Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
QTIKDFLAVAMKKWTAPFEPFQLIDNIYYVGTDGIAVYVIKTSQGLILMDTAMPQSTGMIKDNIAKLGFKVADIKLILNT
HAHLDHTGGFAEIKKETGAQLVAGERDKPLLEGGYYPGDEKNEDLAFPAVKVDRAVKEGDRVTLGDTTLTAHATPGHSPG
CTSWEMTVKDGKEDREVLFFCSGTVALNRLVGQPTYAGIVDDYRATFAKAKAMKIDVLLGPHPEVYGMQAKRAEMKDGAP
NPFIKPGELVTYATSLSEDFDKQLAKQTAALEKK

The query sequence (length=274) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5ngg:A 274 274 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 2gmn:A, 2gmn:B, 3lvz:A, 3lvz:B, 5ngg:B, 5njw:A, 5njw:B, 5wcm:A, 5wcm:B
2 8u00:A 242 259 0.3723 0.4215 0.3938 3.94e-63 8u00:B
3 1l9y:A 263 260 0.3613 0.3764 0.3808 5.80e-56 1jt1:A, 1k07:A, 1k07:B, 1l9y:B, 5w90:A, 5wck:A, 5wck:B
4 6nc5:A 259 259 0.3394 0.3591 0.3591 9.91e-54 6dqh:A, 6dr8:A
5 7luu:A 266 220 0.3102 0.3195 0.3864 4.32e-48
6 6u10:A 269 265 0.3248 0.3309 0.3358 2.30e-47 7l52:A, 7l91:A, 6u0y:A, 6u0y:B, 6u0y:C, 6u0y:D, 6u0z:A, 6u13:A, 6u2y:A, 6u2z:A, 6uac:A, 6uaf:A, 6uah:A, 7uhh:A, 7uhi:A, 7uhj:A, 7uhk:A, 7uhl:A, 7uhm:A, 7uhn:A, 7uho:A, 7uhp:A, 7uhq:A, 7uhr:A, 7uht:A
7 6mfi:A 264 258 0.2993 0.3106 0.3178 2.07e-45
8 8hxi:B 268 260 0.3248 0.3321 0.3423 5.54e-45 7a63:A, 7afz:A, 2aio:A, 7bj8:A, 5dpx:A, 5dpx:B, 5evb:A, 5evd:A, 5evk:A, 2fm6:A, 2fm6:B, 2fu7:A, 2fu7:B, 2fu8:A, 2fu8:B, 2fu9:A, 2fu9:B, 2gfj:A, 2gfj:B, 2gfk:A, 2gfk:B, 2h6a:A, 2h6a:B, 2hb9:A, 5hh5:A, 5hh6:A, 8hxe:A, 8hxe:B, 8hxi:A, 7o0o:A, 2qdt:A, 2qin:A, 2qin:B, 2qin:C, 2qin:D, 2qjs:A, 2qjs:B, 2qjs:C, 2qjs:D, 1sml:A, 7zo2:A, 7zo3:A, 7zo4:A, 7zo5:A, 7zo6:A, 7zo7:A
9 6n36:A 265 224 0.2956 0.3057 0.3616 8.02e-44
10 5aeb:B 266 258 0.3066 0.3158 0.3256 1.05e-43 5aeb:A
11 5iqk:B 270 260 0.3029 0.3074 0.3192 3.79e-43 5iqk:A
12 6e0s:A 264 268 0.3285 0.3409 0.3358 4.69e-42
13 5k0w:B 271 259 0.3102 0.3137 0.3282 9.90e-42 5k0w:A
14 6k4t:A 260 258 0.2847 0.3000 0.3023 4.31e-40 5axo:A, 5axr:A, 5aya:A, 5b15:A, 5b1u:A, 6k4x:A, 3vpe:A, 3vqz:A
15 6auf:B 273 260 0.2847 0.2857 0.3000 5.56e-38
16 4awy:B 270 261 0.2993 0.3037 0.3142 1.03e-37 4awz:A, 4awz:B, 4awz:C, 4ax0:B, 4ax1:B, 4p62:A
17 2xf4:A 210 86 0.1131 0.1476 0.3605 3.71e-08
18 2q42:A 254 110 0.1204 0.1299 0.3000 4.17e-07 2q42:B, 1xm8:A, 1xm8:B
19 4efz:A 295 104 0.1022 0.0949 0.2692 5.66e-07 4efz:B
20 4zo2:B 294 163 0.1606 0.1497 0.2699 2.94e-06 4zo2:A, 4zo3:A, 4zo3:B
21 2gcu:A 244 195 0.1715 0.1926 0.2410 7.14e-06 2gcu:B, 2gcu:C, 2gcu:D
