Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
QQVTADEVGDWYDKFGEVYHLTLGESVHCGLWFPPDAPVPQDMELVTMSSQAQDRYTDYLIETLDPKAGQHLLDIGCGTG
RTALKAARQRGIAVTGVAVSKEQIAAANRLAAGHGLTERLTFEVADAMRLPYEDESFDCAWAIESLCHMDRAKALGEAWR
VLKPGGDLLVLESVVTEELTEPETALFETLYAANVPPRLGEFFDIVSGAGFHTLSLKDLSANLAMTMNVFALGVYSRRAE
FTERFGAEFVDGLLAGLGSAQETLIRKTRFFMATLRKPAVL

The query sequence (length=281) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5gm2:B 282 281 1.0000 0.9965 1.0000 0.0 5gm1:A, 5gm1:B, 5gm1:C, 5gm1:D, 5gm1:E, 5gm1:F, 5gm1:G, 5gm1:H, 5gm1:I, 5gm1:J, 5gm1:K, 5gm1:L, 5gm1:M, 5gm1:N, 5gm1:O, 5gm1:P, 5gm1:Q, 5gm1:R, 5gm2:A, 5gm2:C, 5gm2:D, 5gm2:E, 5gm2:F, 5gm2:G, 5gm2:H, 5gm2:I, 5gm2:J, 5gm2:L, 5gm2:M, 5gm2:N, 5gm2:O, 5gm2:P, 5gm2:Q, 5gm2:R
2 5gm2:K 267 280 0.9253 0.9738 0.9286 0.0
3 3bus:A 251 259 0.3203 0.3586 0.3475 1.32e-38 3bus:B
4 6uv6:C 264 221 0.2918 0.3106 0.3710 3.49e-33 6uv6:A, 6uv6:B
5 4pne:B 272 282 0.3345 0.3456 0.3333 1.12e-32 4pne:A
6 7v6h:A 267 206 0.2562 0.2697 0.3495 1.48e-27 7v6h:B
7 5wp4:A 485 213 0.1993 0.1155 0.2629 1.71e-13
8 5wp5:A 463 132 0.1530 0.0929 0.3258 2.02e-13 5wp5:B
9 4ine:A 431 196 0.1957 0.1276 0.2806 3.61e-13 4ine:B
10 4krh:A 430 198 0.2028 0.1326 0.2879 1.19e-12 4krh:B, 4kri:A, 4kri:B, 4kri:C
11 7fbo:A 282 226 0.2171 0.2163 0.2699 8.41e-11 7fbh:B, 7fbh:C, 7fbo:B, 7fbo:C
12 5z9o:A 373 203 0.1708 0.1287 0.2365 8.50e-11 5z9o:B
13 1ve3:B 226 119 0.1352 0.1681 0.3193 1.51e-10 1ve3:A
14 4f86:A 275 165 0.1459 0.1491 0.2485 5.75e-10 4f84:A, 4f86:B, 4f86:C, 4f86:E, 4f86:F, 4f86:H, 4f86:I, 4f86:J, 4f86:K, 4f86:L
15 3uj7:A 259 230 0.1708 0.1853 0.2087 7.57e-10 4fgz:A, 4fgz:B, 4r6w:A, 4r6w:B, 4r6x:A, 4r6x:B, 3uj6:A, 3uj7:B, 3uj8:A, 3uj9:A, 3uja:A, 3ujb:A, 3ujb:B, 3ujc:A, 3ujd:A
16 5fcd:A 228 118 0.1246 0.1535 0.2966 1.31e-09 5fcd:B
17 2glu:A 234 122 0.1495 0.1795 0.3443 4.28e-09 2glu:B
18 6uak:A 297 102 0.1317 0.1246 0.3627 1.54e-08
19 3kkz:A 256 108 0.1317 0.1445 0.3426 1.30e-07 3kkz:B
20 4mwz:B 265 194 0.1423 0.1509 0.2062 3.18e-07 4iv0:A, 4iv0:B, 4mwz:A
