Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
RDENYFTDKYELTRTHSEVLEAVKVVKPGKTLDLGCGNGRNSLYLAANGYDVDAWDKNAMSIANVERIKSIENLDNLHTR
VVDLNNLTFDRQYDFILSTVVLMFLEAKTIPGLIANMQRCTKPGGYNLIVAAMDTADYPCTVGFPFAFKEGELRRYYEGW
ERVKYNEDVGELHRTDNRIKLRFATMLARK

The query sequence (length=190) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2xva:A 199 193 1.0000 0.9548 0.9845 7.08e-141 2xva:B, 2xva:C, 2xva:D, 2xvm:A, 2xvm:B
2 6mro:A 194 146 0.1789 0.1753 0.2329 1.70e-08 8gdu:A
3 7wzg:B 243 104 0.1737 0.1358 0.3173 3.96e-06 7wzg:A, 7wzg:C, 7wzg:D, 7wzg:E, 7wzg:F
4 4nec:B 244 117 0.1632 0.1270 0.2650 1.46e-05 4nec:A, 4nec:C, 4nec:D
5 1wzn:A 244 114 0.1632 0.1270 0.2719 1.80e-05 1wzn:B, 1wzn:C
6 7bgg:A 216 112 0.1474 0.1296 0.2500 3.52e-05 7ndm:A, 7nmk:A, 7noy:A
7 5wp5:A 463 122 0.2000 0.0821 0.3115 4.24e-05 5wp5:B
8 5wp5:A 463 110 0.1684 0.0691 0.2909 8.27e-04 5wp5:B
9 3e23:A 198 148 0.2053 0.1970 0.2635 6.34e-05
10 1ve3:B 226 117 0.1842 0.1549 0.2991 9.10e-05 1ve3:A
11 3ou7:A 214 110 0.1632 0.1449 0.2818 1.19e-04 3ou2:A, 3ou6:A, 3ou6:B, 3ou6:C, 3ou6:D, 3ou7:B, 3ou7:C, 3ou7:D
12 5bp9:A 237 169 0.2211 0.1772 0.2485 4.32e-04
13 6bqc:A 348 105 0.1526 0.0833 0.2762 0.005
14 2vs1:A 398 64 0.1158 0.0553 0.3438 0.006 2jjq:A
15 5wp4:A 485 123 0.1947 0.0763 0.3008 0.014
16 5wp4:A 485 110 0.1684 0.0660 0.2909 0.20
17 2yqz:A 261 104 0.1684 0.1226 0.3077 0.015 2yqz:B
18 7v6h:A 267 107 0.1684 0.1199 0.2991 0.017 7v6h:B
19 4by9:E 227 150 0.2000 0.1674 0.2533 0.036 4by9:K, 3nmu:F, 3nmu:J, 3nvk:I, 3nvk:J
20 2avn:A 247 74 0.1316 0.1012 0.3378 0.083 2avn:B
21 8r4z:A 341 84 0.1368 0.0762 0.3095 0.13 8r4z:B, 8rvc:A, 8rvc:B, 8rvs:A, 8rvs:B, 8rwm:A, 8rwm:B
22 8pjd:A 347 62 0.1000 0.0548 0.3065 0.16 8bva:A, 8c1j:A, 5ful:A, 5fwa:A, 5fwd:A, 5jmq:A
23 5fad:A 160 110 0.1842 0.2188 0.3182 0.17 5fa8:A
24 3dh0:B 190 115 0.1789 0.1789 0.2957 0.25 3dh0:A
25 5gm2:B 282 107 0.1579 0.1064 0.2804 0.35 5gm1:A, 5gm1:B, 5gm1:C, 5gm1:D, 5gm1:E, 5gm1:F, 5gm1:G, 5gm1:H, 5gm1:I, 5gm1:J, 5gm1:K, 5gm1:L, 5gm1:M, 5gm1:N, 5gm1:O, 5gm1:P, 5gm1:Q, 5gm1:R, 5gm2:A, 5gm2:C, 5gm2:D, 5gm2:E, 5gm2:F, 5gm2:G, 5gm2:H, 5gm2:I, 5gm2:J, 5gm2:L, 5gm2:M, 5gm2:N, 5gm2:O, 5gm2:P, 5gm2:Q, 5gm2:R
