BioLiP

>protein
RGQIQVILGPMFSGKSTELMRRVRRFQIAQYKCLVIKYAKDTRALPACLLRDVAQEALGVAVIGIDEGQFFPDIVEFCEA
MANAGKTVIVAALDGTFQRKPFGAILNLVPLAESVVKLTAVCMECFREAAYTKRLGTEKEVEVIGGADKYHSVCRLCYFK
K

The query sequence (length=161) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1w4r:A	174	174	0.9938	0.9195	0.9195	1.09e-112	2orv:A, 2orv:B, 1w4r:B, 1w4r:C, 1w4r:D, 1w4r:E, 1w4r:F, 1w4r:G, 1w4r:H, 2wvj:A, 2wvj:B, 2wvj:C, 2wvj:D, 2wvj:E, 2wvj:F, 2wvj:G, 2wvj:H, 1xbt:A, 1xbt:B, 1xbt:C, 1xbt:D, 1xbt:E, 1xbt:F, 1xbt:G, 1xbt:H
2	2j87:D	171	169	0.7081	0.6667	0.6746	2.65e-79	2j87:A, 2j87:B, 2j87:C
3	5fuv:A	173	170	0.5404	0.5029	0.5118	4.75e-53	5fuv:B, 5fuw:A, 5fuw:B, 5fux:A, 5fux:B, 5fuy:A, 5fuy:B, 5fuy:C, 5fuy:D, 5fuy:E, 5fuy:F
4	4uxh:A	173	175	0.5590	0.5202	0.5143	8.86e-52	4uxh:B, 4uxi:A, 4uxi:B, 4uxj:A, 4uxj:B, 4uxj:C, 4uxj:D, 4uxj:E, 4uxj:F, 4uxj:G, 4uxj:H
5	2ja1:A	193	181	0.4410	0.3679	0.3923	1.05e-30	2j9r:A
6	2uz3:B	207	181	0.4099	0.3188	0.3646	2.04e-27	2b8t:A, 2b8t:B, 2b8t:C, 2b8t:D, 2uz3:A, 2uz3:C, 2uz3:D
7	1xx6:A	178	169	0.4224	0.3820	0.4024	8.28e-27	1xx6:B
8	3e2i:A	175	170	0.3975	0.3657	0.3765	1.88e-25
9	2orw:B	173	171	0.3727	0.3468	0.3509	9.23e-23	2orw:A, 2qpo:A, 2qpo:B, 2qpo:C, 2qpo:D, 2qq0:A, 2qq0:B, 2qqe:A, 2qqe:B
10	3zv9:A	188	69	0.1118	0.0957	0.2609	0.033	9ax9:A, 7gnv:B, 7gnw:A, 7gnx:A, 7gny:B, 7gnz:A, 7gnz:B, 7go0:B, 7go1:A, 7go1:B, 7go2:A, 7go3:A, 7go3:B, 7go4:B, 7go5:A, 7go5:B, 7go6:A, 7go6:B, 7go7:B, 7go8:A, 7go9:A, 7goa:B, 7gob:B, 7goc:B, 7god:B, 7goe:B, 7gof:B, 7gog:B, 7goh:A, 7goh:B, 7goi:A, 7goj:A, 7goj:B, 7gok:A, 7gok:B, 7gol:A, 7gom:B, 7gon:B, 7goo:A, 7goo:B, 7gop:B, 7goq:A, 7gor:A, 7gos:A, 7gos:B, 7got:B, 7gou:A, 7gou:B, 7gov:B, 7gow:A, 7gox:A, 7goy:A, 7goz:B, 7gp0:A, 7gp0:B, 7gp1:B, 7gp2:A, 7gp3:A, 7gp4:A, 7gp4:B, 7gp5:B, 7gp6:B, 7gp7:A, 7gp8:B, 7gp9:A, 7gpa:B, 7gpc:B, 7gpd:B, 7gpe:A, 7gpf:A, 7gpg:B, 7gph:B, 7gpi:B, 7gpj:B, 7gpk:B, 7gpl:A, 7gpm:B, 7gpn:A, 7gpo:B, 7gpp:A, 7gpq:A, 7gpr:A, 7gps:B, 7gpt:A, 7gpu:A, 7gpu:B, 7gpv:B, 7gpw:A, 7gpw:B, 7gpx:B, 7gpy:A, 7gpy:B, 7gpz:B, 7gq0:B, 7gq1:A, 7gq1:B, 7gq2:A, 7gq3:B, 7gq4:A, 7gq5:A, 7gq5:B, 7gq6:B, 7gq7:A, 7gq8:A, 7gq8:B, 7gq9:A, 7gqa:B, 7gqb:B, 7gqc:A, 7gqc:B, 7gqd:B, 7gqe:B, 7gqf:A, 7gqg:B, 7gqh:A, 7gqi:A, 7gqj:A, 7gqj:B, 7gqk:B, 7gql:A, 7gql:B, 7gqm:A, 7gqn:A, 7gqn:B, 7gqo:B, 7gqp:A, 7gqq:B, 7gqr:B, 7l8h:A, 7l8h:B, 3zva:A, 3zvb:A, 3zvc:A, 3zvd:A, 3zve:A, 3zvf:A, 3zvg:A
11	3qvs:A	392	73	0.1118	0.0459	0.2466	0.17	3qvt:A, 3qvw:A, 3qvx:A, 3qw2:A, 3qw2:B, 3qw2:C, 3qw2:D, 1u1i:A, 1u1i:B, 1u1i:C, 1u1i:D
12	4u00:A	241	46	0.1242	0.0830	0.4348	0.96
13	6ghc:B	286	56	0.0994	0.0559	0.2857	2.3	6ghc:A, 6r64:A, 6r64:B, 6t21:A, 6t21:B, 6t22:A, 6t22:B
14	2dgn:A	431	33	0.0870	0.0325	0.4242	2.3	1iwe:A, 1iwe:B, 1lny:A, 1lny:B, 1lon:A, 1loo:A, 1mez:A, 1mf0:A, 1mf1:A
15	2v40:A	419	33	0.0870	0.0334	0.4242	3.6
16	8tj5:0	1246	70	0.1118	0.0144	0.2571	6.5	8tj5:Y
17	1m7j:A	474	67	0.1180	0.0401	0.2836	8.7	1rjp:A, 1rjq:A, 1rjr:A, 1rk5:A, 1rk6:A, 1v4y:A, 1v51:A

[Back]