BioLiP

>protein
RKEKIIILGSGWGGFNFLLNIDFKKYDVTLISPRNYFTFTPLLPCLCSGTLSVNVCTESIRNFLRKKNGYCGNYLQLECT
DVFYEDKYINCIDIENNKVKLFYDYLIIAVGAKTNTFNINGVDKYAYFVKDIDDALKIRKKFLDILEKCTLPNISNEEKK
KMLHVAVVGGGPTGVEVTAEFADFINKEVKINYKDIFNFISISIIEGGNNLLPTFTQNISDFTKENFHNLNINVLTNYYV
IDVDKHSFHIQSSLNKNEKKKLSYGLLIWASGLAQTTLIQKFLKTIPVQANNAILKVDEKLRVIGIPSNNIYAIGDCKKI
QPKLLHEHTNEIIKILTKLTSEALKLKQSELTKTFPQLSISKWDYEKNKKGEMTPQQFHDYLFEIDKNYKSPTPTAQNAK
QEAYYLSNVFNNFIHTNQKFNIPSFIEKWKGSLAYIGNHQVVADLPYYELKGGRFSSTFWKVVYIQLLLSWKSRFHFFID
FIKTKWYGRPFIK

The query sequence (length=493) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5jwa:A	495	495	1.0000	0.9960	0.9960	0.0	5jwa:H, 5jwb:A, 5jwb:H, 5jwc:A, 5jwc:H
2	5yjy:B	465	321	0.2454	0.2602	0.3769	3.26e-50	5yjw:A, 5yjx:A, 5yjx:B, 5yjy:A
3	4g6h:A	472	339	0.2454	0.2564	0.3569	1.93e-48	4g6g:A, 4g6g:B, 4g6h:B, 4g73:A, 4g73:B, 4g74:A, 4g74:B, 4g9k:A, 4g9k:B, 4gap:A, 4gap:B, 4gav:A, 4gav:B
4	5na1:A	398	325	0.1562	0.1935	0.2369	5.20e-18	5na4:A
5	6bdo:D	395	328	0.1501	0.1873	0.2256	8.48e-18	6bdo:B, 6bdo:A, 6bdo:C, 5kmp:A, 5kmp:B, 5kmq:A, 5kmq:B, 5kmq:C, 5kmq:D, 5kmr:B, 5kmr:A, 5kmr:C, 5kmr:D, 5kms:A, 5kms:B, 5kms:C, 5kms:D, 4nwz:A, 4nwz:B, 4nwz:C, 4nwz:D, 5wed:B, 5wed:A, 5wed:C, 5wed:D
6	3t2z:A	427	131	0.0771	0.0890	0.2901	6.15e-06	3kpk:A, 3sx6:A, 3sxi:A, 3sy4:A, 3syi:A, 3sz0:A, 3szc:A, 3szf:A, 3szw:A, 3t0k:A, 3t14:A, 3t2k:A, 3t2y:A, 3t2z:B, 3t31:A
7	6cmz:A	462	148	0.0669	0.0714	0.2230	1.65e-05	6cmz:B, 6cmz:C, 6cmz:D
8	7xpi:A	363	288	0.1400	0.1901	0.2396	1.92e-05	7ytl:A
9	3h8i:A	356	152	0.0751	0.1039	0.2434	1.40e-04	3h8i:B, 3h8l:A, 3h8l:B
10	3ict:A	557	248	0.1055	0.0934	0.2097	3.19e-04	3icr:A, 3icr:B, 3ics:A, 3ics:B, 3ict:B
11	1ebd:A	455	180	0.0872	0.0945	0.2389	5.41e-04	1ebd:B
12	3hyv:A	429	118	0.0690	0.0793	0.2881	8.62e-04	3hyv:B, 3hyv:C, 3hyv:D, 3hyv:E, 3hyv:F, 3hyw:A, 3hyw:B, 3hyw:C, 3hyw:D, 3hyw:E, 3hyw:F, 3hyx:A, 3hyx:B, 3hyx:C, 3hyx:D, 3hyx:E, 3hyx:F
13	3cgb:A	444	322	0.1440	0.1599	0.2205	0.002	3cgb:B, 3cgc:A, 3cgc:B, 3cgd:A, 3cgd:B, 3cge:A, 3cge:B
14	1lvl:A	458	180	0.0872	0.0939	0.2389	0.002
15	1onf:A	439	121	0.0751	0.0843	0.3058	0.003