26 3e8s:A 220 157 0.1737 0.1500 0.2102 0.39
27 8khq:A 700 40 0.0842 0.0229 0.4000 0.55 8khq:B, 8khq:C, 8khq:D
28 5ufm:A 225 53 0.0947 0.0800 0.3396 0.56 5ufm:B, 5ufn:A, 5ufn:B
29 1l3i:A 186 45 0.0895 0.0914 0.3778 0.56 1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F
30 2b3t:A 276 74 0.1053 0.0725 0.2703 0.56 1t43:A
31 4ax8:A 450 49 0.1053 0.0444 0.4082 0.60 4azs:A, 4azt:A, 4azv:A
32 4uw0:A 501 49 0.1053 0.0399 0.4082 0.66 4azw:A
33 4kdr:A 208 98 0.1263 0.1154 0.2449 0.73 5dpm:A
34 8bxk:A 265 49 0.1000 0.0717 0.3878 0.87 8bxk:B, 8cqh:A, 8qdj:A
35 3i9f:B 169 134 0.1842 0.2071 0.2612 0.88 3i9f:A
36 6wlf:B 434 97 0.1421 0.0622 0.2784 0.95 6wlf:A
37 3sxj:A 245 68 0.1053 0.0816 0.2941 1.2 3sxj:B, 3t0i:A, 3t0i:B
38 7nhn:0 461 72 0.1211 0.0499 0.3194 1.2
39 3frk:A 365 24 0.0579 0.0301 0.4583 1.2 3frk:B
40 5ikm:A 259 44 0.0947 0.0695 0.4091 1.2
41 6gkv:A 351 107 0.1368 0.0741 0.2430 1.3 6gkv:B, 6gky:A, 6gky:B, 6gkz:A, 6gkz:B, 6gkz:C, 6gkz:D
42 3h2b:B 196 101 0.1105 0.1071 0.2079 1.3 3h2b:A
43 6uv6:C 264 87 0.1316 0.0947 0.2874 1.5 6uv6:A, 6uv6:B
44 6cu5:A 314 117 0.1579 0.0955 0.2564 2.0 6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
45 4qpn:A 203 111 0.1421 0.1330 0.2432 2.3
46 2bh2:A 418 73 0.1105 0.0502 0.2877 2.4 2bh2:B, 1uwv:A
47 6uak:A 297 129 0.1895 0.1212 0.2791 2.5
48 3eld:A 277 20 0.0632 0.0433 0.6000 2.7 3elu:A, 3elw:A, 3ely:A, 3emb:A, 3emd:A
49 8b52:B 262 49 0.1053 0.0763 0.4082 3.0 8b51:A, 8b51:B, 8b52:A
50 8gzp:A 854 23 0.0579 0.0129 0.4783 3.6 4c11:A, 5ccv:B, 5ccv:C, 5ccv:D, 5ccv:F, 5ccv:G, 5dto:A, 5f3t:A, 5f3z:A, 5f41:A, 8gzq:A, 4hhj:A, 5hmw:A, 5hmx:A, 5hmy:A, 5hmz:A, 5hn0:A, 5i3p:A, 5i3q:A, 5iq6:A, 6j00:A, 2j7u:A, 2j7w:A, 5jjr:A, 5jjs:A, 4v0q:A, 4v0r:A, 6xd0:A
51 8joz:A 257 100 0.1158 0.0856 0.2200 3.6 4htf:A, 4htf:B
52 8gzr:A 880 23 0.0579 0.0125 0.4783 3.8 8bcr:A, 8bcr:B, 4c11:B, 5ccv:E, 4ctj:A, 4ctj:C, 4ctk:A, 4ctk:C, 5cuq:A, 5cuq:B, 5e9q:A, 5e9q:C, 5ec8:A, 5ec8:C, 5ehg:A, 5ehg:C, 5ehi:A, 5ehi:C, 5eif:A, 5eif:C, 5eiw:A, 5eiw:C, 5ekx:A, 5ekx:B, 3p8z:A, 3p8z:C, 3p97:A, 3p97:C, 4r8s:A, 4r8s:B, 3vws:A, 2xbm:B, 2xbm:A, 2xbm:C, 2xbm:D, 6xd1:A
