Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QQRKVLTLEKGDNQTFGFEIQTYGVTFVARVHESSPAQLAGLTPGDTIASVNGLNVEGIRHREIVDIIKASGNVLRLETL
YGT

The query sequence (length=83) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2egn:A 83 83 1.0000 1.0000 1.0000 7.97e-57
2 5wou:A 95 51 0.2892 0.2526 0.4706 6.70e-09
3 2m0u:A 117 77 0.3494 0.2479 0.3766 8.12e-09
4 6ezi:A 86 75 0.3373 0.3256 0.3733 9.10e-08 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
5 4e34:A 87 84 0.3494 0.3333 0.3452 1.27e-07 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
6 2m0v:A 128 77 0.3012 0.1953 0.3247 1.92e-07
7 6yx0:B 112 98 0.3614 0.2679 0.3061 3.24e-07 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
8 8b82:A 108 51 0.2169 0.1667 0.3529 3.77e-07 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
9 2kqf:A 96 53 0.2771 0.2396 0.4340 6.60e-07 2kyl:A
10 6x23:A 89 75 0.3373 0.3146 0.3733 1.62e-06
11 2os6:A 89 68 0.2892 0.2697 0.3529 2.04e-05
12 2l4t:A 124 94 0.3494 0.2339 0.3085 2.11e-05 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
13 7d6f:A 87 73 0.2892 0.2759 0.3288 2.38e-05
14 2r4h:C 98 75 0.2892 0.2449 0.3200 5.21e-05
15 7pcb:A 415 53 0.2651 0.0530 0.4151 6.31e-05 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
16 7qqn:C 414 46 0.2048 0.0411 0.3696 7.98e-05 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
17 1ihj:B 95 86 0.3253 0.2842 0.3140 1.01e-04 1ihj:A
18 7p73:A 420 52 0.2289 0.0452 0.3654 2.97e-04 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
19 7x2e:A 163 52 0.2289 0.1166 0.3654 3.75e-04 2kbs:A
20 4ynn:A 400 39 0.1928 0.0400 0.4103 0.002 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
21 4ynn:A 400 33 0.1687 0.0350 0.4242 2.9 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
22 2qt5:A 194 40 0.2048 0.0876 0.4250 0.002 2qt5:B
23 2qt5:A 194 76 0.3012 0.1289 0.3289 0.024 2qt5:B
24 8blu:B 195 77 0.2771 0.1179 0.2987 0.003 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
25 8blu:B 195 32 0.1807 0.0769 0.4688 0.021 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
26 6xa7:B 96 52 0.2289 0.1979 0.3654 0.004 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
27 3o5n:E 92 80 0.3253 0.2935 0.3375 0.004
28 4xh7:A 110 60 0.2410 0.1818 0.3333 0.006
29 5ez0:D 95 73 0.2530 0.2211 0.2877 0.008 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
30 8bq8:C 93 52 0.2410 0.2151 0.3846 0.009 8bq8:A, 8bq8:B
31 3ch8:A 190 51 0.2289 0.1000 0.3725 0.009 2qbw:A
32 1n7t:A 103 51 0.2289 0.1845 0.3725 0.009 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
33 8bv7:A 95 44 0.2048 0.1789 0.3864 0.011 8buw:A, 8buw:B
34 4wyu:A 201 57 0.2410 0.0995 0.3509 0.011 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
35 6ar4:B 87 69 0.2410 0.2299 0.2899 0.014 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
36 2pdz:A 86 84 0.2892 0.2791 0.2857 0.016
37 7xft:A 86 56 0.2169 0.2093 0.3214 0.018
38 6hks:B 94 63 0.2651 0.2340 0.3492 0.023 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
39 3pv3:A 392 39 0.1807 0.0383 0.3846 0.024 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
40 4ydp:A 83 67 0.2289 0.2289 0.2836 0.032 4ydp:B
41 3jxt:A 96 49 0.2169 0.1875 0.3673 0.032 3jxt:B
42 3tsz:A 341 39 0.2169 0.0528 0.4615 0.055 3shw:A
