BioLiP

>protein
RKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPIQNKLAPAIAKRRTPKIQEQYRRIGGGSPIKIWTSKQGEGMV
KLLDELSPNTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNQVGRKPTMKWSTI
DRWPTHHLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDPYPQEVSATVQKVMERLEYCNPYRLVWQSK
VGPMPWLGPQTDESIKGLCERGRKNILLVPIAFTSDHIDTLYELDIEYSQVLAKECGVENIRRAESLNGNPLFSKALADL
VHSHIQSNELCSKQLTLSCPLCVNPVCRETKSFFTSQQL

The query sequence (length=359) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3aqi:A	359	359	0.9889	0.9889	0.9889	0.0	3aqi:B, 7ct7:A, 7ct7:B, 7ctc:A, 7ctc:D, 4f4d:A, 4f4d:B, 3hcn:A, 3hcn:B, 3hco:A, 3hco:B, 3hcp:A, 3hcp:B, 3hcr:A, 3hcr:B, 1hrk:A, 1hrk:B, 2hrc:A, 2hrc:B, 2hre:A, 2hre:B, 2hre:C, 2hre:D, 4kla:A, 4kla:B, 4klc:A, 4klc:B, 4klr:A, 4klr:B, 4kmm:A, 4kmm:B, 4mk4:A, 4mk4:B, 2pnj:A, 2pnj:B, 2po5:A, 2po5:B, 2po7:A, 2po7:B, 2qd1:A, 2qd1:B, 2qd1:C, 2qd1:D, 2qd2:A, 2qd2:B, 2qd3:A, 2qd3:B, 2qd4:A, 2qd4:B, 2qd5:A, 2qd5:B, 3w1w:A, 3w1w:B
2	1l8x:B	354	339	0.4791	0.4859	0.5074	2.90e-122
3	2hk6:A	309	327	0.2396	0.2783	0.2630	4.98e-34	1c1h:A, 1c9e:A, 1ld3:A, 3m4z:A, 2q2n:A, 2q2o:A, 2q3j:A
4	8aw7:A	309	326	0.2618	0.3042	0.2883	2.21e-33	8at8:A, 8bbv:A, 9f0f:A, 9f0g:A, 8ofl:A, 8omm:A, 6sv3:A
5	1oqu:C	302	142	0.0975	0.1159	0.2465	1.2	3dhz:A, 3dhz:B, 1kgn:A, 1kgn:B, 1kgn:C, 1kgn:D, 1kgo:A, 1kgo:B, 1kgo:C, 1kgo:D, 1kgp:A, 1kgp:B, 1kgp:C, 1kgp:D, 3mjo:A, 3mjo:B, 1oqu:A, 1oqu:B, 1oqu:D
6	7jrc:A	501	56	0.0390	0.0279	0.2500	1.6	7jru:A, 7jrv:A, 7jrw:A, 7js5:A, 7js7:A, 7js7:B
7	6m29:A	122	70	0.0557	0.1639	0.2857	2.7	8i57:A, 8i57:B, 8i58:A, 8i58:B, 6m27:A, 6m27:B, 6m28:A, 6m28:B, 6m29:B, 6m2e:A, 6m2e:B, 6m2f:A, 6m2f:B, 6m2g:A, 6m2g:B, 6m2h:A, 6m2h:B
8	7z4m:A	497	76	0.0529	0.0382	0.2500	3.6	6ksh:A, 6ksh:B, 6ksh:C, 6ksh:D, 7z4n:A, 7z4r:A
9	4etj:A	164	117	0.0864	0.1890	0.2650	4.3	4jll:A
10	4uhm:A	435	46	0.0334	0.0276	0.2609	6.0	4uhn:A, 4uho:A
11	4oxd:A	185	65	0.0529	0.1027	0.2923	8.3	4d0y:A, 4d0y:B, 4nt9:B, 4nt9:A, 4nt9:C, 4ox5:A, 4oxd:C, 4oxd:B, 4oxd:E, 4oxd:D
12	7qxa:A	954	84	0.0669	0.0252	0.2857	9.0	7bg9:A, 7qxb:A, 7qxs:A, 7trd:A, 7tre:A, 7trf:A
13	6nab:B	497	48	0.0362	0.0262	0.2708	9.8	6nab:A, 6uyh:A, 6uyh:B

[Back]