Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QYSPNTQQGRTSIVHLFEWRWVDIALECERYLAPKGFGGVQVSPPNENVAIYNPFRPWWERYQPVSYKLCTRSGNEDEFR
NMVTRCNNVGVRIYVDAVINHMCGNAVSAGTSSTCGSYFNPGSRDFPAVPYSGWDFNDGKCKTGSGDIENYNDATQVRDC
RLTGLLDLALEKDYVRSKIAEYMNHLIDIGVAGFRLDASKHMWPGDIKAILDKLHNLNSNWFPAGSKPFIYQEVIDLGGE
PIKSSDYFGNGRVTEFKYGAKLGTVIRKWNGEKMSYLKNWGEGWGFVPSDRALVFVDSHDNQRGHGAGGASILTFWDARL
YKMAVGFMLAHPYGFTRVMSSYRWPRQFQNGNDVNDWVGPPNNNGVIKEVTINPDTTCGNDWVCEHRWRQIRNMVIFRNV
VDGQPFTNWYDNGSNQVAFGRGNRGFIVFNNDDWSFSLTLQTGLPAGTYCDVISGDKINGNCTGIKIYVSDDGKAHFSIS
NSAEDPFIAIHAESKL

The query sequence (length=496) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1b2y:A 496 496 0.9980 0.9980 0.9980 0.0 3bai:A, 3baj:A, 3bak:A, 3baw:A, 3bax:A, 3bay:A, 3blk:A, 3blp:X, 1bsi:A, 1c8q:A, 1cpu:A, 2cpu:A, 3cpu:A, 3dhp:A, 5e0f:A, 5emy:A, 4gqq:A, 4gqr:A, 1hny:A, 3ij7:A, 3ij8:A, 3ij9:A, 1jxj:A, 1jxk:A, 1kb3:A, 1kbb:A, 1kbk:A, 5kez:A, 1kgu:A, 1kgw:A, 1kgx:A, 1mfu:A, 1mfv:A, 1nm9:A, 6obx:A, 6ocn:A, 3old:A, 3ole:A, 3olg:A, 3oli:A, 1q4n:X, 2qmk:A, 2qv4:A, 1smd:A, 5td4:A, 1u2y:A, 1u30:A, 1u33:A, 5u3a:A, 5va9:A, 5va9:B, 4w93:A, 4x9y:A, 1xcw:A, 1xcx:A, 1xd0:A, 1xd1:A, 1xgz:A, 1xh0:A, 1xh1:A, 1xh2:A, 1xv8:A, 1xv8:B, 1z32:X, 6z8l:A
2 1bvn:P 496 496 0.8629 0.8629 0.8629 0.0 1dhk:A, 1hx0:A, 1jfh:A, 1kxq:A, 1kxq:B, 1kxq:C, 1kxq:D, 1kxt:A, 1kxt:C, 1kxt:E, 3l2l:A, 3l2m:A, 1ose:A, 1pif:A, 1pig:A, 1ppi:A, 1ua3:A, 1vah:A, 1wo2:A, 4x0n:A
3 3vm5:A 499 497 0.7258 0.7214 0.7243 0.0
4 8orp:A 476 498 0.5363 0.5588 0.5341 0.0 8orp:B
5 6m4k:A 496 495 0.5403 0.5403 0.5414 6.90e-180 6m4l:A, 6m4m:A
6 1clv:A 471 498 0.5141 0.5414 0.5120 1.31e-169 1jae:A, 1tmq:A, 1viw:A
7 1aqh:A 448 489 0.4395 0.4866 0.4458 1.23e-128 1aqm:A, 1b0i:A, 8cqf:A, 8cqg:A, 1g94:A, 1g9h:A, 1jd7:A, 1jd9:A, 1kxh:A, 1l0p:A
8 1bag:A 425 457 0.2157 0.2518 0.2341 4.92e-15 3dc0:A, 1ua7:A
9 1a47:A 683 499 0.2319 0.1684 0.2305 1.91e-10 3bmv:A, 3bmw:A, 1ciu:A
10 1cyg:A 680 469 0.2177 0.1588 0.2303 1.21e-08
