Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QTSDVVIHRKENEGFGFVIISSLATITVPHKIGRIIDGSPADRCAKLKVGDRILAVNGQSIINMPHADIVKLIKDAGLSV
TLRIIPQ

The query sequence (length=87) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7d6f:A 87 87 1.0000 1.0000 1.0000 1.30e-58
2 2r4h:C 98 69 0.2759 0.2449 0.3478 8.75e-11
3 1ihj:B 95 85 0.3448 0.3158 0.3529 5.09e-09 1ihj:A
4 1u38:A 89 75 0.2759 0.2697 0.3200 6.68e-09
5 7p73:A 420 75 0.3218 0.0667 0.3733 2.51e-08 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
6 4e34:A 87 81 0.3103 0.3103 0.3333 3.49e-08 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
7 2qt5:A 194 87 0.3563 0.1598 0.3563 6.68e-08 2qt5:B
8 2qt5:A 194 80 0.2759 0.1237 0.3000 1.70e-04 2qt5:B
9 6yx0:B 112 92 0.2989 0.2321 0.2826 1.31e-07 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
10 5heb:A 119 78 0.3333 0.2437 0.3718 1.52e-07 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
11 8bq8:C 93 86 0.3218 0.3011 0.3256 1.68e-07 8bq8:A, 8bq8:B
12 1n7f:A 86 76 0.3103 0.3140 0.3553 4.96e-07 1n7f:B
13 5zys:A 90 76 0.2989 0.2889 0.3421 5.56e-07
14 6xa7:B 96 80 0.2759 0.2500 0.3000 2.99e-06 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
15 7p70:A 407 84 0.3218 0.0688 0.3333 1.03e-05 7pc4:A, 7qql:A
16 2pdz:A 86 57 0.2414 0.2442 0.3684 1.06e-05
17 4xh7:A 110 80 0.2874 0.2273 0.3125 1.73e-05
18 7qqn:C 414 80 0.2874 0.0604 0.3125 1.88e-05 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
19 8bp4:A 93 79 0.2644 0.2473 0.2911 2.18e-05 8bp4:C, 8bp4:B
20 3jxt:A 96 78 0.3103 0.2812 0.3462 2.33e-05 3jxt:B
21 2egn:A 83 73 0.2759 0.2892 0.3288 2.50e-05
22 2ka9:A 189 76 0.2644 0.1217 0.3026 2.62e-05 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
23 8b82:A 108 53 0.2184 0.1759 0.3585 2.64e-05 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
24 7pc3:A 405 79 0.2644 0.0568 0.2911 4.14e-05 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
25 6nid:B 88 55 0.2069 0.2045 0.3273 5.10e-05 6nid:A, 6nid:C
26 5ez0:D 95 65 0.2529 0.2316 0.3385 5.42e-05 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
27 2ejy:A 85 55 0.2069 0.2118 0.3273 8.51e-05
28 6hks:B 94 65 0.2759 0.2553 0.3692 1.14e-04 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
29 5n7d:A 423 78 0.2759 0.0567 0.3077 1.38e-04 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
30 5wou:A 95 51 0.2184 0.2000 0.3725 1.57e-04
31 8c1t:A 90 91 0.3448 0.3333 0.3297 1.75e-04 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
32 2kpl:A 129 78 0.2759 0.1860 0.3077 1.99e-04
33 2i0i:A 81 78 0.3103 0.3333 0.3462 4.05e-04 2i0i:B, 2i0i:C
34 8bv7:A 95 44 0.1839 0.1684 0.3636 4.40e-04 8buw:A, 8buw:B
35 4wyu:A 201 42 0.1839 0.0796 0.3810 4.64e-04 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
36 4wyu:A 201 38 0.1839 0.0796 0.4211 0.010 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
37 2exg:A 101 87 0.2529 0.2178 0.2529 7.69e-04 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
38 6x23:A 89 86 0.3563 0.3483 0.3605 8.47e-04
39 7qqm:A 413 82 0.2989 0.0630 0.3171 0.002
