BioLiP

>protein
QQSTFLFHDYETFGTHPALDRPAQFAAIRTDSEFNVIGEPEVFYCKPADDYLPQPGAVLITGITPQEARAKGENEAAFAA
RIHSLFTVPKTCILGYNNVRFDDEVTRNIFYRNFYDPYAWSWQHDNSRWDLLDVMRACYALRPEGINWPENLPSFRLEHL
TKANGIEDAMADVYATIAMAKLVKTRQPRLFDYLFTHRNKHKLMALIDVPQMKPLVHVSGMFGAWRGNTSWVAPLAWHPE
NRNAVIMVDLAGDISPLLELDSDTLRERLYTAKTDLGDNAAVPVKLVHINKCPVLAQANTLRPEDADRLGINRQHCLDNL
KILRENPQVREKVVAIFAEAEPFTPSDNVDAQLYNGFFSDADRAAMKIVLETEPRNLPALDITFVDKRIEKLLFNYRARN
FPGTLDYAEQQRWLEHRRQVFTPEFLQGYADELQMLVQQYADDKEKVALLKALWQYADEIVH

The query sequence (length=462) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4js4:A	468	468	0.9935	0.9808	0.9808	0.0	3c94:A, 4hcb:A, 4hcb:B, 4hcc:A, 4hcc:B, 3hl8:A, 3hp9:A, 4jrp:A, 4jrp:B, 4jrq:A, 4jrq:B, 4js4:B, 4js5:A, 4js5:B
2	2qxf:A	433	465	0.9264	0.9885	0.9204	0.0
3	6a4d:A	184	50	0.0368	0.0924	0.3400	0.047	6a4d:B, 6a4e:A, 6a4e:C, 6a4f:A, 6a4f:B
4	5njk:A	147	75	0.0476	0.1497	0.2933	0.16	5njj:A, 5njj:C, 5njj:B, 5njj:D, 5njk:E, 5njk:C, 5njk:D, 5njk:B, 5njk:F
5	5zgc:F	212	33	0.0281	0.0613	0.3939	0.60	6iso:K
6	8bbk:A	274	33	0.0281	0.0474	0.3939	0.68	8bbk:B, 8bbk:C, 8bbk:D, 8bbk:E, 8bbk:F, 4bn4:A, 4bn5:A, 4bn5:B, 4bn5:C, 4bn5:D, 4bn5:E, 4bn5:F, 4bn5:G, 4bn5:H, 4bn5:I, 4bn5:J, 4bn5:K, 4bn5:L, 4bv3:A, 4bvb:A, 4bve:A, 4bvf:A, 4bvg:A, 4bvh:A, 4bvh:B, 4bvh:C, 5bwn:A, 5bwo:A, 4c78:A, 4c7b:A, 9cbt:A, 9cbt:B, 8ccw:A, 8ccz:A, 8ccz:B, 5d7n:A, 5d7n:B, 5d7n:C, 5d7n:D, 5d7n:E, 5d7n:F, 4fvt:A, 4fz3:A, 3glr:A, 3gls:A, 3gls:B, 3gls:C, 3gls:D, 3gls:E, 3gls:F, 3glt:A, 3glu:A, 5h4d:H, 5h4d:A, 4hd8:A, 8hlw:A, 8hly:A, 8hn9:A, 8hn9:B, 6iso:A, 6iso:B, 6iso:E, 6iso:G, 4jsr:A, 4jt8:A, 4jt9:A, 4o8z:A, 8v15:A, 8v15:C, 8v2n:A, 5y4h:A, 5ytk:A, 5ytk:D, 5ytk:E, 5ytk:F, 5ytk:B, 5ytk:C, 5z93:A, 5z94:A, 5z94:B, 5zgc:A, 5zgc:B, 5zgc:C, 5zgc:E, 5zgc:D
7	6w6i:F	605	82	0.0584	0.0446	0.3293	0.71	6w6j:F
8	6w6h:C	636	82	0.0584	0.0425	0.3293	0.72	6w6e:B, 6w6e:C, 6w6g:A, 6w6g:B, 6w6g:C, 6w6h:A, 6w6h:B, 6w6h:F, 6w6i:A, 6w6i:B, 6w6i:C, 6w6j:A, 6w6j:B, 6w6j:C
9	6iso:I	248	33	0.0281	0.0524	0.3939	0.72
10	7l6n:C	675	82	0.0584	0.0400	0.3293	0.78	7l6n:A, 7l6n:B, 6w6e:A
11	4yu6:A	754	44	0.0238	0.0146	0.2500	1.4	4yu5:A, 4yu5:B, 4yu6:B
12	3qb5:K	222	72	0.0433	0.0901	0.2778	1.8
13	2fty:A	532	62	0.0390	0.0338	0.2903	2.8	2fty:B, 2fty:C, 2fty:D, 2fvk:A, 2fvk:B, 2fvk:C, 2fvk:D, 2fvm:A, 2fvm:B, 2fvm:C, 2fvm:D
14	6n6a:A	181	39	0.0281	0.0718	0.3333	4.5	6n6c:A, 6n6d:A, 6n6e:A, 6n6f:A, 6n6g:A, 6n6h:A
15	2igi:A	180	51	0.0281	0.0722	0.2549	4.5	2igi:B, 7vh4:C
16	1qh3:A	260	90	0.0498	0.0885	0.2556	8.0	1qh3:B, 1qh5:A, 1qh5:B
17	3d9k:B	141	40	0.0281	0.0922	0.3250	8.1	3d9k:A, 3d9l:A, 3d9l:B, 3d9m:A, 3d9m:B, 3d9n:A, 3d9n:B, 3d9o:B, 3d9p:A, 3d9p:B

[Back]