11 2taa:A 478 192 0.1069 0.1109 0.2760 2.68e-08 2guy:A, 2gvy:A, 2gvy:B, 3kwx:A, 7p4w:A, 2taa:B, 2taa:C, 6taa:A, 7taa:A, 3vx0:A, 3vx1:A, 6xsj:A, 6xsj:B, 6xsv:A, 6yq7:A, 6yq7:B, 6yq9:AAA, 6yq9:BBB, 6yqa:AAA, 6yqa:BBB, 6yqb:AAA, 6yqb:BBB, 6yqc:AAA, 6yqc:BBB
12 3bc9:A 585 336 0.1754 0.1487 0.2589 3.49e-08 3bcd:A, 3bcf:A
13 1cdg:A 686 468 0.2137 0.1545 0.2265 6.74e-08 1cgv:A, 1cgw:A, 1cgx:A, 1cgy:A, 1cxe:A, 1cxf:A, 1cxh:A, 1cxi:A, 1cxk:A, 1cxl:A, 2cxg:A, 1d3c:A, 2dij:A, 1dtu:A, 1eo5:A, 1eo7:A, 1kck:A, 1kcl:A, 1ot1:A, 1ot2:A, 1pez:A, 1pj9:A, 1tcm:A, 1tcm:B
14 6aij:A 687 489 0.2097 0.1514 0.2127 1.72e-07 4jcl:A, 6l2h:A, 3wms:A
15 1d7f:A 686 474 0.2198 0.1589 0.2300 2.62e-07 1d7f:B, 1ded:A, 1ded:B, 1i75:A, 1i75:B, 1pam:A, 1pam:B, 1ukq:A, 1ukq:B, 1uks:A, 1uks:B, 1ukt:A, 1ukt:B, 1v3j:A, 1v3j:B, 1v3k:A, 1v3k:B, 1v3l:A, 1v3l:B, 1v3m:A, 1v3m:B
16 1qho:A 686 440 0.2198 0.1589 0.2477 3.43e-07 1qhp:A
17 5m99:A 506 180 0.0907 0.0889 0.2500 1.40e-06 5m99:B
18 6wni:A 494 196 0.0988 0.0992 0.2500 1.99e-06 6wni:B, 6wnu:A
19 4jcm:A 669 322 0.1371 0.1016 0.2112 2.13e-06
20 3vm7:A 470 177 0.0927 0.0979 0.2599 9.78e-06
21 1lwh:A 441 136 0.0706 0.0794 0.2574 1.41e-05 1lwh:B, 1lwj:A, 1lwj:B
22 1wza:A 488 143 0.0685 0.0697 0.2378 5.59e-05
23 7jjn:A 514 150 0.0806 0.0778 0.2667 3.11e-04 7jjn:B
24 2ze0:A 531 147 0.0766 0.0716 0.2585 4.02e-04
25 6sau:B 442 180 0.0867 0.0973 0.2389 8.68e-04 6sau:A
26 1cgt:A 684 461 0.2036 0.1477 0.2191 0.001 1cgu:A, 3cgt:A, 4cgt:A, 5cgt:A, 6cgt:A, 7cgt:A, 8cgt:A, 9cgt:A
27 6sao:A 438 174 0.0867 0.0982 0.2471 0.001
28 1gvi:B 588 106 0.0605 0.0510 0.2830 0.004 1gvi:A
29 8slv:A 562 152 0.0726 0.0641 0.2368 0.006
30 5a2a:A 452 175 0.0847 0.0929 0.2400 0.007 5a2b:A, 5a2c:A
31 4lxf:B 546 149 0.0665 0.0604 0.2215 0.049
32 8ibk:A 546 138 0.0706 0.0641 0.2536 0.052 8ids:A, 5zcb:A, 5zcc:A, 5zcd:A, 5zce:A
33 3k8k:A 650 34 0.0282 0.0215 0.4118 0.054 6bs6:A, 6bs6:B, 3k8k:B, 3k8l:A, 3k8l:B, 3k8m:A, 3k8m:B
