RDNMASLIQRIARQASLTFREAPMQPGFPENLSKLKSLLTQLRAEDLNIAPRKATLQPLPPNLPPVTYMHIYETDGFSLG
VFLLKSGTSIPLHDHPGMHGMLKVLYGTVRISCMDKLDAGGGQRPRALPPEQQFEPPLQPREREAVRPGVLRSRAEYTEA
SGPCILTPHRDNLHQIDAVEGPAAFLDILAPPYDPDDGRDCHYYRVLEPVRSDLPREVWLLETPQADDFWCEGEPYPGPK
VFP
The query sequence (length=243) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
| # | Hit | Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
E-value | Homologs to hit |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 7rei:A | 243 | 243 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 0.0 | 8u9j:A, 8u9j:B, 8uan:A |
| 2 | 7lvz:D | 246 | 248 | 0.8601 | 0.8496 | 0.8427 | 8.35e-141 | 7lvz:A, 7lvz:B, 7lvz:C |
| 3 | 7chj:B | 226 | 252 | 0.3169 | 0.3407 | 0.3056 | 6.51e-25 | 7chj:A, 6s0p:A, 6s7e:A |
| 4 | 7chi:A | 220 | 248 | 0.2963 | 0.3273 | 0.2903 | 2.84e-22 | |
| 5 | 7cxz:A | 245 | 177 | 0.2140 | 0.2122 | 0.2938 | 5.24e-18 | |
| 6 | 4a15:A | 596 | 71 | 0.0905 | 0.0369 | 0.3099 | 0.043 | 5h8w:A, 2vsf:A |
| 7 | 8pme:C | 343 | 129 | 0.1317 | 0.0933 | 0.2481 | 0.35 | 8pme:B |
| 8 | 6bgf:A | 188 | 130 | 0.1152 | 0.1489 | 0.2154 | 0.63 | 2atf:A, 2b5h:A, 6bgm:A, 6bpr:A, 6bps:A, 6bpt:A, 6bpu:A, 6bpv:A, 6bpw:A, 6bpx:A, 6cdh:A, 6cdn:A, 6e87:A, 5efu:A, 3eln:A, 5ezw:A, 2gh2:A, 5i0r:A, 5i0s:A, 5i0t:A, 5i0u:A, 2ic1:A, 4ieo:A, 4iep:A, 4ieq:A, 4ier:A, 4ies:A, 4iet:A, 4ieu:A, 4iev:A, 4iew:A, 4iex:A, 4iey:A, 4iez:A, 4jtn:A, 4jto:A, 4kwj:A, 4kwk:A, 4kwl:A, 6n42:A, 6n43:A, 4pix:A, 4piy:A, 4piz:A, 4pjy:A, 6u1m:A, 6u4l:A, 6u4s:A, 6u4v:A, 4ubg:A, 4ubh:A, 8vl9:D, 8vlb:D, 4xet:A, 4xez:A, 4xf0:A, 4xf1:A, 4xf3:A, 4xf4:A, 4xf9:A, 4xfa:A, 4xfb:A, 4xfc:A, 4xff:A, 4xfg:A, 4xfh:A, 4xfi:A, 4ysf:A, 4yyo:A, 4z82:A |
| 9 | 4qma:A | 192 | 81 | 0.1111 | 0.1406 | 0.3333 | 0.86 | |
| 10 | 7ck2:A | 352 | 109 | 0.1193 | 0.0824 | 0.2661 | 1.7 | 7ck2:B |
| 11 | 4oec:A | 248 | 85 | 0.0988 | 0.0968 | 0.2824 | 3.6 | 4oec:B, 4oec:C, 4oec:D |
| 12 | 3ddy:A | 175 | 37 | 0.0576 | 0.0800 | 0.3784 | 3.8 | |
| 13 | 8pmi:B | 409 | 132 | 0.1358 | 0.0807 | 0.2500 | 6.4 | 8has:A, 8has:B, 8has:C, 8has:D, 8has:E, 8has:F, 8hau:A, 8hau:B, 8hau:C, 8hau:D, 8hau:E, 8hau:F, 8pme:A, 8pmg:A, 8pmg:B, 8pmg:C, 8pmg:D, 8pmg:E, 8pmg:F, 8pmi:A, 8pmi:C, 8pmi:D, 8pmi:E, 8pmi:F, 8pml:A, 8pml:B, 8pml:C, 8pml:D, 8pml:E, 8pml:F, 8pmm:A, 8pmm:B, 8pmm:C, 8pn1:A, 8pn1:B, 8pn1:C, 8pn1:D, 8pn1:E, 8pn1:F, 8pn2:A, 8pn2:B, 8pn2:C, 8pn2:D, 8pn2:E, 8pn2:F, 7y77:A, 7y77:B, 7y77:C |
| 14 | 5ahn:A | 297 | 41 | 0.0782 | 0.0640 | 0.4634 | 7.9 | |
| 15 | 5ahm:A | 354 | 41 | 0.0782 | 0.0537 | 0.4634 | 7.9 | 5ahm:B |
| 16 | 7pji:A | 445 | 41 | 0.0782 | 0.0427 | 0.4634 | 8.3 | 4dqw:A, 4dqw:B, 6gk9:A, 6gk9:D, 7pji:B |
umich.edu