Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
RISVAAPRLDGNERDYVLECMDTTWISSVGRFIVEFEKAFADYCGVKHAIACNNGTTALHLALVAMGIGPGDEVIVPSLT
YIASANSVTYCGATPVLVDNDPRTFNLDAAKLEALITPRTKAIMPVHLYGQICDMDPILEVARRHNLLVIEDAAEAVGAT
YRGKKSGSLGDCATFSFFGNAIITTGEGGMITTNDDDLAAKMRLLRGQGMDPNRRYWFPIVGFNYRMTNIQAAIGLAQLE
RVDEHLAARERVVGWYEQKLARLGNRVTKPHVALTGRHVFWMYTVRLGEGLSTTRDQVIKDLDALGIESRPVFHPMHIMP
PYAHLATDDLKIAEACGVDGLNLPTHAGLTEADIDRVIAALDQVLV

The query sequence (length=366) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3bn1:A 368 366 0.9973 0.9918 0.9973 0.0 3bn1:B, 3dr4:A, 3dr4:B, 3dr4:C, 3dr4:D, 3dr7:A, 3dr7:B, 3dr7:C, 3dr7:D
2 3nu7:B 359 335 0.3770 0.3844 0.4119 8.70e-76 3nu7:A, 3nub:A, 3nub:B, 3nys:A, 3nyt:A
3 3frk:A 365 335 0.3661 0.3671 0.4000 1.14e-72 3frk:B
4 8e77:A 358 331 0.3525 0.3603 0.3897 5.50e-66
5 2oga:A 371 334 0.3689 0.3639 0.4042 1.53e-62 2oga:B, 2oga:C, 2oga:D
6 1mdx:A 366 363 0.3552 0.3552 0.3581 1.96e-61 1mdo:A, 1mdz:A, 4oca:A
7 5u23:D 366 349 0.3388 0.3388 0.3553 8.93e-61 5u21:A, 5u21:B, 5u21:C, 5u21:D, 5u23:C, 5u23:A, 5u23:B, 5u24:A, 5u24:B, 5u24:C, 5u24:D
8 9bgr:B 371 339 0.3634 0.3585 0.3923 2.58e-60 9bgr:A
9 4ztc:A 385 383 0.3169 0.3013 0.3029 5.10e-60 1o61:A, 1o61:B, 1o69:A, 1o69:B
10 8snj:A 370 371 0.3579 0.3541 0.3531 6.15e-60 8sng:A, 8sng:B, 8snj:B, 8snj:C, 8snj:D, 8snj:E, 8snj:F, 8su6:A, 8su6:B
11 7n63:A 362 353 0.3333 0.3370 0.3456 1.17e-59
12 7l7x:AAA 395 366 0.3579 0.3316 0.3579 5.76e-59 7l7x:BBB
13 4qgr:A 376 356 0.3361 0.3271 0.3455 6.83e-57 4qgr:B
14 8vr5:B 376 339 0.3470 0.3378 0.3746 3.00e-55 8vr3:B, 8vr5:A, 8vr5:C, 8vr5:D
15 6ewq:C 402 397 0.3333 0.3035 0.3073 3.30e-54 6ewq:A, 6ewq:B, 6ewq:D, 6ewr:A, 6ewr:B, 6ewr:C, 6ewr:D
16 2po3:A 393 341 0.3333 0.3104 0.3578 8.72e-54 2po3:B
17 8gyj:B 428 309 0.3415 0.2921 0.4045 2.80e-52 8gyi:A, 8gyi:B, 8gyj:A
18 5w71:A 413 268 0.2842 0.2518 0.3881 5.82e-52 2c7t:A, 2c81:A, 5w71:B
19 3bb8:A 420 379 0.3087 0.2690 0.2982 3.59e-51 3bb8:B
20 3uwc:A 371 344 0.3333 0.3288 0.3547 9.20e-51
