Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QYSSNTQQGRTSIVHLFEWRWVDIALECERYLAPKGFGGVQVSPPNENVAIHNPFRPWWERYQPVSYKLCTRSGNEDEFR
NMVTRCNNVGVRIYVDAVINHMCGNAVSAGTSSTCGSYFNPGSRDFPAVPYSGWDFNDGKCKTGSGDIENYNDATQVRDC
RLSGLLDLALGKDYVRSKIAEYMNHLIDIGVAGFRIDASKHMWPGDIKAILDKLHNLNSNWFPEGSKPFIYQEVIDLGGE
PIKSSDYFGNGRVTEFKYGAKLGTVIRKWNGEKMSYLKNWGEGWGFMPSDRALVFVDNHDNQRGHSILTFWDARLYKMAV
GFMLAHPYGFTRVMSSYRWPRYFENGKDVNDWVGPPNDNGVTKEVTINPDTTCGNDWVCEHRWRQIRNMVNFRNVVDGQP
FTNWYDNGSNQVAFGRGNRGFIVFNNDDWTFSLTLQTGLPAGTYCDVISGDKINGNCTGIKIYVSDDGKAHFSISNSAED
PFIAIHAESKL

The query sequence (length=491) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1b2y:A 496 496 0.9715 0.9617 0.9617 0.0 3bai:A, 3baj:A, 3bak:A, 3baw:A, 3bax:A, 3bay:A, 3blk:A, 3blp:X, 1bsi:A, 1c8q:A, 1cpu:A, 2cpu:A, 3cpu:A, 3dhp:A, 5e0f:A, 5emy:A, 4gqq:A, 4gqr:A, 1hny:A, 3ij7:A, 3ij8:A, 3ij9:A, 1jxj:A, 1jxk:A, 1kb3:A, 1kbb:A, 1kbk:A, 5kez:A, 1kgu:A, 1kgw:A, 1kgx:A, 1mfu:A, 1mfv:A, 1nm9:A, 6obx:A, 6ocn:A, 3old:A, 3ole:A, 3olg:A, 3oli:A, 1q4n:X, 2qmk:A, 2qv4:A, 1smd:A, 5td4:A, 1u2y:A, 1u30:A, 1u33:A, 5u3a:A, 5va9:A, 5va9:B, 4w93:A, 4x9y:A, 1xcw:A, 1xcx:A, 1xd0:A, 1xd1:A, 1xgz:A, 1xh0:A, 1xh1:A, 1xh2:A, 1xv8:A, 1xv8:B, 1z32:X, 6z8l:A
2 1bvn:P 496 496 0.8554 0.8468 0.8468 0.0 1dhk:A, 1hx0:A, 1jfh:A, 1kxq:A, 1kxq:B, 1kxq:C, 1kxq:D, 1kxt:A, 1kxt:C, 1kxt:E, 3l2l:A, 3l2m:A, 1ose:A, 1pif:A, 1pig:A, 1ppi:A, 1ua3:A, 1vah:A, 1wo2:A, 4x0n:A
3 3vm5:A 499 497 0.7271 0.7154 0.7183 0.0
4 8orp:A 476 498 0.5336 0.5504 0.5261 0.0 8orp:B
5 6m4k:A 496 495 0.5356 0.5302 0.5313 5.69e-176 6m4l:A, 6m4m:A
6 1clv:A 471 496 0.5275 0.5499 0.5222 9.23e-172 1jae:A, 1tmq:A, 1viw:A
7 1aqh:A 448 489 0.4460 0.4888 0.4479 8.45e-129 1aqm:A, 1b0i:A, 8cqf:A, 8cqg:A, 1g94:A, 1g9h:A, 1jd7:A, 1jd9:A, 1kxh:A, 1l0p:A
8 1bag:A 425 447 0.2098 0.2424 0.2304 1.01e-14 3dc0:A, 1ua7:A
9 2taa:A 478 192 0.1100 0.1130 0.2812 1.52e-08 2guy:A, 2gvy:A, 2gvy:B, 3kwx:A, 7p4w:A, 2taa:B, 2taa:C, 6taa:A, 7taa:A, 3vx0:A, 3vx1:A, 6xsj:A, 6xsj:B, 6xsv:A, 6yq7:A, 6yq7:B, 6yq9:AAA, 6yq9:BBB, 6yqa:AAA, 6yqa:BBB, 6yqb:AAA, 6yqb:BBB, 6yqc:AAA, 6yqc:BBB
