BioLiP

>protein
RGQRGCEHYDRGCLLKAPCCDKLYTCRLCHDNNEDHQLDRFKVKEVQCINCEKIQHAQQTCEECSTLFGEYYCDICHLFD
KDKKQYHCENCGICRIGPKEDFFHCLKCNLCLAMNLQGRHKCIENVSRQNCPICLEDIHTSRVVAHVLPCGHLLHRTCYE
EMLKEGYRCPLCMHSALGSGSGAAAAAA

The query sequence (length=188) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7ynx:A	188	188	1.0000	1.0000	1.0000	8.55e-138	2jrj:A, 7ynx:B
2	2k2c:A	137	123	0.6543	0.8978	1.0000	2.19e-87
3	2dkt:A	143	125	0.5904	0.7762	0.8880	7.19e-80
4	2ecm:A	55	50	0.2287	0.7818	0.8600	3.39e-25
5	2lxh:C	58	50	0.0957	0.3103	0.3600	6.70e-05	2lxp:C
6	4lad:B	69	48	0.1011	0.2754	0.3958	3.50e-04
7	2ct2:A	88	45	0.0957	0.2045	0.4000	0.001	5fey:A, 5fey:B
8	2ect:A	78	48	0.1011	0.2436	0.3958	0.001
9	1x4j:A	75	52	0.1064	0.2667	0.3846	0.002
10	4v3k:C	75	46	0.0957	0.2400	0.3913	0.002	7ojx:A, 4v3k:F, 4v3l:C
11	7bvw:A	79	47	0.1011	0.2405	0.4043	0.004	7bvw:B
12	5d0m:C	60	45	0.0798	0.2500	0.3333	0.016	5ulh:C, 5ulk:C
13	6f98:A	78	25	0.0585	0.1410	0.4400	0.018
14	2kiz:A	69	43	0.0851	0.2319	0.3721	0.018	5lg0:A, 5lg7:A, 7p2k:A
15	6w7z:B	71	55	0.0904	0.2394	0.3091	0.025	6w9a:B, 6w9a:D, 6w9d:B, 6w9d:E, 6w9d:H
16	7r70:A	150	44	0.0851	0.1067	0.3636	0.059	5d0i:A, 5d0i:B, 5d0k:C, 5d0k:F, 5d0k:I, 5d0k:L, 7r70:B, 7r71:A
17	6a3z:A	56	47	0.0851	0.2857	0.3404	0.069
18	1chc:A	68	44	0.0851	0.2353	0.3636	0.093
19	2ep4:A	74	47	0.0957	0.2432	0.3830	0.12
20	7dco:M	176	120	0.1702	0.1818	0.2667	0.12	5gm6:a
21	2l0b:A	91	42	0.0851	0.1758	0.3810	0.30
22	6m4f:C	543	43	0.0851	0.0295	0.3721	0.67	6m4e:A, 6m4f:E, 6m55:A, 6m55:D
23	2ea6:A	69	47	0.0798	0.2174	0.3191	0.94
24	2b7r:A	568	76	0.0957	0.0317	0.2368	1.2	2b7s:A, 1e39:A, 1jrx:A, 1jrx:B, 1jry:A, 1jry:B, 1jrz:A, 1jrz:B, 1kss:A, 1ksu:A, 1ksu:B, 1lj1:A, 1lj1:B, 1m64:A, 1m64:B, 1p2e:A, 1p2h:A, 1q9i:A, 1qjd:A, 1y0p:A
25	1iym:A	55	42	0.0691	0.2364	0.3095	1.6
26	7oni:R	86	33	0.0585	0.1279	0.3333	2.7	2ecl:A, 6v9i:R
27	5zbu:A	74	50	0.0851	0.2162	0.3200	3.0	5zbu:D, 5zc4:A, 5zc4:D
28	5ait:A	129	47	0.0798	0.1163	0.3191	3.3	5aiu:A, 4ap4:A, 3ng2:A, 3ng2:B, 4ppe:A, 4ppe:B, 2xeu:A
29	5ait:A	129	47	0.0798	0.1163	0.3191	3.3	5aiu:A, 4ap4:A, 3ng2:A, 3ng2:B, 4ppe:A, 4ppe:B, 2xeu:A
30	5dka:A	96	59	0.0957	0.1875	0.3051	3.7	5dka:B, 8gbq:B, 8gcb:B
31	8pmq:9	412	56	0.0904	0.0413	0.3036	4.1
32	5aie:A	54	45	0.0691	0.2407	0.2889	4.7
33	5ywr:B	87	40	0.0691	0.1494	0.3250	4.7
34	7t92:C	317	56	0.0798	0.0473	0.2679	5.0
35	7ns4:i	358	56	0.0904	0.0475	0.3036	6.3
36	1kyw:C	361	32	0.0479	0.0249	0.2812	7.8	1kyw:F, 1kyz:A, 1kyz:C, 1kyz:E
37	8adl:A	633	112	0.1543	0.0458	0.2589	10.0	8adl:I

[Back]