BioLiP

>protein
RHTVTMIPGDGIGPELMLHVKSVFRHACVPVDFEEVHVSSNADEEDIRNAIMAIRRNRVALKGNIETNHNLPPSHKSRNN
ILRTSLDLYANVIHCKSLPGVVTRHKDIDILIVRENTEGEYSSLEHESVAGVVESLKIITKAKSLRIAEYAFKLAQESGR
KKVTAVHKANIMKLGDGLFLQCCREVAARYPQITFENMIVDNTTMQLVSRPQQFDVMVMPNLYGNIVNNVCAGLVGGPGL
VAGANYGHVYAVFETATRNTGKSIANKNIANPTATLLASCMMLDHLKLHSYATSIRKAVLASMDNENMHTPDIGGQGTTS
EAIQDVIRHIRVI

The query sequence (length=333) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5grf:B	335	333	0.9970	0.9910	0.9970	0.0	5gre:B, 5gri:B, 5grl:B, 6l57:B, 6l59:B, 5yvt:B
2	6kdy:D	342	331	0.5345	0.5205	0.5378	3.65e-124	8grd:B, 8gru:B, 8gru:D, 6kdy:B, 6kdy:F
3	3blv:C	344	331	0.4895	0.4738	0.4924	7.29e-113	3blv:A, 3blv:E, 3blv:G, 3blw:A, 3blw:C, 3blw:E, 3blw:G, 3blw:I, 3blw:K, 3blw:M, 3blw:O
4	6kde:A	336	335	0.4414	0.4375	0.4388	2.13e-93	5gre:A, 5grh:A, 5gri:A, 5grl:A, 8grd:A, 8gru:A, 8gru:C, 6kde:C, 6kdy:A, 6kdy:C, 6kdy:E, 6kdy:G, 6ke3:A, 6ke3:C, 6ke3:E, 6ke3:G, 6l57:A, 6l59:A, 5yvt:A
5	6m3s:B	338	325	0.4354	0.4290	0.4462	2.51e-81	6m3s:A
6	3blw:F	347	338	0.4144	0.3977	0.4083	1.08e-80	3blw:H, 3blw:J
7	6lky:A	339	343	0.4204	0.4130	0.4082	5.81e-77	6lky:B
8	2d1c:A	495	340	0.3784	0.2545	0.3706	1.02e-65	2d1c:B
9	3asj:A	333	334	0.3664	0.3664	0.3653	5.62e-60	3asj:B, 3asj:C, 3asj:D, 4yb4:A, 4yb4:B, 4yb4:C, 4yb4:D
10	4y1p:B	336	339	0.3724	0.3690	0.3658	3.39e-59	4y1p:A
11	5hn4:A	329	337	0.3423	0.3465	0.3383	3.80e-44	5hn6:A
12	3ty3:A	358	358	0.3333	0.3101	0.3101	3.85e-42	3ty3:B
13	2y42:D	355	348	0.3093	0.2901	0.2960	4.84e-37	4f7i:A, 4f7i:B, 4f7i:C, 4f7i:D, 1hex:A, 4wuo:A, 4wuo:B, 2y40:A, 2y40:B, 2y41:A, 2y41:B, 2y42:A, 2y42:B, 2y42:C, 2ztw:A
14	2e5m:A	403	353	0.3033	0.2506	0.2861	6.76e-37	2e5m:B
15	2iv0:A	412	350	0.3033	0.2451	0.2886	2.71e-36	2iv0:B
16	1tyo:A	427	391	0.3544	0.2763	0.3018	5.50e-34	1xkd:A, 1xkd:B
17	3vmk:A	369	337	0.3183	0.2873	0.3145	2.22e-33	3vmk:B, 3vml:A
18	1a05:A	357	339	0.2943	0.2745	0.2891	2.62e-33	1a05:B
19	2g4o:A	337	330	0.2973	0.2938	0.3000	1.04e-32	2g4o:D
20	3vkz:A	364	332	0.3033	0.2775	0.3042	2.99e-32	3vl2:A, 3vl3:A, 3vl4:A, 3vl6:A, 3vl7:A, 3vmj:A, 3wzv:A, 3wzw:A, 3wzx:A, 3wzy:A
21	1cnz:A	363	357	0.3153	0.2893	0.2941	7.54e-32	1cnz:B
22	3flk:A	359	366	0.3123	0.2897	0.2842	3.75e-30	3flk:B, 3flk:C, 3flk:D, 3fmx:X