10 1qho:A 686 431 0.2322 0.1662 0.2645 4.33e-08 1qhp:A
11 1cdg:A 686 466 0.2240 0.1603 0.2361 5.28e-08 1cgv:A, 1cgw:A, 1cgx:A, 1cgy:A, 1cxe:A, 1cxf:A, 1cxh:A, 1cxi:A, 1cxk:A, 1cxl:A, 2cxg:A, 1d3c:A, 2dij:A, 1dtu:A, 1eo5:A, 1eo7:A, 1kck:A, 1kcl:A, 1ot1:A, 1ot2:A, 1pez:A, 1pj9:A, 1tcm:A, 1tcm:B
12 5m99:A 506 180 0.0957 0.0929 0.2611 2.29e-07 5m99:B
13 1d7f:A 686 469 0.2301 0.1647 0.2409 4.15e-07 1d7f:B, 1ded:A, 1ded:B, 1i75:A, 1i75:B, 1pam:A, 1pam:B, 1ukq:A, 1ukq:B, 1uks:A, 1uks:B, 1ukt:A, 1ukt:B, 1v3j:A, 1v3j:B, 1v3k:A, 1v3k:B, 1v3l:A, 1v3l:B, 1v3m:A, 1v3m:B
14 1cyg:A 680 473 0.2179 0.1574 0.2262 1.19e-06
15 3bc9:A 585 342 0.1752 0.1470 0.2515 1.69e-06 3bcd:A, 3bcf:A
16 1a47:A 683 509 0.2424 0.1742 0.2338 1.92e-06 3bmv:A, 3bmw:A, 1ciu:A
17 4jcm:A 669 317 0.1385 0.1016 0.2145 2.30e-06
18 6wni:A 494 308 0.1344 0.1336 0.2143 1.10e-05 6wni:B, 6wnu:A
19 1lwh:A 441 173 0.0876 0.0975 0.2486 1.14e-05 1lwh:B, 1lwj:A, 1lwj:B
20 6aij:A 687 484 0.2016 0.1441 0.2045 1.73e-05 4jcl:A, 6l2h:A, 3wms:A
21 3vm7:A 470 177 0.0937 0.0979 0.2599 2.04e-05
22 1wza:A 488 143 0.0692 0.0697 0.2378 5.23e-05
23 6sau:B 442 180 0.0896 0.0995 0.2444 2.62e-04 6sau:A
24 6sao:A 438 306 0.1446 0.1621 0.2320 5.86e-04
25 2ze0:A 531 147 0.0774 0.0716 0.2585 0.001
26 7jjn:A 514 150 0.0794 0.0759 0.2600 0.002 7jjn:B
27 1gvi:B 588 105 0.0570 0.0476 0.2667 0.003 1gvi:A
28 8slv:A 562 152 0.0754 0.0658 0.2434 0.005
29 5a2a:A 452 175 0.0835 0.0907 0.2343 0.013 5a2b:A, 5a2c:A
30 1cgt:A 684 456 0.1935 0.1389 0.2083 0.014 1cgu:A, 3cgt:A, 4cgt:A, 5cgt:A, 6cgt:A, 7cgt:A, 8cgt:A, 9cgt:A
31 7jjt:A 513 277 0.1100 0.1053 0.1949 0.014
32 1j0h:A 588 75 0.0407 0.0340 0.2667 0.031 1j0h:B, 1j0i:A, 1j0i:B, 1j0j:B, 1j0j:A, 1j0k:A, 1j0k:B
33 3k8k:A 650 72 0.0448 0.0338 0.3056 0.036 6bs6:A, 6bs6:B, 3k8k:B, 3k8l:A, 3k8l:B, 3k8m:A, 3k8m:B
34 4aio:A 883 224 0.1181 0.0657 0.2589 0.047 4cvw:A, 4cvw:B, 4j3s:A, 4j3t:A, 4j3u:A, 4j3u:B, 4j3v:A, 4j3w:A, 4j3x:A, 2y4s:A, 2y5e:A
35 8im8:A 557 118 0.0591 0.0521 0.2458 0.050 8im8:B, 8im8:C, 8im8:D