34 5brp:A 555 143 0.0605 0.0541 0.2098 0.057 5brp:B, 5brp:C, 5brp:D, 5brq:A, 5brq:B, 5brq:C, 5brq:D
35 4aio:A 883 225 0.1149 0.0646 0.2533 0.064 4cvw:A, 4cvw:B, 4j3s:A, 4j3t:A, 4j3u:A, 4j3u:B, 4j3v:A, 4j3w:A, 4j3x:A, 2y4s:A, 2y5e:A
36 3qgv:A 435 153 0.0706 0.0805 0.2288 0.073
37 8uzh:B 626 149 0.0665 0.0527 0.2215 0.081 4lxf:A, 8uqv:A, 8uqv:B, 8uqv:C, 8uqv:D, 8uzh:A
38 1j0h:A 588 76 0.0444 0.0374 0.2895 0.084 1j0h:B, 1j0i:A, 1j0i:B, 1j0j:B, 1j0j:A, 1j0k:A, 1j0k:B
39 4wlc:A 536 127 0.0645 0.0597 0.2520 0.086 4xb3:A, 2zic:A, 2zid:A
40 3vu2:A 692 65 0.0323 0.0231 0.2462 0.11 7ml5:A, 3vu2:B
41 4okd:A 801 148 0.0665 0.0412 0.2230 0.12 4okd:B
42 3vgf:A 555 341 0.1593 0.1423 0.2317 0.13 3vgg:A, 3vgh:A
43 7jjt:A 513 131 0.0565 0.0546 0.2137 0.16
44 5jy7:B 571 149 0.0665 0.0578 0.2215 0.16 5jy7:A, 5jy7:C, 5jy7:D, 5jy7:E, 5jy7:F, 5jy7:G, 5jy7:H, 3zo9:A, 3zo9:B, 3zoa:B, 3zoa:A
45 3czk:A 618 138 0.0645 0.0518 0.2319 0.17 3czg:A, 3czl:A
46 6a0k:A 450 47 0.0343 0.0378 0.3617 0.20 6a0j:A, 6a0k:B, 6a0l:A, 5zxg:A
47 1mxd:A 435 134 0.0605 0.0690 0.2239 0.21 1mwo:A, 1mxg:A
48 4e2o:A 445 174 0.0746 0.0831 0.2126 0.21
49 8sdb:C 604 100 0.0585 0.0480 0.2900 0.33 5e6y:A, 5e6y:B, 5e6y:D, 5e6z:A, 5e6z:B, 5e6z:D, 5e70:A, 5e70:B, 5e70:D, 4lpc:A, 4lpc:B, 4lpc:D, 4lq1:B, 4lq1:C, 4lq1:D, 4lq1:A, 8sdb:A, 8sdb:B
50 3bsg:A 404 203 0.0968 0.1188 0.2365 0.33 3bsh:A, 1ht6:A, 1p6w:A, 2qps:A, 2qpu:B, 2qpu:A, 2qpu:C, 1rp8:A, 1rp9:A, 1rpk:A
51 5e6y:C 584 100 0.0585 0.0497 0.2900 0.36 5e6z:C, 5e70:C, 4lpc:C
52 8im8:A 557 118 0.0565 0.0503 0.2373 0.36 8im8:B, 8im8:C, 8im8:D
53 6sav:A 438 193 0.0867 0.0982 0.2228 0.54 6sav:B
54 5ot1:A 572 38 0.0302 0.0262 0.3947 0.55
55 8jjm:A 484 175 0.0726 0.0744 0.2057 0.88 8jjm:B
56 1bf2:A 750 30 0.0242 0.0160 0.4000 1.0
57 7dt1:A 846 57 0.0302 0.0177 0.2632 1.1 7dt1:B
58 5x7u:A 546 139 0.0665 0.0604 0.2374 1.6
59 3wn6:A 404 73 0.0423 0.0520 0.2877 1.7 3wn6:B, 3wn6:C, 3wn6:D
