BioLiP

>protein
QVPVSVNYHFSRKCNKECLFCFHTATTSHVEKPENAKRGLTLLKQAGMKKINFAGGEPFLYPKFLGEMIDFCKETLQLES
VSIVTNGSLVKEQFLQKHGRNIDILAVSCDSFNEATNIKIGRGSNVQKLYEIGSWCQKYDIKFKLNTVVNKFNHLEDMND
HLNALQPFRWKCFQVLIVTGENDSDKTLRNAHSLTISDDEFDRFCERHSSQTCLVPEPNRLMAKSYLILDEYMRFLDRNG
QQPSKSILEVGVQQALQAVFWDEEAFVERGGIYDWNKSS

The query sequence (length=279) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7n7i:A	279	279	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7n7i:B, 7n7i:C
2	6q2p:B	293	285	0.5591	0.5324	0.5474	3.64e-111	6q2p:A, 6q2q:A, 6q2q:B, 5vsl:A, 5vsl:B, 5vsm:A, 5vsm:B
3	7n7h:A	289	285	0.5627	0.5433	0.5509	4.27e-111
4	8ai2:B	323	215	0.1935	0.1672	0.2512	6.65e-06	8ai1:A, 8ai1:B, 8ai2:A, 8ai3:A, 8ai3:B, 8ai4:A, 8ai4:B, 8ai5:A, 8ai5:B, 8ai6:A, 8ai6:B
5	7x0b:B	301	112	0.1183	0.1096	0.2946	7.33e-05	7wzv:A, 7wzv:B, 7wzx:A, 7x0b:A
6	5why:A	418	117	0.1004	0.0670	0.2393	4.05e-04
7	5wgg:A	440	116	0.0968	0.0614	0.2328	0.002	5why:B
8	7vob:C	327	148	0.1254	0.1070	0.2365	0.002	7voc:C
9	2fb2:A	327	149	0.1254	0.1070	0.2349	0.006	2fb2:B, 2fb3:A, 2fb3:B, 1tv7:A, 1tv7:B, 1tv8:A, 1tv8:B
10	7tom:A	498	130	0.1290	0.0723	0.2769	0.034	7tol:A
11	6efn:A	383	65	0.0645	0.0470	0.2769	0.054
12	3t7v:A	337	94	0.0932	0.0772	0.2766	0.059
13	4k36:A	381	159	0.1362	0.0997	0.2390	0.72	4k36:B, 4k37:A, 4k37:B, 4k38:B, 4k38:A, 4k39:B, 4k39:A
14	8juj:B	380	85	0.0789	0.0579	0.2588	0.79	8juj:A
15	4zrn:A	309	75	0.0753	0.0680	0.2800	0.85	4zrm:A, 4zrm:B, 4zrn:B
16	3apt:A	292	73	0.0860	0.0822	0.3288	0.87	3apy:A, 3apy:B, 3apy:C, 3apy:D, 3apy:E, 3apy:F, 3apy:G, 3apy:H, 8eac:A, 7th4:A, 7th4:B, 7th5:A, 7th5:B, 1v93:A
17	7o1o:A	356	99	0.0860	0.0674	0.2424	2.4	3ciw:A, 3cix:A, 5fep:A, 5fes:A, 5few:A, 5fex:A, 5fez:A, 5ff0:A, 5ff2:A, 5ff3:A, 5ff4:A, 3iix:A, 3iiz:A, 4jxc:A, 4jy8:A, 4jy9:A, 4jyd:A, 4jye:A, 4jyf:A, 7o1p:A, 7o1s:A, 7o1t:A, 7o25:A, 7o26:A, 8qmk:A, 8qml:A, 8qmm:A, 8qmn:A
18	7ufg:B	1182	60	0.0609	0.0144	0.2833	3.5	8d8o:B
19	6inh:A	450	73	0.0681	0.0422	0.2603	6.7	6inf:A, 6ing:A, 6ini:A, 6kvi:A, 6kvj:A, 6kvk:A, 6kvl:A, 6o86:A, 6o87:A, 6o88:A
20	5fgp:A	144	51	0.0502	0.0972	0.2745	7.4
21	7xg0:D	331	77	0.0824	0.0695	0.2987	7.5	7xfz:C, 7xg0:C, 7xg0:E, 7xg0:F, 7xg1:C, 7xg1:D, 7xg1:E, 7xg2:C, 7xg2:D, 7xg2:E, 7xg2:F, 7xg3:C, 7xg3:D, 7xg3:E, 7xg3:F, 7xg4:C, 7xg4:D, 7xg4:E, 7xg4:F
22	3axb:A	428	23	0.0394	0.0257	0.4783	7.8	3vqr:A, 3vqr:B
23	7xg1:F	287	77	0.0824	0.0801	0.2987	8.0	7xfz:D, 7xg0:G, 7xg2:G, 7xg3:G, 7xg4:G
24	8sl1:A	843	88	0.0789	0.0261	0.2500	8.4
25	1kc5:L	214	35	0.0466	0.0607	0.3714	9.8	1kcr:L

[Back]