36 4okd:A 801 171 0.0754 0.0462 0.2164 0.075 4okd:B
37 6sav:A 438 310 0.1385 0.1553 0.2194 0.076 6sav:B
38 3bsg:A 404 337 0.1487 0.1807 0.2166 0.093 3bsh:A, 1ht6:A, 1p6w:A, 2qps:A, 2qpu:B, 2qpu:A, 2qpu:C, 1rp8:A, 1rp9:A, 1rpk:A
39 4lxf:B 546 149 0.0672 0.0604 0.2215 0.096
40 3vu2:A 692 65 0.0326 0.0231 0.2462 0.10 7ml5:A, 3vu2:B
41 8uzh:B 626 149 0.0672 0.0527 0.2215 0.15 4lxf:A, 8uqv:A, 8uqv:B, 8uqv:C, 8uqv:D, 8uzh:A
42 8ibk:A 546 138 0.0692 0.0623 0.2464 0.20 8ids:A, 5zcb:A, 5zcc:A, 5zcd:A, 5zce:A
43 6a0k:A 450 39 0.0285 0.0311 0.3590 0.22 6a0j:A, 6a0k:B, 6a0l:A, 5zxg:A
44 3qgv:A 435 146 0.0692 0.0782 0.2329 0.22
45 2gjp:A 481 303 0.1405 0.1435 0.2277 0.25 2gjr:A, 1w9x:A
46 5jy7:B 571 149 0.0672 0.0578 0.2215 0.29 5jy7:A, 5jy7:C, 5jy7:D, 5jy7:E, 5jy7:F, 5jy7:G, 5jy7:H, 3zo9:A, 3zo9:B, 3zoa:B, 3zoa:A
47 8sdb:C 604 100 0.0591 0.0480 0.2900 0.30 5e6y:A, 5e6y:B, 5e6y:D, 5e6z:A, 5e6z:B, 5e6z:D, 5e70:A, 5e70:B, 5e70:D, 4lpc:A, 4lpc:B, 4lpc:D, 4lq1:B, 4lq1:C, 4lq1:D, 4lq1:A, 8sdb:A, 8sdb:B
48 5e6y:C 584 100 0.0591 0.0497 0.2900 0.31 5e6z:C, 5e70:C, 4lpc:C
49 8jjm:A 484 315 0.1324 0.1343 0.2063 0.35 8jjm:B
50 1mxd:A 435 134 0.0611 0.0690 0.2239 0.35 1mwo:A, 1mxg:A
51 3czk:A 618 138 0.0631 0.0502 0.2246 0.38 3czg:A, 3czl:A
52 3bh4:A 483 45 0.0285 0.0290 0.3111 0.57 3bh4:B, 1e3x:A, 1e3z:A, 1e40:A, 1e43:A
53 3bh4:A 483 55 0.0285 0.0290 0.2545 2.6 3bh4:B, 1e3x:A, 1e3z:A, 1e40:A, 1e43:A
54 5brp:A 555 143 0.0570 0.0505 0.1958 0.59 5brp:B, 5brp:C, 5brp:D, 5brq:A, 5brq:B, 5brq:C, 5brq:D
55 5ot1:A 572 38 0.0305 0.0262 0.3947 0.62
56 4wlc:A 536 127 0.0631 0.0578 0.2441 0.69 4xb3:A, 2zic:A, 2zid:A
57 4rny:A 359 115 0.0509 0.0696 0.2174 0.88 4rny:B, 4rnz:A
58 2die:A 481 44 0.0285 0.0291 0.3182 0.97
59 2die:A 481 34 0.0244 0.0249 0.3529 3.0
60 1bf2:A 750 30 0.0244 0.0160 0.4000 1.00
61 6ag0:C 483 43 0.0285 0.0290 0.3256 1.3 6ag0:A, 1hvx:A, 4uzu:A
62 1bli:A 481 44 0.0285 0.0291 0.3182 1.7 1ob0:A, 6toy:A, 6toz:A, 6tp0:A, 6tp1:A, 6tp2:A
63 1ud2:A 480 79 0.0509 0.0521 0.3165 2.0 1ud3:A, 1ud4:A, 1ud5:A, 1ud8:A