53 3bt7:A 369 50 0.0947 0.0488 0.3600 3.8 3bt7:B
54 5ccv:A 849 23 0.0579 0.0130 0.4783 3.8 6h80:A, 6h9r:A, 6izz:A
55 7wtt:q 235 40 0.0789 0.0638 0.3750 3.9 6g4w:q, 7wts:q, 7wtu:q, 7wtv:q, 7wtw:q
56 5ccv:H 767 23 0.0579 0.0143 0.4783 3.9
57 5w7k:A 274 110 0.1579 0.1095 0.2727 4.4 5w7k:B
58 7fbo:A 282 27 0.0737 0.0496 0.5185 4.6 7fbh:B, 7fbh:C, 7fbo:B, 7fbo:C
59 5u1e:A 321 60 0.1053 0.0623 0.3333 4.6 5tyq:A, 5u0n:A, 5u0t:A, 5u18:A, 5u19:A, 5u1i:A, 5u4t:A
60 5dm0:B 272 44 0.0632 0.0441 0.2727 4.8 5dly:A, 5dm0:A, 4kvz:A
61 4krg:A 466 112 0.1316 0.0536 0.2232 5.5 4krg:B
62 6kr3:B 836 44 0.0789 0.0179 0.3409 5.8 5k5m:A
63 6kr2:A 857 44 0.0789 0.0175 0.3409 5.9 6izx:A, 6izy:A, 6kr2:B, 6kr3:A
64 8t13:B 877 44 0.0789 0.0171 0.3409 6.0 3evg:A, 1l9k:A, 2p1d:A, 2p3l:A, 2p3o:A, 2p3q:A, 2p40:A, 2p41:A, 1r6a:A, 8t12:B, 7xd8:A, 7xd8:D, 7xd8:G, 7xd8:J, 7xd8:M, 7xd8:P, 7xd9:A, 7xd9:D, 7xd9:G, 7xd9:J, 7xd9:M, 7xd9:P, 5zqk:A, 5zqk:B
65 6m0r:A 750 79 0.1211 0.0307 0.2911 6.1 7tao:A
66 5gm2:K 267 107 0.1684 0.1199 0.2991 6.3
67 5h02:A 252 62 0.1053 0.0794 0.3226 6.4 5gwx:A, 5hik:A, 5hil:A, 5him:A
68 5fub:A 337 89 0.1316 0.0742 0.2809 6.6 5g02:A
69 2oxt:A 265 76 0.1158 0.0830 0.2895 6.7 2oxt:B, 2oxt:C, 2oxt:D
70 7n63:A 362 71 0.1158 0.0608 0.3099 6.8
71 3lkz:A 262 51 0.0842 0.0611 0.3137 6.9 3lkz:B, 2oy0:A, 2oy0:B
72 6p3o:A 341 143 0.1789 0.0997 0.2378 7.0 6p3m:A, 6p3n:A
73 2px5:A 265 24 0.0684 0.0491 0.5417 7.8 2px2:A, 2px2:B, 2px4:A, 2px5:B, 2px8:A, 2px8:B, 2pxa:A, 2pxa:B, 2pxc:A
74 4k6m:A 888 22 0.0684 0.0146 0.5909 8.4 4hdg:A, 4hdg:B, 4hdh:A, 4hdh:B, 4k6m:B, 4mtp:A, 4mtp:B
75 5kok:A 348 22 0.0579 0.0316 0.5000 8.4 5koc:A, 5koc:B, 5kok:B, 5kpc:A, 5kpc:B, 5kpg:A, 5kpg:B
76 3uj7:A 259 121 0.1579 0.1158 0.2479 9.7 4fgz:A, 4fgz:B, 4r6w:A, 4r6w:B, 4r6x:A, 4r6x:B, 3uj6:A, 3uj7:B, 3uj8:A, 3uj9:A, 3uja:A, 3ujb:A, 3ujb:B, 3ujc:A, 3ujd:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218