22 2p18:A 283 103 0.1204 0.1166 0.3204 4.17e-05 2p1e:A
23 2zwr:B 207 135 0.1423 0.1884 0.2889 1.21e-04 2zwr:A, 2zzi:A, 2zzi:B
24 7ev5:A 209 118 0.1168 0.1531 0.2712 1.27e-04
25 4le6:A 257 134 0.1204 0.1284 0.2463 1.89e-04 4le6:B, 4le6:C, 4le6:D, 4le6:E
26 4chl:B 237 200 0.1679 0.1941 0.2300 4.44e-04 4chl:A
27 3dha:A 254 152 0.1350 0.1457 0.2434 5.00e-04 2a7m:A, 2br6:A, 2btn:A, 3dhb:A, 3dhc:A, 5eh9:A, 5eht:A, 4j5f:A, 4j5h:A, 7l5f:A
28 5ve5:A 350 86 0.0876 0.0686 0.2791 5.07e-04 5ve3:B, 5ve3:A, 5ve4:A, 5ve4:B, 5ve4:C, 5ve5:B, 5ve5:C
29 3tp9:A 473 118 0.1204 0.0698 0.2797 7.41e-04 3tp9:B
30 2zo4:A 301 62 0.0803 0.0731 0.3548 0.001
31 4ysk:A 294 154 0.1314 0.1224 0.2338 0.002 4ysk:B, 4ysl:A, 4ysl:B
32 4o98:B 307 60 0.0657 0.0586 0.3000 0.002 4o98:A
33 4v0h:D 223 118 0.1131 0.1390 0.2627 0.003 4v0h:A, 4v0h:B, 4v0h:C
34 4ad9:A 288 128 0.1241 0.1181 0.2656 0.003 4ad9:B, 4ad9:C, 4ad9:D, 4ad9:E, 4ad9:F
35 7l0b:A 202 127 0.1314 0.1782 0.2835 0.004 7l0b:B, 7l0b:C, 7l0b:D
36 7y7u:A 288 145 0.1241 0.1181 0.2345 0.016 7y7u:B
37 2p4z:B 276 72 0.0912 0.0906 0.3472 0.030 2p4z:A
38 6c2c:A 299 165 0.1460 0.1338 0.2424 0.044 6c2c:B, 5hif:A, 5hif:B
39 5aij:A 630 70 0.0730 0.0317 0.2857 0.062 5a23:A, 5a23:B, 5a23:C, 5a23:D, 5ajl:A, 5ajl:B, 2cfu:A, 2cfz:A, 2cg2:A, 2cg3:A
40 1p9e:A 294 155 0.1387 0.1293 0.2452 0.10 1p9e:B
41 6v3q:A 226 127 0.1168 0.1416 0.2520 0.13 6v3q:B
42 3r2u:A 348 123 0.1387 0.1092 0.3089 0.21 3r2u:B, 3r2u:C, 3r2u:D
43 2e7y:A 272 128 0.1350 0.1360 0.2891 0.22 2e7y:B
44 2ohh:A 403 124 0.1204 0.0819 0.2661 0.30 2ohh:B, 2ohh:D, 2ohh:E, 2ohi:A, 2ohi:B, 2ohi:D, 2ohi:E, 2ohi:G, 2ohi:H, 2ohi:I, 2ohi:J, 2ohj:A, 2ohj:B, 2ohj:D, 2ohj:E
45 7e3w:B 239 39 0.0474 0.0544 0.3333 0.31 7e3v:A, 7e3v:B, 7e3v:C, 7e3v:D, 7e3v:E, 7e3v:F, 7e3w:A, 7e3w:C, 7e3w:D, 7e3w:E, 7e3w:F
46 2yhe:A 639 70 0.0693 0.0297 0.2714 0.53 4av7:A, 4av7:B, 4av7:C, 4av7:D, 4av7:E, 4av7:F, 4axh:A, 4axh:B, 2yhe:B, 2yhe:C, 2yhe:D, 2yhe:E, 2yhe:F
47 3a4y:A 431 50 0.0620 0.0394 0.3400 0.55 3a4y:B, 3a4y:C, 3a4y:D, 2dkf:A, 2dkf:B, 2dkf:C, 2dkf:D, 3idz:A, 3idz:B, 3idz:C, 3idz:D, 3ie0:A, 3ie0:B, 3ie0:C, 3ie0:D, 3ie1:A, 3ie1:B, 3ie1:C, 3ie1:D, 3ie2:A, 3ie2:B, 3ie2:C, 3ie2:D, 3iek:A, 3iek:B, 3iek:C, 3iek:D, 3iel:A, 3iel:B, 3iel:C, 3iel:D, 3iem:A, 3iem:B, 3iem:D, 3iem:C
48 4xuk:A 291 62 0.0584 0.0550 0.2581 0.61 4xuk:B
