 26 0.0745 0.0244 0.4615 9.0 4iym:A, 4iym:B, 4iym:D, 4iym:E, 4iym:F, 4iym:G, 4iym:H, 4iym:I, 4iym:J, 4iym:K, 4iym:L, 4iym:M, 4iym:N, 4iym:O, 4iym:P

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218