BioLiP

>protein
QVFEYAEVDEIVEKRGKGKDVEYLVRWKDGGDCEWVKGVHVAEDVAKDYEDGLEYAVAESVIGKRVGDDGKTIEYLVKWT
DMSDATWEPQDNVDSTLVLLYQQQQ

The query sequence (length=105) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5e4w:C	105	105	1.0000	1.0000	1.0000	1.31e-71	5e4w:D, 5e4x:A
2	3ui2:A	234	54	0.5143	0.2308	1.0000	1.09e-31	3dep:A, 2hug:A
3	3ui2:A	234	45	0.1810	0.0812	0.4222	1.51e-04	3dep:A, 2hug:A
4	3ui2:A	234	42	0.1238	0.0556	0.3095	0.15	3dep:A, 2hug:A
5	3ui2:A	234	35	0.1429	0.0641	0.4286	0.17	3dep:A, 2hug:A
6	3gv6:A	56	51	0.2000	0.3750	0.4118	6.88e-06	3i90:A, 3i90:B
7	5epl:B	58	57	0.2000	0.3621	0.3684	4.50e-04	5epl:A
8	3tzd:A	58	42	0.1810	0.3276	0.4524	5.87e-04	3dm1:A, 3dm1:C, 3dm1:G, 3dm1:E, 2l11:A
9	5eq0:A	55	52	0.1619	0.3091	0.3269	8.45e-04	3i91:A
10	7n27:A	57	44	0.1810	0.3333	0.4318	0.003	7n27:D, 7n27:B, 7n27:C, 7n27:E, 7n27:F
11	7n27:A	57	42	0.1810	0.3333	0.4524	1.6	7n27:D, 7n27:B, 7n27:C, 7n27:E, 7n27:F
12	1guw:A	73	36	0.1524	0.2192	0.4444	0.012	6d07:A, 6d07:B, 6d08:A, 6d08:B
13	4u68:A	64	46	0.1524	0.2500	0.3478	0.031	4quf:A, 4quf:B, 4quf:C, 4quf:D, 4quf:E, 4quf:F, 4u68:B, 4u68:C
14	6v41:AAA	61	37	0.1429	0.2459	0.4054	0.032
15	6v41:AAA	61	38	0.1619	0.2787	0.4474	2.5
16	2rvn:A	83	45	0.1524	0.1928	0.3556	0.038
17	6asz:A	53	44	0.1619	0.3208	0.3864	0.082	6at0:A, 1kna:A, 1kne:A, 6mha:A, 1q3l:A
18	6irw:A	494	55	0.1619	0.0344	0.3091	0.14	6irw:B
19	8uxq:A	170	43	0.1524	0.0941	0.3721	0.21	3fdt:A
20	2rsn:A	75	37	0.1429	0.2000	0.4054	0.26	3g7l:A
21	6v2d:G	64	29	0.1429	0.2344	0.5172	3.4	5jjz:A, 7slw:A, 7slw:B, 7slw:C, 7slw:D, 7slw:E, 7slw:F, 8sp6:A, 8sp6:B, 8sp6:C, 8sp6:D, 8sp6:E, 8sp6:F, 6v2d:I, 6v2d:K, 6v2d:A, 6v2d:C, 6v2d:E, 6v2h:A, 6v2h:C, 6v2h:E, 6v2h:G, 6v2h:I, 6v2h:K, 6v3n:A, 6v3n:B, 6v8w:A, 6v8w:B, 6v8w:C, 6v8w:D, 6v8w:E, 6v8w:F, 6v8w:G, 6v8w:H, 6v8w:I, 6v8w:J, 6v8w:K, 6v8w:L, 6v8w:M, 6v8w:N, 6v8w:O, 6v8w:P, 6v8w:Q, 6v8w:R, 6v8w:S, 6v8w:T, 6v8w:U, 6v8w:V, 6v8w:W, 6v8w:X, 6v8w:Y, 6v8w:Z
22	5ejw:A	80	28	0.1333	0.1750	0.5000	8.1	5epj:A, 2kvm:A, 2l12:A, 2l1b:A, 4mn3:A, 8sii:A, 8sii:B, 6v2r:A, 4x3k:A, 4x3k:B, 4x3s:B, 4x3s:A, 4x3t:A, 4x3t:B, 4x3t:C, 4x3t:D, 4x3t:E, 4x3t:F, 4x3u:A, 4x3u:B
23	7e7l:A	770	48	0.1429	0.0195	0.3125	8.7	7e7l:B
24	5jcs:r	333	27	0.0952	0.0300	0.3704	9.9

[Back]