21 3vc1:D 288 111 0.1068 0.1042 0.2703 5.63e-07 4f86:D, 4f86:G, 3vc1:A, 3vc1:B, 3vc1:C, 3vc1:E, 3vc1:F, 3vc1:G, 3vc1:H, 3vc1:I, 3vc1:J, 3vc1:K, 3vc1:L, 3vc2:A, 3vc2:B, 3vc2:C, 3vc2:D, 3vc2:E, 3vc2:F, 3vc2:G, 3vc2:H, 3vc2:I, 3vc2:J, 3vc2:K, 3vc2:L
22 3t7s:A 246 103 0.1139 0.1301 0.3107 7.73e-07 3t7s:B, 3t7s:C, 3t7s:D, 3t7t:A, 3t7t:B, 3t7t:C, 3t7t:D
23 7wdq:A 336 144 0.1423 0.1190 0.2778 1.05e-06 7wdq:B, 7wdq:C, 7wdw:A, 7wdw:B, 7wdw:C, 7wdw:D
24 4iv8:A 245 198 0.1459 0.1673 0.2071 1.23e-06 4iv8:B
25 7qos:A 352 242 0.1673 0.1335 0.1942 1.62e-06 7qos:B
26 1p91:A 268 108 0.1495 0.1567 0.3889 8.32e-06 1p91:B
27 3sxj:A 245 102 0.0961 0.1102 0.2647 1.52e-05 3sxj:B, 3t0i:A, 3t0i:B
28 4nec:B 244 99 0.1495 0.1721 0.4242 2.44e-05 4nec:A, 4nec:C, 4nec:D
29 7q2d:A 286 85 0.0961 0.0944 0.3176 3.94e-05 2fk8:A, 3ha3:A, 3ha5:A, 3ha7:A, 7q2b:A, 7q2c:A, 7q2e:A, 7q2f:A, 7q2g:A, 7q2h:A
30 3dlc:A 219 114 0.1103 0.1416 0.2719 7.30e-05
31 5f8f:B 361 117 0.1246 0.0970 0.2991 8.45e-05 5f8e:A, 5f8e:B, 5f8f:A, 5f8f:C
32 2yqz:A 261 106 0.1423 0.1533 0.3774 1.14e-04 2yqz:B
33 1tpy:A 285 227 0.1922 0.1895 0.2379 1.48e-04
34 6wlf:B 434 133 0.1352 0.0876 0.2857 2.03e-04 6wlf:A
35 1wzn:A 244 100 0.0961 0.1107 0.2700 2.72e-04 1wzn:B, 1wzn:C
36 3e23:A 198 102 0.1246 0.1768 0.3431 6.15e-04
37 1kpg:A 285 64 0.0747 0.0737 0.3281 6.83e-04 1kpg:B, 1kpg:C, 1kpg:D, 1kph:A, 1kph:B, 1kph:C, 1kph:D
38 5bp7:A 249 104 0.1139 0.1285 0.3077 6.99e-04 5bp7:B, 5bp7:C
39 6bqc:A 348 66 0.0854 0.0690 0.3636 7.47e-04
40 2gs9:A 211 130 0.1530 0.2038 0.3308 0.001 2gs9:B
41 3hem:A 291 265 0.1993 0.1924 0.2113 0.001 1kpi:A
42 7lxi:A 279 206 0.1744 0.1756 0.2379 0.003 7mcj:A, 7mcj:B
43 1l1e:A 272 212 0.1566 0.1618 0.2075 0.003 1l1e:B
44 2zfu:A 212 106 0.1246 0.1651 0.3302 0.003 2zfu:B
45 5bxy:A 155 70 0.0676 0.1226 0.2714 0.005 5bxy:B
46 4kdr:A 208 112 0.1103 0.1490 0.2768 0.005 5dpm:A
47 6cu5:A 314 105 0.1174 0.1051 0.3143 0.005 6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