23	5j32:A	369	350	0.3003	0.2710	0.2857	8.03e-30	5j32:B, 5j32:C, 5j32:D, 5j33:A, 5j33:B, 5j33:C, 5j33:H, 5j33:D, 5j33:F, 5j33:E, 5j33:G, 5j34:A, 5j34:B, 5j34:C, 5j34:D
24	6xxy:A	358	327	0.2913	0.2709	0.2966	1.29e-29	6xxy:B
25	2d4v:A	427	374	0.3213	0.2506	0.2861	1.05e-28	2d4v:B, 2d4v:C, 2d4v:D
26	6c0e:A	419	391	0.3033	0.2411	0.2583	8.52e-26	6c0e:B
27	4aj3:A	416	360	0.2973	0.2380	0.2750	5.93e-25	1ai2:A, 1ai3:A, 4aja:A, 4ajb:A, 4ajc:A, 4ajr:A, 4ajs:A, 1bl5:A, 1cw1:A, 1cw4:A, 1cw7:A, 1gro:A, 1grp:A, 1hj6:A, 9icd:A, 1idc:A, 1ide:A, 1ika:A, 1iso:A
28	4iwh:A	358	340	0.2763	0.2570	0.2706	4.24e-23	4iwh:B, 4xxv:A, 4xxv:B
29	1gn9:A	543	105	0.0751	0.0460	0.2381	0.99	1gn9:B, 1gnl:A, 1gnl:B, 1oa0:A, 1oa0:B, 1upx:A, 1upx:B
30	6lu4:A	481	76	0.0691	0.0478	0.3026	2.2	6lu3:A
31	4aci:B	177	67	0.0571	0.1073	0.2836	2.6	4aci:A, 4af5:A
32	4kpo:A	317	46	0.0390	0.0410	0.2826	3.5	4kpo:B, 6zk5:A, 6zk5:B
33	6zk3:A	319	49	0.0480	0.0502	0.3265	5.8	6zk1:A, 6zk1:B, 6zk1:C, 6zk1:D, 6zk2:A, 6zk2:B, 6zk2:C, 6zk2:D, 6zk3:B, 6zk3:C, 6zk3:D, 6zk3:E, 6zk3:F, 6zk4:A, 6zk4:B, 6zk4:C, 6zk4:D
34	7pub:CI	427	125	0.0961	0.0749	0.2560	7.7	6hiv:CI, 6hiw:CI, 7pua:CI, 6sg9:CI, 6sgb:CI
35	7m0d:B	340	58	0.0511	0.0500	0.2931	7.8	2bcq:A, 2bcr:A, 2bcs:A, 2bcu:A, 2bcv:A, 3c5f:A, 3c5f:B, 3c5g:A, 3c5g:B, 5ca7:B, 5ca7:A, 5chg:A, 5chg:B, 5cj7:A, 5cj7:B, 5cp2:B, 5cr0:A, 5cr0:B, 5cwr:A, 5cwr:B, 5ddm:B, 5ddy:A, 5ddy:C, 5ddy:E, 5ddy:G, 5dkw:A, 5dkw:B, 4fo6:A, 2gws:A, 2gws:E, 2gws:I, 2gws:M, 3hw8:A, 3hwt:A, 3hx0:A, 3hx0:F, 3hx0:K, 3hx0:P, 5iii:A, 5iij:A, 5iik:A, 5iil:A, 5iim:A, 5iin:A, 5iio:A, 5iio:M, 5iio:E, 5iio:I, 4k4g:A, 4k4g:M, 4k4g:E, 4k4g:I, 4k4h:A, 4k4h:E, 4k4h:I, 4k4h:M, 4k4i:A, 4k4i:E, 4k4i:I, 4k4i:M, 7m07:A, 7m08:A, 7m09:A, 7m0a:A, 7m0b:A, 7m0c:A, 7m0d:A, 7m0e:A, 7m0e:B, 7m0e:C, 7m0e:D, 7m43:A, 7m44:A, 7m45:A, 7m46:A, 7m47:A, 7m48:A, 7m49:A, 7m4a:A, 7m4b:A, 7m4c:A, 7m4d:A, 7m4e:A, 7m4f:A, 7m4g:A, 7m4h:A, 7m4i:A, 7m4j:A, 7m4k:A, 7m4l:A, 3mda:A, 3mdc:A, 3mgh:A, 3mgh:C, 3mgi:A, 2pfn:A, 2pfo:A, 2pfp:A, 2pfq:A, 3pml:A, 3pml:B, 3pmn:A, 3pnc:A, 1rzt:A, 1rzt:M, 1rzt:E, 1rzt:I, 8u0o:A, 8u0p:A, 7un7:A, 3upq:A, 3uq0:A, 3uq2:A, 4x5v:A, 4xa5:A, 4xq8:B, 4xq8:A, 4xrh:B, 4xrh:A, 1xsl:A, 1xsl:E, 1xsl:I, 1xsl:M, 1xsn:A, 1xsp:A, 4xus:A

[Back]