16	6mo6:B	414	237	0.1156	0.1377	0.2405	0.009	8dhk:A, 8dhk:B, 6mo6:A, 6mo6:C, 6mo6:D, 6mp5:A, 6mp5:B, 6mp5:C, 6mp5:D, 6oi5:A, 6oi5:B, 6oi6:A, 6oi6:B, 6oib:A, 6oib:B, 6oic:A, 6oic:B, 6wh6:A, 6wh6:B
17	1q1w:A	422	332	0.1258	0.1469	0.1867	0.035	3lb8:A, 3lb8:B, 1q1r:A, 1q1r:B, 1q1w:B
18	1xhc:A	346	139	0.0751	0.1069	0.2662	0.042
19	8ajk:B	447	240	0.1034	0.1141	0.2125	0.050	8ajj:C, 8ajj:A, 8ajj:B, 8ajj:D, 8ajk:A
20	3oc4:A	422	221	0.1095	0.1280	0.2443	0.14	3oc4:B
21	3klj:A	378	151	0.0892	0.1164	0.2914	0.14
22	1xdi:A	459	160	0.0710	0.0763	0.2188	0.16	1xdi:B
23	1aha:A	246	52	0.0325	0.0650	0.3077	0.32	1ahb:A, 5cf9:B, 5cix:A, 5cso:A, 5cst:A, 4emf:A, 4emr:A, 4f9n:A, 4fxa:A, 4fz9:A, 4guw:A, 4h0z:A, 4hoa:A, 4i47:A, 5ilw:A, 5ilx:A, 4jtp:A, 4k2z:A, 4kpv:A, 6loq:A, 6lor:A, 6lov:A, 6low:A, 6loy:A, 6loz:A, 6lp0:A, 4lt4:A, 4lwx:A, 4m5a:A, 1mrg:A, 1mrh:A, 3mry:A, 3my6:A, 3n1d:A, 3n1n:A, 3n2d:A, 3n31:A, 3n3x:A, 3n5d:A, 3nfm:A, 3njs:A, 3nx9:A, 4o0o:A, 4o4q:A, 4o8e:A, 3q4p:A, 4q9f:A, 3qji:A, 3rl9:A, 3sj6:A, 3u6t:A, 3u6z:A, 3u70:A, 3u8f:A, 3v14:A, 3v2k:A, 5wv1:A, 5y48:A, 4yp2:B, 4zt8:A, 4zu0:A, 4zz6:A
24	1hyu:A	521	80	0.0487	0.0461	0.3000	0.33	1fl2:A, 4o5q:A, 4o5u:A, 4xvg:A, 4ykf:A, 4ykg:A
25	6pfz:A	541	221	0.0994	0.0906	0.2217	0.57	6pfz:D, 6pfz:C, 6pfz:B
26	6kgy:B	441	155	0.0791	0.0884	0.2516	0.78	6kgy:A, 6kgy:C, 6kgy:D, 6kod:A, 6kod:B, 6kod:C, 6kod:D, 6kyy:A, 6kyy:B, 6kyy:C, 6kyy:D
27	3fg2:P	404	193	0.0872	0.1064	0.2228	0.99
28	2cdu:A	451	111	0.0588	0.0643	0.2613	1.8	2cdu:B
29	1q5e:A	404	97	0.0507	0.0619	0.2577	1.8	1pkf:A, 1q5d:A
30	8a56:B	539	232	0.0994	0.0909	0.2112	2.0	8a56:A
31	8wik:A	364	156	0.0751	0.1016	0.2372	3.1	8jsc:C
32	3l8k:A	458	233	0.0994	0.1070	0.2103	3.1	3l8k:B
33	7jm6:A	667	128	0.0629	0.0465	0.2422	3.5	7jm6:B
34	4i6z:B	200	55	0.0365	0.0900	0.3273	3.6	4i76:A
35	5d73:A	207	54	0.0365	0.0870	0.3333	5.3	5d73:B
36	5f0o:A	1018	50	0.0304	0.0147	0.3000	5.4
37	2pp1:A	395	65	0.0406	0.0506	0.3077	5.9	2pp1:B, 2pp1:C, 2pp1:D, 2pp1:E, 2pp1:F, 2pp3:A, 2pp3:B, 2pp3:C
38	5x1y:B	454	44	0.0284	0.0308	0.3182	6.1	5x1y:A, 5x1y:C, 5x1y:D, 5x1y:E, 5x1y:F
39	2bc0:A	473	252	0.1197	0.1247	0.2341	8.3	2bc0:B, 2bc1:A, 2bc1:B, 2bcp:A, 2bcp:B
40	6hm3:A	183	58	0.0345	0.0929	0.2931	10.0	4bu0:A, 4bu1:A, 4bu1:B, 6hm4:A

[Back]