Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RELKLLLLGTGESGKSTFIKQMRIIHGSGYSDEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLKIPYKYEHNKAHAQLVREVD
VEKVSAFENPYVDAIKSLWNDPGIQECYDRRREYQLSDSTKYYLNDLDRVADPAYLPTQQDVLRVRVPTTGIIEYPFDLQ
SVIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLVESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKD
LLEEKIMYSHLVDYFPEYDGPQRDAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLN

The query sequence (length=315) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8iys:A 355 319 1.0000 0.8873 0.9875 0.0 3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
2 7rkf:A 350 315 0.9111 0.8200 0.9111 0.0
3 1agr:A 350 320 0.5524 0.4971 0.5437 4.84e-116 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
4 3v00:C 353 317 0.5270 0.4703 0.5237 4.25e-109 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
5 3c7k:C 311 311 0.5143 0.5209 0.5209 1.62e-108 3c7k:A
6 1shz:D 327 324 0.5111 0.4924 0.4969 9.35e-108 1shz:A
7 3ab3:A 322 323 0.4794 0.4689 0.4675 2.33e-101 3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
8 1zca:A 318 325 0.4540 0.4497 0.4400 4.04e-96 1zca:B
9 3ffb:A 327 320 0.4952 0.4771 0.4875 1.76e-93 1bof:A, 1gdd:A, 4pan:A
10 8htg:B 334 331 0.4222 0.3982 0.4018 1.14e-81 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
11 6eg8:I 372 332 0.4317 0.3656 0.4096 1.31e-79 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
12 2xtz:A 343 335 0.3937 0.3615 0.3701 1.76e-65
13 8uo1:A 334 331 0.4032 0.3802 0.3837 8.07e-65 8gga:A
14 8ggb:A 310 329 0.4159 0.4226 0.3982 1.64e-63 8gg9:A, 8ggc:A
15 4fid:A 318 316 0.3524 0.3491 0.3513 1.18e-62 4fid:B
16 2xtz:B 291 324 0.3619 0.3918 0.3519 3.26e-61
17 8pjk:A 222 167 0.2889 0.4099 0.5449 3.21e-55 7e2x:A, 7e2z:A
18 8pjk:A 222 34 0.0603 0.0856 0.5588 5.87e-04 7e2x:A, 7e2z:A
19 2xtz:C 270 324 0.3492 0.4074 0.3395 5.24e-52
20 8uo4:A 292 326 0.3714 0.4007 0.3589 8.96e-49 8uo2:A
21 8fn0:B 212 166 0.2603 0.3868 0.4940 3.99e-43
22 8fn0:B 212 27 0.0540 0.0802 0.6296 0.001
23 8unx:A 244 182 0.2540 0.3279 0.4396 2.51e-41 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
24 8unx:A 244 21 0.0540 0.0697 0.8095 0.001 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
25 8xql:A 240 183 0.2444 0.3208 0.4208 4.39e-37
26 8xql:A 240 28 0.0571 0.0750 0.6429 2.29e-04
27 6a8d:A 181 95 0.0889 0.1547 0.2947 6.40e-08
28 2k5u:A 181 154 0.1143 0.1989 0.2338 6.98e-06 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
29 1z6x:A 175 95 0.0794 0.1429 0.2632 2.08e-05 1z6x:B
