BioLiP

>protein
RKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPIQNKLAPFIAKRLTPKIQEQYRRIGGGSPIKIWTSKQGEGMV
KLLDELSPNTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNQVGRKPTMKWSTI
DRWPTHHLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSACSLPMSVVNRGDPYPQEVSATVQKVMERLEYCNPYRLVWQSK
VGPMPWLGPQTDESIKGLCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLYELDIEYSQVLAKECGVENIRRAESLNGNPLFSKALADL
VHSHIQSNELCSKQLTLSCPLCVNPVCRETKSFFTSQQL

The query sequence (length=359) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3aqi:A	359	359	0.9944	0.9944	0.9944	0.0	3aqi:B, 7ct7:A, 7ct7:B, 7ctc:A, 7ctc:D, 4f4d:A, 4f4d:B, 3hcn:A, 3hcn:B, 3hco:A, 3hco:B, 3hcp:A, 3hcp:B, 3hcr:A, 3hcr:B, 1hrk:A, 1hrk:B, 2hrc:A, 2hrc:B, 2hre:A, 2hre:B, 2hre:C, 2hre:D, 4kla:A, 4kla:B, 4klc:A, 4klc:B, 4klr:A, 4klr:B, 4kmm:A, 4kmm:B, 4mk4:A, 4mk4:B, 2pnj:A, 2pnj:B, 2po5:A, 2po5:B, 2po7:A, 2po7:B, 2qd1:A, 2qd1:B, 2qd1:C, 2qd1:D, 2qd2:A, 2qd2:B, 2qd3:A, 2qd3:B, 2qd4:A, 2qd4:B, 2qd5:A, 2qd5:B, 3w1w:A, 3w1w:B
2	1l8x:B	354	339	0.4763	0.4831	0.5044	8.70e-121
3	2hk6:A	309	327	0.2368	0.2751	0.2599	3.90e-33	1c1h:A, 1c9e:A, 1ld3:A, 3m4z:A, 2q2n:A, 2q2o:A, 2q3j:A
4	8aw7:A	309	326	0.2618	0.3042	0.2883	4.37e-33	8at8:A, 8bbv:A, 9f0f:A, 9f0g:A, 8ofl:A, 8omm:A, 6sv3:A
5	1oqu:C	302	142	0.0975	0.1159	0.2465	0.77	3dhz:A, 3dhz:B, 1kgn:A, 1kgn:B, 1kgn:C, 1kgn:D, 1kgo:A, 1kgo:B, 1kgo:C, 1kgo:D, 1kgp:A, 1kgp:B, 1kgp:C, 1kgp:D, 3mjo:A, 3mjo:B, 1oqu:A, 1oqu:B, 1oqu:D
6	7jrc:A	501	56	0.0390	0.0279	0.2500	1.5	7jru:A, 7jrv:A, 7jrw:A, 7js5:A, 7js7:A, 7js7:B
7	6m29:A	122	70	0.0557	0.1639	0.2857	2.7	8i57:A, 8i57:B, 8i58:A, 8i58:B, 6m27:A, 6m27:B, 6m28:A, 6m28:B, 6m29:B, 6m2e:A, 6m2e:B, 6m2f:A, 6m2f:B, 6m2g:A, 6m2g:B, 6m2h:A, 6m2h:B
8	8c81:C	561	91	0.0669	0.0428	0.2637	4.6	8c80:C, 8c82:C, 8c82:G, 8iaj:B, 8iaj:F, 8iak:B, 8iak:F, 8iam:B, 8iam:F, 8qof:C, 8qof:G, 8qog:C
9	8xlp:2	173	68	0.0557	0.1156	0.2941	5.2	8wm6:c, 8wmj:c, 8wmv:c, 8wmw:c, 8xlp:O
10	4uhm:A	435	83	0.0585	0.0483	0.2530	6.2	4uhn:A, 4uho:A
11	4oxd:A	185	65	0.0529	0.1027	0.2923	8.0	4d0y:A, 4d0y:B, 4nt9:B, 4nt9:A, 4nt9:C, 4ox5:A, 4oxd:C, 4oxd:B, 4oxd:E, 4oxd:D
12	5myj:BG	176	109	0.0724	0.1477	0.2385	9.5
13	7z4m:A	497	76	0.0529	0.0382	0.2500	9.5	6ksh:A, 6ksh:B, 6ksh:C, 6ksh:D, 7z4n:A, 7z4r:A

[Back]