48 7pd7:B 250 104 0.1068 0.1200 0.2885 0.005 7pd7:A, 7pd7:C, 7pd7:D
49 5kok:A 348 47 0.0712 0.0575 0.4255 0.006 5koc:A, 5koc:B, 5kok:B, 5kpc:A, 5kpc:B, 5kpg:A, 5kpg:B
50 5h02:A 252 132 0.1388 0.1548 0.2955 0.006 5gwx:A, 5hik:A, 5hil:A, 5him:A
51 5epe:A 248 106 0.1032 0.1169 0.2736 0.008
52 6mro:A 194 119 0.1281 0.1856 0.3025 0.008 8gdu:A
53 7qcb:A 240 127 0.1281 0.1500 0.2835 0.010
54 8joz:A 257 108 0.1139 0.1245 0.2963 0.012 4htf:A, 4htf:B
55 6p3o:A 341 158 0.1317 0.1085 0.2342 0.016 6p3m:A, 6p3n:A
56 3e8s:A 220 101 0.1103 0.1409 0.3069 0.017
57 1qzz:A 340 116 0.1317 0.1088 0.3190 0.018 1r00:A, 1xds:A, 1xds:B, 1xdu:A
58 5u1e:A 321 69 0.0925 0.0810 0.3768 0.032 5tyq:A, 5u0n:A, 5u0t:A, 5u18:A, 5u19:A, 5u1i:A, 5u4t:A
59 5dm2:A 258 40 0.0605 0.0659 0.4250 0.040 5dm1:A, 5dm4:A, 4kwc:A
60 3wst:I 644 51 0.0641 0.0280 0.3529 0.063 3wst:A, 3wst:D, 3wst:B, 3wst:C, 3wst:F, 3wst:E, 3wst:G, 3wst:H, 3wst:M, 3wst:N, 3wst:O, 3wst:P, 3wst:Q, 3wst:R, 3wst:J, 3wst:K, 3wst:L, 3x0d:A
61 6gkv:A 351 106 0.1139 0.0912 0.3019 0.075 6gkv:B, 6gky:A, 6gky:B, 6gkz:A, 6gkz:B, 6gkz:C, 6gkz:D
62 6f5z:B 228 186 0.1779 0.2193 0.2688 0.076 6f5z:A
63 5je1:A 244 106 0.1032 0.1189 0.2736 0.077 5jdy:A, 5jdy:B, 5jdz:A, 5jdz:B, 5je0:A, 5je0:B, 5je1:B, 5je2:A, 5je2:B, 5je3:A, 5je3:B, 5je4:A, 5je4:B, 5je5:A
64 5m58:A 230 142 0.1281 0.1565 0.2535 0.090 5m58:B
65 3lcc:A 216 181 0.1601 0.2083 0.2486 0.14
66 3jwh:A 191 112 0.1246 0.1832 0.3125 0.14 3jwh:B
67 6cx6:B 333 134 0.1281 0.1081 0.2687 0.28 6cx6:A, 5eg5:A, 4fr0:A, 4fsd:A, 4kw7:A, 4rsr:A
68 5e72:A 323 143 0.1388 0.1207 0.2727 0.30
69 5fad:A 160 95 0.0819 0.1437 0.2421 0.33 5fa8:A
70 7cpx:A 2262 116 0.1174 0.0146 0.2845 0.49 7cpx:B, 7cpy:A, 7cpy:B
71 8khq:A 700 63 0.0712 0.0286 0.3175 0.67 8khq:B, 8khq:C, 8khq:D
72 2xva:A 199 109 0.1068 0.1508 0.2752 0.70 2xva:B, 2xva:C, 2xva:D, 2xvm:A, 2xvm:B
73 1l3i:A 186 111 0.1139 0.1720 0.2883 0.84 1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F