30 8d4c:C 180 95 0.0762 0.1333 0.2526 4.33e-05 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
31 3lrp:A 181 95 0.0730 0.1271 0.2421 6.14e-05
32 7rll:B 177 96 0.0984 0.1751 0.3229 9.59e-05 7rll:A
33 3lvq:E 420 95 0.0794 0.0595 0.2632 3.66e-04 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
34 3doe:A 189 94 0.0698 0.1164 0.2340 0.001 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
35 3doe:A 189 21 0.0349 0.0582 0.5238 8.6 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
36 4ile:A 176 102 0.0825 0.1477 0.2549 0.001 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
37 6bbp:A 520 95 0.0762 0.0462 0.2526 0.004 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
38 4y0v:A 165 95 0.0730 0.1394 0.2421 0.008 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
39 2b6h:A 171 113 0.0825 0.1520 0.2301 0.009
40 8e0c:A 185 102 0.0794 0.1351 0.2451 0.009 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
41 5di3:B 204 103 0.0762 0.1176 0.2330 0.020 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
42 2h57:B 167 97 0.0794 0.1497 0.2577 0.024 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
43 1yzg:A 168 94 0.0730 0.1369 0.2447 0.031
44 8oun:A 181 117 0.0825 0.1436 0.2222 0.034 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
45 4q66:C 134 97 0.0825 0.1940 0.2680 0.034
46 6vs4:A 223 118 0.0825 0.1166 0.2203 0.036 6vs4:B
47 3aq4:A 170 95 0.0762 0.1412 0.2526 0.042 3aq4:B
48 4zi2:A 185 96 0.0794 0.1351 0.2604 0.042 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
49 4zi2:A 185 22 0.0317 0.0541 0.4545 9.0 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
50 6pta:A 165 95 0.0667 0.1273 0.2211 0.059 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
51 3o47:A 289 95 0.0698 0.0761 0.2316 0.061 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
52 5uf8:D 160 95 0.0698 0.1375 0.2316 0.097
53 5de3:A 166 105 0.0667 0.1265 0.2000 0.14 5di3:A
54 1upt:G 170 107 0.0730 0.1353 0.2150 0.35 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
55 3n7x:A 299 122 0.0857 0.0903 0.2213 0.36
56 2x77:A 181 82 0.0603 0.1050 0.2317 0.38 2x77:B
57 6zga:C 168 71 0.0667 0.1250 0.2958 0.38 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
58 4bas:A 172 89 0.0667 0.1221 0.2360 0.85
59 3das:A 334 43 0.0444 0.0419 0.3256 0.91
60 8e0h:A 179 122 0.0889 0.1564 0.2295 1.0 8dzm:A, 8dzm:B, 8dzn:A, 8dzn:B, 8dzo:A, 8dzo:B, 8dzt:A, 8dzt:B, 8e0h:B, 2gao:A, 2gao:B
61 6fvt:J 405 108 0.0762 0.0593 0.2222 1.5 6ef0:J, 6ef1:J, 6ef2:J, 6ef3:J, 6fvu:J, 6fvv:J, 6fvw:J, 6fvx:J, 6fvy:J, 5mp9:J, 5mpa:J, 5mpb:J, 5mpc:J, 7qo4:J, 7qo5:J, 7qo6:J
