BioLiP

>protein
QVLKIRRPDDWHVHLRDGDMLKTVVPYTSEIYGRAIVMPNLASPITTVDAAIAYRQRILDAVPAGHDFTPLMTCYLTDSL
DADELERGFHEGVFTAAKLYPANATTNSSHGVTSVDAIMPVLERMEKLGIPLLVHGEVTHADVDIFDREARFIDTVMEPL
RQRLTALKVVFEHITTKDAAQYVRDGNDYLAATITPQHLMFNRNDMLVGGIRPHLYCLPILKRNIHQQALRELVASGFTR
AFLGTDSAPHSRHRKETSCGCAGCFNAPSALGSYAAVFEEMNALAHFEAFCSLNGPQFYGLPMNTGWVELVRDEQQIPGN
IALADDSLVPFLAGETVRWSVK

The query sequence (length=342) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3jze:A	344	342	1.0000	0.9942	1.0000	0.0	3jze:B, 3jze:C, 3jze:D
2	3mjm:A	344	342	0.8860	0.8808	0.8860	0.0	2e25:A, 2eg6:A, 2eg6:B, 2eg7:A, 2eg7:B, 2eg8:A, 2eg8:B, 1j79:A, 1j79:B, 3mjm:B, 1xge:A, 1xge:B, 2z24:A, 2z24:B, 2z25:A, 2z25:B, 2z26:A, 2z26:B, 2z27:A, 2z27:B, 2z28:A, 2z28:B, 2z29:A, 2z29:B, 2z2a:A, 2z2a:B, 2z2b:A
3	6cty:C	353	342	0.7251	0.7025	0.7251	0.0	6cty:A, 6cty:B, 6cty:D, 6cty:E, 6cty:F
4	4lfy:B	353	343	0.5526	0.5354	0.5510	6.62e-130	4lfy:A
5	5vgm:B	342	340	0.5292	0.5292	0.5324	3.25e-126	5vgm:A
6	3pnu:A	338	344	0.3684	0.3728	0.3663	5.40e-66	3pnu:B
7	6l0a:C	365	356	0.3392	0.3178	0.3258	1.57e-45	7ca0:A, 7ca0:B, 7ca0:C, 7ca0:D, 7ca1:A, 7ca1:C, 7ca1:B, 7ca1:D, 6l0a:A, 6l0a:B, 6l0a:D, 6l0b:A, 6l0b:C, 6l0b:B, 6l0b:D, 6l0f:A, 6l0f:B, 6l0f:C, 6l0f:D, 6l0g:A, 6l0g:B, 6l0g:C, 6l0g:D, 6l0h:A, 6l0h:B, 6l0h:C, 6l0h:D, 6l0i:A, 6l0i:B, 6l0i:C, 6l0i:D, 6l0j:A, 6l0j:D, 6l0j:B, 6l0j:C, 6l0k:A, 6l0k:B, 6l0k:C, 6l0k:D
8	6hg1:A	371	266	0.2164	0.1995	0.2782	1.77e-05	4by3:A, 4c6c:A, 4c6d:A, 4c6e:A, 4c6f:A, 4c6i:A, 4c6j:A, 4c6k:A, 4c6l:A, 4c6m:A, 4c6n:A, 4c6o:A, 4c6p:A, 4c6q:A, 8gvz:A, 8gw0:A, 6hfd:A, 6hfe:A, 6hff:A, 6hfh:A, 6hfi:A, 6hfj:A, 6hfk:A, 6hfl:A, 6hfn:A, 6hfp:A, 6hfq:A, 6hfr:A, 6hfs:A, 6hfu:A, 6hg2:A, 6hg3:A, 8pbe:A, 8pbg:A, 8pbh:A, 8pbi:A, 8pbj:A, 8pbk:A, 8pbm:A, 8pbn:A, 8pbp:A, 8pbq:A, 8pbr:A, 8pbs:A, 8pbt:A, 8pbu:A, 5ynz:A
9	4bjh:A	422	326	0.2222	0.1801	0.2331	2.12e-05	3d6n:A
10	2z00:A	426	304	0.1988	0.1596	0.2237	4.42e-04
11	3gri:B	423	86	0.0760	0.0615	0.3023	0.002	3gri:A
12	6gdd:A	375	220	0.1433	0.1307	0.2227	0.018	6gde:A, 6gdf:A, 1xrf:A, 1xrt:A, 1xrt:B
13	2gwn:A	451	103	0.0789	0.0599	0.2621	0.19
14	3oyo:A	225	46	0.0497	0.0756	0.3696	1.4	3oyo:B
15	6dxs:A	342	85	0.0702	0.0702	0.2824	2.0	6dwv:B, 6dwv:A, 6dwv:C, 6dwv:D, 6dxq:A, 6dxq:B, 6dxq:C, 6dxq:D, 6dxs:B, 6dxs:C, 6dxs:D
16	2q85:A	341	147	0.1082	0.1085	0.2517	2.5	1mbb:A, 1mbt:A, 2mbr:A, 1uxy:A
17	7ev9:A	382	13	0.0322	0.0288	0.8462	2.7	7ev9:E, 7ev9:I, 8oyi:A, 8oyi:E, 8oyi:I, 3rgb:A, 3rgb:E, 3rgb:I, 7s4h:A, 7s4h:E, 7s4h:I, 7s4i:A, 7s4i:E, 7s4i:I, 7s4j:A, 7s4j:E, 7s4j:I, 7s4k:A, 7s4k:E, 7s4k:I, 8sqw:A, 8sqw:E, 8sqw:I, 8sr1:A, 8sr1:E, 8sr1:I, 8sr2:A, 8sr2:E, 8sr2:I, 8sr4:A, 8sr4:E, 8sr4:I, 8sr5:A, 8sr5:E, 8sr5:I, 7t4o:A, 7t4o:E, 7t4o:I, 7t4p:A, 7t4p:E, 7t4p:I, 1yew:A, 1yew:E, 1yew:I
18	4y5q:A	449	99	0.0760	0.0579	0.2626	2.8	9d8s:A, 3igo:A, 3mwu:A, 3ncg:A, 2wei:A
19	6cxh:A	382	72	0.0643	0.0576	0.3056	3.5	7s4l:A, 7s4l:D, 7s4l:E
20	8qlj:A	621	88	0.0702	0.0386	0.2727	4.3	8qlk:A, 8qlm:A, 8qlm:B, 8qlv:A
21	4zxh:A	1314	66	0.0585	0.0152	0.3030	4.7	4zxi:A
22	8a42:A	627	27	0.0322	0.0175	0.4074	4.8	8qm0:A, 8qm0:B, 8qm0:C, 8qm0:D
23	1lld:A	313	62	0.0614	0.0671	0.3387	5.7	1lld:B, 1lth:T, 1lth:R
24	3zm8:A	444	57	0.0497	0.0383	0.2982	9.3

[Back]