BioLiP

>protein
QSYHSSIFFSISKGSDKIGGLLEYLEIIKKHNINITRIESRPSKTEKKDYDFFLDLEYPTENNKEVEKVIKDLEEKGVKA
TTLQESSNQTYAPWFPRKISDLDLFANKVLEPGASDPVYRERRREIAKIASTYKHGDEIPRIDYTEEEIKTWGVVYNRLK
ELFPTNACHQHAYIFPLLEQNCGYSPDNIPQLQDISNFLQECTGWRIRPVQGLLSARDFLNGLAFRVFHATQYIRHPSVP
LYTPEPDCCHELLGHVPLLADPDFADFSQEIGLASIGASDEDIQLLSTCYWFTVEFGLCKEGDTIRAYGAGILSSTGEME
HFLTDKAKKLPFNPFDACNTEYPITTFQPLYYVAESFQKAKEQMRQFADSFKKPFSIRYNPYTQSIEILD

The query sequence (length=390) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5jk5:A	400	399	1.0000	0.9750	0.9774	0.0	5jk5:B, 5jk6:A, 5jk6:B, 5jk8:A, 5jk8:B
2	5fgj:A	428	392	0.5641	0.5140	0.5612	1.06e-159	4anp:A, 5den:A, 5den:B, 5den:C, 5den:D, 1dmw:A, 5fgj:B, 5fgj:C, 5fgj:D, 6hpo:A, 6hyc:D, 6hyc:C, 6hyc:B, 1j8t:A, 1j8u:A, 1kw0:A, 1lrm:A, 1mmk:A, 1mmt:A, 6n1k:A, 6n1k:B, 6n1k:C, 6n1k:D, 1pah:A, 2pah:A, 2pah:B, 3pah:A, 4pah:A, 5pah:A, 6pah:A, 1phz:A, 2phm:A, 1tdw:A, 1tg2:A
3	3e2t:A	307	305	0.4846	0.6156	0.6197	6.20e-140	8cji:A, 8cjj:A, 8cjk:A, 8cjl:A, 8cjm:A, 8cjn:A, 8cjo:A, 3hf6:A, 3hf8:A, 3hfb:A, 5j6d:A, 5l01:A, 1mlw:A, 7zif:A, 7zig:A, 7zih:A, 7zii:A, 7zij:A, 7zik:A, 7zik:B
4	4v06:A	349	307	0.4846	0.5415	0.6156	2.35e-138	4v06:B, 7wiy:B, 7wiy:C, 7wiy:D, 7wiy:A
5	6zvp:D	458	391	0.4769	0.4061	0.4757	1.09e-125	7a2g:A, 7a2g:B, 7a2g:C, 7a2g:D, 7pim:B, 7pim:A, 7pim:D, 7pim:F, 1toh:A, 2toh:A, 2xsn:A, 2xsn:B, 2xsn:C, 2xsn:D, 6zn2:A, 6zn2:C, 6zn2:E, 6zn2:G, 6zvp:A, 6zvp:B, 6zvp:C, 6zzu:B, 6zzu:A, 6zzu:C, 6zzu:D
6	5tpg:A	271	281	0.4308	0.6199	0.5979	6.77e-123
7	5j6d:B	248	279	0.3923	0.6169	0.5484	3.88e-96
8	4etl:A	277	218	0.2051	0.2888	0.3670	2.44e-37	4esm:A, 4jpx:A, 4jpy:A, 1ltv:A, 1ltz:A, 4q3w:A, 4q3x:A, 4q3y:A, 4q3z:A, 3tcy:A, 3tk2:A, 3tk4:A
9	2v27:B	272	233	0.2000	0.2868	0.3348	5.19e-35	2v27:A
10	7vgm:A	571	248	0.1846	0.1261	0.2903	1.91e-23
11	5fii:B	78	52	0.0487	0.2436	0.3654	1.76e-05	5fii:A, 5fii:C, 5fii:D
12	2qmx:A	278	83	0.0615	0.0863	0.2892	0.073	2qmx:B
13	3mwb:A	306	42	0.0385	0.0490	0.3571	0.21	3mwb:B
14	7qri:A	100	71	0.0462	0.1800	0.2535	1.0	7qri:B
15	6e8r:A	142	40	0.0410	0.1127	0.4000	2.5	6e8r:B
16	5xzu:A	334	79	0.0487	0.0569	0.2405	6.1
17	3luy:A	326	65	0.0436	0.0521	0.2615	8.6
18	7xoi:B	436	65	0.0513	0.0459	0.3077	9.1	7xoi:D, 7xoi:F, 7xoi:H, 7xoi:J, 7xoi:L, 7xoi:N, 7xoi:P

[Back]