64 3wn6:A 404 72 0.0407 0.0495 0.2778 2.1 3wn6:B, 3wn6:C, 3wn6:D
65 8xx9:A 620 33 0.0224 0.0177 0.3333 2.2 8xxa:A
66 3vgf:A 555 77 0.0468 0.0414 0.2987 2.5 3vgg:A, 3vgh:A
67 5x7u:A 546 139 0.0672 0.0604 0.2374 2.9
68 4mf3:A 258 158 0.0692 0.1318 0.2152 2.9 3c31:A, 3c31:B, 3c32:A, 3c32:B, 3c33:A, 3c33:B, 3c34:A, 3c34:B, 3c35:A, 3c35:B, 3c36:A, 3c36:B, 4dld:A, 4dld:B, 4e0x:A, 4e0x:B, 2f34:A, 2f34:B, 2f35:A, 2f35:B, 2f36:A, 2f36:B, 2f36:C, 2f36:D, 3fuz:A, 3fuz:B, 3fv1:A, 3fv1:B, 3fv2:A, 3fv2:B, 3fvg:A, 3fvg:B, 3fvk:A, 3fvk:B, 3fvn:A, 3fvn:B, 3fvo:A, 3fvo:B, 6fz4:A, 3gba:A, 3gba:B, 3gba:C, 3gba:D, 3gbb:A, 3gbb:B, 5m2v:A, 5m2v:B, 4mf3:B, 5mfq:A, 5mfq:B, 5mfv:A, 5mfv:B, 5mfw:A, 5mfw:B, 5neb:B, 5neb:A, 5nf5:B, 5nf5:A, 2ojt:A, 2ojt:B, 2pbw:A, 2pbw:B, 4qf9:A, 4qf9:B, 4qf9:C, 2qs1:A, 2qs1:B, 2qs2:A, 2qs2:B, 2qs3:A, 2qs3:B, 2qs4:A, 2qs4:B, 2qs4:C, 2qs4:D, 8r36:A, 8r36:B, 3s2v:A, 3s2v:B, 6sbt:A, 1txf:A, 1vso:A, 2wky:A, 2wky:B, 1ycj:A, 1ycj:B, 4ymb:A, 4ymb:B, 2zns:A, 2znt:A, 2znu:A
69 2d3l:A 481 57 0.0326 0.0333 0.2807 2.9 2d3n:A, 1wp6:A, 1wpc:A
70 8yif:A 537 143 0.0692 0.0633 0.2378 3.3 8yie:A, 8yie:B
71 7p38:A 832 34 0.0224 0.0132 0.3235 3.3 8hw3:A, 8hw3:B, 8hwk:A, 8hwk:B, 7p38:B, 7p39:A, 7p39:B
72 6cnb:S 217 59 0.0407 0.0922 0.3390 3.4 6cnc:S, 6cnd:S, 6cnf:S
73 6f40:W 218 59 0.0407 0.0917 0.3390 3.5 6f41:W
74 7dt1:A 846 57 0.0285 0.0165 0.2456 3.7 7dt1:B
75 4aie:A 537 181 0.0713 0.0652 0.1934 3.8
76 7d9b:A 588 35 0.0224 0.0187 0.3143 4.2 7d9c:A, 7dcg:A, 7dch:A, 7ehh:A, 7ehi:A
77 4e2o:A 445 175 0.0713 0.0787 0.2000 4.2
78 1fw2:A 257 67 0.0407 0.0778 0.2985 4.5 7ezz:A, 7ezz:B, 1qd6:C, 1qd6:D
79 1ys4:A 348 92 0.0509 0.0718 0.2717 5.5 1ys4:B
80 6k5p:A 531 186 0.0876 0.0810 0.2312 6.8 6k5p:B, 6k5p:C, 6k5p:D
81 8asb:A 1715 41 0.0387 0.0111 0.4634 7.1 8as6:A, 8asg:A, 8r6u:A
82 8r6y:A 1991 41 0.0387 0.0095 0.4634 7.2 8as7:A, 8r6w:A, 6xya:B
83 7alp:U 1935 41 0.0387 0.0098 0.4634 7.4
84 8asd:A 1826 41 0.0387 0.0104 0.4634 7.4

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218