21 1b9h:A 384 333 0.3087 0.2943 0.3393 8.26e-50 1b9i:A
22 5uid:A 367 362 0.3142 0.3134 0.3177 1.54e-49 5uid:D
23 4k2m:A 442 361 0.3251 0.2692 0.3296 7.40e-49 4k2i:A, 4k2i:B, 4k2m:B
24 2fni:A 374 364 0.2896 0.2834 0.2912 1.07e-48 2fni:B, 2fnu:A, 2fnu:B
25 4zah:A 370 374 0.3279 0.3243 0.3209 1.25e-48 4zah:B, 4zah:C, 4zah:D, 4zah:E, 4zah:F, 4zah:G, 4zah:H
26 5w70:A 414 296 0.3033 0.2681 0.3750 3.61e-48 5w70:B
27 5k8b:A 394 213 0.2295 0.2132 0.3944 2.53e-47 5k8b:B, 5k8b:C, 5k8b:D
28 7kz3:D 439 357 0.3169 0.2642 0.3249 1.24e-46 7kz5:A, 7kz5:B, 7kz5:C, 7kz5:D, 7kz6:A, 7kz6:B, 7kz6:C, 7kz6:D, 7kzd:A, 7kzd:B, 7kzd:C, 7kzd:D, 7kzd:E, 7kzd:H, 7kzd:F, 7kzd:G
29 2gms:A 390 376 0.2541 0.2385 0.2473 6.63e-35 3b8x:A, 3b8x:B, 2gms:B, 2gmu:A, 2gmu:B, 3gr9:A, 3gr9:B, 3gr9:C, 3gr9:D, 3gr9:E, 3gr9:F, 3gr9:G, 3gr9:H, 2r0t:A, 2r0t:B
30 4zas:A 369 270 0.2514 0.2493 0.3407 2.06e-34 4zas:B, 4zas:D, 4zas:E, 4zas:F
31 4xau:C 374 364 0.3142 0.3075 0.3159 3.30e-32
32 7mfp:B 354 260 0.1721 0.1780 0.2423 3.64e-10 7mfo:A, 7mfo:B, 7mfo:C, 7mfo:D, 7mfo:E, 7mfo:F, 7mfo:G, 7mfo:H, 7mfo:I, 7mfo:J, 7mfp:A, 7mfp:C, 7mfp:D, 7mfq:A, 7mfq:B, 7mfq:C, 7mfq:D
33 6f35:A 400 117 0.1066 0.0975 0.3333 1.26e-08 6f35:B
34 1v2e:A 368 135 0.1120 0.1114 0.3037 2.39e-08 1v2d:A, 1v2e:B, 1v2f:A, 1v2f:B
35 6f77:A 399 81 0.0792 0.0727 0.3580 6.31e-06 6f77:C, 6f77:D, 6f77:E, 6f77:F
36 1gd9:A 388 171 0.1093 0.1031 0.2339 6.41e-05 1dju:A, 1dju:B, 1gd9:B, 1gde:A, 1gde:B
37 8wkj:A 391 58 0.0519 0.0486 0.3276 8.18e-05
38 1j32:A 388 115 0.0902 0.0851 0.2870 1.07e-04 1j32:B
39 4cvq:A 404 112 0.0929 0.0842 0.3036 3.05e-04 4cvq:B
40 5wml:A 404 111 0.0874 0.0792 0.2883 6.57e-04 6f5v:A, 6f5v:B, 6f5v:C, 6f5v:D, 5wmh:A, 5wmh:B, 5wmh:C, 5wmh:D, 5wmh:E, 5wmh:F, 5wmi:A, 5wml:B
41 1xi9:C 393 123 0.1066 0.0992 0.3171 0.001 1xi9:A, 1xi9:B, 1xi9:D
42 1b5o:A 382 113 0.0902 0.0864 0.2920 0.003 1b5o:B, 1b5p:A, 1b5p:B, 1bjw:A, 1bjw:B, 5bj3:A, 5bj3:B, 5bj3:C, 5bj3:D, 5bj4:A, 5bj4:B, 1bkg:A, 1bkg:B, 1bkg:C, 1bkg:D, 1gc3:A, 1gc3:B, 1gc3:C, 1gc3:D, 1gc3:E, 1gc3:F, 1gc3:G, 1gc3:H, 1gc4:A, 1gc4:B, 1gc4:C, 1gc4:D, 1gck:A, 1gck:B