40 6gbe:A 119 52 0.1724 0.1261 0.2885 0.002
41 2m0u:A 117 76 0.2759 0.2051 0.3158 0.003
42 2os6:A 89 79 0.2989 0.2921 0.3291 0.004
43 2m0v:A 128 77 0.2414 0.1641 0.2727 0.004
44 2koh:A 111 40 0.1379 0.1081 0.3000 0.006 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
45 3ch8:A 190 52 0.2184 0.1000 0.3654 0.006 2qbw:A
46 1n7t:A 103 52 0.2184 0.1845 0.3654 0.007 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
47 6kz1:A 97 39 0.1724 0.1546 0.3846 0.008 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
48 6ezi:A 86 53 0.2184 0.2209 0.3585 0.009 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
49 4wsi:A 372 55 0.1954 0.0457 0.3091 0.010 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
50 6ar4:B 87 49 0.1724 0.1724 0.3061 0.023 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
51 3vqg:A 85 30 0.1379 0.1412 0.4000 0.047
52 8xud:D 651 62 0.2529 0.0338 0.3548 0.082 6iqq:C, 6iqq:D, 5wql:D, 5wql:C, 8xud:C
53 2l4t:A 124 35 0.1494 0.1048 0.3714 0.093 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
54 7w6z:A 414 30 0.1609 0.0338 0.4667 0.10 7w6y:A
55 2m0z:A 97 48 0.1839 0.1649 0.3333 0.16 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
56 5oak:A 90 47 0.1839 0.1778 0.3404 0.18 5oak:C
57 3o5n:E 92 81 0.2529 0.2391 0.2716 0.18
58 1b8q:A 127 70 0.1839 0.1260 0.2286 0.23
59 7x2e:A 163 39 0.1609 0.0859 0.3590 0.24 2kbs:A
60 8blu:B 195 82 0.2414 0.1077 0.2561 0.26 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
61 6q0m:B 94 48 0.1954 0.1809 0.3542 0.37
62 5en1:A 184 45 0.1954 0.0924 0.3778 0.47 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
63 6k2z:A 138 52 0.1609 0.1014 0.2692 0.48 6k2z:B
64 5f67:A 98 46 0.2069 0.1837 0.3913 0.60 5f67:B
65 4xhv:A 94 80 0.2414 0.2234 0.2625 0.72
66 5izu:A 124 90 0.2299 0.1613 0.2222 0.82 6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
67 6bxg:A 98 82 0.2989 0.2653 0.3171 0.94
68 2p1r:A 290 32 0.1149 0.0345 0.3125 1.0 2p1r:B, 2p1r:C, 2p1r:D
69 1zub:A 109 54 0.1609 0.1284 0.2593 1.4
70 2bon:B 265 32 0.1034 0.0340 0.2812 1.4 2jgr:A
71 2bon:A 287 32 0.1034 0.0314 0.2812 1.4
72 6n1x:A 377 29 0.1264 0.0292 0.3793 2.9 6d9t:A
73 8t4e:B 551 24 0.1034 0.0163 0.3750 3.1 8t4f:B, 8t4g:B, 8t4h:B, 8t4i:B, 8t4j:B
74 7qct:A 90 50 0.1609 0.1556 0.2800 3.6 7qct:B
75 3wyw:B 214 41 0.1379 0.0561 0.2927 3.7 3wyw:A
76 4ayx:A 571 29 0.1149 0.0175 0.3448 4.2 4ayt:A, 4ayw:A, 7y48:B, 3zdq:A
77 4qnu:A 323 31 0.1264 0.0341 0.3548 5.1 4qnu:B, 4qnu:C, 4qnu:D, 4qnu:E, 4qnu:F, 4qnu:G, 4qnu:H, 4qnv:A, 4qnv:B
78 1dvr:A 220 41 0.1379 0.0545 0.2927 5.4 1aky:A, 2aky:A, 3aky:A, 1dvr:B
79 7w6x:A 447 41 0.1839 0.0358 0.3902 5.9
80 2joa:A 105 51 0.1724 0.1429 0.2941 6.8
81 3pak:A 145 15 0.0920 0.0552 0.5333 7.6 5ffr:A, 5ffs:A, 5fft:A, 3paq:A, 3par:A, 3pbf:A, 1r13:A, 1r14:A, 4wr9:A, 4wrc:A, 4wre:A, 4wrf:A, 4wuw:A, 4wux:A
82 7ye1:C 1312 66 0.2299 0.0152 0.3030 9.4 7ye2:C
83 1e6y:A 568 66 0.1724 0.0264 0.2273 9.9 1e6y:D, 8gf5:A, 8gf5:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218