BioLiP

>protein
RGQIQVILGPMFSGKSTELMRRVRRFQIAQYKCLVIKYAKDTREALPACLLRDVAQEALGVAVIGIDEGQFFPDIVEFCE
AMANAGKTVIVAALDGTFQRKPFGAILNLVPLAESVVKLTAVCMECFREAAYTKRLGTEKEVEVIGGADKYHSVCRLCYF
K

The query sequence (length=161) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1w4r:A	174	174	1.0000	0.9253	0.9253	1.34e-113	2orv:A, 2orv:B, 1w4r:B, 1w4r:C, 1w4r:D, 1w4r:E, 1w4r:F, 1w4r:G, 1w4r:H, 2wvj:A, 2wvj:B, 2wvj:C, 2wvj:D, 2wvj:E, 2wvj:F, 2wvj:G, 2wvj:H, 1xbt:A, 1xbt:B, 1xbt:C, 1xbt:D, 1xbt:E, 1xbt:F, 1xbt:G, 1xbt:H
2	2j87:D	171	169	0.7143	0.6725	0.6805	3.34e-80	2j87:A, 2j87:B, 2j87:C
3	5fuv:A	173	167	0.5342	0.4971	0.5150	3.70e-53	5fuv:B, 5fuw:A, 5fuw:B, 5fux:A, 5fux:B, 5fuy:A, 5fuy:B, 5fuy:C, 5fuy:D, 5fuy:E, 5fuy:F
4	4uxh:A	173	175	0.5652	0.5260	0.5200	1.24e-52	4uxh:B, 4uxi:A, 4uxi:B, 4uxj:A, 4uxj:B, 4uxj:C, 4uxj:D, 4uxj:E, 4uxj:F, 4uxj:G, 4uxj:H
5	2ja1:A	193	181	0.4410	0.3679	0.3923	6.54e-31	2j9r:A
6	2uz3:B	207	181	0.4099	0.3188	0.3646	1.63e-27	2b8t:A, 2b8t:B, 2b8t:C, 2b8t:D, 2uz3:A, 2uz3:C, 2uz3:D
7	1xx6:A	178	170	0.4224	0.3820	0.4000	3.24e-27	1xx6:B
8	3e2i:A	175	170	0.3975	0.3657	0.3765	7.43e-27
9	2orw:B	173	171	0.3851	0.3584	0.3626	1.97e-22	2orw:A, 2qpo:A, 2qpo:B, 2qpo:C, 2qpo:D, 2qq0:A, 2qq0:B, 2qqe:A, 2qqe:B
10	3zv9:A	188	67	0.1056	0.0904	0.2537	0.27	9ax9:A, 7gnv:B, 7gnw:A, 7gnx:A, 7gny:B, 7gnz:A, 7gnz:B, 7go0:B, 7go1:A, 7go1:B, 7go2:A, 7go3:A, 7go3:B, 7go4:B, 7go5:A, 7go5:B, 7go6:A, 7go6:B, 7go7:B, 7go8:A, 7go9:A, 7goa:B, 7gob:B, 7goc:B, 7god:B, 7goe:B, 7gof:B, 7gog:B, 7goh:A, 7goh:B, 7goi:A, 7goj:A, 7goj:B, 7gok:A, 7gok:B, 7gol:A, 7gom:B, 7gon:B, 7goo:A, 7goo:B, 7gop:B, 7goq:A, 7gor:A, 7gos:A, 7gos:B, 7got:B, 7gou:A, 7gou:B, 7gov:B, 7gow:A, 7gox:A, 7goy:A, 7goz:B, 7gp0:A, 7gp0:B, 7gp1:B, 7gp2:A, 7gp3:A, 7gp4:A, 7gp4:B, 7gp5:B, 7gp6:B, 7gp7:A, 7gp8:B, 7gp9:A, 7gpa:B, 7gpc:B, 7gpd:B, 7gpe:A, 7gpf:A, 7gpg:B, 7gph:B, 7gpi:B, 7gpj:B, 7gpk:B, 7gpl:A, 7gpm:B, 7gpn:A, 7gpo:B, 7gpp:A, 7gpq:A, 7gpr:A, 7gps:B, 7gpt:A, 7gpu:A, 7gpu:B, 7gpv:B, 7gpw:A, 7gpw:B, 7gpx:B, 7gpy:A, 7gpy:B, 7gpz:B, 7gq0:B, 7gq1:A, 7gq1:B, 7gq2:A, 7gq3:B, 7gq4:A, 7gq5:A, 7gq5:B, 7gq6:B, 7gq7:A, 7gq8:A, 7gq8:B, 7gq9:A, 7gqa:B, 7gqb:B, 7gqc:A, 7gqc:B, 7gqd:B, 7gqe:B, 7gqf:A, 7gqg:B, 7gqh:A, 7gqi:A, 7gqj:A, 7gqj:B, 7gqk:B, 7gql:A, 7gql:B, 7gqm:A, 7gqn:A, 7gqn:B, 7gqo:B, 7gqp:A, 7gqq:B, 7gqr:B, 7l8h:A, 7l8h:B, 3zva:A, 3zvb:A, 3zvc:A, 3zvd:A, 3zve:A, 3zvf:A, 3zvg:A
11	6ghc:B	286	56	0.0994	0.0559	0.2857	2.2	6ghc:A, 6r64:A, 6r64:B, 6t21:A, 6t21:B, 6t22:A, 6t22:B
12	2dgn:A	431	33	0.0870	0.0325	0.4242	2.3	1iwe:A, 1iwe:B, 1lny:A, 1lny:B, 1lon:A, 1loo:A, 1mez:A, 1mf0:A, 1mf1:A
13	2v40:A	419	33	0.0870	0.0334	0.4242	3.6
14	7qd1:A	311	119	0.2050	0.1061	0.2773	3.7	7qcz:A, 7qd0:A, 7qd1:C, 7qd2:A, 7qd2:C
15	3qn3:A	415	43	0.0870	0.0337	0.3256	3.8	3qn3:B, 3qn3:C, 3qn3:D
16	1m7j:A	474	67	0.1180	0.0401	0.2836	9.3	1rjp:A, 1rjq:A, 1rjr:A, 1rk5:A, 1rk6:A, 1v4y:A, 1v51:A

[Back]