Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QVLLLPFPATNPMLQFGRRLAYHGLRPTLVTTRYVLSTTPPPGDPFRVAAISDGFDDASGMAALPDPGEYLRTLEAHGAR
TLAELLLSEARAGRPARVLVYDPHLPWARRVARAAGVATAAFLSQPCAVDLIYGEVCARRLALPVTPTDARGLYARGVLG
VELGPDDVPPFVAAPELTPAFCEQSIEQFAGLEDDDDVLVNSFSDLEPKEAAYMESTWRAKTIGPSLPSFYLDDGRLVPC
MEWLDKQPPRSVVLVSYGTVSTFDVAKLEELGNGLCNSGKPFLWVVRSNEEHKLSVQLRKKCEKRGLIVPFCPQLEVLAH
KATGCFLSHCGWNSTLEAIVNGVPLVAMPHWADQPTISKYVESLWGMGVRVQLDKSGILQREEVERCIREVMDGDRKEDY
RRNATRLMKKAKESMQEGGSSDKNIAEFAAKYS

The query sequence (length=433) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5tmb:A 451 451 1.0000 0.9601 0.9601 0.0 6bk0:A, 6bk1:A, 6bk2:A, 6bk3:A, 5tmd:A, 5tme:A
2 5u6n:B 448 454 0.4018 0.3884 0.3833 4.91e-104 5u6m:A, 5u6m:B, 5u6n:A, 5u6s:A, 5u6s:B, 5v2j:A, 5v2j:B, 5v2k:A, 5v2k:B
3 8wrk:A 434 441 0.3580 0.3571 0.3515 4.91e-93 8in7:A, 8ina:A, 8ind:A, 8inj:A, 8ino:A, 8inv:A, 8wrj:A
4 8wvd:A 450 452 0.3811 0.3667 0.3650 1.10e-92 6l8z:A
5 7w0k:A 457 449 0.3580 0.3392 0.3452 1.57e-90 7w0z:A, 7w10:A, 7w1b:A, 7w1h:A
6 7w11:A 435 442 0.3557 0.3540 0.3484 2.96e-88
7 8inh:B 454 452 0.3349 0.3194 0.3208 3.88e-68 8inh:A
8 8w7y:A 474 442 0.3141 0.2869 0.3077 1.33e-57
9 8i90:A 440 431 0.2910 0.2864 0.2923 6.39e-56 8i90:B, 8i94:A, 8i94:B
10 6jem:A 440 243 0.2148 0.2114 0.3827 1.79e-47 6jem:B, 6jem:C, 6jen:A, 6jen:B, 6jen:C
11 2vg8:A 465 258 0.1986 0.1849 0.3333 1.30e-39 2vce:A, 2vch:A
12 8ita:A 429 244 0.2009 0.2028 0.3566 2.17e-39 8inp:A
13 6lzy:A 454 373 0.2610 0.2489 0.3029 8.30e-38 6lzx:A, 6lzx:B, 6lzy:B, 7vej:A, 7vej:B, 7vek:A, 7vek:B, 7vel:A, 7vel:B
14 7zer:A 474 448 0.3095 0.2827 0.2991 9.29e-37 7zf0:A
15 7q3s:A 453 259 0.1963 0.1876 0.3282 2.37e-36
16 2c1z:A 439 383 0.2517 0.2483 0.2846 6.08e-36 2c1x:A, 2c9z:A
17 5nlm:B 448 246 0.1917 0.1853 0.3374 7.26e-36
18 8i0d:A 446 440 0.2910 0.2825 0.2864 7.71e-36 8i0e:A
19 8chd:A 461 256 0.1940 0.1822 0.3281 2.01e-34 8chd:B
20 6su6:A 467 258 0.1894 0.1756 0.3178 2.90e-34 5nlm:A, 6su6:B, 6su7:A
21 6inh:A 450 251 0.2079 0.2000 0.3586 7.60e-34 6inf:A, 6ing:A, 6ini:A, 6kvi:A, 6kvj:A, 6kvk:A, 6kvl:A, 6o86:A, 6o87:A, 6o88:A
22 8hjo:B 440 244 0.1917 0.1886 0.3402 7.82e-34 8hjf:A, 8hjf:B, 8hjg:A, 8hjg:B, 8hjh:A, 8hjh:B, 8hjk:A, 8hjl:A, 8hjl:B, 8hjn:A, 8hjn:B, 8hjo:A, 8hjp:A, 8hjp:B, 8j66:A
23 3hbj:A 445 230 0.1663 0.1618 0.3130 1.84e-33 3hbf:A
24 8w53:B 479 263 0.1894 0.1712 0.3118 2.88e-32 8w53:A
25 6lg0:B 444 279 0.2171 0.2117 0.3369 4.20e-32 6lg0:A, 6lg0:C, 6lg0:D, 6lg0:E, 6lg0:F
26 2acv:A 461 246 0.1824 0.1714 0.3211 1.34e-31 2acv:B, 2acw:A, 2acw:B
27 6llz:A 436 275 0.2079 0.2064 0.3273 7.17e-31 7cyw:A, 6llw:A, 6llw:B, 6llz:B
28 6jtd:A 477 213 0.1617 0.1468 0.3286 1.00e-30 6jtd:B
29 8wp5:A 479 258 0.1755 0.1587 0.2946 2.71e-30