43 1o4s:B 384 112 0.0738 0.0703 0.2411 0.003 1o4s:A
44 2zc0:A 405 111 0.0956 0.0864 0.3153 0.034 2zc0:B, 2zc0:C, 2zc0:D
45 7kb1:A 428 110 0.0874 0.0748 0.2909 0.054 7kb1:B, 7kb1:C, 7kb1:D
46 6hrh:A 429 152 0.1038 0.0886 0.2500 0.093 6hrh:B, 5qqq:B, 5qqq:A, 5qqr:B, 5qqr:A, 5qqs:B, 5qqs:A, 5qqt:B, 5qqt:A, 5qqu:B, 5qqu:A, 5qqv:B, 5qqv:A, 5qqw:B, 5qqw:A, 5qqx:B, 5qqx:A, 5qqy:B, 5qqy:A, 5qqz:B, 5qqz:A, 5qr0:B, 5qr0:A, 5qr1:B, 5qr1:A, 5qr2:B, 5qr2:A, 5qr3:B, 5qr3:A, 5qr4:B, 5qr4:A, 5qr5:B, 5qr5:A, 5qr6:B, 5qr6:A, 5qr7:B, 5qr7:A, 5qr8:B, 5qr8:A, 5qr9:B, 5qr9:A, 5qra:B, 5qra:A, 5qrb:B, 5qrb:A, 5qrc:B, 5qrc:A, 5qrd:B, 5qrd:A, 5qre:B, 5qre:A, 5qt3:B, 5qt3:A
47 1u08:A 382 119 0.0820 0.0785 0.2521 0.10 1u08:B
48 7yjm:B 471 135 0.0956 0.0743 0.2593 0.11 7yjk:B, 7yjk:F, 7yjn:B, 7yjo:B
49 6ldo:A 381 93 0.0847 0.0814 0.3333 0.15 6ldo:B, 6ldo:C, 6ldo:D, 6ldo:E, 6ldo:F, 6le4:A, 6le4:B, 6le4:C, 6le4:D, 6le4:E, 6le4:F
50 2o0r:A 385 85 0.0738 0.0701 0.3176 0.18 2o0r:B
51 8j6n:A 390 189 0.1284 0.1205 0.2487 0.21 8j6n:D, 8j6n:B, 8j6n:C, 8j6n:E, 8j6n:H, 8j6n:J, 8j6n:K, 8j6n:F, 8j6n:G, 8j6n:I, 8j6n:L
52 3e2y:A 410 101 0.0710 0.0634 0.2574 0.97 3e2y:B, 3e2z:A, 3e2z:B, 5vep:A, 5veq:A, 5veq:B, 5ver:A, 5ver:B
53 6k61:A 742 43 0.0492 0.0243 0.4186 1.0 6jeo:aA, 6jeo:bA, 6jeo:cA, 6jeo:dA, 6k61:a, 6tcl:A1, 6tcl:A2, 6tcl:A, 6tcl:AA, 7y3f:A
54 4r2n:A 353 94 0.0765 0.0793 0.2979 1.0 4r2n:C, 4r2n:B, 4r2n:D, 4r5z:A, 4r5z:B, 4r5z:C, 4r5z:D
55 6qp0:A 188 48 0.0492 0.0957 0.3750 1.6
56 7lx0:G 751 43 0.0519 0.0253 0.4419 1.9 7lx0:a, 7lx0:A, 6pnj:A, 6pnj:G, 6pnj:a
57 8wm6:A 742 43 0.0519 0.0256 0.4419 1.9 8wmj:A, 8wmv:A, 8wmw:A, 7y7b:A, 7y8a:A
58 6kif:A 751 43 0.0546 0.0266 0.4651 2.0 6kif:G, 6kif:e, 6kig:A, 6kig:G, 6kig:e
59 7qco:A 728 43 0.0492 0.0247 0.4186 2.2 7qco:E, 7qco:e, 7qco:a
60 7coy:aA 685 43 0.0519 0.0277 0.4419 2.5 7coy:bA, 7coy:cA
61 7dwq:A 726 43 0.0519 0.0262 0.4419 2.7