60 4h8v:A 557 143 0.0645 0.0575 0.2238 1.9 4gi6:A, 4gi6:B, 4gi8:A, 4gi8:B, 4gi9:A, 4gi9:B, 4gia:A, 4gia:B, 4gin:A, 4go8:A, 4go8:B, 4go9:A, 4go9:B, 4h2c:A, 4h7v:A, 4h7v:B, 4h8h:A, 4h8h:B, 4h8u:A, 4h8u:B, 4h8v:B, 4ha1:A, 4ha1:B, 2pwd:A, 2pwd:B, 2pwe:A, 2pwe:B, 2pwf:A, 2pwf:B, 2pwf:C, 2pwf:D, 2pwg:A, 2pwg:B, 2pwh:A, 2pwh:B, 1zja:A, 1zja:B, 1zjb:A, 1zjb:B
61 7wtl:SX 121 118 0.0645 0.2645 0.2712 2.1
62 8xx9:A 620 33 0.0222 0.0177 0.3333 2.3 8xxa:A
63 4aie:A 537 181 0.0706 0.0652 0.1934 2.6
64 3bh4:A 483 55 0.0282 0.0290 0.2545 2.7 3bh4:B, 1e3x:A, 1e3z:A, 1e40:A, 1e43:A
65 8yif:A 537 32 0.0222 0.0205 0.3438 3.2 8yie:A, 8yie:B
66 2d3l:A 481 57 0.0323 0.0333 0.2807 3.2 2d3n:A, 1wp6:A, 1wpc:A
67 2die:A 481 34 0.0242 0.0249 0.3529 3.2
68 7p38:A 832 53 0.0302 0.0180 0.2830 3.6 8hw3:A, 8hw3:B, 8hwk:A, 8hwk:B, 7p38:B, 7p39:A, 7p39:B
69 6k5p:A 531 192 0.0927 0.0866 0.2396 3.7 6k5p:B, 6k5p:C, 6k5p:D
70 1fw2:A 257 59 0.0363 0.0700 0.3051 3.7 7ezz:A, 7ezz:B, 1qd6:C, 1qd6:D
71 1ys4:A 348 91 0.0464 0.0661 0.2527 3.7 1ys4:B
72 2gjp:A 481 55 0.0302 0.0312 0.2727 4.1 2gjr:A, 1w9x:A
73 3a6o:A 585 268 0.1129 0.0957 0.2090 4.3 3a6o:B, 2d2o:A, 2d2o:B, 1g1y:A, 1g1y:B, 1jf5:A, 1jf5:B, 1jf6:A, 1jf6:B, 1ji2:A, 1ji2:B, 1jib:A, 1jib:B, 1jl8:A, 1jl8:B, 1vb9:A, 1vb9:B, 1vfm:A, 1vfm:B, 1vfo:A, 1vfo:B, 1vfu:A, 1vfu:B, 1wzk:A, 1wzk:B, 1wzl:A, 1wzl:B, 1wzm:A, 1wzm:B
74 7d9b:A 588 35 0.0222 0.0187 0.3143 4.3 7d9c:A, 7dcg:A, 7dch:A, 7ehh:A, 7ehi:A
75 6cnb:S 217 59 0.0403 0.0922 0.3390 5.3 6cnc:S, 6cnd:S, 6cnf:S
76 4rny:A 359 119 0.0524 0.0724 0.2185 5.5 4rny:B, 4rnz:A
77 6f40:W 218 59 0.0403 0.0917 0.3390 5.6 6f41:W
78 3wdh:A 698 179 0.0847 0.0602 0.2346 6.2 3wdi:A, 3wdj:A
79 4mph:B 184 49 0.0323 0.0870 0.3265 6.9 4mph:A
80 5jbd:B 855 53 0.0282 0.0164 0.2642 8.6 5jbd:A, 5jbe:A, 5jbe:B, 5jbf:A, 5jbf:B
81 3hch:A 145 73 0.0403 0.1379 0.2740 9.2 3hch:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218