49 3aj3:A 273 66 0.0620 0.0623 0.2576 0.64 4kep:A, 4keq:A
50 3fai:A 227 217 0.1971 0.2379 0.2488 0.74 3f9o:A, 2gkl:A, 3iof:A, 3iog:A, 2qds:A, 1x8g:A, 1x8h:A, 1x8i:A
51 8z99:H 582 150 0.1204 0.0567 0.2200 0.85 8yhd:I, 8yhd:L, 8yhe:I, 8yhe:L, 8z4j:H, 8z4j:I, 8z4j:L, 8z4l:H, 8z4l:I, 8z4l:L, 8z99:I, 8z99:L, 8z9c:H, 8z9c:I, 8z9c:L, 8z9e:I, 8z9e:L
52 6cgy:A 276 160 0.1314 0.1304 0.2250 0.90 6cgy:H, 6cgy:L, 6cgz:A, 6cgz:B, 6cgz:C, 6ch0:C, 6ch0:F, 6ch0:I
53 8gyg:B 305 27 0.0401 0.0361 0.4074 0.96 8gyg:A
54 6hrg:A 233 28 0.0474 0.0558 0.4643 1.2
55 4ysb:A 225 88 0.0803 0.0978 0.2500 1.4 4ysb:B
56 2m5c:A 227 59 0.0693 0.0837 0.3220 1.4 1bc2:A, 1bc2:B, 2bc2:A, 2bc2:B, 3bc2:A, 2bfk:A, 2bfk:B, 2bfl:A, 2bfl:B, 2bfz:A, 2bfz:B, 2bg2:A, 2bg2:B, 2bg6:A, 2bg6:B, 2bg7:A, 2bg7:B, 2bg8:A, 2bg8:B, 2bga:A, 2bga:B, 1bmc:A, 1bvt:A, 4c09:A, 4c1c:A, 4c1h:A, 6dja:A, 1dxk:A, 6eum:A, 6ewe:A, 6f2n:A, 3fcz:A, 3fcz:B, 5fqa:A, 5fqb:A, 3i11:A, 3i13:A, 3i14:A, 3i15:A, 5jmx:A, 3knr:A, 3knr:B, 3knr:C, 3knr:D, 3kns:A, 3kns:B, 3kns:C, 3kns:D, 2m5d:A, 4nq4:A, 4nq5:A, 4nq6:A, 2nxa:A, 2nyp:A, 2nze:A, 2nze:B, 2nzf:A, 4tyt:A, 2uyx:A, 5w8w:A
57 5bw4:B 224 44 0.0620 0.0759 0.3864 1.5 5bw4:A, 5d1n:A
58 2ycb:B 635 156 0.1350 0.0583 0.2372 1.6 2ycb:A
59 1qh3:A 260 84 0.0949 0.1000 0.3095 1.7 1qh3:B, 1qh5:A, 1qh5:B
60 5nde:B 247 33 0.0584 0.0648 0.4848 1.9 4bp0:A, 4bp0:C, 4bp0:B, 4bp0:D, 2fhx:A, 2fhx:B, 5ls3:B, 5ls3:A, 5ndb:A, 5ndb:B, 5nde:A
61 7bj9:B 230 79 0.0876 0.1043 0.3038 2.4 7bj9:A, 5ew0:A, 5ew0:B, 8hxn:A, 3q6v:A, 3q6v:B, 3sd9:A, 3sd9:B
62 6vwf:A 450 43 0.0547 0.0333 0.3488 3.3 6vwf:B
63 4nur:A 633 70 0.0620 0.0269 0.2429 3.3 4nur:B
64 6vr6:D 493 43 0.0547 0.0304 0.3488 3.6 6vr6:A, 6vr6:B, 6vr6:C, 6vr6:E, 6vr6:F, 6vr6:G, 6vr6:H
65 8u3g:A 427 34 0.0511 0.0328 0.4118 4.1 8u3h:A
66 6n9q:P 277 76 0.0693 0.0686 0.2500 4.7 6n9i:A, 6n9i:B, 6n9i:C, 6n9q:D, 6n9r:A, 6n9r:P, 6n9r:X
67 5mtz:A 768 111 0.0876 0.0312 0.2162 5.7 5mtz:B
68 7u2s:A 248 86 0.1058 0.1169 0.3372 5.8 7u2s:B
69 7zpq:CA 1742 86 0.0876 0.0138 0.2791 6.1 7zrs:CA, 7zuw:CA
70 8yhe:H 524 147 0.1241 0.0649 0.2313 7.1 8yhd:H
71 4xdy:A 331 54 0.0620 0.0514 0.3148 7.4 4xdy:B
72 7u2r:A 244 27 0.0438 0.0492 0.4444 8.0
73 4rel:A 446 29 0.0474 0.0291 0.4483 8.8 4rem:A, 4ren:A, 4whm:A
74 3h3e:A 256 92 0.1058 0.1133 0.3152 8.9
75 7t28:A 238 49 0.0730 0.0840 0.4082 9.7

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218