30 8hoj:A 451 246 0.1778 0.1707 0.3130 2.45e-29 8hoj:B
31 6l5s:A 454 280 0.2263 0.2159 0.3500 7.52e-29 6l5p:A, 6l5q:A, 6l5r:A, 6l7h:A
32 7va8:A 456 280 0.1871 0.1776 0.2893 7.61e-29 7va8:B, 7vaa:A, 7vaa:B
33 7bv3:B 439 263 0.1755 0.1731 0.2890 1.64e-28
34 7bv3:A 457 262 0.1778 0.1685 0.2939 4.66e-28
35 8j2t:A 477 303 0.2079 0.1887 0.2970 1.16e-27 8j2s:A, 8j2s:B, 8j2s:C, 8j2s:D, 8j2s:E, 8j2s:F, 8j2s:G, 8j2t:B, 8j2u:A, 8j2u:B, 8j2v:A, 9j9c:A, 9j9c:B, 9j9c:C, 9j9c:D, 9j9c:E, 9j9c:F, 9j9c:G, 9j9k:A, 9j9k:B
36 6lfz:B 439 263 0.1824 0.1800 0.3004 2.19e-25 6lfz:A
37 4rel:A 446 449 0.2517 0.2444 0.2428 3.32e-25 4rem:A, 4ren:A, 4whm:A
38 8cgq:A 458 233 0.1709 0.1616 0.3176 2.39e-24 6lf6:A
39 6lg1:A 429 258 0.1755 0.1772 0.2946 7.13e-24 6lg1:B
40 7c2x:A 490 254 0.1663 0.1469 0.2835 9.67e-23
41 6ija:A 415 245 0.1778 0.1855 0.3143 1.04e-22 6ij9:A, 6ij9:B, 6ij9:C, 6ija:B, 6ijd:A, 6ijd:B
42 7es1:A 408 196 0.1570 0.1667 0.3469 2.31e-22 7erx:A, 7es0:A, 7es2:A
43 6ij9:D 388 238 0.1663 0.1856 0.3025 6.45e-21
44 7vlb:A 385 73 0.0808 0.0909 0.4795 1.85e-08
45 7vlb:B 353 73 0.0808 0.0992 0.4795 2.02e-08
46 7vm0:B 406 181 0.1178 0.1256 0.2818 5.33e-07 8h5d:A, 8h5d:B, 7vm0:A
47 8sft:B 428 183 0.1062 0.1075 0.2514 6.29e-07 8gkn:A, 8gkn:B, 8sft:A, 8sft:C, 8sft:D, 8sfu:A, 8sfu:B, 8sfw:A, 8sfy:A
48 6kqx:A 327 58 0.0624 0.0826 0.4655 3.66e-06
49 7xx4:A 395 113 0.0808 0.0886 0.3097 2.54e-05 2iyf:A, 2iyf:B, 4m83:A, 4m83:B, 7xx4:B
50 2iya:A 392 65 0.0531 0.0587 0.3538 4.17e-05 2iya:B
51 6j31:B 387 68 0.0508 0.0568 0.3235 0.002 6j31:A, 6j31:C, 6j31:D
52 3ia7:A 397 95 0.0831 0.0907 0.3789 0.002 3ia7:B
53 3pdm:P 162 144 0.0762 0.2037 0.2292 0.076
54 8any:A4 595 64 0.0439 0.0319 0.2969 0.97 8oir:Ae, 8ois:Ae, 7po2:4, 7qi4:A4, 7qi5:A4, 7qi6:A4, 6zm5:A4, 6zm6:A4
55 3rsc:A 397 58 0.0462 0.0504 0.3448 1.2 3iaa:A, 3iaa:B, 3rsc:B
56 1zny:A 183 119 0.0739 0.1749 0.2689 1.5 1znx:A, 1znz:A
57 6rhz:1 197 76 0.0439 0.0964 0.2500 1.6 6qph:1, 6sl5:1, 6yxr:1
58 8cmo:1 194 74 0.0462 0.1031 0.2703 3.3 8cmo:Z
59 7yp3:F 419 129 0.0762 0.0788 0.2558 4.3 7yp3:B, 7yp3:C, 7yp3:D, 7yp3:E, 7yp5:A, 7yp5:B, 7yp6:A, 7yp6:B
60 6h0a:A 339 92 0.0577 0.0737 0.2717 6.3 6g82:A, 6gmu:A, 4hho:A, 4hhq:A, 4q1u:A, 3sre:A, 3srg:A, 1v04:A
61 3qpb:C 254 53 0.0508 0.0866 0.4151 6.8 3qpb:A, 3qpb:B, 3qpb:D, 3qpb:E, 3qpb:F, 3qpb:G, 3qpb:H, 3qpb:I, 3qpb:J, 3qpb:K, 3qpb:L, 3qpb:M, 3qpb:N, 3qpb:O, 3qpb:P, 3qpb:Q, 3qpb:R
62 4ako:A 506 89 0.0531 0.0455 0.2584 6.9 4a66:A, 4a67:A, 4a68:A, 4akp:A, 4akq:A, 2bhf:A, 1gsk:A, 1of0:A, 4q89:A, 4q89:B, 4q8b:A, 4q8b:B, 1w6l:A, 1w6w:A, 1w8e:A, 2wsd:A, 2x87:A, 2x88:A, 7y8b:A, 7y8b:B, 7y8c:A, 7y8c:B, 4yvn:A, 4yvu:A, 3zdw:A, 5zlj:A, 5zlk:A, 5zll:A, 5zlm:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218