43 5heb:A 119 56 0.2048 0.1429 0.3036 0.060 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
44 2m0z:A 97 56 0.2048 0.1753 0.3036 0.064 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
45 7p70:A 407 44 0.2048 0.0418 0.3864 0.065 7pc4:A, 7qql:A
46 3bpu:A 86 31 0.1566 0.1512 0.4194 0.081
47 4c2c:A 433 35 0.1687 0.0323 0.4000 0.10 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
48 8sxg:A 366 37 0.1566 0.0355 0.3514 0.18 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
49 7qqm:A 413 51 0.2169 0.0436 0.3529 0.19
50 8tua:A 1329 42 0.2048 0.0128 0.4048 0.22 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
51 8tua:A 1329 51 0.1928 0.0120 0.3137 3.7 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
52 1q2v:A 518 68 0.2289 0.0367 0.2794 0.25 1q2v:B, 1q2v:C, 1q2v:D, 1q3q:A, 1q3q:B, 1q3q:C, 1q3q:D, 1q3r:A, 1q3s:A, 1q3s:B, 1q3s:C, 1q3s:D, 1q3s:E, 1q3s:F, 1q3s:G, 1q3s:H
53 7w6z:A 414 23 0.1566 0.0314 0.5652 0.28 7w6y:A
54 5t63:A 283 55 0.2289 0.0671 0.3455 0.33 5b6l:A, 5gnd:A
55 2joa:A 105 43 0.1687 0.1333 0.3256 0.53
56 5f67:A 98 26 0.1325 0.1122 0.4231 0.54 5f67:B
57 5gmj:B 224 47 0.2410 0.0893 0.4255 0.66 5gmi:A, 5gmi:B, 5gmj:A, 5h3j:A
58 5izu:A 124 95 0.3373 0.2258 0.2947 0.69 6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
59 3cs0:A 392 28 0.1566 0.0332 0.4643 0.73 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
60 7co7:D 329 49 0.2169 0.0547 0.3673 0.77 7co2:A, 7co3:A, 7co5:H, 7co5:B, 7co5:D, 7co5:F, 7co5:J, 7co5:L
61 6q0m:B 94 51 0.2048 0.1809 0.3333 0.78
62 1u38:A 89 54 0.2048 0.1910 0.3148 1.3
63 1g7u:A 284 58 0.2048 0.0599 0.2931 1.8 1g7v:A, 1gg0:A, 1phq:A, 1phw:A, 1pl9:A, 1q3n:A, 1x6u:A
64 7bjv:C 252 47 0.1566 0.0516 0.2766 2.0 7bju:A, 7bjv:A, 7bjv:B, 1g2n:A, 3ixp:A, 1r1k:A, 1r20:A, 2r40:A, 4umm:F
65 7pc5:A 405 72 0.2410 0.0494 0.2778 2.2
66 2ka9:A 189 54 0.1928 0.0847 0.2963 3.1 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
67 7pc3:A 405 53 0.1807 0.0370 0.2830 3.3 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
68 5f1a:A 553 52 0.1807 0.0271 0.2885 3.3 5f19:A, 5f19:B, 5f1a:B, 5ikq:A, 5ikq:B, 5ikr:A, 5ikr:B, 5ikt:A, 5ikt:B, 5ikv:A, 5ikv:B, 5kir:A, 5kir:B
69 5n7d:A 423 36 0.1807 0.0355 0.4167 3.4 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
70 6kz1:A 97 27 0.1566 0.1340 0.4815 3.6 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
71 4wsi:A 372 67 0.1807 0.0403 0.2239 4.4 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
72 7xs0:A 376 30 0.1566 0.0346 0.4333 4.4
73 6p8j:C 300 45 0.2048 0.0567 0.3778 4.8 6p8j:A, 6p8j:B, 6p8j:D
74 3cyy:B 81 75 0.2048 0.2099 0.2267 4.8 3cyy:A
75 2kpl:A 129 36 0.1807 0.1163 0.4167 4.9
76 2jk8:A 291 32 0.1325 0.0378 0.3438 5.1 5nh2:A
77 3sv1:A 163 49 0.1807 0.0920 0.3061 5.8 1aqc:A, 3sv1:B, 3sv1:C
78 5cuo:B 189 61 0.2048 0.0899 0.2787 5.9 5cuo:A, 5cup:A, 5cup:B
79 7qyr:D 293 74 0.2530 0.0717 0.2838 8.5 7qyr:A, 7qyr:B, 7qyr:C, 7qyr:E, 7qyr:F, 7qyr:G, 7qyr:H, 7qys:A, 7qys:B, 7qys:C, 7qys:D, 7qys:E, 7qys:G, 7qys:H, 7qys:J, 7qys:K, 7qys:M, 7qys:O
80 8kic:A 300 40 0.1687 0.0467 0.3500 8.7 8kic:C, 8kic:B, 3stj:A, 3stj:B, 3stj:C, 3stj:D, 3stj:E, 3stj:F, 3stj:G, 3stj:H, 3stj:I, 3stj:J, 3stj:K, 3stj:L, 8w69:A, 8w69:C, 8w69:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218