62 7blz:A 743 28 0.0410 0.0202 0.5357 3.0 6fos:A, 8wey:A, 5zgb:A, 5zgh:A
63 7yca:A 742 43 0.0519 0.0256 0.4419 3.1 7a4p:A, 7bgi:A, 7blx:A, 8cmo:A, 7d0j:A, 7dz7:A, 7dz8:A, 8h2u:A, 6ijj:A, 6ijo:A, 6jo5:A, 6jo6:A, 7r3k:A, 7wyi:A, 7wzn:A, 7zq9:A, 7zqc:A, 7zqd:A, 7zqd:A2, 6zzx:A, 6zzy:A
64 7c8j:A 707 35 0.0301 0.0156 0.3143 3.3 7c8k:A, 8k4u:B, 8u0t:A, 7xa7:A, 7xa7:C, 7xa7:E, 7xa7:G
65 5l8r:A 743 43 0.0519 0.0256 0.4419 3.9 8bcv:A, 8bcw:A, 7dkz:A, 7ew6:A, 7ewk:A, 7f9o:A, 7f9o:e, 8htu:A, 8j6z:A, 8j7a:A, 8j7b:A, 7ksq:A, 7kux:A, 6l35:A, 3lw5:A, 2o01:A, 4rku:A, 7wfd:AA, 7wfe:BA, 7wg5:AA, 7wg5:BA, 8wgh:A, 2wsc:A, 2wse:A, 2wsf:A, 4xk8:A, 4xk8:a, 7xqp:A, 4y28:A, 6yac:A, 6yez:A, 5zji:A, 6zoo:A, 6zxs:A
66 6igz:A 740 32 0.0410 0.0203 0.4688 4.2 6qph:A, 6rhz:A, 6sl5:A, 6yxr:A
67 7y5e:AN 745 43 0.0492 0.0242 0.4186 4.8 7y5e:A2, 7y7a:A7, 7y7a:Ao
68 6ly5:a 742 43 0.0492 0.0243 0.4186 4.9 6l4u:A
69 7dr0:A 739 37 0.0410 0.0203 0.4054 5.2 7dr1:A, 7dr2:aA, 7dr2:bA, 7dr2:cA, 7dr2:dA
70 7x5o:B 412 157 0.1038 0.0922 0.2420 5.8 7v3d:A, 7v3d:B, 7x5n:A, 7x5n:B, 7x5o:A
71 8ffu:A 360 110 0.0738 0.0750 0.2455 5.8 8fft:A, 8fft:B, 8fft:C, 8fft:D, 8ffu:B, 8ffu:C, 8ffu:D
72 6tgh:A 410 142 0.0847 0.0756 0.2183 5.9 6tgh:C, 6tgh:B, 6tgh:D, 6ti1:A, 6ti1:C, 6ti3:A, 6ti3:C, 6ti3:B, 6ti3:D, 6ti4:A, 6ti4:C, 4wxf:A, 4wxf:C, 4wxg:A, 4wxg:C, 6yrw:A, 6yrw:C, 6yrw:B, 6yrw:D
73 6kmx:aA 717 27 0.0383 0.0195 0.5185 7.2 6kmx:bA, 6kmx:cA
74 7pub:DL 291 133 0.0874 0.1100 0.2406 7.7 7pua:DL
75 6mgr:C 369 65 0.0492 0.0488 0.2769 8.0 6mgr:A, 6mgr:B, 6mgr:D, 4mz1:A, 4mz1:B, 4mz1:C, 4mz8:A, 4mz8:B, 4mz8:C, 4mz8:D, 4r7j:A, 5uqf:A, 5uqf:B, 5uqf:C, 5uqg:A, 5uqg:B, 5uqg:H, 5uqg:C, 5uqg:G, 5uqg:D, 5uqg:E, 5uqg:F, 5uqh:A, 5uqh:B, 5uqh:C, 5uqh:D, 5uqh:E, 5uqh:F, 5uqh:G, 5uqh:H, 5urq:A, 5urq:D, 5urq:B, 5urq:C, 5urq:E, 5urq:H, 5urq:F, 5urq:G
76 6kmw:aA 721 32 0.0383 0.0194 0.4375 8.1 6kmw:bA, 6kmw:cA
77 3mc6:A 426 78 0.0492 0.0423 0.2308 8.5 3mc6:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218