62 7dfa:A 363 57 0.0667 0.0579 0.3684 2.4 8as2:A, 8as3:A, 7df9:A, 7dfb:A, 7dfc:A, 8go8:A, 8go8:B, 8gp3:A, 8gp3:B, 8hsv:A, 8hsv:B, 8i0n:B, 8i0n:A, 8i0q:B, 8i0q:A, 8j8z:A, 8j8z:B, 4jqi:A, 8jrv:A, 6ni2:B, 7r0j:C, 6up7:B, 8wrz:A, 1zsh:A
63 1h6f:B 186 63 0.0603 0.1022 0.3016 3.7 1h6f:A
64 8pv1:Cf 285 53 0.0444 0.0491 0.2642 4.6 8i9r:Cy, 7ozs:C, 8pv2:Cf, 8pv3:Cf, 8pv4:Cf, 8pv5:Cf, 8pv7:Cf, 8pvk:Cf, 8pvl:Cf
65 1byu:B 215 20 0.0317 0.0465 0.5000 4.9 6a38:A, 6a3a:A, 6a3b:A, 6a3c:A, 6a3e:A, 3a6p:C, 3a6p:H, 7b51:B, 2bku:A, 2bku:C, 5bxq:C, 5bxq:D, 5bxq:E, 1byu:A, 4c0q:C, 4c0q:D, 3ch5:A, 5ciq:A, 5ciq:B, 5cit:A, 5cit:B, 5ciw:A, 5ciw:B, 6cit:A, 5cj2:A, 5cj2:B, 5cj2:C, 5cj2:D, 5cj2:E, 5cj2:F, 5cj2:G, 5cj2:H, 5cll:A, 5cll:C, 5clq:A, 5clq:C, 7cnd:A, 7dbg:A, 5dh9:A, 5dha:A, 5dhf:A, 5di9:A, 5dif:A, 5dis:B, 5dlq:C, 5dlq:D, 3ea5:A, 3ea5:C, 3gj0:A, 3gj0:B, 3gj3:A, 3gj4:A, 3gj4:C, 3gj5:A, 3gj5:C, 3gj6:A, 3gj7:A, 3gj7:C, 3gj8:A, 3gj8:C, 3gjx:C, 3gjx:F, 4gmx:A, 4gpt:A, 4hat:A, 4hau:A, 4hav:A, 4haw:A, 4hax:A, 4hay:A, 4haz:A, 4hb0:A, 4hb2:A, 4hb3:A, 4hb4:A, 8hq3:A, 8hq4:A, 8hq5:A, 8hq6:A, 8huf:A, 8hug:A, 1ibr:A, 1ibr:C, 8itv:A, 5jlj:A, 1k5d:A, 1k5d:D, 1k5d:G, 1k5d:J, 1k5g:A, 1k5g:D, 1k5g:G, 1k5g:J, 6kft:A, 7l5e:A, 6lq9:A, 6m60:A, 6m6x:A, 7mnp:A, 7mnp:C, 7mnq:A, 7mnr:A, 7mns:A, 7mnt:A, 7mnt:C, 7mnu:A, 7mnv:A, 7mnw:A, 7mnw:C, 7mnw:E, 7mnw:G, 7mnx:A, 7mnx:C, 7mnx:E, 7mnx:G, 7mnx:I, 7mnx:K, 7mny:A, 7mny:C, 7mny:E, 7mny:G, 7mny:I, 7mny:K, 7mnz:A, 7mnz:C, 7mnz:E, 7mnz:G, 7mnz:I, 7mnz:K, 7mo0:A, 7mo0:C, 7mo1:A, 7mo2:A, 7mo2:C, 7mo3:A, 7mo3:C, 7mo4:A, 7mo4:C, 7mo5:A, 3nby:C, 3nby:F, 3nbz:C, 3nbz:F, 3nc0:C, 3nc0:F, 3nc1:C, 4ol0:A, 6q82:B, 6q84:B, 6q84:E, 1qbk:C, 1qg2:A, 1qg4:A, 1qg4:B, 3ran:A, 3ran:B, 3ran:C, 3ran:D, 1rrp:A, 1rrp:C, 6tvo:B, 5uwh:A, 5uwi:A, 5uwj:A, 5uwo:A, 5uwp:A, 5uwq:A, 5uwr:A, 5uws:A, 5uwt:A, 5uwu:A, 5uww:A, 3w3z:B, 1wa5:A, 4wvf:A, 6x2m:A, 6x2o:A, 6x2p:A, 6x2r:A, 6x2s:A, 6x2u:A, 6x2v:A, 6x2w:A, 6x2x:A, 6x2y:A, 6xjp:A, 6xjr:A, 6xjs:A, 6xjt:A, 6xju:A, 7ypz:A, 5yro:A, 5yst:A, 5ysu:A, 5ytb:A, 5yu6:B, 5yu6:D, 3zjy:A, 3zjy:D, 3zjy:F, 5zpu:A
66 5ebe:A 418 45 0.0571 0.0431 0.4000 5.0 5ebb:A, 5ebb:B, 5ebb:C, 5ebe:B, 5ebe:C
67 4wnr:A 323 21 0.0317 0.0310 0.4762 7.6
68 3m1i:A 200 19 0.0317 0.0500 0.5263 9.1 8dyo:B, 8f19:B, 8f1e:D, 8f7a:B, 3icq:B, 3icq:C, 3wyf:A, 3wyf:D, 3wyg:A, 2x19:A, 5xoj:A
69 4v0l:A 168 94 0.0667 0.1250 0.2234 9.5 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
70 7nhl:0 465 25 0.0349 0.0237 0.4400 9.7

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218