BioLiP

>protein
QRFERIAVQPLTGVLGAEITGVDLREPLDDSTWNEILDAFHTYQVIYFPGQAITNEQHIAFSRRFGPVDPVPLLKSIEGY
PEVQMIRRIGDDWHTDSTFLDAPPAAVVMRAIDVPEHGGDTGFLSMYTAWETLSPTMQATIEGLNVVHSATRVFGSLYQA
QNRMDVDAGDRETVHPLVVTHPGSGRKGLYVNQVYCQRIEGMSEKESEPLLSFLFAHATKPEFTCRVRWKKDQVVVWDNL
CTMHYAINDYHGQTRILHRTTVGGVRPARHHHHH

The query sequence (length=274) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6d0o:B	267	270	0.9745	1.0000	0.9889	0.0
2	5bk9:A	289	286	0.9124	0.8651	0.8741	0.0	5bk9:B, 5bkb:A, 5bkb:B, 5bkc:A, 5bkd:A, 5bkd:B, 6d0o:A, 6d0o:C, 6d0o:D, 6d3h:A, 6d3h:B, 6d3h:I, 6d3i:G, 6d3i:D, 6d3i:J, 6d3m:A, 6d3m:B, 6d3m:F, 6d3m:J
3	5bkc:B	264	275	0.8650	0.8977	0.8618	4.10e-174
4	6d3h:M	287	286	0.8248	0.7875	0.7902	2.98e-168	6d3i:A
5	6d3j:A	247	269	0.7555	0.8381	0.7695	3.80e-152
6	6edh:A	281	276	0.3942	0.3843	0.3913	1.96e-64	6edh:B, 1gqw:A, 1gqw:B, 1gy9:A, 1gy9:B, 1os7:A, 1os7:B, 1os7:C, 1os7:D
7	3v17:A	276	274	0.3686	0.3659	0.3686	1.57e-57	3v17:C, 3v17:B, 3v17:D
8	7qte:B	284	260	0.3431	0.3310	0.3615	3.33e-52	7qtd:A, 7qtd:B, 7qtd:C, 7qtd:D, 7qte:A, 7qtg:A, 7qtg:B
9	5keu:B	280	269	0.3759	0.3679	0.3829	3.02e-51	5keu:A
10	5vn6:A	273	271	0.3394	0.3407	0.3432	4.78e-46	5vn6:B
11	1vz4:D	259	261	0.3212	0.3398	0.3372	3.47e-40	1oii:A, 1oii:B, 1oii:D, 1oij:A, 1oij:B, 1oik:A, 1oik:D, 1vz4:A
12	1oij:C	238	260	0.3139	0.3613	0.3308	3.74e-39	1oii:C, 1oij:D
13	5bke:E	255	263	0.3248	0.3490	0.3384	1.03e-34	5bke:F, 5bke:G
14	4y0e:H	308	272	0.3102	0.2760	0.3125	4.71e-34	4y0e:A, 4y0e:B, 4y0e:C, 4y0e:D, 4y0e:E, 4y0e:F, 4y0e:G
15	3swt:B	246	268	0.3066	0.3415	0.3134	6.02e-33	3swt:A
16	3r1j:A	246	267	0.3102	0.3455	0.3184	2.35e-32	3r1j:B
17	8evo:B	242	263	0.3029	0.3430	0.3156	3.16e-32	4cvy:A, 4cvy:B, 4cvy:C, 4cvy:D
18	5bke:C	289	286	0.3248	0.3080	0.3112	4.67e-32	5bke:A, 5bke:B, 5bke:D
19	4j5i:B	285	268	0.3029	0.2912	0.3097	5.78e-31	4j5i:C, 4j5i:G
20	5j92:B	259	243	0.2883	0.3050	0.3251	1.17e-29	5j92:A, 5j92:C, 5j92:D
21	4j5i:E	250	263	0.2810	0.3080	0.2928	1.54e-28	4j5i:A, 4j5i:D, 4j5i:F, 4j5i:H
22	8kif:C	286	272	0.2445	0.2343	0.2463	1.10e-14	8kif:B, 8kif:A, 8kif:D
23	8kht:B	285	276	0.2445	0.2351	0.2428	5.93e-14	8kht:A
24	6dch:A	296	287	0.2409	0.2230	0.2300	2.65e-12	6l6w:A, 6l6x:A, 7scp:A, 6xn6:A, 6xo3:A, 6xoj:A, 6xpa:A
25	6l86:A	292	274	0.2153	0.2021	0.2153	2.02e-10	6l86:B, 6l86:C, 6l86:D
26	1l5j:A	862	88	0.0657	0.0209	0.2045	0.40	1l5j:B
27	3sae:A	780	79	0.0803	0.0282	0.2785	4.4	3sdr:A, 3sdt:A, 3sdu:A, 3sdv:A
28	4m8i:A	311	106	0.0912	0.0804	0.2358	4.8	4dxd:A, 5h5g:A, 5h5g:B, 5h5h:A, 5h5i:A, 8htb:A, 6kvp:A, 6kvq:A, 5mn4:A, 5mn5:A, 5mn5:B, 5mn6:A, 5mn6:B, 5mn7:A, 5mn7:B, 5mn8:B, 5mn8:A, 7ohh:A, 7ohk:A, 7ohl:A, 7ohn:A, 7oi2:A, 7oja:A, 7ojb:A, 7ojc:A, 7ojd:A, 7ojz:A, 7on2:A, 7on3:A, 7on4:A, 6rvm:A, 6rvm:B, 6rvm:C, 6rvn:A, 6rvp:A, 6rvq:A, 6si9:A, 3vo8:A, 3vo8:B, 3voa:A, 3vob:A, 3wgj:A, 3wgj:B, 3wgk:A, 3wgk:B, 3wgl:A, 3wgl:B, 3wgm:A, 3wgm:B, 3wgn:A, 3wgn:B, 5xdt:A, 5xdu:A, 5xdv:A, 5xdw:A, 6yd1:A, 6yd5:A, 6yd6:A
29	4asu:H	83	60	0.0620	0.2048	0.2833	6.7

[Back]