74 7cta:A 329 131 0.1139 0.0973 0.2443 1.0 7ct9:A, 7ct9:B, 7cta:B
75 7vru:A 497 98 0.1032 0.0584 0.2959 1.1 7vs4:A
76 5dm0:B 272 40 0.0534 0.0551 0.3750 1.5 5dly:A, 5dm0:A, 4kvz:A
77 1ri1:A 252 67 0.0605 0.0675 0.2537 1.6 2hv9:A, 1ri2:A, 1ri3:A, 1ri4:A, 1z3c:A
78 6dxp:A 206 105 0.1139 0.1553 0.3048 1.6 6dxp:C, 6dxp:B, 6dxp:D, 8h4j:A, 8h4j:B, 8h4j:C, 8h4j:D, 8h4j:E, 8h4j:F, 8h4j:G, 8h4j:H, 7n2w:A, 7n2w:B, 7n2w:C, 7n2w:D
79 4a6d:A 345 88 0.0854 0.0696 0.2727 1.7 4a6e:A
80 6p2l:A 685 124 0.1210 0.0496 0.2742 1.8
81 4hh4:C 256 104 0.0890 0.0977 0.2404 1.8 4hh4:A, 4hh4:B, 4hh4:D, 4hh4:E, 4hh4:F
82 7wzf:A 243 111 0.1281 0.1481 0.3243 2.1
83 6eqo:A 1804 69 0.0925 0.0144 0.3768 2.2 6eqo:B
84 4obw:D 235 88 0.0925 0.1106 0.2955 2.2 4obw:A, 4obw:C, 4obw:B
85 6hp2:A 297 87 0.0819 0.0774 0.2644 2.4
86 7rbq:A 614 69 0.0641 0.0293 0.2609 3.2 7t39:A
87 7wzg:B 243 110 0.0996 0.1152 0.2545 3.2 7wzg:A, 7wzg:C, 7wzg:D, 7wzg:E, 7wzg:F
88 8hkr:B 384 47 0.0498 0.0365 0.2979 3.3 8hkr:A
89 6dnz:A 317 50 0.0569 0.0505 0.3200 3.3 6dnz:C
90 3mq2:A 215 80 0.0819 0.1070 0.2875 3.4 3mq2:B
91 4qtu:B 191 112 0.0996 0.1466 0.2500 3.9 4qtu:D
92 4o29:A 207 120 0.0961 0.1304 0.2250 4.1
93 8pjd:A 347 68 0.0641 0.0519 0.2647 4.2 8bva:A, 8c1j:A, 5ful:A, 5fwa:A, 5fwd:A, 5jmq:A
94 5i2h:A 335 127 0.1246 0.1045 0.2756 4.2 5i2h:B
95 1sg9:A 274 47 0.0498 0.0511 0.2979 4.6 1nv8:A, 1nv8:B, 1nv9:A, 1sg9:B, 1sg9:C, 1vq1:A, 1vq1:B
96 5w7m:A 273 178 0.1423 0.1465 0.2247 5.0
97 8i4q:A 479 52 0.0712 0.0418 0.3846 5.1 8i4q:B
98 6ecx:A 283 79 0.0641 0.0636 0.2278 5.2 6ect:A
99 7clf:A 335 131 0.1103 0.0925 0.2366 6.0 7clf:B
100 2jae:A 478 114 0.1174 0.0690 0.2895 6.1 2jae:B, 2jb1:A, 2jb1:B, 2jb2:A, 2jb2:B, 2jb3:A, 2jb3:B
101 1hro:A 105 33 0.0463 0.1238 0.3939 6.2 1hro:B
102 4oqd:C 241 50 0.0676 0.0788 0.3800 8.5 6m81:A, 6m81:B, 6m81:C, 6m81:D, 6m82:A, 6m83:A, 4oqd:A, 4oqd:B, 4oqd:D, 4oqe:A, 4oqe:B, 3pfg:A, 3pfh:A, 3pfh:D, 3px2:A, 3px2:D, 3px3:A, 3px3:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218